MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 19058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011961	GGC	2	6	115369	115374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635525
2502	NC_011961	GAGG	2	8	115375	115382	25 %	0 %	75 %	0 %	221635525
2503	NC_011961	GCTG	2	8	115384	115391	0 %	25 %	50 %	25 %	221635525
2504	NC_011961	GCT	2	6	115428	115433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635525
2505	NC_011961	GCATC	2	10	115572	115581	20 %	20 %	20 %	40 %	221635526
2506	NC_011961	CTCC	2	8	115588	115595	0 %	25 %	0 %	75 %	221635526
2507	NC_011961	GAC	2	6	115604	115609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635526
2508	NC_011961	CTG	2	6	115681	115686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635526
2509	NC_011961	TCG	2	6	115692	115697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635526
2510	NC_011961	GC	3	6	115735	115740	0 %	0 %	50 %	50 %	221635526
2511	NC_011961	ACCGC	2	10	115752	115761	20 %	0 %	20 %	60 %	221635526
2512	NC_011961	CCA	2	6	115765	115770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635526
2513	NC_011961	GGT	2	6	115815	115820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635526
2514	NC_011961	GGA	2	6	115855	115860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635526
2515	NC_011961	GGC	2	6	115867	115872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635526
2516	NC_011961	GC	3	6	115884	115889	0 %	0 %	50 %	50 %	221635526
2517	NC_011961	GAT	2	6	115970	115975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635526
2518	NC_011961	CGT	2	6	115978	115983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635526
2519	NC_011961	TCC	2	6	115995	116000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635526
2520	NC_011961	GGCCG	2	10	116001	116010	0 %	0 %	60 %	40 %	221635526
2521	NC_011961	GTA	2	6	116057	116062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635526
2522	NC_011961	GGGT	2	8	116099	116106	0 %	25 %	75 %	0 %	221635526
2523	NC_011961	CCG	2	6	116169	116174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635526
2524	NC_011961	GTC	2	6	116184	116189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635526
2525	NC_011961	TCC	2	6	116247	116252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635526
2526	NC_011961	AGA	2	6	116302	116307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635526
2527	NC_011961	GCA	3	9	116343	116351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635526
2528	NC_011961	GAT	2	6	116414	116419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635526
2529	NC_011961	ACCG	2	8	116426	116433	25 %	0 %	25 %	50 %	221635526
2530	NC_011961	TCG	2	6	116490	116495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635526
2531	NC_011961	TGA	2	6	116569	116574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635526
2532	NC_011961	GTCG	2	8	116702	116709	0 %	25 %	50 %	25 %	221635526
2533	NC_011961	TCG	2	6	116712	116717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635526
2534	NC_011961	CTC	2	6	116720	116725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635526
2535	NC_011961	GCA	2	6	116772	116777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635526
2536	NC_011961	GAGC	2	8	116869	116876	25 %	0 %	50 %	25 %	221635526
2537	NC_011961	AGC	2	6	116886	116891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635526
2538	NC_011961	GCGAT	2	10	117065	117074	20 %	20 %	40 %	20 %	221635527
2539	NC_011961	GCA	2	6	117155	117160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635527
2540	NC_011961	GCGA	2	8	117206	117213	25 %	0 %	50 %	25 %	221635527
2541	NC_011961	CTCC	2	8	117287	117294	0 %	25 %	0 %	75 %	221635527
2542	NC_011961	ACG	2	6	117319	117324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635527
2543	NC_011961	ACCCG	2	10	117332	117341	20 %	0 %	20 %	60 %	221635527
2544	NC_011961	GAC	2	6	117414	117419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635527
2545	NC_011961	CGC	2	6	117434	117439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635527
2546	NC_011961	TAT	2	6	117467	117472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221635527
2547	NC_011961	CCG	2	6	117480	117485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635527
2548	NC_011961	TTC	3	9	117498	117506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635527
2549	NC_011961	GCT	2	6	117566	117571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635527
2550	NC_011961	CTC	2	6	117638	117643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635527
2551	NC_011961	CTG	2	6	117679	117684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635527
2552	NC_011961	CGGTG	2	10	117710	117719	0 %	20 %	60 %	20 %	221635527
2553	NC_011961	CGGA	2	8	117772	117779	25 %	0 %	50 %	25 %	221635527
2554	NC_011961	GGA	2	6	117827	117832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635527
2555	NC_011961	CGC	2	6	117845	117850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635527
2556	NC_011961	CGC	2	6	117922	117927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635527
2557	NC_011961	GC	3	6	117932	117937	0 %	0 %	50 %	50 %	221635527
2558	NC_011961	CCG	2	6	118110	118115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635527
2559	NC_011961	CGGCT	2	10	118145	118154	0 %	20 %	40 %	40 %	221635527
2560	NC_011961	ATC	2	6	118177	118182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635527
2561	NC_011961	CG	4	8	118196	118203	0 %	0 %	50 %	50 %	221635527
2562	NC_011961	TGC	2	6	118207	118212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635527
2563	NC_011961	TGA	2	6	118237	118242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635527
2564	NC_011961	TTC	2	6	118308	118313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635527
2565	NC_011961	GGA	2	6	118367	118372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635527
2566	NC_011961	GC	4	8	118386	118393	0 %	0 %	50 %	50 %	221635527
2567	NC_011961	GCG	2	6	118689	118694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635528
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2569	NC_011961	CGT	2	6	118739	118744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635528
2570	NC_011961	GCA	2	6	118756	118761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635528
2571	NC_011961	TCG	2	6	118770	118775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635528
2572	NC_011961	CGC	2	6	118783	118788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635528
2573	NC_011961	TCA	2	6	118915	118920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635529
2574	NC_011961	GC	3	6	118950	118955	0 %	0 %	50 %	50 %	221635529
2575	NC_011961	AC	3	6	118974	118979	50 %	0 %	0 %	50 %	221635529
2576	NC_011961	CGG	2	6	118985	118990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635529
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2578	NC_011961	CGG	2	6	119067	119072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635529
2579	NC_011961	GAG	2	6	119081	119086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635529
2580	NC_011961	CGG	2	6	119093	119098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635529
2581	NC_011961	AGCG	2	8	119100	119107	25 %	0 %	50 %	25 %	221635529
2582	NC_011961	CTC	2	6	119191	119196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635529
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2584	NC_011961	GTT	2	6	119399	119404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221635529
2585	NC_011961	TCA	2	6	119446	119451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635529
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2587	NC_011961	G	6	6	119492	119497	0 %	0 %	100 %	0 %	221635529
2588	NC_011961	ACGC	2	8	119512	119519	25 %	0 %	25 %	50 %	221635529
2589	NC_011961	GCG	2	6	119588	119593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635529
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2591	NC_011961	CGAA	2	8	119634	119641	50 %	0 %	25 %	25 %	221635529
2592	NC_011961	ATCCG	2	10	119653	119662	20 %	20 %	20 %	40 %	221635529
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2596	NC_011961	CGA	2	6	119854	119859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635529
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2599	NC_011961	CCG	2	6	119966	119971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635529
2600	NC_011961	TCG	2	6	119980	119985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635529
2601	NC_011961	CTG	2	6	120060	120065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635529
2602	NC_011961	GCG	2	6	120098	120103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635529
2603	NC_011961	CGAC	2	8	120146	120153	25 %	0 %	25 %	50 %	221635529
2604	NC_011961	TCG	2	6	120160	120165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635529
2605	NC_011961	GCGA	2	8	120199	120206	25 %	0 %	50 %	25 %	221635529
2606	NC_011961	CAG	2	6	120229	120234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635529
2607	NC_011961	CGA	2	6	120240	120245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635529
2608	NC_011961	GAG	3	9	120246	120254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635529
2609	NC_011961	CAT	2	6	120329	120334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635529
2610	NC_011961	CGA	2	6	120338	120343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635529
2611	NC_011961	TGG	2	6	120366	120371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635529
2612	NC_011961	GCT	2	6	120377	120382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635529
2613	NC_011961	ACG	2	6	120427	120432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635529
2614	NC_011961	TCG	2	6	120478	120483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635529
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2617	NC_011961	GCG	2	6	120656	120661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635529
2618	NC_011961	GAA	2	6	120672	120677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635529
2619	NC_011961	AGCGC	2	10	120724	120733	20 %	0 %	40 %	40 %	221635529
2620	NC_011961	GC	3	6	120759	120764	0 %	0 %	50 %	50 %	221635529
2621	NC_011961	GAG	2	6	120795	120800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635529
2622	NC_011961	GC	3	6	120815	120820	0 %	0 %	50 %	50 %	221635529
2623	NC_011961	GAC	2	6	120879	120884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635529
2624	NC_011961	CGA	2	6	120902	120907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635529
2625	NC_011961	TGTC	2	8	120913	120920	0 %	50 %	25 %	25 %	221635529
2626	NC_011961	ACC	2	6	121067	121072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635530
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2644	NC_011961	AGC	2	6	122088	122093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635532
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2654	NC_011961	TGA	2	6	122431	122436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635532
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2725	NC_011961	GCT	2	6	125715	125720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635537
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2730	NC_011961	CTG	2	6	125983	125988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635537
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2734	NC_011961	CACGG	2	10	126064	126073	20 %	0 %	40 %	40 %	221635537
2735	NC_011961	GCA	2	6	126116	126121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635537
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2738	NC_011961	TCACTG	2	12	126234	126245	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	221635537
2739	NC_011961	CAG	2	6	126255	126260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635537
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2741	NC_011961	GAT	2	6	126274	126279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635537
2742	NC_011961	GCG	2	6	126568	126573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635538
2743	NC_011961	GCCTA	2	10	126661	126670	20 %	20 %	20 %	40 %	221635538
2744	NC_011961	GTC	2	6	126705	126710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635538
2745	NC_011961	GGT	2	6	126791	126796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635538
2746	NC_011961	CG	3	6	126804	126809	0 %	0 %	50 %	50 %	221635538
2747	NC_011961	ACC	2	6	126814	126819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635538
2748	NC_011961	CGG	2	6	126828	126833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635538
2749	NC_011961	GAC	2	6	126885	126890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635538
2750	NC_011961	ATC	2	6	126903	126908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635538
2751	NC_011961	GA	3	6	126909	126914	50 %	0 %	50 %	0 %	221635538
2752	NC_011961	TCT	2	6	126929	126934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635538
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2755	NC_011961	CCTG	2	8	127182	127189	0 %	25 %	25 %	50 %	221635539
2756	NC_011961	ACG	2	6	127288	127293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635539
2757	NC_011961	CTCGCT	2	12	127303	127314	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	221635539
2758	NC_011961	GCC	2	6	127329	127334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635539
2759	NC_011961	TGC	2	6	127359	127364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635539
2760	NC_011961	GCA	3	9	127368	127376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635539
2761	NC_011961	GCGA	2	8	127379	127386	25 %	0 %	50 %	25 %	221635539
2762	NC_011961	AGT	2	6	127473	127478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635539
2763	NC_011961	CTG	2	6	127483	127488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635539
2764	NC_011961	TGGA	2	8	127506	127513	25 %	25 %	50 %	0 %	221635539
2765	NC_011961	TGC	2	6	127520	127525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635539
2766	NC_011961	GCG	2	6	127538	127543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635539
2767	NC_011961	GTATC	2	10	127548	127557	20 %	40 %	20 %	20 %	221635539
2768	NC_011961	GCT	2	6	127558	127563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635539
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2770	NC_011961	CGC	2	6	127720	127725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635539
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2772	NC_011961	TGA	2	6	127823	127828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635539
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2774	NC_011961	ACG	2	6	128194	128199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635541
2775	NC_011961	GACC	2	8	128231	128238	25 %	0 %	25 %	50 %	221635541
2776	NC_011961	GGCTC	2	10	128239	128248	0 %	20 %	40 %	40 %	221635541
2777	NC_011961	CCGA	2	8	128254	128261	25 %	0 %	25 %	50 %	221635541
2778	NC_011961	GCTG	2	8	128441	128448	0 %	25 %	50 %	25 %	221635542
2779	NC_011961	GC	4	8	128471	128478	0 %	0 %	50 %	50 %	221635542
2780	NC_011961	CCT	2	6	128487	128492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635542
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2783	NC_011961	CG	4	8	128664	128671	0 %	0 %	50 %	50 %	221635542
2784	NC_011961	GAC	2	6	128760	128765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635542
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2787	NC_011961	TCCA	2	8	129002	129009	25 %	25 %	0 %	50 %	221635542
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2798	NC_011961	TCC	2	6	129375	129380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635543
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2803	NC_011961	CGA	2	6	129604	129609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635543
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2846	NC_011961	GC	3	6	131171	131176	0 %	0 %	50 %	50 %	221635546
2847	NC_011961	CGA	2	6	131202	131207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635546
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2850	NC_011961	GAG	2	6	131341	131346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635546
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2852	NC_011961	CCGAGC	2	12	131381	131392	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	221635546
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2854	NC_011961	GAG	2	6	131494	131499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635546
2855	NC_011961	CCAG	2	8	131546	131553	25 %	0 %	25 %	50 %	221635546
2856	NC_011961	AGCGAG	2	12	131554	131565	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	221635546
2857	NC_011961	GAC	2	6	131586	131591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635546
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2859	NC_011961	GC	3	6	131654	131659	0 %	0 %	50 %	50 %	221635547
2860	NC_011961	CTG	2	6	131721	131726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635547
2861	NC_011961	TCG	2	6	131731	131736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635547
2862	NC_011961	CG	4	8	131792	131799	0 %	0 %	50 %	50 %	221635547
2863	NC_011961	TCC	2	6	131803	131808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635547
2864	NC_011961	TGG	2	6	132002	132007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635547
2865	NC_011961	GAA	2	6	132009	132014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635547
2866	NC_011961	GCT	2	6	132017	132022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635547
2867	NC_011961	CG	3	6	132107	132112	0 %	0 %	50 %	50 %	221635547
2868	NC_011961	GCGCT	2	10	132166	132175	0 %	20 %	40 %	40 %	221635547
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2874	NC_011961	TGCGC	2	10	132278	132287	0 %	20 %	40 %	40 %	221635547
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2876	NC_011961	GAC	3	9	132340	132348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635547
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2882	NC_011961	CGC	2	6	132581	132586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635549
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2884	NC_011961	GAAG	2	8	132617	132624	50 %	0 %	50 %	0 %	221635549
2885	NC_011961	CG	3	6	132626	132631	0 %	0 %	50 %	50 %	221635549
2886	NC_011961	CGA	2	6	132664	132669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635549
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2983	NC_011961	CG	3	6	136337	136342	0 %	0 %	50 %	50 %	221635551
2984	NC_011961	GGC	2	6	136348	136353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635551
2985	NC_011961	GGC	2	6	136359	136364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635551
2986	NC_011961	GC	3	6	136389	136394	0 %	0 %	50 %	50 %	221635551
2987	NC_011961	GCTG	2	8	136983	136990	0 %	25 %	50 %	25 %	221635552
2988	NC_011961	TCGG	2	8	137050	137057	0 %	25 %	50 %	25 %	221635552
2989	NC_011961	CCG	2	6	137071	137076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635552
2990	NC_011961	CG	3	6	137075	137080	0 %	0 %	50 %	50 %	221635552
2991	NC_011961	G	6	6	137091	137096	0 %	0 %	100 %	0 %	221635552
2992	NC_011961	GGGA	2	8	137117	137124	25 %	0 %	75 %	0 %	221635552
2993	NC_011961	TCA	2	6	138051	138056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635553
2994	NC_011961	GC	3	6	138072	138077	0 %	0 %	50 %	50 %	221635553
2995	NC_011961	CGGC	2	8	138091	138098	0 %	0 %	50 %	50 %	221635553
2996	NC_011961	CGCC	2	8	138104	138111	0 %	0 %	25 %	75 %	221635553
2997	NC_011961	CGC	2	6	138135	138140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635553
2998	NC_011961	GC	3	6	138139	138144	0 %	0 %	50 %	50 %	221635553
2999	NC_011961	TTC	2	6	138171	138176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635553
3000	NC_011961	ATC	2	6	138214	138219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635553

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