MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 19058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12003	NC_011961	TCG	2	6	578960	578965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635993
12004	NC_011961	CAG	2	6	578968	578973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635993
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12119	NC_011961	CCGAT	2	10	584090	584099	20 %	20 %	20 %	40 %	221635999
12120	NC_011961	CGA	2	6	584250	584255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635999
12121	NC_011961	TCCT	2	8	584275	584282	0 %	50 %	0 %	50 %	221635999
12122	NC_011961	GC	3	6	584313	584318	0 %	0 %	50 %	50 %	221635999
12123	NC_011961	TGA	2	6	584331	584336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635999
12124	NC_011961	CAG	2	6	584394	584399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635999
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12126	NC_011961	GCTG	2	8	584430	584437	0 %	25 %	50 %	25 %	221635999
12127	NC_011961	TCA	2	6	584460	584465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635999
12128	NC_011961	CGAC	2	8	584505	584512	25 %	0 %	25 %	50 %	221635999
12129	NC_011961	CGAGAT	2	12	584527	584538	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	221635999
12130	NC_011961	CTT	2	6	584548	584553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635999
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12148	NC_011961	CTC	2	6	585202	585207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636000
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12216	NC_011961	TCGC	2	8	588390	588397	0 %	25 %	25 %	50 %	221636004
12217	NC_011961	GTGG	2	8	588403	588410	0 %	25 %	75 %	0 %	221636004
12218	NC_011961	TCG	2	6	588459	588464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636004
12219	NC_011961	GA	3	6	588468	588473	50 %	0 %	50 %	0 %	221636004
12220	NC_011961	CG	3	6	588500	588505	0 %	0 %	50 %	50 %	221636004
12221	NC_011961	TCT	2	6	588538	588543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221636004
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12223	NC_011961	GCC	2	6	588578	588583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636004
12224	NC_011961	CCA	2	6	588636	588641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636004
12225	NC_011961	AC	3	6	588656	588661	50 %	0 %	0 %	50 %	221636004
12226	NC_011961	ACCCT	2	10	588678	588687	20 %	20 %	0 %	60 %	221636004
12227	NC_011961	CGCC	2	8	588712	588719	0 %	0 %	25 %	75 %	221636004
12228	NC_011961	CTC	2	6	588763	588768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636004
12229	NC_011961	ACC	2	6	588770	588775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636004
12230	NC_011961	CG	3	6	588776	588781	0 %	0 %	50 %	50 %	221636004
12231	NC_011961	AC	3	6	588805	588810	50 %	0 %	0 %	50 %	221636004
12232	NC_011961	CAG	2	6	588879	588884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636004
12233	NC_011961	CG	4	8	588886	588893	0 %	0 %	50 %	50 %	221636004
12234	NC_011961	CGA	2	6	588951	588956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636004
12235	NC_011961	TGC	2	6	588970	588975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636004
12236	NC_011961	GCT	2	6	588997	589002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636004
12237	NC_011961	CGTGGC	2	12	589018	589029	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	221636004
12238	NC_011961	CACG	2	8	589030	589037	25 %	0 %	25 %	50 %	221636004
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12357	NC_011961	CTC	2	6	594633	594638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636009
12358	NC_011961	AGC	2	6	594703	594708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636009
12359	NC_011961	TCGG	2	8	594861	594868	0 %	25 %	50 %	25 %	221636009
12360	NC_011961	CTGC	2	8	594874	594881	0 %	25 %	25 %	50 %	221636009
12361	NC_011961	TCG	2	6	594975	594980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636010
12362	NC_011961	TCG	2	6	595014	595019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636010
12363	NC_011961	TCGG	2	8	595107	595114	0 %	25 %	50 %	25 %	221636010
12364	NC_011961	GCT	2	6	595127	595132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636010
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12372	NC_011961	CCAC	2	8	595509	595516	25 %	0 %	0 %	75 %	221636010
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12377	NC_011961	GCT	2	6	595979	595984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636011
12378	NC_011961	GCG	2	6	595992	595997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636011
12379	NC_011961	CTC	2	6	596047	596052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636011
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12381	NC_011961	TCGT	2	8	596188	596195	0 %	50 %	25 %	25 %	221636011
12382	NC_011961	CTG	2	6	596211	596216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636011
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12384	NC_011961	CATG	2	8	596258	596265	25 %	25 %	25 %	25 %	221636011
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12388	NC_011961	GATC	2	8	596420	596427	25 %	25 %	25 %	25 %	221636011
12389	NC_011961	GAC	2	6	596466	596471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636011
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12391	NC_011961	CCT	2	6	596507	596512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636011
12392	NC_011961	GCC	2	6	596575	596580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636011
12393	NC_011961	TCC	2	6	596614	596619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636011
12394	NC_011961	TGG	2	6	596620	596625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221636011
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12402	NC_011961	CTG	2	6	596949	596954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636012
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12408	NC_011961	CCAG	2	8	597230	597237	25 %	0 %	25 %	50 %	221636012
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12447	NC_011961	GCCA	2	8	599076	599083	25 %	0 %	25 %	50 %	221636013
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12459	NC_011961	CCGCG	2	10	599866	599875	0 %	0 %	40 %	60 %	221636014
12460	NC_011961	TCG	2	6	599926	599931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636014
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12464	NC_011961	GTC	2	6	600009	600014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636014
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12467	NC_011961	CGC	2	6	600247	600252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221636014
12468	NC_011961	GTC	2	6	600273	600278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636014
12469	NC_011961	CCA	3	9	600281	600289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636014
12470	NC_011961	ACG	2	6	600448	600453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636015
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12472	NC_011961	ATC	2	6	600498	600503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221636015
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12474	NC_011961	GGA	2	6	600537	600542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636015
12475	NC_011961	GCT	2	6	600546	600551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636015
12476	NC_011961	CTCCC	2	10	600562	600571	0 %	20 %	0 %	80 %	221636015
12477	NC_011961	CACC	2	8	600592	600599	25 %	0 %	0 %	75 %	221636015
12478	NC_011961	CCCGAC	2	12	600662	600673	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	221636015
12479	NC_011961	GC	3	6	600674	600679	0 %	0 %	50 %	50 %	221636015
12480	NC_011961	ATG	2	6	600681	600686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221636015
12481	NC_011961	GC	3	6	600756	600761	0 %	0 %	50 %	50 %	221636015
12482	NC_011961	CTG	2	6	600780	600785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636015
12483	NC_011961	ACG	2	6	600802	600807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636015
12484	NC_011961	GGTA	2	8	600809	600816	25 %	25 %	50 %	0 %	221636015
12485	NC_011961	GC	3	6	600871	600876	0 %	0 %	50 %	50 %	221636015
12486	NC_011961	CG	3	6	600880	600885	0 %	0 %	50 %	50 %	221636015
12487	NC_011961	ACG	2	6	600900	600905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636015
12488	NC_011961	CGA	2	6	600914	600919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221636015
12489	NC_011961	CGT	2	6	600924	600929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636015
12490	NC_011961	CGT	2	6	601088	601093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636015
12491	NC_011961	ACC	2	6	601143	601148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636015
12492	NC_011961	GGA	2	6	601208	601213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221636015
12493	NC_011961	GGC	2	6	601260	601265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221636016
12494	NC_011961	CTG	2	6	601286	601291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221636016
12495	NC_011961	TC	3	6	601294	601299	0 %	50 %	0 %	50 %	221636016
12496	NC_011961	CCT	2	6	601371	601376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636016
12497	NC_011961	CT	3	6	601375	601380	0 %	50 %	0 %	50 %	221636016
12498	NC_011961	CAC	2	6	601399	601404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221636016
12499	NC_011961	ACCG	2	8	601450	601457	25 %	0 %	25 %	50 %	221636016
12500	NC_011961	CTC	2	6	601493	601498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221636016

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