MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 plasmid unnamed

Total Repeats: 19058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011961	CCG	2	6	258616	258621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635681
5502	NC_011961	CAGC	2	8	258688	258695	25 %	0 %	25 %	50 %	221635681
5503	NC_011961	CGG	2	6	258723	258728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635681
5504	NC_011961	AGG	2	6	258744	258749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635681
5505	NC_011961	GCT	2	6	258814	258819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635681
5506	NC_011961	CTA	2	6	258823	258828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635681
5507	NC_011961	CG	3	6	258855	258860	0 %	0 %	50 %	50 %	221635681
5508	NC_011961	CGT	2	6	258871	258876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635681
5509	NC_011961	GAG	2	6	258890	258895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635681
5510	NC_011961	TTC	2	6	259034	259039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635681
5511	NC_011961	GCTG	2	8	259111	259118	0 %	25 %	50 %	25 %	221635681
5512	NC_011961	CGA	3	9	259159	259167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635681
5513	NC_011961	GC	3	6	259196	259201	0 %	0 %	50 %	50 %	221635681
5514	NC_011961	ACT	2	6	259206	259211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635681
5515	NC_011961	GGA	2	6	259303	259308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635681
5516	NC_011961	CTG	2	6	259355	259360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635681
5517	NC_011961	GAG	2	6	259373	259378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635681
5518	NC_011961	GGA	2	6	259396	259401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635681
5519	NC_011961	CG	3	6	259405	259410	0 %	0 %	50 %	50 %	221635681
5520	NC_011961	CGA	2	6	259440	259445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635681
5521	NC_011961	GAA	2	6	259465	259470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221635681
5522	NC_011961	TGGCG	2	10	259486	259495	0 %	20 %	60 %	20 %	221635681
5523	NC_011961	CAC	2	6	259529	259534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635681
5524	NC_011961	CTC	2	6	259559	259564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635681
5525	NC_011961	GCG	2	6	259755	259760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635681
5526	NC_011961	GCG	2	6	259801	259806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635681
5527	NC_011961	GTTCA	2	10	260101	260110	20 %	40 %	20 %	20 %	221635682
5528	NC_011961	TCT	2	6	260140	260145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635682
5529	NC_011961	G	6	6	260152	260157	0 %	0 %	100 %	0 %	221635682
5530	NC_011961	TC	3	6	260214	260219	0 %	50 %	0 %	50 %	221635682
5531	NC_011961	TGT	2	6	260273	260278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221635682
5532	NC_011961	GCTT	2	8	260317	260324	0 %	50 %	25 %	25 %	221635682
5533	NC_011961	TGGG	2	8	260349	260356	0 %	25 %	75 %	0 %	221635682
5534	NC_011961	GCT	2	6	260377	260382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635682
5535	NC_011961	AGTC	2	8	260401	260408	25 %	25 %	25 %	25 %	221635682
5536	NC_011961	GCCAG	2	10	260430	260439	20 %	0 %	40 %	40 %	221635682
5537	NC_011961	GCT	2	6	260539	260544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635682
5538	NC_011961	TGG	2	6	260550	260555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635682
5539	NC_011961	GCA	2	6	260572	260577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635682
5540	NC_011961	CGGC	2	8	260641	260648	0 %	0 %	50 %	50 %	221635682
5541	NC_011961	GAC	2	6	260663	260668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635682
5542	NC_011961	CAG	2	6	260684	260689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635682
5543	NC_011961	GTT	2	6	260699	260704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221635682
5544	NC_011961	TCG	2	6	260709	260714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635682
5545	NC_011961	CGT	2	6	260715	260720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635682
5546	NC_011961	CGAT	2	8	260841	260848	25 %	25 %	25 %	25 %	221635682
5547	NC_011961	TCA	2	6	260985	260990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635682
5548	NC_011961	CCG	2	6	261022	261027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635682
5549	NC_011961	CTG	2	6	261091	261096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635683
5550	NC_011961	GTC	2	6	261105	261110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635683
5551	NC_011961	TCG	2	6	261128	261133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635683
5552	NC_011961	AG	3	6	261152	261157	50 %	0 %	50 %	0 %	221635683
5553	NC_011961	GTA	2	6	261164	261169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635683
5554	NC_011961	CGC	2	6	261176	261181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635683
5555	NC_011961	GGT	2	6	261191	261196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635683
5556	NC_011961	ATA	2	6	261211	261216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221635683
5557	NC_011961	TGG	2	6	261278	261283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635683
5558	NC_011961	TG	3	6	261349	261354	0 %	50 %	50 %	0 %	221635683
5559	NC_011961	ATG	2	6	261361	261366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635683
5560	NC_011961	CGG	2	6	261449	261454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635683
5561	NC_011961	CGCT	2	8	261956	261963	0 %	25 %	25 %	50 %	221635684
5562	NC_011961	CG	3	6	261977	261982	0 %	0 %	50 %	50 %	221635684
5563	NC_011961	CTT	2	6	262056	262061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635684
5564	NC_011961	TCT	2	6	262151	262156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221635684
5565	NC_011961	GTG	2	6	262175	262180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635684
5566	NC_011961	CTG	2	6	262195	262200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635684
5567	NC_011961	CTC	2	6	262210	262215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635684
5568	NC_011961	GGT	2	6	262287	262292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635684
5569	NC_011961	CGGA	2	8	262302	262309	25 %	0 %	50 %	25 %	221635684
5570	NC_011961	CGG	2	6	262360	262365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635684
5571	NC_011961	CTC	2	6	262453	262458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635684
5572	NC_011961	GCC	2	6	262467	262472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635684
5573	NC_011961	GCGA	2	8	262488	262495	25 %	0 %	50 %	25 %	221635684
5574	NC_011961	ACG	2	6	262510	262515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635684
5575	NC_011961	ACC	2	6	262520	262525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635684
5576	NC_011961	GTCGCC	2	12	262555	262566	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	221635684
5577	NC_011961	CTGGAG	2	12	262663	262674	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	221635684
5578	NC_011961	GATC	2	8	262695	262702	25 %	25 %	25 %	25 %	221635684
5579	NC_011961	GC	3	6	262822	262827	0 %	0 %	50 %	50 %	221635684
5580	NC_011961	CAT	2	6	262968	262973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635684
5581	NC_011961	GTC	2	6	262981	262986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635684
5582	NC_011961	CGG	2	6	263000	263005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635684
5583	NC_011961	CG	3	6	263010	263015	0 %	0 %	50 %	50 %	221635684
5584	NC_011961	TCCTC	2	10	263210	263219	0 %	40 %	0 %	60 %	221635684
5585	NC_011961	GATC	2	8	263254	263261	25 %	25 %	25 %	25 %	221635684
5586	NC_011961	CAG	2	6	263332	263337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635684
5587	NC_011961	GCT	2	6	263373	263378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635684
5588	NC_011961	CGA	2	6	263436	263441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635684
5589	NC_011961	ACG	2	6	263607	263612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635684
5590	NC_011961	TGG	2	6	263614	263619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635684
5591	NC_011961	GC	3	6	263691	263696	0 %	0 %	50 %	50 %	221635684
5592	NC_011961	AGC	2	6	263738	263743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635684
5593	NC_011961	CGAG	2	8	263793	263800	25 %	0 %	50 %	25 %	221635684
5594	NC_011961	CTA	2	6	263847	263852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635684
5595	NC_011961	ACCGG	2	10	263858	263867	20 %	0 %	40 %	40 %	221635684
5596	NC_011961	CTC	2	6	264001	264006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635684
5597	NC_011961	GCC	2	6	264011	264016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221635684
5598	NC_011961	GCG	2	6	264060	264065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635684
5599	NC_011961	ACC	2	6	264113	264118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635684
5600	NC_011961	G	6	6	264163	264168	0 %	0 %	100 %	0 %	221635684
5601	NC_011961	CTA	2	6	264288	264293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635684
5602	NC_011961	CAC	2	6	264312	264317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221635684
5603	NC_011961	ACGA	2	8	264427	264434	50 %	0 %	25 %	25 %	221635684
5604	NC_011961	CAG	2	6	264460	264465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635684
5605	NC_011961	AGC	2	6	264470	264475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635684
5606	NC_011961	TCC	2	6	264638	264643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635684
5607	NC_011961	GACC	2	8	264671	264678	25 %	0 %	25 %	50 %	221635684
5608	NC_011961	GGC	2	6	264704	264709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635684
5609	NC_011961	GTC	2	6	264710	264715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635684
5610	NC_011961	GAC	2	6	264724	264729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635684
5611	NC_011961	TCGA	2	8	264757	264764	25 %	25 %	25 %	25 %	221635684
5612	NC_011961	GC	3	6	264775	264780	0 %	0 %	50 %	50 %	221635684
5613	NC_011961	GA	3	6	264872	264877	50 %	0 %	50 %	0 %	221635684
5614	NC_011961	ACA	2	6	264954	264959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221635684
5615	NC_011961	GCT	2	6	264960	264965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635684
5616	NC_011961	TCG	2	6	264971	264976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635684
5617	NC_011961	GGA	2	6	265002	265007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635684
5618	NC_011961	CAG	2	6	265012	265017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635684
5619	NC_011961	CGA	2	6	265026	265031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635685
5620	NC_011961	TCA	2	6	265070	265075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221635685
5621	NC_011961	CGA	2	6	265088	265093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635685
5622	NC_011961	TCG	2	6	265111	265116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635685
5623	NC_011961	GCT	2	6	265160	265165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635685
5624	NC_011961	CGA	2	6	265232	265237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635685
5625	NC_011961	GCT	2	6	265295	265300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635685
5626	NC_011961	CGCAC	2	10	265301	265310	20 %	0 %	20 %	60 %	221635685
5627	NC_011961	TTG	2	6	265329	265334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221635685
5628	NC_011961	GGA	2	6	265406	265411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635685
5629	NC_011961	TGG	2	6	265416	265421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635685
5630	NC_011961	ACG	2	6	265428	265433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635685
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5632	NC_011961	GCT	2	6	265559	265564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635685
5633	NC_011961	GCG	3	9	265595	265603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635685
5634	NC_011961	GCT	2	6	265683	265688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635686
5635	NC_011961	GGCT	2	8	265796	265803	0 %	25 %	50 %	25 %	221635686
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5640	NC_011961	CG	3	6	266017	266022	0 %	0 %	50 %	50 %	221635686
5641	NC_011961	GC	3	6	266024	266029	0 %	0 %	50 %	50 %	221635686
5642	NC_011961	AGCTG	2	10	266056	266065	20 %	20 %	40 %	20 %	221635686
5643	NC_011961	CGG	2	6	266080	266085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635686
5644	NC_011961	GCG	2	6	266105	266110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635686
5645	NC_011961	TCC	2	6	266116	266121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635686
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5647	NC_011961	CCGG	2	8	266156	266163	0 %	0 %	50 %	50 %	221635686
5648	NC_011961	AGG	2	6	266164	266169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635686
5649	NC_011961	CG	3	6	266225	266230	0 %	0 %	50 %	50 %	221635686
5650	NC_011961	ACG	2	6	266264	266269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635686
5651	NC_011961	GGGT	2	8	266287	266294	0 %	25 %	75 %	0 %	221635686
5652	NC_011961	GGC	2	6	266310	266315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635686
5653	NC_011961	GGC	2	6	266330	266335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635686
5654	NC_011961	TGC	2	6	266383	266388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635686
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5656	NC_011961	CGG	3	9	266414	266422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635686
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5661	NC_011961	GCG	2	6	266618	266623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635686
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5677	NC_011961	GC	4	8	267402	267409	0 %	0 %	50 %	50 %	221635686
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5695	NC_011961	CTC	2	6	268365	268370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635686
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5731	NC_011961	TCC	2	6	270064	270069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635687
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5737	NC_011961	ATG	2	6	270310	270315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635687
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5740	NC_011961	CTG	2	6	270355	270360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635687
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5742	NC_011961	CTC	2	6	270477	270482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221635687
5743	NC_011961	GGT	2	6	270486	270491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635687
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5848	NC_011961	TCG	2	6	275577	275582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635694
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5850	NC_011961	GTG	2	6	275778	275783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221635694
5851	NC_011961	CGA	2	6	275794	275799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221635694
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5853	NC_011961	GGGT	2	8	275818	275825	0 %	25 %	75 %	0 %	221635694
5854	NC_011961	GTA	2	6	275837	275842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221635694
5855	NC_011961	CGGGG	2	10	275845	275854	0 %	0 %	80 %	20 %	221635694
5856	NC_011961	GGA	2	6	275857	275862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635694
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5859	NC_011961	GAG	2	6	276471	276476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221635695
5860	NC_011961	TCG	2	6	276478	276483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635695
5861	NC_011961	GATC	2	8	276605	276612	25 %	25 %	25 %	25 %	221635695
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5986	NC_011961	CG	3	6	282191	282196	0 %	0 %	50 %	50 %	221635701
5987	NC_011961	TGC	2	6	282289	282294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635701
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5990	NC_011961	GGC	2	6	282502	282507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221635701
5991	NC_011961	CGT	2	6	282538	282543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221635701
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