MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 19058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011961	TGAC	2	8	25186	25193	25 %	25 %	25 %	25 %	221635433
502	NC_011961	GAG	2	6	25208	25213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635433
503	NC_011961	GAGAG	2	10	25263	25272	40 %	0 %	60 %	0 %	221635433
504	NC_011961	GCC	2	6	25291	25296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635434
505	NC_011961	TCG	2	6	25355	25360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635434
506	NC_011961	ACGACC	2	12	25361	25372	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	221635434
507	NC_011961	CGC	2	6	25374	25379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635434
508	NC_011961	TTG	2	6	25394	25399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221635434
509	NC_011961	CGA	2	6	25440	25445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635434
510	NC_011961	CAG	2	6	25503	25508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635434
511	NC_011961	CGA	2	6	25581	25586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635434
512	NC_011961	GC	3	6	25588	25593	0 %	0 %	50 %	50 %	221635434
513	NC_011961	GTC	2	6	25654	25659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635434
514	NC_011961	CCT	2	6	25681	25686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635435
515	NC_011961	CTC	2	6	25698	25703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635435
516	NC_011961	CAG	2	6	25866	25871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635435
517	NC_011961	GGCG	2	8	25886	25893	0 %	0 %	75 %	25 %	221635435
518	NC_011961	GAG	2	6	25961	25966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635435
519	NC_011961	CG	3	6	25971	25976	0 %	0 %	50 %	50 %	221635435
520	NC_011961	GAC	2	6	26046	26051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635435
521	NC_011961	CAT	2	6	26118	26123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635435
522	NC_011961	CTG	2	6	26133	26138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635435
523	NC_011961	GAC	2	6	26148	26153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635435
524	NC_011961	GGA	2	6	26234	26239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635435
525	NC_011961	GCA	2	6	26240	26245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635435
526	NC_011961	TCG	3	9	26261	26269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635435
527	NC_011961	GGCG	2	8	26278	26285	0 %	0 %	75 %	25 %	221635435
528	NC_011961	CTC	2	6	26286	26291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635435
529	NC_011961	CGA	2	6	26315	26320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635435
530	NC_011961	CGA	2	6	26363	26368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635435
531	NC_011961	GAC	2	6	26394	26399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635435
532	NC_011961	AGGC	2	8	26406	26413	25 %	0 %	50 %	25 %	221635435
533	NC_011961	CGT	2	6	26433	26438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635435
534	NC_011961	CCG	2	6	26468	26473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635435
535	NC_011961	AG	3	6	26487	26492	50 %	0 %	50 %	0 %	221635435
536	NC_011961	TGGA	2	8	26533	26540	25 %	25 %	50 %	0 %	221635435
537	NC_011961	GAC	2	6	26570	26575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635435
538	NC_011961	GTC	2	6	26623	26628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635435
539	NC_011961	CCT	2	6	26657	26662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635436
540	NC_011961	GCTG	2	8	26717	26724	0 %	25 %	50 %	25 %	221635436
541	NC_011961	TCG	2	6	26780	26785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635436
542	NC_011961	GC	3	6	26852	26857	0 %	0 %	50 %	50 %	221635436
543	NC_011961	TGC	2	6	26868	26873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635436
544	NC_011961	CCA	3	9	26879	26887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635436
545	NC_011961	CCG	2	6	26891	26896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635436
546	NC_011961	GCG	2	6	26906	26911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635436
547	NC_011961	ACG	2	6	26951	26956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635436
548	NC_011961	GATAGC	2	12	26970	26981	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	221635436
549	NC_011961	CGAG	2	8	27015	27022	25 %	0 %	50 %	25 %	221635436
550	NC_011961	TGC	2	6	27032	27037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635436
551	NC_011961	TGC	2	6	27046	27051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635436
552	NC_011961	C	6	6	27058	27063	0 %	0 %	0 %	100 %	221635436
553	NC_011961	GAG	2	6	27121	27126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635436
554	NC_011961	ACC	2	6	27146	27151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635436
555	NC_011961	AGC	2	6	27170	27175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635436
556	NC_011961	ATC	2	6	27203	27208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635436
557	NC_011961	GCC	2	6	27229	27234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635437
558	NC_011961	CGT	2	6	27278	27283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635437
559	NC_011961	AGCC	2	8	27357	27364	25 %	0 %	25 %	50 %	221635437
560	NC_011961	GCGGAG	2	12	27438	27449	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	221635437
561	NC_011961	GAT	2	6	27496	27501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635437
562	NC_011961	GA	3	6	27578	27583	50 %	0 %	50 %	0 %	221635437
563	NC_011961	GCCGA	2	10	27637	27646	20 %	0 %	40 %	40 %	221635437
564	NC_011961	GC	3	6	27666	27671	0 %	0 %	50 %	50 %	221635437
565	NC_011961	GGT	2	6	27734	27739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635437
566	NC_011961	GAC	2	6	27832	27837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635437
567	NC_011961	GAA	2	6	27838	27843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635437
568	NC_011961	TGA	2	6	27858	27863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635437
569	NC_011961	TGA	2	6	27876	27881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635437
570	NC_011961	ATG	2	6	27913	27918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635437
571	NC_011961	CGG	2	6	27975	27980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635438
572	NC_011961	CG	4	8	28000	28007	0 %	0 %	50 %	50 %	221635438
573	NC_011961	GCG	2	6	28011	28016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635438
574	NC_011961	GAG	2	6	28027	28032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635438
575	NC_011961	GAT	2	6	28087	28092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635438
576	NC_011961	CTT	2	6	28110	28115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635438
577	NC_011961	TGC	2	6	28119	28124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635438
578	NC_011961	AGCTTG	2	12	28127	28138	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	221635438
579	NC_011961	GAT	2	6	28276	28281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635438
580	NC_011961	TGG	2	6	28287	28292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635438
581	NC_011961	GCT	2	6	28341	28346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635438
582	NC_011961	TCAGC	2	10	28383	28392	20 %	20 %	20 %	40 %	221635438
583	NC_011961	CGA	2	6	28404	28409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635438
584	NC_011961	TTC	2	6	28424	28429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635438
585	NC_011961	CGG	2	6	28478	28483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635438
586	NC_011961	CGA	2	6	28512	28517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635438
587	NC_011961	CGGG	2	8	28533	28540	0 %	0 %	75 %	25 %	221635438
588	NC_011961	ATG	2	6	28556	28561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635438
589	NC_011961	GAT	2	6	28630	28635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635438
590	NC_011961	GA	3	6	28664	28669	50 %	0 %	50 %	0 %	221635438
591	NC_011961	GC	3	6	28701	28706	0 %	0 %	50 %	50 %	221635438
592	NC_011961	TGG	2	6	28731	28736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635438
593	NC_011961	ATCC	2	8	28741	28748	25 %	25 %	0 %	50 %	221635438
594	NC_011961	TCG	2	6	28772	28777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635439
595	NC_011961	CCG	2	6	28820	28825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635439
596	NC_011961	GAC	3	9	28957	28965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635439
597	NC_011961	GCGA	3	12	29274	29285	25 %	0 %	50 %	25 %	221635440
598	NC_011961	G	6	6	29306	29311	0 %	0 %	100 %	0 %	221635440
599	NC_011961	CGC	2	6	29316	29321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635440
600	NC_011961	AGC	2	6	29344	29349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635440
601	NC_011961	AGG	2	6	29403	29408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635440
602	NC_011961	GCA	2	6	29431	29436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635440
603	NC_011961	TCT	2	6	29450	29455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635440
604	NC_011961	CTG	2	6	29473	29478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635440
605	NC_011961	CGA	2	6	29480	29485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635440
606	NC_011961	TGA	2	6	29495	29500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635440
607	NC_011961	GATCGT	2	12	29514	29525	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	221635440
608	NC_011961	CCG	2	6	29566	29571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635440
609	NC_011961	GACA	2	8	29735	29742	50 %	0 %	25 %	25 %	221635440
610	NC_011961	GGA	2	6	29802	29807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635440
611	NC_011961	GAGC	2	8	29844	29851	25 %	0 %	50 %	25 %	221635440
612	NC_011961	GAT	2	6	29940	29945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635440
613	NC_011961	CCG	2	6	29953	29958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635440
614	NC_011961	GTC	2	6	29959	29964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635440
615	NC_011961	TGG	2	6	29999	30004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635440
616	NC_011961	GTC	2	6	30034	30039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635440
617	NC_011961	CTG	2	6	30080	30085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635441
618	NC_011961	GTC	2	6	30155	30160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635441
619	NC_011961	TGG	2	6	30396	30401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635442
620	NC_011961	GCT	2	6	30427	30432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635442
621	NC_011961	GCCC	2	8	30463	30470	0 %	0 %	25 %	75 %	221635442
622	NC_011961	CGT	2	6	30484	30489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635442
623	NC_011961	CCGA	2	8	30518	30525	25 %	0 %	25 %	50 %	221635442
624	NC_011961	GGC	2	6	30637	30642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635442
625	NC_011961	GGC	2	6	30676	30681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635442
626	NC_011961	CTTGGC	2	12	30733	30744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635442
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874	NC_011961	TGG	2	6	41088	41093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635454
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876	NC_011961	CAA	2	6	41140	41145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221635454
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1000	NC_011961	CTC	2	6	47701	47706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635463

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