MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 19058

< Previous12...27282930313233343536373839Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_011961	ACG	2	6	915066	915071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636341
19002	NC_011961	TGG	2	6	915086	915091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636341
19003	NC_011961	GTCG	2	8	915244	915251	0 %	25 %	50 %	25 %	221636342
19004	NC_011961	TCGC	2	8	915254	915261	0 %	25 %	25 %	50 %	221636342
19005	NC_011961	CGTGC	2	10	915313	915322	0 %	20 %	40 %	40 %	221636342
19006	NC_011961	GAC	2	6	915334	915339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636342
19007	NC_011961	GC	3	6	915342	915347	0 %	0 %	50 %	50 %	221636342
19008	NC_011961	GCC	2	6	915381	915386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636342
19009	NC_011961	TCG	2	6	915410	915415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636342
19010	NC_011961	GGC	2	6	915443	915448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636342
19011	NC_011961	GCA	2	6	915459	915464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636342
19012	NC_011961	AGC	2	6	915512	915517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636342
19013	NC_011961	CGC	2	6	915598	915603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636342
19014	NC_011961	TGG	2	6	915618	915623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636342
19015	NC_011961	CAG	2	6	915721	915726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636342
19016	NC_011961	CGA	2	6	915775	915780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636342
19017	NC_011961	CGC	2	6	915783	915788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636342
19018	NC_011961	GC	3	6	915899	915904	0 %	0 %	50 %	50 %	221636342
19019	NC_011961	AGG	2	6	915905	915910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636342
19020	NC_011961	CAAG	2	8	915954	915961	50 %	0 %	25 %	25 %	221636342
19021	NC_011961	AGC	2	6	915962	915967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636342
19022	NC_011961	GGA	2	6	915993	915998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636342
19023	NC_011961	GCGCA	2	10	916000	916009	20 %	0 %	40 %	40 %	221636342
19024	NC_011961	GA	3	6	916016	916021	50 %	0 %	50 %	0 %	221636342
19025	NC_011961	ACG	4	12	916037	916048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636342
19026	NC_011961	TTC	2	6	916105	916110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221636342
19027	NC_011961	GGA	2	6	916113	916118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636342
19028	NC_011961	GCA	2	6	916134	916139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636342
19029	NC_011961	CG	3	6	916222	916227	0 %	0 %	50 %	50 %	221636342
19030	NC_011961	TCC	2	6	916277	916282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636342
19031	NC_011961	GAGC	2	8	916309	916316	25 %	0 %	50 %	25 %	221636342
19032	NC_011961	CG	4	8	916332	916339	0 %	0 %	50 %	50 %	221636342
19033	NC_011961	GC	3	6	916375	916380	0 %	0 %	50 %	50 %	221636342
19034	NC_011961	CGA	2	6	916386	916391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636342
19035	NC_011961	CGA	2	6	916395	916400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636342
19036	NC_011961	CCG	2	6	916401	916406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636342
19037	NC_011961	GC	3	6	916557	916562	0 %	0 %	50 %	50 %	221636342
19038	NC_011961	GC	3	6	916585	916590	0 %	0 %	50 %	50 %	221636342
19039	NC_011961	GAG	2	6	916597	916602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636342
19040	NC_011961	AGC	2	6	916625	916630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636342
19041	NC_011961	GAG	2	6	916780	916785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636342
19042	NC_011961	GTC	2	6	916795	916800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636342
19043	NC_011961	CCT	2	6	916806	916811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636342
19044	NC_011961	GTG	2	6	916817	916822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636342
19045	NC_011961	AGC	2	6	916883	916888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636342
19046	NC_011961	GCC	2	6	916907	916912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636342
19047	NC_011961	CGAG	2	8	916946	916953	25 %	0 %	50 %	25 %	221636342
19048	NC_011961	GTG	2	6	916992	916997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636342
19049	NC_011961	GTC	2	6	917047	917052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636342
19050	NC_011961	GTC	2	6	917074	917079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636342
19051	NC_011961	TCG	2	6	917102	917107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636342
19052	NC_011961	ATG	2	6	917162	917167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636342
19053	NC_011961	CGT	2	6	917223	917228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636342
19054	NC_011961	GA	3	6	917411	917416	50 %	0 %	50 %	0 %	221636343
19055	NC_011961	GCA	2	6	917450	917455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636343
19056	NC_011961	AAC	2	6	917461	917466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221636343
19057	NC_011961	GCTCG	2	10	917476	917485	0 %	20 %	40 %	40 %	221636343
19058	NC_011961	GATCG	2	10	917505	917514	20 %	20 %	40 %	20 %	221636343

< Previous12...27282930313233343536373839Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.