MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 19058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_011961	ACC	2	6	47740	47745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635463
1003	NC_011961	GGA	2	6	47778	47783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635463
1004	NC_011961	GAC	2	6	47821	47826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635463
1005	NC_011961	CGG	2	6	47897	47902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635463
1006	NC_011961	TGG	2	6	47944	47949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635463
1007	NC_011961	AAG	2	6	47962	47967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635463
1008	NC_011961	ACG	2	6	47978	47983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635463
1009	NC_011961	GCCA	2	8	48018	48025	25 %	0 %	25 %	50 %	221635463
1010	NC_011961	GCC	2	6	48034	48039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635463
1011	NC_011961	ACG	2	6	48053	48058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635463
1012	NC_011961	GGCT	2	8	48094	48101	0 %	25 %	50 %	25 %	221635463
1013	NC_011961	GGAC	2	8	48123	48130	25 %	0 %	50 %	25 %	221635463
1014	NC_011961	ACGAGC	2	12	48218	48229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635463
1015	NC_011961	GAC	2	6	48276	48281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635463
1016	NC_011961	CAC	2	6	48298	48303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635463
1017	NC_011961	GCTG	2	8	48323	48330	0 %	25 %	50 %	25 %	221635463
1018	NC_011961	CTGG	2	8	48333	48340	0 %	25 %	50 %	25 %	221635463
1019	NC_011961	TGA	2	6	48602	48607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635463
1020	NC_011961	AGT	2	6	48650	48655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635463
1021	NC_011961	TTC	2	6	48743	48748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635464
1022	NC_011961	CGG	2	6	48826	48831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635464
1023	NC_011961	ACA	2	6	48861	48866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221635464
1024	NC_011961	GGC	2	6	48891	48896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635464
1025	NC_011961	GCTG	2	8	48942	48949	0 %	25 %	50 %	25 %	221635464
1026	NC_011961	ATG	2	6	48950	48955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635464
1027	NC_011961	TGCG	2	8	48974	48981	0 %	25 %	50 %	25 %	221635464
1028	NC_011961	CTGC	2	8	48984	48991	0 %	25 %	25 %	50 %	221635464
1029	NC_011961	CAT	2	6	49015	49020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635464
1030	NC_011961	GTC	2	6	49040	49045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635464
1031	NC_011961	CAG	2	6	49049	49054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635464
1032	NC_011961	GCAT	2	8	49076	49083	25 %	25 %	25 %	25 %	221635464
1033	NC_011961	GC	3	6	49188	49193	0 %	0 %	50 %	50 %	221635464
1034	NC_011961	CGA	2	6	49231	49236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635464
1035	NC_011961	AGC	2	6	49266	49271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635464
1036	NC_011961	GC	3	6	49295	49300	0 %	0 %	50 %	50 %	221635464
1037	NC_011961	ACG	2	6	49311	49316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635464
1038	NC_011961	CTAC	2	8	49345	49352	25 %	25 %	0 %	50 %	221635464
1039	NC_011961	CGA	2	6	49357	49362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635464
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1041	NC_011961	CCA	2	6	49404	49409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635464
1042	NC_011961	GGT	2	6	49447	49452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635464
1043	NC_011961	GGA	2	6	49495	49500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635464
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1045	NC_011961	GTC	2	6	49603	49608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635465
1046	NC_011961	TTC	2	6	49612	49617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635465
1047	NC_011961	CTC	2	6	49657	49662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635465
1048	NC_011961	TCG	2	6	49691	49696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635465
1049	NC_011961	CG	3	6	49695	49700	0 %	0 %	50 %	50 %	221635465
1050	NC_011961	TGC	2	6	49790	49795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635465
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1052	NC_011961	GTG	2	6	49830	49835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635465
1053	NC_011961	CGT	2	6	49883	49888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635465
1054	NC_011961	T	6	6	49944	49949	0 %	100 %	0 %	0 %	221635465
1055	NC_011961	CAT	2	6	49971	49976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635465
1056	NC_011961	CGT	2	6	49977	49982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635465
1057	NC_011961	TCC	2	6	50027	50032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635465
1058	NC_011961	G	6	6	50057	50062	0 %	0 %	100 %	0 %	221635465
1059	NC_011961	GC	3	6	50078	50083	0 %	0 %	50 %	50 %	221635465
1060	NC_011961	TCT	2	6	50084	50089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635465
1061	NC_011961	CGG	2	6	50108	50113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635465
1062	NC_011961	TGC	2	6	50120	50125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635465
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1074	NC_011961	TGC	2	6	50402	50407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635465
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1088	NC_011961	CCT	2	6	50778	50783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635467
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1099	NC_011961	GCC	2	6	51553	51558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635467
1100	NC_011961	CG	3	6	51622	51627	0 %	0 %	50 %	50 %	221635468
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1105	NC_011961	GCTGA	2	10	51918	51927	20 %	20 %	40 %	20 %	221635468
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1108	NC_011961	ACG	2	6	52141	52146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635469
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1110	NC_011961	GCA	2	6	52240	52245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635469
1111	NC_011961	GCG	2	6	52279	52284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635469
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1113	NC_011961	CAGCC	2	10	52391	52400	20 %	0 %	20 %	60 %	221635469
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1122	NC_011961	ACC	2	6	52656	52661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635469
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1125	NC_011961	GGT	2	6	52716	52721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635469
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1130	NC_011961	GCACTG	2	12	52840	52851	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	221635469
1131	NC_011961	GC	3	6	52862	52867	0 %	0 %	50 %	50 %	221635469
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1249	NC_011961	AG	3	6	60196	60201	50 %	0 %	50 %	0 %	221635476
1250	NC_011961	TCG	2	6	60228	60233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635476
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1375	NC_011961	CTG	2	6	65582	65587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635483
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1492	NC_011961	CTT	2	6	70247	70252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635488
1493	NC_011961	CAG	2	6	70326	70331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635488
1494	NC_011961	AG	3	6	70333	70338	50 %	0 %	50 %	0 %	221635488
1495	NC_011961	CGGGAT	2	12	70399	70410	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	221635488
1496	NC_011961	CG	3	6	70450	70455	0 %	0 %	50 %	50 %	221635488
1497	NC_011961	GATC	2	8	70489	70496	25 %	25 %	25 %	25 %	221635488
1498	NC_011961	TGA	2	6	70618	70623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635488
1499	NC_011961	CAC	2	6	70675	70680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635488
1500	NC_011961	CAG	2	6	70697	70702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635488

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