MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 19058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011961	GTT	2	6	283003	283008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221635701
6002	NC_011961	TGC	2	6	283014	283019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635701
6003	NC_011961	AGC	2	6	283029	283034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635701
6004	NC_011961	GACTG	2	10	283055	283064	20 %	20 %	40 %	20 %	221635701
6005	NC_011961	GC	3	6	283183	283188	0 %	0 %	50 %	50 %	221635701
6006	NC_011961	CGAG	2	8	283207	283214	25 %	0 %	50 %	25 %	221635701
6007	NC_011961	ACG	2	6	283237	283242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635701
6008	NC_011961	CCT	2	6	283373	283378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635702
6009	NC_011961	CAGC	2	8	283439	283446	25 %	0 %	25 %	50 %	221635702
6010	NC_011961	GAG	2	6	283461	283466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635702
6011	NC_011961	GATC	2	8	283517	283524	25 %	25 %	25 %	25 %	221635703
6012	NC_011961	GT	3	6	283557	283562	0 %	50 %	50 %	0 %	221635703
6013	NC_011961	GC	3	6	283601	283606	0 %	0 %	50 %	50 %	221635703
6014	NC_011961	TCT	2	6	283630	283635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635703
6015	NC_011961	TC	3	6	283647	283652	0 %	50 %	0 %	50 %	221635703
6016	NC_011961	AGG	2	6	283672	283677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635703
6017	NC_011961	CCT	2	6	283685	283690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635703
6018	NC_011961	TCGG	2	8	283712	283719	0 %	25 %	50 %	25 %	221635703
6019	NC_011961	ACG	2	6	283735	283740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635703
6020	NC_011961	GGC	2	6	283754	283759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635703
6021	NC_011961	GGTGAC	2	12	283761	283772	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	221635703
6022	NC_011961	TGC	2	6	283796	283801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635704
6023	NC_011961	GA	3	6	283822	283827	50 %	0 %	50 %	0 %	221635704
6024	NC_011961	TCT	2	6	283842	283847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635704
6025	NC_011961	AGC	2	6	283851	283856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635704
6026	NC_011961	CCGG	2	8	283906	283913	0 %	0 %	50 %	50 %	221635704
6027	NC_011961	GCGG	2	8	283962	283969	0 %	0 %	75 %	25 %	221635705
6028	NC_011961	AGC	2	6	283984	283989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635705
6029	NC_011961	GGCG	2	8	283990	283997	0 %	0 %	75 %	25 %	221635705
6030	NC_011961	CGGA	2	8	284048	284055	25 %	0 %	50 %	25 %	221635705
6031	NC_011961	CAT	2	6	284095	284100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635705
6032	NC_011961	GAC	2	6	284164	284169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635705
6033	NC_011961	TCG	2	6	284181	284186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635705
6034	NC_011961	TGA	2	6	284193	284198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635705
6035	NC_011961	GTC	2	6	284264	284269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635705
6036	NC_011961	TCG	2	6	284325	284330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635705
6037	NC_011961	TCA	2	6	284343	284348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635705
6038	NC_011961	TCGG	2	8	284420	284427	0 %	25 %	50 %	25 %	221635705
6039	NC_011961	GGC	2	6	284465	284470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635705
6040	NC_011961	CGA	2	6	284482	284487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635705
6041	NC_011961	CG	3	6	284572	284577	0 %	0 %	50 %	50 %	221635705
6042	NC_011961	CTC	2	6	284594	284599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635705
6043	NC_011961	CAC	2	6	284614	284619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635705
6044	NC_011961	CAT	2	6	284629	284634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635705
6045	NC_011961	CCGTG	2	10	284638	284647	0 %	20 %	40 %	40 %	221635705
6046	NC_011961	TTC	2	6	284744	284749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635705
6047	NC_011961	GTC	2	6	284780	284785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635705
6048	NC_011961	CAT	2	6	284791	284796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635705
6049	NC_011961	CTT	2	6	284806	284811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635705
6050	NC_011961	GGCA	2	8	284844	284851	25 %	0 %	50 %	25 %	221635705
6051	NC_011961	GCG	2	6	284868	284873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635705
6052	NC_011961	TCG	2	6	284901	284906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635705
6053	NC_011961	CTCG	2	8	284908	284915	0 %	25 %	25 %	50 %	221635705
6054	NC_011961	GTC	2	6	284921	284926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635705
6055	NC_011961	CCT	2	6	284943	284948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635705
6056	NC_011961	CGA	2	6	284952	284957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635705
6057	NC_011961	CGG	2	6	284970	284975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635705
6058	NC_011961	GGTCT	2	10	285002	285011	0 %	40 %	40 %	20 %	221635705
6059	NC_011961	GGT	2	6	285013	285018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635705
6060	NC_011961	TCC	2	6	285033	285038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635705
6061	NC_011961	GTC	2	6	285059	285064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635705
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6063	NC_011961	TCG	3	9	285102	285110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635705
6064	NC_011961	GAT	3	9	285115	285123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635705
6065	NC_011961	AGCCG	2	10	285134	285143	20 %	0 %	40 %	40 %	221635705
6066	NC_011961	AAGCCG	2	12	285144	285155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635705
6067	NC_011961	G	6	6	285181	285186	0 %	0 %	100 %	0 %	221635705
6068	NC_011961	ACCATG	2	12	285224	285235	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	221635705
6069	NC_011961	TGA	2	6	285237	285242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635705
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6071	NC_011961	TCA	2	6	285300	285305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635705
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6081	NC_011961	GAGC	2	8	285691	285698	25 %	0 %	50 %	25 %	221635707
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6091	NC_011961	CGC	3	9	286168	286176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635709
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6097	NC_011961	CGCGCC	2	12	286459	286470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635709
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6101	NC_011961	CGC	2	6	286688	286693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635709
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6103	NC_011961	GAGCAC	2	12	286823	286834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635709
6104	NC_011961	GCGT	2	8	286843	286850	0 %	25 %	50 %	25 %	221635709
6105	NC_011961	GATC	2	8	286853	286860	25 %	25 %	25 %	25 %	221635709
6106	NC_011961	CG	3	6	286904	286909	0 %	0 %	50 %	50 %	221635709
6107	NC_011961	CGC	2	6	287013	287018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635709
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6109	NC_011961	CTG	2	6	287094	287099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635709
6110	NC_011961	GGCTC	2	10	287144	287153	0 %	20 %	40 %	40 %	221635709
6111	NC_011961	CG	4	8	287167	287174	0 %	0 %	50 %	50 %	221635709
6112	NC_011961	CGG	2	6	287232	287237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635709
6113	NC_011961	GA	3	6	287256	287261	50 %	0 %	50 %	0 %	221635709
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6115	NC_011961	CCGG	2	8	287927	287934	0 %	0 %	50 %	50 %	221635710
6116	NC_011961	CCGC	2	8	287951	287958	0 %	0 %	25 %	75 %	221635710
6117	NC_011961	GAT	2	6	287972	287977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635710
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6121	NC_011961	GTC	2	6	288177	288182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635710
6122	NC_011961	GGGC	2	8	288200	288207	0 %	0 %	75 %	25 %	221635710
6123	NC_011961	GCT	2	6	288240	288245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635710
6124	NC_011961	TCG	2	6	288325	288330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635710
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6129	NC_011961	GCTG	2	8	288548	288555	0 %	25 %	50 %	25 %	221635710
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6233	NC_011961	GC	3	6	292408	292413	0 %	0 %	50 %	50 %	221635714
6234	NC_011961	GGCT	3	12	292443	292454	0 %	25 %	50 %	25 %	221635714
6235	NC_011961	GTGA	2	8	292481	292488	25 %	25 %	50 %	0 %	221635714
6236	NC_011961	CGGA	2	8	292496	292503	25 %	0 %	50 %	25 %	221635714
6237	NC_011961	GGCA	2	8	292533	292540	25 %	0 %	50 %	25 %	221635714
6238	NC_011961	GTTC	2	8	292844	292851	0 %	50 %	25 %	25 %	221635715
6239	NC_011961	GACG	2	8	292887	292894	25 %	0 %	50 %	25 %	221635715
6240	NC_011961	GGC	2	6	293133	293138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635715
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6242	NC_011961	CAC	2	6	293164	293169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635715
6243	NC_011961	GGT	2	6	293214	293219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635715
6244	NC_011961	GGA	2	6	293232	293237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635715
6245	NC_011961	GTC	2	6	293245	293250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635715
6246	NC_011961	CG	3	6	293283	293288	0 %	0 %	50 %	50 %	221635715
6247	NC_011961	CG	3	6	293332	293337	0 %	0 %	50 %	50 %	221635715
6248	NC_011961	GCG	2	6	293412	293417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635715
6249	NC_011961	CGCT	2	8	293426	293433	0 %	25 %	25 %	50 %	221635715
6250	NC_011961	CGATC	2	10	293517	293526	20 %	20 %	20 %	40 %	221635715
6251	NC_011961	GATC	2	8	293556	293563	25 %	25 %	25 %	25 %	221635715
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6255	NC_011961	TGC	2	6	293715	293720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635715
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6262	NC_011961	CGG	2	6	293983	293988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635715
6263	NC_011961	GCA	2	6	294011	294016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635715
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6273	NC_011961	CGAGG	2	10	294501	294510	20 %	0 %	60 %	20 %	221635715
6274	NC_011961	TCA	2	6	294515	294520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635715
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6278	NC_011961	TGG	2	6	294707	294712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635715
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6282	NC_011961	CAA	2	6	294897	294902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221635715
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6474	NC_011961	CGA	3	9	303936	303944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635723
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6478	NC_011961	GACT	2	8	304050	304057	25 %	25 %	25 %	25 %	221635723
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6486	NC_011961	CGCT	2	8	304562	304569	0 %	25 %	25 %	50 %	221635724
6487	NC_011961	CTC	2	6	304590	304595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635724
6488	NC_011961	TCG	2	6	304634	304639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635724
6489	NC_011961	GTG	2	6	304651	304656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635724
6490	NC_011961	GAG	2	6	304668	304673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635724
6491	NC_011961	GC	3	6	304685	304690	0 %	0 %	50 %	50 %	221635724
6492	NC_011961	GAT	2	6	304761	304766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635724
6493	NC_011961	GCT	2	6	304777	304782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635724
6494	NC_011961	GC	3	6	304813	304818	0 %	0 %	50 %	50 %	221635724
6495	NC_011961	ACG	2	6	304874	304879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635724
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6499	NC_011961	CAT	2	6	305001	305006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635724
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