MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 19058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_011961	CAC	2	6	864168	864173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636286
18002	NC_011961	AGG	2	6	864193	864198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636286
18003	NC_011961	CGC	2	6	864281	864286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636287
18004	NC_011961	TCC	2	6	864294	864299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636287
18005	NC_011961	GCT	2	6	864300	864305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636287
18006	NC_011961	CGT	2	6	864335	864340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636287
18007	NC_011961	TC	3	6	864381	864386	0 %	50 %	0 %	50 %	221636287
18008	NC_011961	GGAA	2	8	864424	864431	50 %	0 %	50 %	0 %	221636287
18009	NC_011961	GAG	2	6	864433	864438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636287
18010	NC_011961	CCT	2	6	864460	864465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636287
18011	NC_011961	C	6	6	864565	864570	0 %	0 %	0 %	100 %	221636287
18012	NC_011961	CG	3	6	864583	864588	0 %	0 %	50 %	50 %	221636287
18013	NC_011961	CGG	2	6	864613	864618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636287
18014	NC_011961	GTACG	2	10	864634	864643	20 %	20 %	40 %	20 %	221636287
18015	NC_011961	CGG	2	6	864780	864785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636287
18016	NC_011961	GATCG	2	10	864794	864803	20 %	20 %	40 %	20 %	221636287
18017	NC_011961	AGCC	2	8	864812	864819	25 %	0 %	25 %	50 %	221636287
18018	NC_011961	CGA	2	6	864832	864837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636287
18019	NC_011961	CGAA	2	8	864946	864953	50 %	0 %	25 %	25 %	221636287
18020	NC_011961	CGT	2	6	864989	864994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636287
18021	NC_011961	GTC	2	6	865037	865042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636287
18022	NC_011961	CTC	2	6	865076	865081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636287
18023	NC_011961	GCTC	2	8	865087	865094	0 %	25 %	25 %	50 %	221636287
18024	NC_011961	CCT	2	6	865123	865128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636287
18025	NC_011961	CAACGC	2	12	865151	865162	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	221636287
18026	NC_011961	GCG	2	6	865180	865185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636287
18027	NC_011961	ATC	2	6	865196	865201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636287
18028	NC_011961	AGCG	2	8	865207	865214	25 %	0 %	50 %	25 %	221636287
18029	NC_011961	CGC	2	6	865532	865537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636288
18030	NC_011961	CG	3	6	865542	865547	0 %	0 %	50 %	50 %	221636288
18031	NC_011961	AGC	3	9	865612	865620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636288
18032	NC_011961	CTC	2	6	865659	865664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636288
18033	NC_011961	TTC	2	6	865722	865727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221636288
18034	NC_011961	GC	3	6	865754	865759	0 %	0 %	50 %	50 %	221636288
18035	NC_011961	CGCT	2	8	865810	865817	0 %	25 %	25 %	50 %	221636288
18036	NC_011961	T	6	6	865827	865832	0 %	100 %	0 %	0 %	221636288
18037	NC_011961	TCG	2	6	865846	865851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636288
18038	NC_011961	GCG	2	6	865870	865875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636288
18039	NC_011961	CGC	2	6	865919	865924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636288
18040	NC_011961	CTG	2	6	865995	866000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636288
18041	NC_011961	TGA	2	6	866029	866034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636288
18042	NC_011961	CGCT	2	8	866035	866042	0 %	25 %	25 %	50 %	221636288
18043	NC_011961	CGC	3	9	866096	866104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636288
18044	NC_011961	CTC	2	6	866127	866132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636288
18045	NC_011961	CCGC	2	8	866140	866147	0 %	0 %	25 %	75 %	221636288
18046	NC_011961	GTCGCT	2	12	866169	866180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636288
18047	NC_011961	ACG	2	6	866290	866295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636289
18048	NC_011961	CG	3	6	866348	866353	0 %	0 %	50 %	50 %	221636289
18049	NC_011961	GTC	2	6	866358	866363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636289
18050	NC_011961	GCAC	2	8	866370	866377	25 %	0 %	25 %	50 %	221636289
18051	NC_011961	GCT	2	6	866399	866404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636289
18052	NC_011961	GAT	2	6	866436	866441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636289
18053	NC_011961	GCT	2	6	866442	866447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636289
18054	NC_011961	CCG	2	6	866517	866522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636289
18055	NC_011961	CAA	2	6	866530	866535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221636289
18056	NC_011961	GAC	2	6	866538	866543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636289
18057	NC_011961	TCCG	2	8	866551	866558	0 %	25 %	25 %	50 %	221636289
18058	NC_011961	GAA	2	6	866597	866602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221636289
18059	NC_011961	GAT	2	6	866613	866618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636289
18060	NC_011961	CTC	2	6	866672	866677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636289
18061	NC_011961	TCG	3	9	866731	866739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636289
18062	NC_011961	ACC	2	6	866740	866745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636289
18063	NC_011961	GCCT	2	8	866757	866764	0 %	25 %	25 %	50 %	221636289
18064	NC_011961	TCGTC	2	10	867378	867387	0 %	40 %	20 %	40 %	221636290
18065	NC_011961	CTG	2	6	867437	867442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636290
18066	NC_011961	CGAG	2	8	867444	867451	25 %	0 %	50 %	25 %	221636290
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18068	NC_011961	CGAG	2	8	867513	867520	25 %	0 %	50 %	25 %	221636290
18069	NC_011961	CGT	3	9	867630	867638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636290
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18071	NC_011961	CA	3	6	867838	867843	50 %	0 %	0 %	50 %	221636291
18072	NC_011961	TCGA	2	8	867887	867894	25 %	25 %	25 %	25 %	221636291
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18081	NC_011961	ATCG	2	8	868566	868573	25 %	25 %	25 %	25 %	221636293
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18083	NC_011961	ATCGAG	2	12	868600	868611	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	221636293
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18085	NC_011961	GC	3	6	868637	868642	0 %	0 %	50 %	50 %	221636293
18086	NC_011961	CGC	2	6	868704	868709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636294
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18088	NC_011961	CCG	2	6	868833	868838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636294
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18091	NC_011961	TCG	2	6	869102	869107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636294
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18093	NC_011961	GCT	2	6	869158	869163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636294
18094	NC_011961	ATCC	2	8	869206	869213	25 %	25 %	0 %	50 %	221636294
18095	NC_011961	CGCT	2	8	869215	869222	0 %	25 %	25 %	50 %	221636294
18096	NC_011961	TCG	2	6	869244	869249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636294
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18103	NC_011961	GTC	3	9	869560	869568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636294
18104	NC_011961	GAT	2	6	869601	869606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636294
18105	NC_011961	CTG	2	6	869693	869698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636294
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18107	NC_011961	GGC	2	6	869736	869741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636294
18108	NC_011961	CGC	2	6	869767	869772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636294
18109	NC_011961	CTC	2	6	869779	869784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636294
18110	NC_011961	GCA	2	6	869842	869847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636294
18111	NC_011961	GCGGTC	2	12	869848	869859	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	221636294
18112	NC_011961	GC	3	6	869891	869896	0 %	0 %	50 %	50 %	221636294
18113	NC_011961	ACG	2	6	869915	869920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636294
18114	NC_011961	CCCT	2	8	869995	870002	0 %	25 %	0 %	75 %	221636294
18115	NC_011961	TGG	3	9	870017	870025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636294
18116	NC_011961	TCG	2	6	870041	870046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636294
18117	NC_011961	C	6	6	870049	870054	0 %	0 %	0 %	100 %	221636294
18118	NC_011961	TCAC	2	8	870134	870141	25 %	25 %	0 %	50 %	221636294
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18120	NC_011961	CCA	2	6	870283	870288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636295
18121	NC_011961	CTC	2	6	870332	870337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636295
18122	NC_011961	GCG	2	6	870349	870354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636295
18123	NC_011961	ACC	2	6	870360	870365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636295
18124	NC_011961	GATC	2	8	870383	870390	25 %	25 %	25 %	25 %	221636295
18125	NC_011961	CTG	2	6	870395	870400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636295
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18127	NC_011961	GCT	2	6	870517	870522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636295
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18129	NC_011961	TCG	2	6	870637	870642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636295
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18140	NC_011961	CGA	3	9	871144	871152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636295
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18142	NC_011961	GCA	2	6	871177	871182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636295
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18145	NC_011961	GGA	2	6	871273	871278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636295
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18149	NC_011961	CGC	2	6	871399	871404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636295
18150	NC_011961	GC	3	6	871403	871408	0 %	0 %	50 %	50 %	221636295
18151	NC_011961	TCG	2	6	871428	871433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636295
18152	NC_011961	GC	3	6	871472	871477	0 %	0 %	50 %	50 %	221636295
18153	NC_011961	CAT	2	6	871490	871495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636295
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18157	NC_011961	GC	3	6	871700	871705	0 %	0 %	50 %	50 %	221636295
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18221	NC_011961	CAGT	2	8	875807	875814	25 %	25 %	25 %	25 %	221636299
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18223	NC_011961	CGAT	2	8	875908	875915	25 %	25 %	25 %	25 %	221636300
18224	NC_011961	GCG	2	6	875943	875948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636300
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18229	NC_011961	ACCT	2	8	876114	876121	25 %	25 %	0 %	50 %	221636300
18230	NC_011961	GC	3	6	876158	876163	0 %	0 %	50 %	50 %	221636300
18231	NC_011961	CCGA	2	8	876205	876212	25 %	0 %	25 %	50 %	221636300
18232	NC_011961	GGTCGC	2	12	876224	876235	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	221636300
18233	NC_011961	CGGTG	2	10	876283	876292	0 %	20 %	60 %	20 %	221636300
18234	NC_011961	CCG	2	6	876322	876327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636300
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18237	NC_011961	CGC	3	9	876414	876422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636300
18238	NC_011961	GCCA	2	8	876483	876490	25 %	0 %	25 %	50 %	221636301
18239	NC_011961	TCG	2	6	876529	876534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636301
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18482	NC_011961	CAC	2	6	887867	887872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636312
18483	NC_011961	GTG	2	6	887922	887927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636312
18484	NC_011961	CTG	2	6	888116	888121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636312
18485	NC_011961	CGA	2	6	888130	888135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636312
18486	NC_011961	TGC	2	6	888164	888169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636312
18487	NC_011961	GCT	2	6	888198	888203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636312
18488	NC_011961	TCA	2	6	888228	888233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636312
18489	NC_011961	CCG	2	6	888246	888251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636312
18490	NC_011961	GCA	2	6	888351	888356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636312
18491	NC_011961	GCG	2	6	888403	888408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636312
18492	NC_011961	CAG	2	6	888418	888423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636312
18493	NC_011961	ACC	2	6	888431	888436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636312
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18495	NC_011961	CTTGG	2	10	888542	888551	0 %	40 %	40 %	20 %	221636312
18496	NC_011961	CAGT	2	8	888691	888698	25 %	25 %	25 %	25 %	221636312
18497	NC_011961	TGA	2	6	888721	888726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636312
18498	NC_011961	GAC	2	6	888817	888822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636312
18499	NC_011961	CAG	3	9	888823	888831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636312
18500	NC_011961	TCG	2	6	888843	888848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636312

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