MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 19058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_011961	TCG	2	6	328315	328320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635747
7003	NC_011961	GAG	2	6	328346	328351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635747
7004	NC_011961	GCG	2	6	328497	328502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635747
7005	NC_011961	GTC	2	6	328535	328540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635747
7006	NC_011961	GCT	2	6	328557	328562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635747
7007	NC_011961	CAC	2	6	328632	328637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635747
7008	NC_011961	GA	3	6	328743	328748	50 %	0 %	50 %	0 %	221635747
7009	NC_011961	TTG	2	6	328817	328822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221635747
7010	NC_011961	CCGATG	2	12	328881	328892	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	221635747
7011	NC_011961	TGCG	2	8	328935	328942	0 %	25 %	50 %	25 %	221635747
7012	NC_011961	CAC	2	6	329008	329013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635747
7013	NC_011961	GAA	2	6	329105	329110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635747
7014	NC_011961	GA	3	6	329147	329152	50 %	0 %	50 %	0 %	221635747
7015	NC_011961	CATT	2	8	329223	329230	25 %	50 %	0 %	25 %	221635747
7016	NC_011961	GGT	2	6	329260	329265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635747
7017	NC_011961	CGA	2	6	329275	329280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635747
7018	NC_011961	AGC	2	6	329317	329322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635747
7019	NC_011961	TCG	2	6	329412	329417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635747
7020	NC_011961	TCG	2	6	329623	329628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635747
7021	NC_011961	GGT	2	6	329672	329677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635748
7022	NC_011961	CGC	2	6	329678	329683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635748
7023	NC_011961	CTG	2	6	329720	329725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635748
7024	NC_011961	AGGA	2	8	329768	329775	50 %	0 %	50 %	0 %	221635748
7025	NC_011961	GTA	2	6	329783	329788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635748
7026	NC_011961	GGC	2	6	329790	329795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635748
7027	NC_011961	TGT	2	6	329854	329859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221635748
7028	NC_011961	GAA	2	6	330053	330058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635748
7029	NC_011961	CGA	2	6	330160	330165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635748
7030	NC_011961	TAT	2	6	330229	330234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221635748
7031	NC_011961	ATC	2	6	330291	330296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635748
7032	NC_011961	CGGC	2	8	330323	330330	0 %	0 %	50 %	50 %	221635748
7033	NC_011961	GAA	2	6	330361	330366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635748
7034	NC_011961	CGAT	2	8	330375	330382	25 %	25 %	25 %	25 %	221635748
7035	NC_011961	CGT	2	6	330401	330406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635748
7036	NC_011961	GC	3	6	330439	330444	0 %	0 %	50 %	50 %	221635748
7037	NC_011961	CGA	3	9	330454	330462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635748
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7039	NC_011961	ATC	2	6	330564	330569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635748
7040	NC_011961	ATG	2	6	330651	330656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635748
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7044	NC_011961	GGA	2	6	330901	330906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635749
7045	NC_011961	GC	3	6	330935	330940	0 %	0 %	50 %	50 %	221635749
7046	NC_011961	GAT	3	9	331115	331123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635749
7047	NC_011961	GTA	2	6	331127	331132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635749
7048	NC_011961	CGC	2	6	331175	331180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635749
7049	NC_011961	TCG	2	6	331221	331226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635749
7050	NC_011961	GC	3	6	331233	331238	0 %	0 %	50 %	50 %	221635749
7051	NC_011961	AG	3	6	331246	331251	50 %	0 %	50 %	0 %	221635749
7052	NC_011961	CAA	2	6	331352	331357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221635749
7053	NC_011961	GCGAG	2	10	331417	331426	20 %	0 %	60 %	20 %	221635749
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7055	NC_011961	GAT	2	6	331517	331522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635749
7056	NC_011961	GC	3	6	332074	332079	0 %	0 %	50 %	50 %	221635750
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7058	NC_011961	GGCG	2	8	332120	332127	0 %	0 %	75 %	25 %	221635750
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7061	NC_011961	GCG	2	6	332230	332235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635750
7062	NC_011961	CGA	3	9	332273	332281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635750
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7064	NC_011961	CGA	2	6	332348	332353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635750
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7102	NC_011961	TGG	2	6	333844	333849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635751
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7117	NC_011961	CGAG	2	8	334394	334401	25 %	0 %	50 %	25 %	221635751
7118	NC_011961	CG	3	6	334411	334416	0 %	0 %	50 %	50 %	221635751
7119	NC_011961	GAC	2	6	334512	334517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635751
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7121	NC_011961	ACG	2	6	334568	334573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635751
7122	NC_011961	GGT	2	6	334581	334586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635751
7123	NC_011961	TCG	2	6	334589	334594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635751
7124	NC_011961	CGA	2	6	334595	334600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635751
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7141	NC_011961	CTG	2	6	335343	335348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635752
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7153	NC_011961	GGC	2	6	335886	335891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635752
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7159	NC_011961	GTCG	2	8	336330	336337	0 %	25 %	50 %	25 %	221635753
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7194	NC_011961	GTCG	2	8	337897	337904	0 %	25 %	50 %	25 %	221635755
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7231	NC_011961	CGA	2	6	339426	339431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635756
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7233	NC_011961	CGT	2	6	339693	339698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635756
7234	NC_011961	CG	3	6	339782	339787	0 %	0 %	50 %	50 %	221635756
7235	NC_011961	GCA	2	6	340262	340267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635757
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7237	NC_011961	TCG	2	6	340282	340287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635757
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7239	NC_011961	CGA	2	6	340321	340326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635757
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7241	NC_011961	TCG	2	6	340342	340347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635757
7242	NC_011961	C	6	6	340358	340363	0 %	0 %	0 %	100 %	221635757
7243	NC_011961	CCG	2	6	340371	340376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635757
7244	NC_011961	AGC	2	6	340388	340393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635757
7245	NC_011961	TCGCT	2	10	340444	340453	0 %	40 %	20 %	40 %	221635757
7246	NC_011961	AGC	2	6	340480	340485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635757
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7250	NC_011961	TCGA	2	8	340611	340618	25 %	25 %	25 %	25 %	221635757
7251	NC_011961	TCG	2	6	340660	340665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635757
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7271	NC_011961	CG	3	6	341253	341258	0 %	0 %	50 %	50 %	221635758
7272	NC_011961	GTACGG	2	12	341322	341333	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	221635758
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7347	NC_011961	TCGC	2	8	345159	345166	0 %	25 %	25 %	50 %	221635762
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7357	NC_011961	TCT	2	6	345545	345550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635762
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7362	NC_011961	GGT	2	6	345725	345730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635762
7363	NC_011961	TGG	2	6	345778	345783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635762
7364	NC_011961	CGA	2	6	345797	345802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635762
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7366	NC_011961	CGAG	3	12	345943	345954	25 %	0 %	50 %	25 %	221635762
7367	NC_011961	GAT	2	6	345993	345998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635762
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7369	NC_011961	CGAC	2	8	346096	346103	25 %	0 %	25 %	50 %	221635762
7370	NC_011961	CTG	2	6	346119	346124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635762
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7375	NC_011961	GTC	2	6	346419	346424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635762
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7381	NC_011961	TGG	2	6	346555	346560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635762
7382	NC_011961	CAT	2	6	346671	346676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635762
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7393	NC_011961	CGA	2	6	347322	347327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635764
7394	NC_011961	TCG	2	6	347332	347337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635764
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7477	NC_011961	GGAG	2	8	351978	351985	25 %	0 %	75 %	0 %	221635769
7478	NC_011961	TCC	2	6	351996	352001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635769
7479	NC_011961	GAC	2	6	352042	352047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635769
7480	NC_011961	GAC	2	6	352051	352056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635769
7481	NC_011961	GCT	2	6	352061	352066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635769
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7483	NC_011961	TCG	2	6	352128	352133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635769
7484	NC_011961	CGG	2	6	352182	352187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635769
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