MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 19058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_011961	CGATC	2	10	647519	647528	20 %	20 %	20 %	40 %	221636063
13502	NC_011961	TCG	3	9	647545	647553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636063
13503	NC_011961	GTC	2	6	647601	647606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636063
13504	NC_011961	CAT	2	6	647642	647647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636063
13505	NC_011961	GCG	2	6	647714	647719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636063
13506	NC_011961	TCGC	2	8	647743	647750	0 %	25 %	25 %	50 %	221636063
13507	NC_011961	CTCG	2	8	647826	647833	0 %	25 %	25 %	50 %	221636063
13508	NC_011961	CTG	2	6	647850	647855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636063
13509	NC_011961	TCG	2	6	647911	647916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636063
13510	NC_011961	CGC	2	6	647983	647988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636063
13511	NC_011961	ACC	2	6	647989	647994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636063
13512	NC_011961	CTC	2	6	648039	648044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636063
13513	NC_011961	CGA	2	6	648091	648096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636064
13514	NC_011961	TCGC	2	8	648106	648113	0 %	25 %	25 %	50 %	221636064
13515	NC_011961	GCT	2	6	648164	648169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636064
13516	NC_011961	CCTG	3	12	648170	648181	0 %	25 %	25 %	50 %	221636064
13517	NC_011961	CCT	2	6	648228	648233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636064
13518	NC_011961	TC	3	6	648288	648293	0 %	50 %	0 %	50 %	221636064
13519	NC_011961	CCGGT	2	10	648343	648352	0 %	20 %	40 %	40 %	221636064
13520	NC_011961	CTC	2	6	648372	648377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636064
13521	NC_011961	GTG	2	6	648462	648467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636064
13522	NC_011961	CGC	2	6	648509	648514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636064
13523	NC_011961	TC	3	6	648559	648564	0 %	50 %	0 %	50 %	221636064
13524	NC_011961	GGGT	2	8	648570	648577	0 %	25 %	75 %	0 %	221636064
13525	NC_011961	TAC	2	6	648585	648590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636064
13526	NC_011961	GTC	2	6	648621	648626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636064
13527	NC_011961	GAT	2	6	648642	648647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636064
13528	NC_011961	G	6	6	648705	648710	0 %	0 %	100 %	0 %	221636064
13529	NC_011961	TCGCT	2	10	648787	648796	0 %	40 %	20 %	40 %	221636064
13530	NC_011961	GCTC	2	8	648829	648836	0 %	25 %	25 %	50 %	221636064
13531	NC_011961	ACGA	2	8	648909	648916	50 %	0 %	25 %	25 %	221636064
13532	NC_011961	CGC	2	6	648965	648970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636064
13533	NC_011961	TCG	3	9	649021	649029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636064
13534	NC_011961	CCG	2	6	649065	649070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636064
13535	NC_011961	ACT	2	6	649089	649094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636064
13536	NC_011961	CGTG	2	8	649118	649125	0 %	25 %	50 %	25 %	221636064
13537	NC_011961	CGGA	2	8	649207	649214	25 %	0 %	50 %	25 %	221636064
13538	NC_011961	CTG	2	6	649219	649224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636064
13539	NC_011961	TCGG	2	8	649255	649262	0 %	25 %	50 %	25 %	221636064
13540	NC_011961	CGT	2	6	649271	649276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636064
13541	NC_011961	CGGA	2	8	649285	649292	25 %	0 %	50 %	25 %	221636064
13542	NC_011961	CCT	2	6	649301	649306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636064
13543	NC_011961	GAC	2	6	649347	649352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636064
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13545	NC_011961	ATA	2	6	649718	649723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221636065
13546	NC_011961	CGT	2	6	649733	649738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636065
13547	NC_011961	CCA	2	6	649786	649791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636065
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13550	NC_011961	CAG	2	6	649980	649985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636065
13551	NC_011961	GCGCC	2	10	649987	649996	0 %	0 %	40 %	60 %	221636065
13552	NC_011961	GC	3	6	650027	650032	0 %	0 %	50 %	50 %	221636065
13553	NC_011961	GAC	2	6	650044	650049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636065
13554	NC_011961	ATC	2	6	650052	650057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636065
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13556	NC_011961	GAT	2	6	650090	650095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636065
13557	NC_011961	CGA	2	6	650122	650127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636065
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13559	NC_011961	TGT	2	6	650189	650194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221636065
13560	NC_011961	GCTC	2	8	650274	650281	0 %	25 %	25 %	50 %	221636065
13561	NC_011961	CAC	2	6	650296	650301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636065
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13564	NC_011961	CGAA	2	8	650371	650378	50 %	0 %	25 %	25 %	221636065
13565	NC_011961	GCC	2	6	650455	650460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636065
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13568	NC_011961	GCTC	2	8	650607	650614	0 %	25 %	25 %	50 %	221636066
13569	NC_011961	CGA	2	6	650625	650630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636066
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13574	NC_011961	TCG	3	9	650903	650911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636066
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13579	NC_011961	CTG	2	6	651047	651052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636067
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13587	NC_011961	TCG	2	6	651365	651370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636067
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13592	NC_011961	ACG	2	6	651527	651532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636067
13593	NC_011961	CCGGG	2	10	651551	651560	0 %	0 %	60 %	40 %	221636067
13594	NC_011961	CGGA	2	8	651635	651642	25 %	0 %	50 %	25 %	221636067
13595	NC_011961	GC	3	6	651655	651660	0 %	0 %	50 %	50 %	221636067
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13605	NC_011961	CGG	2	6	652201	652206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636067
13606	NC_011961	GCT	2	6	652207	652212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636067
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13609	NC_011961	GC	3	6	652293	652298	0 %	0 %	50 %	50 %	221636067
13610	NC_011961	CG	3	6	652325	652330	0 %	0 %	50 %	50 %	221636067
13611	NC_011961	CCGC	2	8	652415	652422	0 %	0 %	25 %	75 %	221636067
13612	NC_011961	TCC	2	6	652469	652474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636067
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13615	NC_011961	GAT	2	6	652627	652632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636067
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13619	NC_011961	CCG	2	6	652741	652746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636067
13620	NC_011961	TTGGA	2	10	652763	652772	20 %	40 %	40 %	0 %	221636067
13621	NC_011961	GATCG	2	10	652794	652803	20 %	20 %	40 %	20 %	221636067
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13625	NC_011961	ACG	2	6	652902	652907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636068
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13641	NC_011961	GAGC	2	8	653426	653433	25 %	0 %	50 %	25 %	221636069
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13652	NC_011961	TCG	2	6	654358	654363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636070
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13722	NC_011961	CAT	2	6	658266	658271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636072
13723	NC_011961	CGT	2	6	658300	658305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636072
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13725	NC_011961	CAGG	2	8	658402	658409	25 %	0 %	50 %	25 %	221636072
13726	NC_011961	GAT	2	6	658471	658476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636072
13727	NC_011961	CGAT	2	8	658528	658535	25 %	25 %	25 %	25 %	221636073
13728	NC_011961	CACC	2	8	658552	658559	25 %	0 %	0 %	75 %	221636073
13729	NC_011961	CAG	2	6	658603	658608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636073
13730	NC_011961	GAG	2	6	658624	658629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636073
13731	NC_011961	AGC	2	6	658730	658735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636073
13732	NC_011961	CTG	2	6	658781	658786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636073
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13734	NC_011961	GGCC	2	8	658833	658840	0 %	0 %	50 %	50 %	221636073
13735	NC_011961	GCC	2	6	658903	658908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636073
13736	NC_011961	CGT	2	6	659055	659060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636073
13737	NC_011961	CT	3	6	659076	659081	0 %	50 %	0 %	50 %	221636073
13738	NC_011961	ACG	2	6	659287	659292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636074
13739	NC_011961	GC	3	6	659323	659328	0 %	0 %	50 %	50 %	221636074
13740	NC_011961	ACG	2	6	659842	659847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636075
13741	NC_011961	GAC	2	6	659865	659870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636075
13742	NC_011961	CGA	2	6	659872	659877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636075
13743	NC_011961	CAT	2	6	659883	659888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636075
13744	NC_011961	AGGA	2	8	659963	659970	50 %	0 %	50 %	0 %	221636075
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13750	NC_011961	CGCTG	2	10	660178	660187	0 %	20 %	40 %	40 %	221636075
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13758	NC_011961	TCT	2	6	660575	660580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221636075
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13761	NC_011961	GTCC	2	8	660655	660662	0 %	25 %	25 %	50 %	221636075
13762	NC_011961	TCC	2	6	660668	660673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636075
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13853	NC_011961	GGAG	2	8	664815	664822	25 %	0 %	75 %	0 %	221636079
13854	NC_011961	CGG	2	6	664832	664837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636079
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13950	NC_011961	TCC	2	6	669545	669550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636084
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13977	NC_011961	TCA	2	6	670654	670659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636085
13978	NC_011961	CG	3	6	670727	670732	0 %	0 %	50 %	50 %	221636085
13979	NC_011961	CGC	2	6	670832	670837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636085
13980	NC_011961	CG	3	6	670939	670944	0 %	0 %	50 %	50 %	221636085
13981	NC_011961	ACG	2	6	670968	670973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636085
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13984	NC_011961	CGG	2	6	671061	671066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636086
13985	NC_011961	CCGGT	2	10	671080	671089	0 %	20 %	40 %	40 %	221636086
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13991	NC_011961	GCT	2	6	671299	671304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636086
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