MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 19058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2005	NC_011961	CACTG	2	10	92972	92981	20 %	20 %	20 %	40 %	221635509
2006	NC_011961	GA	4	8	92985	92992	50 %	0 %	50 %	0 %	221635509
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2126	NC_011961	CGT	2	6	99964	99969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635512
2127	NC_011961	GAC	2	6	100033	100038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635512
2128	NC_011961	CAT	2	6	100064	100069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635512
2129	NC_011961	CAA	2	6	100079	100084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221635512
2130	NC_011961	AGG	2	6	100086	100091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635512
2131	NC_011961	GAA	2	6	100112	100117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635512
2132	NC_011961	CGG	2	6	100179	100184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635512
2133	NC_011961	GGA	2	6	100204	100209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635512
2134	NC_011961	GAT	2	6	100243	100248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635512
2135	NC_011961	GCAG	2	8	100309	100316	25 %	0 %	50 %	25 %	221635512
2136	NC_011961	GCGAG	2	10	100324	100333	20 %	0 %	60 %	20 %	221635512
2137	NC_011961	AGC	3	9	100386	100394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635512
2138	NC_011961	CGA	2	6	100506	100511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635512
2139	NC_011961	AGT	2	6	100696	100701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635512
2140	NC_011961	GGC	2	6	100729	100734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635512
2141	NC_011961	CTGG	2	8	100741	100748	0 %	25 %	50 %	25 %	221635512
2142	NC_011961	AAC	2	6	100815	100820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221635512
2143	NC_011961	CCTG	2	8	100825	100832	0 %	25 %	25 %	50 %	221635512
2144	NC_011961	GGTCA	2	10	100901	100910	20 %	20 %	40 %	20 %	221635512
2145	NC_011961	CTG	2	6	100955	100960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635512
2146	NC_011961	TCTCG	2	10	100975	100984	0 %	40 %	20 %	40 %	221635512
2147	NC_011961	GAG	2	6	100991	100996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635512
2148	NC_011961	GGAC	2	8	101025	101032	25 %	0 %	50 %	25 %	221635513
2149	NC_011961	CGA	2	6	101067	101072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635513
2150	NC_011961	GGA	2	6	101199	101204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635513
2151	NC_011961	CGCT	2	8	101300	101307	0 %	25 %	25 %	50 %	221635513
2152	NC_011961	GGA	2	6	101329	101334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635513
2153	NC_011961	GAC	2	6	101493	101498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635513
2154	NC_011961	GAG	2	6	101503	101508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635513
2155	NC_011961	ATC	2	6	101518	101523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635513
2156	NC_011961	GTG	2	6	101602	101607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635513
2157	NC_011961	AGA	2	6	101616	101621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635513
2158	NC_011961	CGC	2	6	101690	101695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635513
2159	NC_011961	GC	3	6	101949	101954	0 %	0 %	50 %	50 %	221635513
2160	NC_011961	TCGG	2	8	101963	101970	0 %	25 %	50 %	25 %	221635513
2161	NC_011961	CAGG	2	8	102022	102029	25 %	0 %	50 %	25 %	221635513
2162	NC_011961	GAC	2	6	102076	102081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635513
2163	NC_011961	GTGA	2	8	102121	102128	25 %	25 %	50 %	0 %	221635513
2164	NC_011961	GCT	2	6	102138	102143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635513
2165	NC_011961	GACC	2	8	102162	102169	25 %	0 %	25 %	50 %	221635513
2166	NC_011961	GA	3	6	102306	102311	50 %	0 %	50 %	0 %	221635513
2167	NC_011961	GGC	2	6	102359	102364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635513
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2170	NC_011961	CTACGG	2	12	102430	102441	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	221635513
2171	NC_011961	CGT	2	6	102501	102506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635513
2172	NC_011961	GAC	2	6	102510	102515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635513
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2174	NC_011961	AGC	2	6	102588	102593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635513
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2180	NC_011961	GTC	2	6	102841	102846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635513
2181	NC_011961	GC	3	6	102864	102869	0 %	0 %	50 %	50 %	221635513
2182	NC_011961	ACGA	2	8	102901	102908	50 %	0 %	25 %	25 %	221635513
2183	NC_011961	GA	3	6	102960	102965	50 %	0 %	50 %	0 %	221635513
2184	NC_011961	CGC	2	6	103040	103045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635513
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2187	NC_011961	GGA	2	6	103167	103172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635513
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2197	NC_011961	CGT	2	6	103613	103618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635514
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2204	NC_011961	GTC	2	6	103995	104000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635514
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2221	NC_011961	TCG	2	6	104682	104687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635515
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2227	NC_011961	GTCC	2	8	104932	104939	0 %	25 %	25 %	50 %	221635515
2228	NC_011961	GTC	3	9	104978	104986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635515
2229	NC_011961	GACGG	2	10	105002	105011	20 %	0 %	60 %	20 %	221635515
2230	NC_011961	GCA	2	6	105023	105028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635515
2231	NC_011961	GAG	2	6	105044	105049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635515
2232	NC_011961	AAC	2	6	105077	105082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221635515
2233	NC_011961	GTG	2	6	105135	105140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635515
2234	NC_011961	CT	3	6	105261	105266	0 %	50 %	0 %	50 %	221635515
2235	NC_011961	CGA	2	6	105284	105289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635515
2236	NC_011961	CCT	2	6	105301	105306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635515
2237	NC_011961	GAG	2	6	105398	105403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635515
2238	NC_011961	CCT	2	6	105442	105447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635515
2239	NC_011961	CAG	2	6	105520	105525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635515
2240	NC_011961	GAA	2	6	105659	105664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635515
2241	NC_011961	CGA	2	6	105672	105677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635515
2242	NC_011961	GGATCG	2	12	105681	105692	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	221635515
2243	NC_011961	ACG	2	6	105701	105706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635515
2244	NC_011961	CG	3	6	105705	105710	0 %	0 %	50 %	50 %	221635515
2245	NC_011961	GC	3	6	105721	105726	0 %	0 %	50 %	50 %	221635515
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2367	NC_011961	GTGGA	2	10	110731	110740	20 %	20 %	60 %	0 %	221635520
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2488	NC_011961	GCTCT	2	10	114960	114969	0 %	40 %	20 %	40 %	221635524
2489	NC_011961	TCG	2	6	115016	115021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635524
2490	NC_011961	TCGC	2	8	115056	115063	0 %	25 %	25 %	50 %	221635524
2491	NC_011961	CGCT	2	8	115099	115106	0 %	25 %	25 %	50 %	221635524
2492	NC_011961	GCTC	2	8	115177	115184	0 %	25 %	25 %	50 %	221635524
2493	NC_011961	GGC	2	6	115193	115198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635524
2494	NC_011961	AGCG	2	8	115215	115222	25 %	0 %	50 %	25 %	221635524
2495	NC_011961	AGG	2	6	115246	115251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635524
2496	NC_011961	CCGG	2	8	115290	115297	0 %	0 %	50 %	50 %	221635524
2497	NC_011961	GC	3	6	115304	115309	0 %	0 %	50 %	50 %	221635524
2498	NC_011961	GAG	2	6	115324	115329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635524
2499	NC_011961	TGGC	2	8	115337	115344	0 %	25 %	50 %	25 %	221635524
2500	NC_011961	GAT	2	6	115361	115366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635525

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