MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 19058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_011961	GGC	2	6	625853	625858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636041
13002	NC_011961	TTC	2	6	625913	625918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221636041
13003	NC_011961	TGC	2	6	625987	625992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636041
13004	NC_011961	GGT	2	6	625997	626002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636041
13005	NC_011961	CAT	2	6	626014	626019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636041
13006	NC_011961	CTT	2	6	626041	626046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221636041
13007	NC_011961	CCGA	2	8	626125	626132	25 %	0 %	25 %	50 %	221636041
13008	NC_011961	TGGG	2	8	626154	626161	0 %	25 %	75 %	0 %	221636041
13009	NC_011961	GAG	2	6	626162	626167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636041
13010	NC_011961	CGG	2	6	626217	626222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636042
13011	NC_011961	TCG	2	6	626246	626251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636042
13012	NC_011961	GCG	2	6	626274	626279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636042
13013	NC_011961	GCA	2	6	626338	626343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636042
13014	NC_011961	CCTGGC	2	12	626427	626438	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	221636042
13015	NC_011961	GCT	2	6	626560	626565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636042
13016	NC_011961	CGT	2	6	626586	626591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636042
13017	NC_011961	TGC	2	6	626595	626600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636042
13018	NC_011961	TCC	2	6	626684	626689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636042
13019	NC_011961	GTC	2	6	626746	626751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636042
13020	NC_011961	CTT	2	6	626763	626768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221636042
13021	NC_011961	CCGG	2	8	626798	626805	0 %	0 %	50 %	50 %	221636042
13022	NC_011961	TCG	2	6	626822	626827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636042
13023	NC_011961	GC	3	6	626860	626865	0 %	0 %	50 %	50 %	221636042
13024	NC_011961	TGG	2	6	626867	626872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636042
13025	NC_011961	TCC	3	9	626876	626884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636042
13026	NC_011961	TCG	2	6	626936	626941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636042
13027	NC_011961	CTT	2	6	627018	627023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221636042
13028	NC_011961	CGATCG	2	12	627107	627118	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	221636042
13029	NC_011961	GGTC	2	8	627144	627151	0 %	25 %	50 %	25 %	221636042
13030	NC_011961	GGT	2	6	627256	627261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636042
13031	NC_011961	CG	3	6	627282	627287	0 %	0 %	50 %	50 %	221636042
13032	NC_011961	CGTCCT	2	12	627333	627344	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	221636042
13033	NC_011961	TC	3	6	627345	627350	0 %	50 %	0 %	50 %	221636042
13034	NC_011961	TCG	2	6	627434	627439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636042
13035	NC_011961	GCG	2	6	627515	627520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636042
13036	NC_011961	CTC	2	6	627568	627573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636042
13037	NC_011961	CGT	2	6	627585	627590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636042
13038	NC_011961	CGG	2	6	627606	627611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636042
13039	NC_011961	GTC	3	9	627631	627639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636042
13040	NC_011961	GCGCTC	2	12	627643	627654	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	221636042
13041	NC_011961	ATG	2	6	627727	627732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636042
13042	NC_011961	GAG	2	6	627784	627789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636042
13043	NC_011961	GAG	2	6	627845	627850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636042
13044	NC_011961	TCACC	2	10	627879	627888	20 %	20 %	0 %	60 %	221636043
13045	NC_011961	CGG	2	6	627897	627902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636043
13046	NC_011961	TCG	2	6	627905	627910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636043
13047	NC_011961	ACC	2	6	627985	627990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636043
13048	NC_011961	TCC	2	6	628013	628018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636043
13049	NC_011961	TGG	2	6	628079	628084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636043
13050	NC_011961	TCGC	2	8	628097	628104	0 %	25 %	25 %	50 %	221636043
13051	NC_011961	CGT	2	6	628200	628205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636043
13052	NC_011961	CGAG	2	8	628230	628237	25 %	0 %	50 %	25 %	221636043
13053	NC_011961	ACG	2	6	628329	628334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636043
13054	NC_011961	CG	3	6	628344	628349	0 %	0 %	50 %	50 %	221636043
13055	NC_011961	GCTCCT	2	12	628371	628382	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	221636043
13056	NC_011961	CGA	2	6	628383	628388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636043
13057	NC_011961	CCG	2	6	628394	628399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636043
13058	NC_011961	CGA	2	6	628419	628424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636043
13059	NC_011961	CCG	2	6	628440	628445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636043
13060	NC_011961	CGA	2	6	628452	628457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636043
13061	NC_011961	CATGA	2	10	628486	628495	40 %	20 %	20 %	20 %	221636043
13062	NC_011961	GTC	2	6	628498	628503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636043
13063	NC_011961	GCG	2	6	628575	628580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636043
13064	NC_011961	CG	3	6	628586	628591	0 %	0 %	50 %	50 %	221636043
13065	NC_011961	TGC	2	6	628617	628622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636043
13066	NC_011961	GTCCAT	2	12	628697	628708	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	221636044
13067	NC_011961	GC	3	6	628810	628815	0 %	0 %	50 %	50 %	221636044
13068	NC_011961	CCG	2	6	628839	628844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636044
13069	NC_011961	TCG	2	6	628896	628901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636044
13070	NC_011961	GCC	2	6	628929	628934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636044
13071	NC_011961	GGA	2	6	628957	628962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636044
13072	NC_011961	ACG	2	6	629056	629061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636044
13073	NC_011961	CCA	2	6	629062	629067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636044
13074	NC_011961	GGCG	2	8	629068	629075	0 %	0 %	75 %	25 %	221636044
13075	NC_011961	CG	3	6	629117	629122	0 %	0 %	50 %	50 %	221636044
13076	NC_011961	ATG	2	6	629126	629131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636044
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13078	NC_011961	TCG	2	6	629184	629189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636044
13079	NC_011961	GAC	2	6	629230	629235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636044
13080	NC_011961	TCG	2	6	629244	629249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636044
13081	NC_011961	CAG	2	6	629328	629333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636044
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13083	NC_011961	TCG	2	6	629409	629414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636045
13084	NC_011961	CG	3	6	629418	629423	0 %	0 %	50 %	50 %	221636045
13085	NC_011961	ACCG	2	8	629452	629459	25 %	0 %	25 %	50 %	221636045
13086	NC_011961	CG	3	6	629466	629471	0 %	0 %	50 %	50 %	221636045
13087	NC_011961	TGA	2	6	629526	629531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636045
13088	NC_011961	TCA	2	6	629602	629607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636045
13089	NC_011961	CAC	2	6	629629	629634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636045
13090	NC_011961	CAC	2	6	629654	629659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636045
13091	NC_011961	ACC	2	6	629678	629683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636045
13092	NC_011961	AGCGC	2	10	629692	629701	20 %	0 %	40 %	40 %	221636045
13093	NC_011961	CGC	2	6	629735	629740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636045
13094	NC_011961	AGC	2	6	629784	629789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636045
13095	NC_011961	TC	3	6	629842	629847	0 %	50 %	0 %	50 %	221636045
13096	NC_011961	GAG	2	6	629861	629866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636045
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13099	NC_011961	CAT	2	6	629906	629911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636045
13100	NC_011961	C	6	6	629942	629947	0 %	0 %	0 %	100 %	221636045
13101	NC_011961	TCGA	2	8	629993	630000	25 %	25 %	25 %	25 %	221636045
13102	NC_011961	CAT	3	9	630008	630016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636045
13103	NC_011961	CTCC	2	8	630073	630080	0 %	25 %	0 %	75 %	221636045
13104	NC_011961	CAG	2	6	630152	630157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636045
13105	NC_011961	CAG	2	6	630230	630235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636045
13106	NC_011961	AGCGC	2	10	630256	630265	20 %	0 %	40 %	40 %	221636045
13107	NC_011961	CGCC	2	8	630269	630276	0 %	0 %	25 %	75 %	221636045
13108	NC_011961	CGA	2	6	630292	630297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636045
13109	NC_011961	CATC	2	8	630316	630323	25 %	25 %	0 %	50 %	221636045
13110	NC_011961	GAG	2	6	630871	630876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636046
13111	NC_011961	GGTC	2	8	630965	630972	0 %	25 %	50 %	25 %	221636046
13112	NC_011961	CGA	2	6	630973	630978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636046
13113	NC_011961	TTCG	2	8	630979	630986	0 %	50 %	25 %	25 %	221636046
13114	NC_011961	CCG	2	6	631108	631113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636046
13115	NC_011961	CAGC	2	8	631141	631148	25 %	0 %	25 %	50 %	221636046
13116	NC_011961	ACG	2	6	631149	631154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636046
13117	NC_011961	TGC	2	6	631156	631161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636046
13118	NC_011961	GAT	2	6	631207	631212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636046
13119	NC_011961	CGCT	2	8	631230	631237	0 %	25 %	25 %	50 %	221636046
13120	NC_011961	ACG	2	6	631251	631256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636046
13121	NC_011961	GCTC	2	8	631309	631316	0 %	25 %	25 %	50 %	221636046
13122	NC_011961	CCGT	2	8	631335	631342	0 %	25 %	25 %	50 %	221636046
13123	NC_011961	CGT	2	6	631358	631363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636046
13124	NC_011961	TCG	2	6	631425	631430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636046
13125	NC_011961	ACG	2	6	631435	631440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636046
13126	NC_011961	CCAG	2	8	631443	631450	25 %	0 %	25 %	50 %	221636046
13127	NC_011961	CGC	3	9	631478	631486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636046
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13130	NC_011961	CG	3	6	631531	631536	0 %	0 %	50 %	50 %	221636047
13131	NC_011961	CGC	2	6	631548	631553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636047
13132	NC_011961	CAT	2	6	631559	631564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636047
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13134	NC_011961	CAT	2	6	631580	631585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636047
13135	NC_011961	TCG	2	6	631672	631677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636047
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13143	NC_011961	GCC	3	9	632099	632107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636047
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13148	NC_011961	GCT	2	6	632254	632259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636047
13149	NC_011961	GGC	2	6	632330	632335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636047
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13151	NC_011961	GCT	2	6	632420	632425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636047
13152	NC_011961	TTCC	2	8	632464	632471	0 %	50 %	0 %	50 %	221636047
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13220	NC_011961	GTC	2	6	634875	634880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636048
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13226	NC_011961	CCGGC	2	10	635126	635135	0 %	0 %	40 %	60 %	221636048
13227	NC_011961	CAC	2	6	635268	635273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636048
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13229	NC_011961	ACC	2	6	635362	635367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636048
13230	NC_011961	TCGG	2	8	635410	635417	0 %	25 %	50 %	25 %	221636048
13231	NC_011961	CGAC	2	8	635467	635474	25 %	0 %	25 %	50 %	221636048
13232	NC_011961	GGT	2	6	635484	635489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636048
13233	NC_011961	TGT	2	6	635504	635509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221636048
13234	NC_011961	TCCA	2	8	635521	635528	25 %	25 %	0 %	50 %	221636048
13235	NC_011961	ATCG	2	8	635566	635573	25 %	25 %	25 %	25 %	221636048
13236	NC_011961	CAT	2	6	635574	635579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636048
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13238	NC_011961	CG	3	6	635783	635788	0 %	0 %	50 %	50 %	221636049
13239	NC_011961	CAC	2	6	635789	635794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636049
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13358	NC_011961	CG	3	6	641205	641210	0 %	0 %	50 %	50 %	221636055
13359	NC_011961	CCA	2	6	641213	641218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636055
13360	NC_011961	AGC	2	6	641236	641241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636055
13361	NC_011961	GCT	2	6	641246	641251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636055
13362	NC_011961	CCG	2	6	641252	641257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636055
13363	NC_011961	GAC	2	6	641276	641281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636055
13364	NC_011961	GCT	3	9	641309	641317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636055
13365	NC_011961	TCGC	2	8	641354	641361	0 %	25 %	25 %	50 %	221636055
13366	NC_011961	TCC	2	6	641365	641370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636055
13367	NC_011961	GCC	3	9	641374	641382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636055
13368	NC_011961	CGC	3	9	641388	641396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636055
13369	NC_011961	CGCTTC	2	12	641400	641411	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	221636055
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13371	NC_011961	GAC	2	6	641460	641465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636055
13372	NC_011961	ACC	2	6	641503	641508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636055
13373	NC_011961	CCT	2	6	641529	641534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636056
13374	NC_011961	CCT	2	6	641562	641567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636056
13375	NC_011961	GCC	2	6	641571	641576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636056
13376	NC_011961	GCT	2	6	641595	641600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636056
13377	NC_011961	CCT	2	6	641604	641609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636056
13378	NC_011961	TCT	2	6	641694	641699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221636056
13379	NC_011961	TCG	2	6	641708	641713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636056
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13381	NC_011961	GCA	2	6	641760	641765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636056
13382	NC_011961	AGCG	2	8	641774	641781	25 %	0 %	50 %	25 %	221636056
13383	NC_011961	AGG	2	6	641789	641794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636056
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13387	NC_011961	GGA	2	6	641962	641967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636056
13388	NC_011961	CCG	3	9	641971	641979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636056
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13391	NC_011961	CG	3	6	642041	642046	0 %	0 %	50 %	50 %	221636056
13392	NC_011961	GCC	2	6	642089	642094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636056
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13396	NC_011961	CGAT	2	8	642227	642234	25 %	25 %	25 %	25 %	221636056
13397	NC_011961	CG	3	6	642281	642286	0 %	0 %	50 %	50 %	221636056
13398	NC_011961	ACCG	2	8	642298	642305	25 %	0 %	25 %	50 %	221636056
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13405	NC_011961	CTT	2	6	642608	642613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221636057
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13417	NC_011961	GCCG	2	8	642983	642990	0 %	0 %	50 %	50 %	221636057
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13422	NC_011961	TTCGC	2	10	643148	643157	0 %	40 %	20 %	40 %	221636057
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13426	NC_011961	CTG	2	6	643265	643270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636057
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13430	NC_011961	CCA	2	6	643461	643466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636057
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13434	NC_011961	CGTC	2	8	643588	643595	0 %	25 %	25 %	50 %	221636057
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13437	NC_011961	GCTG	2	8	643714	643721	0 %	25 %	50 %	25 %	221636057
13438	NC_011961	GCT	2	6	643768	643773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636057
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13440	NC_011961	TCG	2	6	643897	643902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636057
13441	NC_011961	CGT	2	6	643906	643911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636057
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13450	NC_011961	GCAGC	2	10	644232	644241	20 %	0 %	40 %	40 %	221636058
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13458	NC_011961	GGGCT	2	10	644795	644804	0 %	20 %	60 %	20 %	221636059
13459	NC_011961	GCG	2	6	644850	644855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636059
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13462	NC_011961	GATG	2	8	645365	645372	25 %	25 %	50 %	0 %	221636060
13463	NC_011961	TCC	2	6	645410	645415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636060
13464	NC_011961	GGA	2	6	645421	645426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636060
13465	NC_011961	TGC	2	6	645447	645452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636060
13466	NC_011961	TCC	2	6	645526	645531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636060
13467	NC_011961	CGC	2	6	645553	645558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636060
13468	NC_011961	CGC	2	6	645667	645672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636061
13469	NC_011961	AGC	2	6	645755	645760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636061
13470	NC_011961	ACC	2	6	645809	645814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636061
13471	NC_011961	GCAC	2	8	645866	645873	25 %	0 %	25 %	50 %	221636061
13472	NC_011961	CTG	2	6	645879	645884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636061
13473	NC_011961	GCC	2	6	645895	645900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636061
13474	NC_011961	CCAC	2	8	645967	645974	25 %	0 %	0 %	75 %	221636061
13475	NC_011961	ATC	2	6	646015	646020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636061
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13477	NC_011961	GC	3	6	646030	646035	0 %	0 %	50 %	50 %	221636061
13478	NC_011961	GCC	2	6	646089	646094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636061
13479	NC_011961	AGG	2	6	646112	646117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636061
13480	NC_011961	ACGA	2	8	646241	646248	50 %	0 %	25 %	25 %	221636062
13481	NC_011961	TCG	2	6	646276	646281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636062
13482	NC_011961	CGATGA	2	12	646298	646309	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	221636062
13483	NC_011961	GCG	2	6	646357	646362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636062
13484	NC_011961	CGC	2	6	646878	646883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636063
13485	NC_011961	TCG	2	6	646936	646941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636063
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13491	NC_011961	CGA	2	6	647150	647155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636063
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