MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 19058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_011961	GCGA	2	8	305066	305073	25 %	0 %	50 %	25 %	221635725
6502	NC_011961	TCG	2	6	305118	305123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635725
6503	NC_011961	CGA	2	6	305140	305145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635725
6504	NC_011961	GCTC	2	8	305173	305180	0 %	25 %	25 %	50 %	221635725
6505	NC_011961	GCG	2	6	305181	305186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635725
6506	NC_011961	GCGT	2	8	305197	305204	0 %	25 %	50 %	25 %	221635725
6507	NC_011961	GCTC	2	8	305212	305219	0 %	25 %	25 %	50 %	221635725
6508	NC_011961	CGA	2	6	305329	305334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635725
6509	NC_011961	GAG	2	6	305369	305374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635725
6510	NC_011961	GCA	2	6	305413	305418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635725
6511	NC_011961	CTT	2	6	305419	305424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635725
6512	NC_011961	CTG	2	6	305432	305437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635725
6513	NC_011961	GCG	2	6	305489	305494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635725
6514	NC_011961	CCG	2	6	305555	305560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635725
6515	NC_011961	GCTC	2	8	305565	305572	0 %	25 %	25 %	50 %	221635725
6516	NC_011961	CCA	2	6	305593	305598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635725
6517	NC_011961	GAG	2	6	305651	305656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635725
6518	NC_011961	AAG	2	6	305657	305662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635725
6519	NC_011961	GCA	2	6	305707	305712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635725
6520	NC_011961	TCC	2	6	305730	305735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635725
6521	NC_011961	GCA	2	6	305758	305763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635725
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6523	NC_011961	CTGG	2	8	305898	305905	0 %	25 %	50 %	25 %	221635726
6524	NC_011961	TCG	2	6	305930	305935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635726
6525	NC_011961	GTC	2	6	305953	305958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635726
6526	NC_011961	GCTC	2	8	305993	306000	0 %	25 %	25 %	50 %	221635726
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6529	NC_011961	CG	4	8	306109	306116	0 %	0 %	50 %	50 %	221635726
6530	NC_011961	TGC	2	6	306134	306139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635726
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6532	NC_011961	CGACC	2	10	306219	306228	20 %	0 %	20 %	60 %	221635726
6533	NC_011961	CGA	2	6	306237	306242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635726
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6538	NC_011961	TCCT	2	8	306634	306641	0 %	50 %	0 %	50 %	221635726
6539	NC_011961	CCGAAG	2	12	306650	306661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635726
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6543	NC_011961	CGG	2	6	306793	306798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635726
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6553	NC_011961	CAG	2	6	307211	307216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635727
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6561	NC_011961	GCG	2	6	307597	307602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635727
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6622	NC_011961	CCA	2	6	310439	310444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635729
6623	NC_011961	CTG	2	6	310673	310678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635730
6624	NC_011961	GCCA	2	8	310685	310692	25 %	0 %	25 %	50 %	221635730
6625	NC_011961	GCT	2	6	310746	310751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635730
6626	NC_011961	GAT	2	6	310793	310798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635730
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6632	NC_011961	CCAG	2	8	310934	310941	25 %	0 %	25 %	50 %	221635730
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6730	NC_011961	AGT	2	6	315400	315405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635734
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6741	NC_011961	TTC	2	6	315973	315978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635734
6742	NC_011961	ATCGAT	2	12	316020	316031	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	221635734
6743	NC_011961	CGG	2	6	316067	316072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635734
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6861	NC_011961	GAT	2	6	321120	321125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635739
6862	NC_011961	GTC	2	6	321285	321290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635739
6863	NC_011961	CTC	3	9	321329	321337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635739
6864	NC_011961	CGC	2	6	321357	321362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635739
6865	NC_011961	CTT	2	6	321401	321406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635739
6866	NC_011961	GGC	2	6	321427	321432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635739
6867	NC_011961	CAT	2	6	321447	321452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635739
6868	NC_011961	GAT	2	6	321495	321500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635739
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6871	NC_011961	GTC	2	6	321618	321623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635739
6872	NC_011961	CAG	2	6	321642	321647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635739
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6880	NC_011961	GC	3	6	322134	322139	0 %	0 %	50 %	50 %	221635740
6881	NC_011961	GTA	2	6	322148	322153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635740
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6891	NC_011961	GAT	2	6	322477	322482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635741
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6893	NC_011961	GCA	2	6	322526	322531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635741
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6899	NC_011961	TCG	2	6	322877	322882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635741
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6934	NC_011961	GCT	2	6	324863	324868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635743
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6972	NC_011961	CCG	2	6	326901	326906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635744
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6977	NC_011961	TGA	2	6	327165	327170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635744
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6979	NC_011961	CCA	2	6	327226	327231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635744
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6981	NC_011961	ACA	2	6	327300	327305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221635744
6982	NC_011961	TCGG	2	8	327381	327388	0 %	25 %	50 %	25 %	221635744
6983	NC_011961	TCGC	2	8	327590	327597	0 %	25 %	25 %	50 %	221635745
6984	NC_011961	GTGA	2	8	327610	327617	25 %	25 %	50 %	0 %	221635745
6985	NC_011961	TCA	2	6	327671	327676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635746
6986	NC_011961	GAA	2	6	327680	327685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635746
6987	NC_011961	GAT	3	9	327719	327727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635746
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6990	NC_011961	CGC	2	6	327814	327819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635746
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