MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 19058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_011961	CAGC	2	8	719194	719201	25 %	0 %	25 %	50 %	221636135
15002	NC_011961	CG	3	6	719206	719211	0 %	0 %	50 %	50 %	221636135
15003	NC_011961	ACC	2	6	719220	719225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636135
15004	NC_011961	GAC	2	6	719246	719251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636135
15005	NC_011961	GAG	2	6	719252	719257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636135
15006	NC_011961	GC	4	8	719293	719300	0 %	0 %	50 %	50 %	221636135
15007	NC_011961	GCT	2	6	719386	719391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636135
15008	NC_011961	CGCT	2	8	719484	719491	0 %	25 %	25 %	50 %	221636135
15009	NC_011961	GAC	2	6	719603	719608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636135
15010	NC_011961	CCAG	2	8	719625	719632	25 %	0 %	25 %	50 %	221636135
15011	NC_011961	CAC	2	6	719651	719656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636135
15012	NC_011961	CGT	2	6	719750	719755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636135
15013	NC_011961	GGA	2	6	719791	719796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636135
15014	NC_011961	TGC	2	6	719833	719838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636135
15015	NC_011961	CGA	2	6	719845	719850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636135
15016	NC_011961	CGG	2	6	719865	719870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636135
15017	NC_011961	GCC	2	6	719898	719903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636135
15018	NC_011961	GCT	2	6	719905	719910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636135
15019	NC_011961	GAG	2	6	719930	719935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636135
15020	NC_011961	CGC	2	6	719936	719941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636135
15021	NC_011961	TCC	2	6	719942	719947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636135
15022	NC_011961	GCC	2	6	719952	719957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636135
15023	NC_011961	CGA	2	6	719965	719970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636135
15024	NC_011961	CTC	2	6	719980	719985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636135
15025	NC_011961	TCCC	2	8	719987	719994	0 %	25 %	0 %	75 %	221636135
15026	NC_011961	CAG	2	6	719995	720000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636135
15027	NC_011961	AGC	3	9	720015	720023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636135
15028	NC_011961	AGG	2	6	720039	720044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636135
15029	NC_011961	CGC	2	6	720075	720080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636135
15030	NC_011961	TGC	2	6	720098	720103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636135
15031	NC_011961	AGA	2	6	720148	720153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221636135
15032	NC_011961	CCG	2	6	720208	720213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636135
15033	NC_011961	GCT	2	6	720256	720261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636135
15034	NC_011961	GAT	2	6	720302	720307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636135
15035	NC_011961	CCGC	2	8	720309	720316	0 %	0 %	25 %	75 %	221636135
15036	NC_011961	GC	3	6	720331	720336	0 %	0 %	50 %	50 %	221636135
15037	NC_011961	GCA	2	6	720352	720357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636135
15038	NC_011961	GGCCA	2	10	720365	720374	20 %	0 %	40 %	40 %	221636135
15039	NC_011961	CAGC	2	8	720442	720449	25 %	0 %	25 %	50 %	221636135
15040	NC_011961	GTC	2	6	720471	720476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636135
15041	NC_011961	CGA	2	6	720535	720540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636135
15042	NC_011961	TCG	2	6	720541	720546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636135
15043	NC_011961	CGA	2	6	720559	720564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636135
15044	NC_011961	CGC	2	6	720593	720598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636135
15045	NC_011961	CGC	2	6	720604	720609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636135
15046	NC_011961	TCCG	2	8	720631	720638	0 %	25 %	25 %	50 %	221636135
15047	NC_011961	TCG	2	6	720708	720713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636135
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15050	NC_011961	CGT	2	6	720875	720880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636136
15051	NC_011961	CTC	2	6	720904	720909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636136
15052	NC_011961	TCGC	2	8	720946	720953	0 %	25 %	25 %	50 %	221636136
15053	NC_011961	ACG	2	6	720974	720979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636136
15054	NC_011961	GC	3	6	720997	721002	0 %	0 %	50 %	50 %	221636136
15055	NC_011961	CGG	2	6	721157	721162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636136
15056	NC_011961	CG	3	6	721168	721173	0 %	0 %	50 %	50 %	221636136
15057	NC_011961	CTC	2	6	721198	721203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636136
15058	NC_011961	CCAGCT	2	12	721224	721235	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	221636136
15059	NC_011961	TCC	2	6	721260	721265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636136
15060	NC_011961	GTC	2	6	721270	721275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636136
15061	NC_011961	CGA	2	6	721293	721298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636136
15062	NC_011961	CTACG	2	10	721314	721323	20 %	20 %	20 %	40 %	221636136
15063	NC_011961	CGC	2	6	721326	721331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636136
15064	NC_011961	GCT	2	6	721332	721337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636136
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15066	NC_011961	ACC	2	6	721344	721349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636136
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15070	NC_011961	TCT	2	6	721481	721486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221636136
15071	NC_011961	CTGG	2	8	721520	721527	0 %	25 %	50 %	25 %	221636136
15072	NC_011961	CG	3	6	721601	721606	0 %	0 %	50 %	50 %	221636136
15073	NC_011961	CGC	2	6	721622	721627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636136
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15092	NC_011961	CCGA	2	8	722611	722618	25 %	0 %	25 %	50 %	221636137
15093	NC_011961	ACG	2	6	722695	722700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636138
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15102	NC_011961	GGT	2	6	723173	723178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636139
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15104	NC_011961	AGCC	2	8	723203	723210	25 %	0 %	25 %	50 %	221636139
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15108	NC_011961	CCGA	2	8	723344	723351	25 %	0 %	25 %	50 %	221636139
15109	NC_011961	CGC	2	6	723355	723360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636139
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15111	NC_011961	CG	3	6	723733	723738	0 %	0 %	50 %	50 %	221636140
15112	NC_011961	CGC	2	6	723741	723746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636140
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15116	NC_011961	GCTC	2	8	723909	723916	0 %	25 %	25 %	50 %	221636140
15117	NC_011961	TGG	2	6	723925	723930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636140
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15119	NC_011961	CGG	2	6	723948	723953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636140
15120	NC_011961	CTC	2	6	723970	723975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636140
15121	NC_011961	TTC	2	6	723976	723981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221636140
15122	NC_011961	CGT	2	6	724372	724377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636141
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15237	NC_011961	CGCC	2	8	730088	730095	0 %	0 %	25 %	75 %	221636146
15238	NC_011961	GTA	2	6	730124	730129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636146
15239	NC_011961	GAT	2	6	730139	730144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636146
15240	NC_011961	CGA	2	6	730160	730165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636146
15241	NC_011961	CGG	2	6	730182	730187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636146
15242	NC_011961	CGATCA	2	12	730264	730275	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	221636146
15243	NC_011961	CCGCG	2	10	730484	730493	0 %	0 %	40 %	60 %	221636147
15244	NC_011961	ACCC	2	8	730501	730508	25 %	0 %	0 %	75 %	221636147
15245	NC_011961	AGC	2	6	730559	730564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636147
15246	NC_011961	TCGC	2	8	730591	730598	0 %	25 %	25 %	50 %	221636147
15247	NC_011961	GAG	2	6	730610	730615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636147
15248	NC_011961	ATCG	2	8	730692	730699	25 %	25 %	25 %	25 %	221636147
15249	NC_011961	CGAG	2	8	730729	730736	25 %	0 %	50 %	25 %	221636147
15250	NC_011961	CTC	2	6	730738	730743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636147
15251	NC_011961	CGG	2	6	730796	730801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636147
15252	NC_011961	CGCTCG	2	12	730867	730878	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	221636148
15253	NC_011961	CGT	2	6	730916	730921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636148
15254	NC_011961	CTC	2	6	730952	730957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636148
15255	NC_011961	GAG	2	6	731027	731032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636148
15256	NC_011961	CG	3	6	731059	731064	0 %	0 %	50 %	50 %	221636148
15257	NC_011961	CTG	2	6	731129	731134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636148
15258	NC_011961	CGA	2	6	731137	731142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636148
15259	NC_011961	CTC	2	6	731189	731194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636148
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15261	NC_011961	GCT	2	6	731239	731244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636148
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15263	NC_011961	GAC	2	6	731492	731497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636149
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15267	NC_011961	GCA	2	6	731625	731630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636149
15268	NC_011961	GAC	2	6	731642	731647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636149
15269	NC_011961	GCC	2	6	731667	731672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636149
15270	NC_011961	CGGA	2	8	731705	731712	25 %	0 %	50 %	25 %	221636149
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15273	NC_011961	GCG	2	6	731806	731811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636149
15274	NC_011961	CGC	2	6	731940	731945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636149
15275	NC_011961	GCTCG	2	10	731968	731977	0 %	20 %	40 %	40 %	221636149
15276	NC_011961	CG	3	6	732253	732258	0 %	0 %	50 %	50 %	221636150
15277	NC_011961	CGC	2	6	732283	732288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636150
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15282	NC_011961	ACC	2	6	732401	732406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636150
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15293	NC_011961	CAT	2	6	732766	732771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636150
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15309	NC_011961	GC	3	6	733719	733724	0 %	0 %	50 %	50 %	221636151
15310	NC_011961	CGG	2	6	733785	733790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636151
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15313	NC_011961	TGA	2	6	733874	733879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636151
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15322	NC_011961	TCG	2	6	734201	734206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636151
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15326	NC_011961	CGT	2	6	734367	734372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636151
15327	NC_011961	CGC	2	6	734376	734381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636151
15328	NC_011961	GTC	2	6	734386	734391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636151
15329	NC_011961	TC	3	6	734456	734461	0 %	50 %	0 %	50 %	221636151
15330	NC_011961	GC	4	8	734471	734478	0 %	0 %	50 %	50 %	221636151
15331	NC_011961	GAT	2	6	734505	734510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636151
15332	NC_011961	CTCG	2	8	734544	734551	0 %	25 %	25 %	50 %	221636151
15333	NC_011961	C	6	6	734590	734595	0 %	0 %	0 %	100 %	221636151
15334	NC_011961	CGT	2	6	734639	734644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636151
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15336	NC_011961	CACG	2	8	734766	734773	25 %	0 %	25 %	50 %	221636151
15337	NC_011961	GAG	2	6	734789	734794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636151
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15339	NC_011961	TC	3	6	734918	734923	0 %	50 %	0 %	50 %	221636151
15340	NC_011961	GCG	2	6	734924	734929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636151
15341	NC_011961	TCG	2	6	735037	735042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636152
15342	NC_011961	CGCT	2	8	735094	735101	0 %	25 %	25 %	50 %	221636152
15343	NC_011961	CTC	2	6	735128	735133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636152
15344	NC_011961	ATC	2	6	735161	735166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636153
15345	NC_011961	CGA	2	6	735284	735289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636153
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15347	NC_011961	TCGC	2	8	735402	735409	0 %	25 %	25 %	50 %	221636154
15348	NC_011961	TGG	2	6	735446	735451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636154
15349	NC_011961	CGGGA	2	10	735463	735472	20 %	0 %	60 %	20 %	221636154
15350	NC_011961	CAC	2	6	735542	735547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636154
15351	NC_011961	GTC	2	6	735549	735554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636154
15352	NC_011961	CGG	2	6	735593	735598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636154
15353	NC_011961	CGA	2	6	735689	735694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636154
15354	NC_011961	GAT	2	6	735764	735769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636154
15355	NC_011961	GCT	3	9	735816	735824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636154
15356	NC_011961	TAC	2	6	735915	735920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636154
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15358	NC_011961	TG	3	6	736018	736023	0 %	50 %	50 %	0 %	221636154
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15475	NC_011961	TCGA	2	8	741487	741494	25 %	25 %	25 %	25 %	221636160
15476	NC_011961	TCG	2	6	741517	741522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636160
15477	NC_011961	GACCA	2	10	741528	741537	40 %	0 %	20 %	40 %	221636160
15478	NC_011961	GCT	2	6	741539	741544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636160
15479	NC_011961	TCG	2	6	741556	741561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636160
15480	NC_011961	CGG	2	6	741566	741571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636160
15481	NC_011961	TCG	2	6	741583	741588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636160
15482	NC_011961	GGT	2	6	741603	741608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636160
15483	NC_011961	CTC	2	6	741612	741617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636160
15484	NC_011961	CGA	2	6	741635	741640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636160
15485	NC_011961	CAT	2	6	741713	741718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636160
15486	NC_011961	CGA	2	6	741746	741751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636160
15487	NC_011961	GC	3	6	741776	741781	0 %	0 %	50 %	50 %	221636160
15488	NC_011961	AGC	2	6	741818	741823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636160
15489	NC_011961	CACG	2	8	741932	741939	25 %	0 %	25 %	50 %	221636161
15490	NC_011961	CGT	2	6	741940	741945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636161
15491	NC_011961	CGGG	2	8	741961	741968	0 %	0 %	75 %	25 %	221636161
15492	NC_011961	CTGC	2	8	741984	741991	0 %	25 %	25 %	50 %	221636161
15493	NC_011961	TCGC	2	8	742010	742017	0 %	25 %	25 %	50 %	221636161
15494	NC_011961	CCTG	2	8	742026	742033	0 %	25 %	25 %	50 %	221636161
15495	NC_011961	CAG	2	6	742036	742041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636161
15496	NC_011961	CGC	2	6	742320	742325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636162
15497	NC_011961	GTC	2	6	742349	742354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636162
15498	NC_011961	TCCTGC	2	12	742615	742626	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	221636163
15499	NC_011961	TCAG	2	8	742657	742664	25 %	25 %	25 %	25 %	221636163
15500	NC_011961	GAG	2	6	742724	742729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636164

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