MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 40761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011959	GAC	2	6	173112	173117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632201
3502	NC_011959	GGA	2	6	173136	173141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632201
3503	NC_011959	CAT	2	6	173280	173285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632201
3504	NC_011959	AC	3	6	173347	173352	50 %	0 %	0 %	50 %	221632201
3505	NC_011959	CCGA	2	8	173382	173389	25 %	0 %	25 %	50 %	221632201
3506	NC_011959	TCGG	2	8	173390	173397	0 %	25 %	50 %	25 %	221632201
3507	NC_011959	CGAA	2	8	173455	173462	50 %	0 %	25 %	25 %	221632201
3508	NC_011959	AAG	2	6	173508	173513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632202
3509	NC_011959	GCG	2	6	173531	173536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632202
3510	NC_011959	GGA	2	6	173579	173584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632202
3511	NC_011959	CGTC	2	8	173800	173807	0 %	25 %	25 %	50 %	221632202
3512	NC_011959	TGG	2	6	173828	173833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632202
3513	NC_011959	GCT	2	6	173835	173840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632202
3514	NC_011959	CGA	2	6	173851	173856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632202
3515	NC_011959	CGT	2	6	173942	173947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632202
3516	NC_011959	CGA	2	6	174051	174056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632202
3517	NC_011959	TCG	2	6	174100	174105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632202
3518	NC_011959	CTT	2	6	174129	174134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632202
3519	NC_011959	GCC	2	6	174194	174199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632202
3520	NC_011959	CTA	2	6	174227	174232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632202
3521	NC_011959	GGA	2	6	174239	174244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632202
3522	NC_011959	GAG	2	6	174249	174254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632202
3523	NC_011959	GCG	2	6	174257	174262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632202
3524	NC_011959	GTC	2	6	174317	174322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632202
3525	NC_011959	CCG	2	6	174359	174364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632202
3526	NC_011959	CGT	2	6	174406	174411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632203
3527	NC_011959	GGC	2	6	174442	174447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632203
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3529	NC_011959	CTC	2	6	174512	174517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632203
3530	NC_011959	GCG	2	6	174544	174549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632203
3531	NC_011959	TTA	2	6	174607	174612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221632203
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3533	NC_011959	GCG	2	6	174706	174711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632203
3534	NC_011959	TCG	2	6	174714	174719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632203
3535	NC_011959	CGAC	2	8	174882	174889	25 %	0 %	25 %	50 %	221632203
3536	NC_011959	TCG	2	6	174957	174962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632203
3537	NC_011959	CCGGT	2	10	175052	175061	0 %	20 %	40 %	40 %	221632203
3538	NC_011959	GAC	2	6	175067	175072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632203
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3540	NC_011959	ATC	2	6	175114	175119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632203
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3543	NC_011959	CGG	2	6	175157	175162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632204
3544	NC_011959	AGCGG	2	10	175175	175184	20 %	0 %	60 %	20 %	221632204
3545	NC_011959	TTG	2	6	175243	175248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632204
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3552	NC_011959	GAT	2	6	175566	175571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632204
3553	NC_011959	TGG	2	6	175616	175621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632204
3554	NC_011959	CGC	2	6	175690	175695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632204
3555	NC_011959	TCT	2	6	175696	175701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632204
3556	NC_011959	CCGC	2	8	175736	175743	0 %	0 %	25 %	75 %	221632204
3557	NC_011959	GCT	2	6	175826	175831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632204
3558	NC_011959	CTG	2	6	175851	175856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632204
3559	NC_011959	CCG	2	6	175881	175886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632204
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3562	NC_011959	GC	3	6	175959	175964	0 %	0 %	50 %	50 %	221632204
3563	NC_011959	CTGG	2	8	176027	176034	0 %	25 %	50 %	25 %	221632204
3564	NC_011959	CG	3	6	176132	176137	0 %	0 %	50 %	50 %	221632204
3565	NC_011959	CG	3	6	176198	176203	0 %	0 %	50 %	50 %	221632204
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3592	NC_011959	CG	3	6	177024	177029	0 %	0 %	50 %	50 %	221632204
3593	NC_011959	CACG	2	8	177032	177039	25 %	0 %	25 %	50 %	221632204
3594	NC_011959	CAT	2	6	177051	177056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632204
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3601	NC_011959	GC	3	6	177331	177336	0 %	0 %	50 %	50 %	221632204
3602	NC_011959	GAT	2	6	177453	177458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632204
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3604	NC_011959	TCG	2	6	177508	177513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632204
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3621	NC_011959	CCA	2	6	178402	178407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632205
3622	NC_011959	CGA	2	6	178450	178455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632205
3623	NC_011959	GTC	2	6	178531	178536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632205
3624	NC_011959	CTTC	2	8	178626	178633	0 %	50 %	0 %	50 %	221632205
3625	NC_011959	GAA	2	6	178659	178664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632205
3626	NC_011959	CGAT	2	8	178706	178713	25 %	25 %	25 %	25 %	221632205
3627	NC_011959	TCG	2	6	178727	178732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632205
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3629	NC_011959	TCG	2	6	178805	178810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632205
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3640	NC_011959	GT	3	6	179272	179277	0 %	50 %	50 %	0 %	221632206
3641	NC_011959	GCT	3	9	179298	179306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632206
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3643	NC_011959	TCG	2	6	179566	179571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632206
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3651	NC_011959	AGTGG	2	10	179904	179913	20 %	20 %	60 %	0 %	221632206
3652	NC_011959	TCG	2	6	179920	179925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632206
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3740	NC_011959	CGA	2	6	183634	183639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632211
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3742	NC_011959	GACG	2	8	183662	183669	25 %	0 %	50 %	25 %	221632211
3743	NC_011959	CAT	2	6	183685	183690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632211
3744	NC_011959	CCA	2	6	183709	183714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632211
3745	NC_011959	CGG	2	6	183721	183726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632211
3746	NC_011959	CTCGC	2	10	183740	183749	0 %	20 %	20 %	60 %	221632211
3747	NC_011959	GGC	2	6	183750	183755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632211
3748	NC_011959	CGAT	2	8	183819	183826	25 %	25 %	25 %	25 %	221632211
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3755	NC_011959	GA	3	6	184230	184235	50 %	0 %	50 %	0 %	221632211
3756	NC_011959	TTCAGC	2	12	184244	184255	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	221632211
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3761	NC_011959	GC	3	6	184445	184450	0 %	0 %	50 %	50 %	221632211
3762	NC_011959	CTGG	2	8	184475	184482	0 %	25 %	50 %	25 %	221632211
3763	NC_011959	AGC	2	6	184489	184494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632211
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3769	NC_011959	CGATCT	2	12	184630	184641	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	221632211
3770	NC_011959	GGC	2	6	184741	184746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632212
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3773	NC_011959	TTC	2	6	184898	184903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632212
3774	NC_011959	AGGA	2	8	184908	184915	50 %	0 %	50 %	0 %	221632212
3775	NC_011959	GAC	2	6	184972	184977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632212
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3777	NC_011959	GC	3	6	185157	185162	0 %	0 %	50 %	50 %	221632212
3778	NC_011959	CGA	2	6	185195	185200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632212
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3822	NC_011959	CGAT	2	8	187131	187138	25 %	25 %	25 %	25 %	221632215
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3852	NC_011959	CAG	2	6	187927	187932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632216
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3857	NC_011959	GAG	2	6	188104	188109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632216
3858	NC_011959	CAG	2	6	188122	188127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632216
3859	NC_011959	CGA	2	6	188226	188231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632216
3860	NC_011959	ATG	2	6	188255	188260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632216
3861	NC_011959	TCG	2	6	188408	188413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632216
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3982	NC_011959	TCA	2	6	194067	194072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632222
3983	NC_011959	ACG	3	9	194156	194164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632222
3984	NC_011959	ACC	2	6	194317	194322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632222
3985	NC_011959	CTGGGC	2	12	194329	194340	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	221632222
3986	NC_011959	CGT	2	6	194359	194364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632222
3987	NC_011959	CG	3	6	194406	194411	0 %	0 %	50 %	50 %	221632222
3988	NC_011959	ATG	2	6	194504	194509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632222
3989	NC_011959	GA	3	6	194538	194543	50 %	0 %	50 %	0 %	221632222
3990	NC_011959	CTCG	2	8	194683	194690	0 %	25 %	25 %	50 %	221632223
3991	NC_011959	CGACCT	2	12	194719	194730	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	221632223
3992	NC_011959	GGGC	2	8	194767	194774	0 %	0 %	75 %	25 %	221632223
3993	NC_011959	CTTC	2	8	194791	194798	0 %	50 %	0 %	50 %	221632223
3994	NC_011959	CCG	2	6	194813	194818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632223
3995	NC_011959	GAT	2	6	194819	194824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632223
3996	NC_011959	TGG	2	6	194844	194849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632223
3997	NC_011959	TCC	2	6	194850	194855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632223
3998	NC_011959	GCT	2	6	194900	194905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632223
3999	NC_011959	GAG	2	6	194987	194992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632223
4000	NC_011959	CGCTGG	2	12	195058	195069	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	221632224

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