MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 19058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_011961	CCAG	2	8	525400	525407	25 %	0 %	25 %	50 %	221635938
11002	NC_011961	CTC	2	6	525494	525499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635939
11003	NC_011961	CCCGC	2	10	525500	525509	0 %	0 %	20 %	80 %	221635939
11004	NC_011961	CCA	2	6	525517	525522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635939
11005	NC_011961	CAG	3	9	525556	525564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635939
11006	NC_011961	CGG	2	6	525600	525605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635939
11007	NC_011961	GTC	2	6	525683	525688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635939
11008	NC_011961	CG	3	6	525754	525759	0 %	0 %	50 %	50 %	221635939
11009	NC_011961	GCT	2	6	525785	525790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635939
11010	NC_011961	TGT	2	6	525809	525814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221635939
11011	NC_011961	GC	3	6	525824	525829	0 %	0 %	50 %	50 %	221635939
11012	NC_011961	CGA	2	6	525870	525875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635939
11013	NC_011961	CCAACG	2	12	525930	525941	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	221635939
11014	NC_011961	AG	3	6	525975	525980	50 %	0 %	50 %	0 %	221635939
11015	NC_011961	CAC	2	6	526018	526023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635939
11016	NC_011961	CG	4	8	526136	526143	0 %	0 %	50 %	50 %	221635939
11017	NC_011961	TGG	2	6	526252	526257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635939
11018	NC_011961	AGC	2	6	526285	526290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635939
11019	NC_011961	GAC	2	6	526336	526341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635939
11020	NC_011961	GCC	2	6	526358	526363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635939
11021	NC_011961	GA	3	6	526382	526387	50 %	0 %	50 %	0 %	221635939
11022	NC_011961	ATCGCG	2	12	526433	526444	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	221635939
11023	NC_011961	CGT	2	6	526468	526473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635939
11024	NC_011961	AGC	2	6	526475	526480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635939
11025	NC_011961	AACGG	2	10	526508	526517	40 %	0 %	40 %	20 %	221635939
11026	NC_011961	GC	3	6	526558	526563	0 %	0 %	50 %	50 %	221635939
11027	NC_011961	CGC	2	6	526597	526602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635939
11028	NC_011961	GC	3	6	526601	526606	0 %	0 %	50 %	50 %	221635939
11029	NC_011961	GAA	2	6	526660	526665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635939
11030	NC_011961	GAGT	2	8	526686	526693	25 %	25 %	50 %	0 %	221635939
11031	NC_011961	AGC	2	6	526709	526714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635939
11032	NC_011961	AGCG	2	8	526717	526724	25 %	0 %	50 %	25 %	221635939
11033	NC_011961	GCCA	2	8	526805	526812	25 %	0 %	25 %	50 %	221635939
11034	NC_011961	CCG	2	6	526813	526818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635939
11035	NC_011961	CGC	2	6	526879	526884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635939
11036	NC_011961	GAGG	2	8	526942	526949	25 %	0 %	75 %	0 %	221635939
11037	NC_011961	CCTC	2	8	526964	526971	0 %	25 %	0 %	75 %	221635939
11038	NC_011961	GC	3	6	526976	526981	0 %	0 %	50 %	50 %	221635939
11039	NC_011961	CGACG	2	10	527014	527023	20 %	0 %	40 %	40 %	221635939
11040	NC_011961	CAC	2	6	527053	527058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635939
11041	NC_011961	CCT	2	6	527129	527134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635940
11042	NC_011961	GA	3	6	527173	527178	50 %	0 %	50 %	0 %	221635940
11043	NC_011961	CGG	2	6	527187	527192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635940
11044	NC_011961	GCG	2	6	527207	527212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635940
11045	NC_011961	GAG	2	6	527241	527246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635940
11046	NC_011961	AAT	2	6	527300	527305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221635940
11047	NC_011961	TC	3	6	527483	527488	0 %	50 %	0 %	50 %	221635940
11048	NC_011961	TCG	2	6	527495	527500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635940
11049	NC_011961	TTG	2	6	527518	527523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221635940
11050	NC_011961	GC	3	6	527568	527573	0 %	0 %	50 %	50 %	221635940
11051	NC_011961	TCC	2	6	527578	527583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635940
11052	NC_011961	TCG	2	6	527630	527635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635940
11053	NC_011961	CGA	2	6	527681	527686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635940
11054	NC_011961	GCG	2	6	527822	527827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635940
11055	NC_011961	CCTT	2	8	527836	527843	0 %	50 %	0 %	50 %	221635940
11056	NC_011961	GAA	2	6	527877	527882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635940
11057	NC_011961	CTG	2	6	527888	527893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635940
11058	NC_011961	TCC	2	6	527908	527913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635940
11059	NC_011961	CGG	2	6	527933	527938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635940
11060	NC_011961	AATA	2	8	528026	528033	75 %	25 %	0 %	0 %	221635940
11061	NC_011961	TCA	2	6	528059	528064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635940
11062	NC_011961	CGGT	2	8	528065	528072	0 %	25 %	50 %	25 %	221635940
11063	NC_011961	GCCG	2	8	528078	528085	0 %	0 %	50 %	50 %	221635940
11064	NC_011961	GCA	2	6	528094	528099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635940
11065	NC_011961	TGCC	2	8	528131	528138	0 %	25 %	25 %	50 %	221635940
11066	NC_011961	GCT	2	6	528142	528147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635940
11067	NC_011961	GGC	2	6	528195	528200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635940
11068	NC_011961	TCCA	2	8	528209	528216	25 %	25 %	0 %	50 %	221635940
11069	NC_011961	GCG	2	6	528217	528222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635940
11070	NC_011961	CCG	2	6	528232	528237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635940
11071	NC_011961	CCT	2	6	528422	528427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635941
11072	NC_011961	GTC	2	6	528432	528437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635941
11073	NC_011961	TGGA	2	8	528473	528480	25 %	25 %	50 %	0 %	221635941
11074	NC_011961	GCG	2	6	528559	528564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635941
11075	NC_011961	ACC	2	6	528568	528573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635941
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11077	NC_011961	TCG	3	9	528901	528909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635942
11078	NC_011961	CTG	2	6	528997	529002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635942
11079	NC_011961	CTGC	2	8	529031	529038	0 %	25 %	25 %	50 %	221635942
11080	NC_011961	GCT	2	6	529073	529078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635942
11081	NC_011961	CCGA	2	8	529095	529102	25 %	0 %	25 %	50 %	221635942
11082	NC_011961	GCG	2	6	529232	529237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635942
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11085	NC_011961	GGA	2	6	529301	529306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635942
11086	NC_011961	CGA	3	9	529351	529359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635942
11087	NC_011961	CGAG	2	8	529401	529408	25 %	0 %	50 %	25 %	221635942
11088	NC_011961	GAG	2	6	529428	529433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635942
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11091	NC_011961	CT	3	6	529587	529592	0 %	50 %	0 %	50 %	221635942
11092	NC_011961	CGA	2	6	529772	529777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635943
11093	NC_011961	ATCG	2	8	529778	529785	25 %	25 %	25 %	25 %	221635943
11094	NC_011961	AGG	2	6	529816	529821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635943
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11099	NC_011961	GAA	2	6	530037	530042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635943
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11102	NC_011961	CG	3	6	530148	530153	0 %	0 %	50 %	50 %	221635943
11103	NC_011961	GGCT	2	8	530155	530162	0 %	25 %	50 %	25 %	221635943
11104	NC_011961	CGA	2	6	530198	530203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635943
11105	NC_011961	GAA	2	6	530331	530336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635943
11106	NC_011961	CGA	2	6	530345	530350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635943
11107	NC_011961	CG	3	6	530364	530369	0 %	0 %	50 %	50 %	221635943
11108	NC_011961	CGT	2	6	530372	530377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635943
11109	NC_011961	GTG	2	6	530432	530437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635943
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11116	NC_011961	ATCCG	2	10	530868	530877	20 %	20 %	20 %	40 %	221635944
11117	NC_011961	CCG	2	6	530895	530900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635944
11118	NC_011961	ACG	2	6	530907	530912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635944
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11120	NC_011961	TCA	2	6	531090	531095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635944
11121	NC_011961	CTG	2	6	531130	531135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635944
11122	NC_011961	GAA	2	6	531151	531156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635944
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11124	NC_011961	CG	3	6	531316	531321	0 %	0 %	50 %	50 %	221635944
11125	NC_011961	GGA	2	6	531334	531339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635944
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11229	NC_011961	CGA	2	6	541540	541545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635952
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11231	NC_011961	CCT	2	6	541628	541633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635952
11232	NC_011961	GCA	2	6	541670	541675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635952
11233	NC_011961	CGGCTT	2	12	541700	541711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635952
11234	NC_011961	CAC	2	6	541777	541782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635952
11235	NC_011961	CT	3	6	541837	541842	0 %	50 %	0 %	50 %	221635952
11236	NC_011961	CG	3	6	541843	541848	0 %	0 %	50 %	50 %	221635952
11237	NC_011961	CG	3	6	541865	541870	0 %	0 %	50 %	50 %	221635952
11238	NC_011961	GC	3	6	541890	541895	0 %	0 %	50 %	50 %	221635952
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11240	NC_011961	AGC	2	6	542011	542016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635952
11241	NC_011961	GCG	3	9	542177	542185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635952
11242	NC_011961	GGC	2	6	542240	542245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635952
11243	NC_011961	TGCG	2	8	542277	542284	0 %	25 %	50 %	25 %	221635952
11244	NC_011961	GGC	2	6	542318	542323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635952
11245	NC_011961	GC	3	6	542322	542327	0 %	0 %	50 %	50 %	221635952
11246	NC_011961	GCG	2	6	542360	542365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635952
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11249	NC_011961	GCCC	2	8	542635	542642	0 %	0 %	25 %	75 %	221635953
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11259	NC_011961	CAGCT	2	10	543209	543218	20 %	20 %	20 %	40 %	221635954
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11262	NC_011961	CCGA	2	8	543359	543366	25 %	0 %	25 %	50 %	221635954
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11350	NC_011961	CG	3	6	547754	547759	0 %	0 %	50 %	50 %	221635963
11351	NC_011961	TCGC	2	8	547792	547799	0 %	25 %	25 %	50 %	221635963
11352	NC_011961	CGA	2	6	547843	547848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635963
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11356	NC_011961	TCCG	2	8	547950	547957	0 %	25 %	25 %	50 %	221635963
11357	NC_011961	GCGCT	2	10	548015	548024	0 %	20 %	40 %	40 %	221635964
11358	NC_011961	CGG	2	6	548087	548092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635964
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11361	NC_011961	TGA	2	6	548144	548149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635964
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11471	NC_011961	GGTC	2	8	553156	553163	0 %	25 %	50 %	25 %	221635968
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11473	NC_011961	CGGAG	2	10	553212	553221	20 %	0 %	60 %	20 %	221635968
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11477	NC_011961	GCTC	2	8	553471	553478	0 %	25 %	25 %	50 %	221635968
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11479	NC_011961	CGA	2	6	553516	553521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635968
11480	NC_011961	GCG	2	6	553525	553530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635968
11481	NC_011961	GGC	2	6	553544	553549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635968
11482	NC_011961	GC	3	6	553548	553553	0 %	0 %	50 %	50 %	221635968
11483	NC_011961	GGAT	2	8	553560	553567	25 %	25 %	50 %	0 %	221635968
11484	NC_011961	ACG	2	6	553608	553613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635968
11485	NC_011961	CGT	2	6	553676	553681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635968
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11487	NC_011961	AGCGC	2	10	553705	553714	20 %	0 %	40 %	40 %	221635968
11488	NC_011961	ACG	2	6	553758	553763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635968
11489	NC_011961	CAG	2	6	553792	553797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635968
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11491	NC_011961	GT	3	6	553913	553918	0 %	50 %	50 %	0 %	221635968
11492	NC_011961	GCG	2	6	553961	553966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635968
11493	NC_011961	CAC	2	6	553979	553984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635968
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11499	NC_011961	TCCG	2	8	554272	554279	0 %	25 %	25 %	50 %	221635968
11500	NC_011961	TCG	3	9	554304	554312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635968

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