MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 19058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_011961	GCT	2	6	815389	815394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636235
17002	NC_011961	GC	3	6	815408	815413	0 %	0 %	50 %	50 %	221636235
17003	NC_011961	CGA	2	6	815437	815442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636235
17004	NC_011961	CGT	2	6	815516	815521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636235
17005	NC_011961	GAC	2	6	815567	815572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636235
17006	NC_011961	CGC	2	6	815645	815650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636235
17007	NC_011961	CGGC	2	8	815680	815687	0 %	0 %	50 %	50 %	221636235
17008	NC_011961	AGC	2	6	815724	815729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636235
17009	NC_011961	CGA	2	6	815749	815754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636235
17010	NC_011961	AGCC	2	8	815808	815815	25 %	0 %	25 %	50 %	221636235
17011	NC_011961	GCA	2	6	815827	815832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636235
17012	NC_011961	CCA	2	6	815839	815844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636235
17013	NC_011961	CGT	2	6	815870	815875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636235
17014	NC_011961	GAA	2	6	815906	815911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221636235
17015	NC_011961	CGC	2	6	815982	815987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636235
17016	NC_011961	CAC	2	6	816026	816031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636235
17017	NC_011961	CGC	2	6	816036	816041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636235
17018	NC_011961	TTCAG	2	10	816045	816054	20 %	40 %	20 %	20 %	221636235
17019	NC_011961	CCT	2	6	816157	816162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636235
17020	NC_011961	CAC	2	6	816188	816193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636235
17021	NC_011961	GAA	2	6	816194	816199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221636235
17022	NC_011961	GAT	2	6	816203	816208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636235
17023	NC_011961	CGC	2	6	816221	816226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636235
17024	NC_011961	CAA	2	6	816338	816343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221636235
17025	NC_011961	GAGC	2	8	816358	816365	25 %	0 %	50 %	25 %	221636235
17026	NC_011961	TCG	2	6	816373	816378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636235
17027	NC_011961	GAT	2	6	816482	816487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636235
17028	NC_011961	GGT	2	6	816556	816561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636235
17029	NC_011961	GAA	2	6	816569	816574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221636235
17030	NC_011961	CGC	2	6	816590	816595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636235
17031	NC_011961	CCGAC	2	10	816634	816643	20 %	0 %	20 %	60 %	221636235
17032	NC_011961	GTT	2	6	816683	816688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221636235
17033	NC_011961	CGCA	2	8	816692	816699	25 %	0 %	25 %	50 %	221636235
17034	NC_011961	CT	3	6	817482	817487	0 %	50 %	0 %	50 %	221636236
17035	NC_011961	CGC	2	6	817503	817508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636236
17036	NC_011961	ACCG	2	8	817577	817584	25 %	0 %	25 %	50 %	221636236
17037	NC_011961	CGAACG	2	12	818002	818013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636237
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17039	NC_011961	ACT	2	6	818226	818231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636237
17040	NC_011961	CTC	2	6	818282	818287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636237
17041	NC_011961	GCT	2	6	818293	818298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636237
17042	NC_011961	CGAG	2	8	818453	818460	25 %	0 %	50 %	25 %	221636238
17043	NC_011961	GCT	2	6	818485	818490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636238
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17046	NC_011961	GGTC	2	8	818861	818868	0 %	25 %	50 %	25 %	221636239
17047	NC_011961	GTC	2	6	818889	818894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636239
17048	NC_011961	TCG	2	6	818953	818958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636239
17049	NC_011961	CGA	2	6	818972	818977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636239
17050	NC_011961	GC	4	8	818991	818998	0 %	0 %	50 %	50 %	221636239
17051	NC_011961	CGAG	2	8	819005	819012	25 %	0 %	50 %	25 %	221636239
17052	NC_011961	GC	3	6	819017	819022	0 %	0 %	50 %	50 %	221636239
17053	NC_011961	GCC	2	6	819030	819035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636239
17054	NC_011961	TTC	2	6	819055	819060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221636240
17055	NC_011961	CAG	2	6	819061	819066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636240
17056	NC_011961	CGT	2	6	819099	819104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636240
17057	NC_011961	CCT	2	6	819174	819179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636240
17058	NC_011961	GGGA	2	8	819185	819192	25 %	0 %	75 %	0 %	221636240
17059	NC_011961	ATC	2	6	819208	819213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636240
17060	NC_011961	CAT	2	6	819247	819252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636240
17061	NC_011961	CGC	2	6	819258	819263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636240
17062	NC_011961	CGA	2	6	819275	819280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636240
17063	NC_011961	GTC	2	6	819358	819363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636240
17064	NC_011961	CCAT	2	8	819371	819378	25 %	25 %	0 %	50 %	221636240
17065	NC_011961	TCG	2	6	819473	819478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636240
17066	NC_011961	TCGC	2	8	819485	819492	0 %	25 %	25 %	50 %	221636240
17067	NC_011961	TGC	2	6	819522	819527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636240
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17070	NC_011961	C	6	6	819568	819573	0 %	0 %	0 %	100 %	221636240
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17074	NC_011961	AAC	2	6	819667	819672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221636240
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17079	NC_011961	GCCT	2	8	819873	819880	0 %	25 %	25 %	50 %	221636240
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17087	NC_011961	CG	3	6	820349	820354	0 %	0 %	50 %	50 %	221636240
17088	NC_011961	GC	3	6	820398	820403	0 %	0 %	50 %	50 %	221636240
17089	NC_011961	ACG	2	6	820417	820422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636240
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17099	NC_011961	CCA	2	6	821157	821162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636242
17100	NC_011961	CG	3	6	821184	821189	0 %	0 %	50 %	50 %	221636242
17101	NC_011961	CACG	2	8	821268	821275	25 %	0 %	25 %	50 %	221636242
17102	NC_011961	CTG	2	6	821308	821313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636242
17103	NC_011961	ACGC	2	8	821393	821400	25 %	0 %	25 %	50 %	221636242
17104	NC_011961	CCA	2	6	821461	821466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636242
17105	NC_011961	GC	3	6	821467	821472	0 %	0 %	50 %	50 %	221636242
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17110	NC_011961	CGG	2	6	821607	821612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636242
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17114	NC_011961	CGC	2	6	821818	821823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636242
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17117	NC_011961	CGAG	2	8	821907	821914	25 %	0 %	50 %	25 %	221636242
17118	NC_011961	GATC	2	8	822045	822052	25 %	25 %	25 %	25 %	221636242
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17120	NC_011961	TTC	2	6	822137	822142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221636242
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17241	NC_011961	CGT	3	9	827797	827805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636249
17242	NC_011961	CCG	2	6	827847	827852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636249
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17353	NC_011961	TCG	2	6	834193	834198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636257
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17355	NC_011961	GCT	2	6	834220	834225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636257
17356	NC_011961	CT	4	8	834350	834357	0 %	50 %	0 %	50 %	221636257
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17358	NC_011961	TCG	2	6	834402	834407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636257
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17477	NC_011961	GCG	2	6	840229	840234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636263
17478	NC_011961	CCA	2	6	840259	840264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636263
17479	NC_011961	TGC	2	6	840351	840356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636263
17480	NC_011961	ACCG	2	8	840365	840372	25 %	0 %	25 %	50 %	221636263
17481	NC_011961	GAC	2	6	840377	840382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636263
17482	NC_011961	TC	3	6	840391	840396	0 %	50 %	0 %	50 %	221636263
17483	NC_011961	CCG	2	6	840594	840599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636264
17484	NC_011961	TGCC	2	8	840635	840642	0 %	25 %	25 %	50 %	221636264
17485	NC_011961	GGA	2	6	840715	840720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636264
17486	NC_011961	CTC	2	6	840866	840871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636264
17487	NC_011961	CAG	2	6	841024	841029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636264
17488	NC_011961	GCG	2	6	841039	841044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636264
17489	NC_011961	CGA	2	6	841114	841119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636264
17490	NC_011961	GAGCG	2	10	841238	841247	20 %	0 %	60 %	20 %	221636264
17491	NC_011961	TCG	2	6	841290	841295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636264
17492	NC_011961	CGG	2	6	841327	841332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636264
17493	NC_011961	CTG	2	6	841357	841362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636264
17494	NC_011961	CGC	2	6	841372	841377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636264
17495	NC_011961	CTCGGC	2	12	841397	841408	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	221636264
17496	NC_011961	TCG	2	6	841431	841436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636264
17497	NC_011961	TCC	2	6	841443	841448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636264
17498	NC_011961	GCT	2	6	841522	841527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636264
17499	NC_011961	AGT	2	6	841550	841555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636264
17500	NC_011961	TGC	3	9	841576	841584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636264

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