MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 19058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_011961	CTC	2	6	694216	694221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636110
14502	NC_011961	CAGC	2	8	694247	694254	25 %	0 %	25 %	50 %	221636110
14503	NC_011961	CGA	2	6	694382	694387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636110
14504	NC_011961	CGC	2	6	694446	694451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636110
14505	NC_011961	GGC	2	6	694459	694464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636110
14506	NC_011961	AGC	2	6	694523	694528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636110
14507	NC_011961	CGGGCT	2	12	694542	694553	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	221636110
14508	NC_011961	CTC	2	6	694609	694614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636110
14509	NC_011961	AAC	2	6	694645	694650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221636110
14510	NC_011961	ATCT	2	8	694702	694709	25 %	50 %	0 %	25 %	221636110
14511	NC_011961	ATG	2	6	694741	694746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636110
14512	NC_011961	GTC	2	6	694757	694762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636110
14513	NC_011961	ACG	2	6	694999	695004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636111
14514	NC_011961	CGA	2	6	695194	695199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636111
14515	NC_011961	TCC	2	6	695269	695274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636111
14516	NC_011961	CTT	2	6	695285	695290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221636111
14517	NC_011961	TC	3	6	695360	695365	0 %	50 %	0 %	50 %	221636111
14518	NC_011961	GAT	2	6	695429	695434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636111
14519	NC_011961	CCT	2	6	695503	695508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636111
14520	NC_011961	CCA	2	6	695544	695549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636111
14521	NC_011961	CGA	2	6	695588	695593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636111
14522	NC_011961	C	6	6	695608	695613	0 %	0 %	0 %	100 %	221636111
14523	NC_011961	TGG	2	6	695636	695641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636111
14524	NC_011961	ACA	2	6	695737	695742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221636111
14525	NC_011961	ATC	2	6	695752	695757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636111
14526	NC_011961	GTC	2	6	695760	695765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636111
14527	NC_011961	CG	3	6	695854	695859	0 %	0 %	50 %	50 %	221636111
14528	NC_011961	TCG	3	9	695893	695901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636111
14529	NC_011961	CGG	2	6	695951	695956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636111
14530	NC_011961	GGT	2	6	695961	695966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636111
14531	NC_011961	GC	3	6	696034	696039	0 %	0 %	50 %	50 %	221636111
14532	NC_011961	GTC	2	6	696102	696107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636111
14533	NC_011961	AGCC	2	8	696172	696179	25 %	0 %	25 %	50 %	221636112
14534	NC_011961	TCC	2	6	696185	696190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636112
14535	NC_011961	CG	3	6	696207	696212	0 %	0 %	50 %	50 %	221636112
14536	NC_011961	AGC	2	6	696228	696233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636112
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14540	NC_011961	ACC	2	6	696387	696392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636112
14541	NC_011961	TCAG	2	8	696422	696429	25 %	25 %	25 %	25 %	221636112
14542	NC_011961	TCG	2	6	696449	696454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636112
14543	NC_011961	GAG	2	6	696463	696468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636112
14544	NC_011961	GGC	2	6	696531	696536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636112
14545	NC_011961	GAG	2	6	696565	696570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636112
14546	NC_011961	CG	3	6	696571	696576	0 %	0 %	50 %	50 %	221636112
14547	NC_011961	CGC	2	6	696579	696584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636112
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14550	NC_011961	CG	3	6	696690	696695	0 %	0 %	50 %	50 %	221636112
14551	NC_011961	AGCC	2	8	696713	696720	25 %	0 %	25 %	50 %	221636112
14552	NC_011961	GCC	2	6	696727	696732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636112
14553	NC_011961	GCA	2	6	696733	696738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636112
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14555	NC_011961	GTC	2	6	696760	696765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636112
14556	NC_011961	TCG	2	6	696833	696838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636112
14557	NC_011961	CCG	2	6	696854	696859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636112
14558	NC_011961	CGA	2	6	696936	696941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636112
14559	NC_011961	CGA	2	6	696957	696962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636112
14560	NC_011961	GCG	2	6	696969	696974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636112
14561	NC_011961	CTC	2	6	697012	697017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636112
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14563	NC_011961	TCCG	2	8	697044	697051	0 %	25 %	25 %	50 %	221636112
14564	NC_011961	TCG	2	6	697076	697081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636112
14565	NC_011961	GC	3	6	697109	697114	0 %	0 %	50 %	50 %	221636112
14566	NC_011961	GC	3	6	697123	697128	0 %	0 %	50 %	50 %	221636112
14567	NC_011961	CGAC	2	8	697140	697147	25 %	0 %	25 %	50 %	221636112
14568	NC_011961	AGA	2	6	697160	697165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221636112
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14572	NC_011961	TGGCGG	2	12	697372	697383	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	221636113
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14589	NC_011961	TCG	2	6	698163	698168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636113
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14591	NC_011961	GAC	2	6	698244	698249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636113
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14598	NC_011961	CGC	2	6	698509	698514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636114
14599	NC_011961	TCC	2	6	698522	698527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636114
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14601	NC_011961	CCTCG	2	10	698595	698604	0 %	20 %	20 %	60 %	221636114
14602	NC_011961	CTC	2	6	698743	698748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636114
14603	NC_011961	GCG	2	6	698818	698823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636114
14604	NC_011961	TCG	2	6	698840	698845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636114
14605	NC_011961	CG	3	6	698844	698849	0 %	0 %	50 %	50 %	221636114
14606	NC_011961	CTG	2	6	698890	698895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636114
14607	NC_011961	CGCT	2	8	698908	698915	0 %	25 %	25 %	50 %	221636114
14608	NC_011961	CTCG	2	8	698938	698945	0 %	25 %	25 %	50 %	221636114
14609	NC_011961	CGC	2	6	698960	698965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636114
14610	NC_011961	CGCC	2	8	698989	698996	0 %	0 %	25 %	75 %	221636114
14611	NC_011961	GCG	2	6	699019	699024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636114
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14614	NC_011961	GC	3	6	699073	699078	0 %	0 %	50 %	50 %	221636114
14615	NC_011961	TGA	2	6	699183	699188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636114
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14617	NC_011961	GGGA	2	8	699230	699237	25 %	0 %	75 %	0 %	221636114
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14619	NC_011961	GATG	2	8	699305	699312	25 %	25 %	50 %	0 %	221636114
14620	NC_011961	GCA	2	6	699334	699339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636114
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14622	NC_011961	ATC	2	6	699421	699426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636114
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14977	NC_011961	ACG	2	6	717189	717194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636133
14978	NC_011961	AAC	2	6	717197	717202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221636133
14979	NC_011961	AGCCG	2	10	718086	718095	20 %	0 %	40 %	40 %	221636134
14980	NC_011961	GCC	3	9	718143	718151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636134
14981	NC_011961	TC	4	8	718157	718164	0 %	50 %	0 %	50 %	221636134
14982	NC_011961	CTCG	2	8	718205	718212	0 %	25 %	25 %	50 %	221636134
14983	NC_011961	GCA	2	6	718297	718302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636134
14984	NC_011961	CGCC	2	8	718388	718395	0 %	0 %	25 %	75 %	221636134
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14986	NC_011961	GAT	2	6	718518	718523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636134
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14988	NC_011961	ACC	2	6	718564	718569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636134
14989	NC_011961	CGG	2	6	718577	718582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636134
14990	NC_011961	CTC	2	6	718614	718619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636134
14991	NC_011961	CGG	2	6	718635	718640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636134
14992	NC_011961	CCGG	2	8	718647	718654	0 %	0 %	50 %	50 %	221636134
14993	NC_011961	GACC	2	8	718691	718698	25 %	0 %	25 %	50 %	221636134
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14996	NC_011961	GCG	2	6	719006	719011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636134
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15000	NC_011961	CG	3	6	719176	719181	0 %	0 %	50 %	50 %	221636135

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