MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 19058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_011961	GGC	2	6	601565	601570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636016
12502	NC_011961	CTC	2	6	601580	601585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636016
12503	NC_011961	ACCTAC	2	12	601607	601618	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	221636016
12504	NC_011961	CGG	2	6	601657	601662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636016
12505	NC_011961	GTC	2	6	601697	601702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636016
12506	NC_011961	ACTGG	2	10	601737	601746	20 %	20 %	40 %	20 %	221636016
12507	NC_011961	CCG	2	6	601780	601785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636016
12508	NC_011961	GGT	2	6	601823	601828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636016
12509	NC_011961	ATT	2	6	601845	601850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221636016
12510	NC_011961	CTCTC	2	10	601895	601904	0 %	40 %	0 %	60 %	221636016
12511	NC_011961	CG	3	6	601923	601928	0 %	0 %	50 %	50 %	221636016
12512	NC_011961	GCG	2	6	601953	601958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636016
12513	NC_011961	CGA	2	6	601984	601989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636016
12514	NC_011961	GC	3	6	602066	602071	0 %	0 %	50 %	50 %	221636016
12515	NC_011961	CGA	2	6	602074	602079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636016
12516	NC_011961	AGC	2	6	602104	602109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636016
12517	NC_011961	CTTTCA	2	12	602146	602157	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	221636016
12518	NC_011961	CCG	2	6	602193	602198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636016
12519	NC_011961	CGC	2	6	602208	602213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636016
12520	NC_011961	CTC	2	6	602246	602251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636016
12521	NC_011961	CGAGT	2	10	602261	602270	20 %	20 %	40 %	20 %	221636016
12522	NC_011961	TCT	2	6	602343	602348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221636016
12523	NC_011961	TCG	2	6	602440	602445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636017
12524	NC_011961	CGAA	2	8	602478	602485	50 %	0 %	25 %	25 %	221636017
12525	NC_011961	CGA	2	6	602509	602514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636017
12526	NC_011961	GCT	2	6	602515	602520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636017
12527	NC_011961	GCT	2	6	602560	602565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636017
12528	NC_011961	TCGC	2	8	602594	602601	0 %	25 %	25 %	50 %	221636017
12529	NC_011961	GCT	2	6	602638	602643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636017
12530	NC_011961	CTT	2	6	602653	602658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221636017
12531	NC_011961	GCA	2	6	602668	602673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636017
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12533	NC_011961	CA	3	6	602730	602735	50 %	0 %	0 %	50 %	221636017
12534	NC_011961	GCC	2	6	602769	602774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636017
12535	NC_011961	GGC	2	6	602830	602835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636017
12536	NC_011961	AGCG	2	8	602857	602864	25 %	0 %	50 %	25 %	221636017
12537	NC_011961	CGG	2	6	602967	602972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636017
12538	NC_011961	CAG	2	6	603032	603037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636017
12539	NC_011961	CAGC	2	8	603050	603057	25 %	0 %	25 %	50 %	221636017
12540	NC_011961	GAT	2	6	603106	603111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636018
12541	NC_011961	GAA	2	6	603148	603153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221636018
12542	NC_011961	GGT	2	6	603159	603164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636018
12543	NC_011961	CAT	2	6	603169	603174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636018
12544	NC_011961	CTCG	2	8	603175	603182	0 %	25 %	25 %	50 %	221636018
12545	NC_011961	GC	4	8	603185	603192	0 %	0 %	50 %	50 %	221636018
12546	NC_011961	C	6	6	603251	603256	0 %	0 %	0 %	100 %	221636018
12547	NC_011961	CGCTCG	2	12	603267	603278	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	221636018
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12549	NC_011961	CCTG	2	8	603346	603353	0 %	25 %	25 %	50 %	221636018
12550	NC_011961	CCG	2	6	603365	603370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636018
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12552	NC_011961	CAG	4	12	603409	603420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636018
12553	NC_011961	CAG	2	6	603427	603432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636018
12554	NC_011961	CTC	2	6	603484	603489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636018
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12556	NC_011961	CCCG	2	8	603608	603615	0 %	0 %	25 %	75 %	221636018
12557	NC_011961	CGAT	2	8	603683	603690	25 %	25 %	25 %	25 %	221636018
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12562	NC_011961	TCG	2	6	603996	604001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636019
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12564	NC_011961	CGA	2	6	604060	604065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636019
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12572	NC_011961	TCC	2	6	604422	604427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636019
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12576	NC_011961	TCCG	2	8	604575	604582	0 %	25 %	25 %	50 %	221636019
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12585	NC_011961	CTGG	2	8	605222	605229	0 %	25 %	50 %	25 %	221636021
12586	NC_011961	CTC	3	9	605257	605265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636021
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12589	NC_011961	CAG	2	6	605423	605428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636021
12590	NC_011961	CAG	2	6	605431	605436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636021
12591	NC_011961	GCGG	2	8	605544	605551	0 %	0 %	75 %	25 %	221636021
12592	NC_011961	CT	3	6	605576	605581	0 %	50 %	0 %	50 %	221636021
12593	NC_011961	AACG	2	8	605598	605605	50 %	0 %	25 %	25 %	221636021
12594	NC_011961	ACCG	2	8	605634	605641	25 %	0 %	25 %	50 %	221636021
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12599	NC_011961	CGAC	2	8	605905	605912	25 %	0 %	25 %	50 %	221636021
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12601	NC_011961	CCA	2	6	605977	605982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636021
12602	NC_011961	CT	3	6	606025	606030	0 %	50 %	0 %	50 %	221636021
12603	NC_011961	GTC	2	6	606088	606093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636021
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12610	NC_011961	TCCC	2	8	606398	606405	0 %	25 %	0 %	75 %	221636021
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12619	NC_011961	TGC	3	9	607008	607016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636022
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12621	NC_011961	GC	3	6	607092	607097	0 %	0 %	50 %	50 %	221636022
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12721	NC_011961	CT	3	6	612126	612131	0 %	50 %	0 %	50 %	221636028
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12732	NC_011961	ACCGA	2	10	612704	612713	40 %	0 %	20 %	40 %	221636028
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12736	NC_011961	GC	3	6	612973	612978	0 %	0 %	50 %	50 %	221636028
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12738	NC_011961	CGA	2	6	613076	613081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636029
12739	NC_011961	CGTGCT	2	12	613082	613093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636029
12740	NC_011961	CGAG	2	8	613122	613129	25 %	0 %	50 %	25 %	221636029
12741	NC_011961	GC	3	6	613149	613154	0 %	0 %	50 %	50 %	221636029
12742	NC_011961	CCT	2	6	613157	613162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636029
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12843	NC_011961	TCGGG	2	10	618587	618596	0 %	20 %	60 %	20 %	221636034
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12849	NC_011961	GAA	2	6	619134	619139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221636034
12850	NC_011961	CCA	2	6	619187	619192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636034
12851	NC_011961	TCG	2	6	619250	619255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636034
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12853	NC_011961	CTC	3	9	619320	619328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636034
12854	NC_011961	GCT	2	6	619358	619363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636034
12855	NC_011961	CGG	2	6	619418	619423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636034
12856	NC_011961	GCT	2	6	619426	619431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636034
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12858	NC_011961	TCG	2	6	619477	619482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636034
12859	NC_011961	ACC	2	6	619520	619525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636034
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12977	NC_011961	GAC	2	6	624453	624458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636040
12978	NC_011961	CTA	2	6	624512	624517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636040
12979	NC_011961	CGGC	2	8	624532	624539	0 %	0 %	50 %	50 %	221636040
12980	NC_011961	TCA	2	6	624544	624549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636040
12981	NC_011961	TGA	2	6	624592	624597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636040
12982	NC_011961	CCTGA	2	10	624672	624681	20 %	20 %	20 %	40 %	221636040
12983	NC_011961	CAG	2	6	624723	624728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636040
12984	NC_011961	ACG	2	6	624772	624777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636040
12985	NC_011961	GAT	3	9	624782	624790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636040
12986	NC_011961	AAG	2	6	624804	624809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221636040
12987	NC_011961	GGACG	2	10	624827	624836	20 %	0 %	60 %	20 %	221636040
12988	NC_011961	ACCTG	2	10	624907	624916	20 %	20 %	20 %	40 %	221636040
12989	NC_011961	TCG	2	6	625206	625211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636041
12990	NC_011961	GAC	2	6	625390	625395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636041
12991	NC_011961	CTT	2	6	625396	625401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221636041
12992	NC_011961	CTTC	2	8	625581	625588	0 %	50 %	0 %	50 %	221636041
12993	NC_011961	TCC	2	6	625590	625595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636041
12994	NC_011961	TTCGG	2	10	625616	625625	0 %	40 %	40 %	20 %	221636041
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12998	NC_011961	CG	3	6	625772	625777	0 %	0 %	50 %	50 %	221636041
12999	NC_011961	AGC	2	6	625795	625800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636041
13000	NC_011961	GTCGAT	2	12	625814	625825	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	221636041

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