MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 40761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36502	NC_011959	GCA	2	6	1802096	1802101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633770
36503	NC_011959	TCAC	2	8	1802102	1802109	25 %	25 %	0 %	50 %	221633770
36504	NC_011959	TGC	2	6	1802134	1802139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633770
36505	NC_011959	AGC	2	6	1802180	1802185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633770
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36511	NC_011959	TGGAC	2	10	1802333	1802342	20 %	20 %	40 %	20 %	221633771
36512	NC_011959	AGC	2	6	1802435	1802440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633771
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36517	NC_011959	GA	3	6	1802533	1802538	50 %	0 %	50 %	0 %	221633771
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36519	NC_011959	CGAT	2	8	1802629	1802636	25 %	25 %	25 %	25 %	221633771
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36609	NC_011959	CG	3	6	1806110	1806115	0 %	0 %	50 %	50 %	221633773
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36616	NC_011959	GTC	2	6	1806382	1806387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633773
36617	NC_011959	CGG	2	6	1806422	1806427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633773
36618	NC_011959	GCA	2	6	1806429	1806434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633773
36619	NC_011959	CTG	2	6	1806505	1806510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633773
36620	NC_011959	CT	3	6	1806512	1806517	0 %	50 %	0 %	50 %	221633773
36621	NC_011959	GCT	2	6	1806522	1806527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633773
36622	NC_011959	TCGCG	2	10	1806546	1806555	0 %	20 %	40 %	40 %	221633773
36623	NC_011959	CTG	2	6	1806560	1806565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633773
36624	NC_011959	ATG	2	6	1806597	1806602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633773
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36628	NC_011959	CCGAT	2	10	1806846	1806855	20 %	20 %	20 %	40 %	221633775
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36634	NC_011959	CGT	2	6	1807136	1807141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633775
36635	NC_011959	CGG	2	6	1807229	1807234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633775
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36639	NC_011959	GCG	2	6	1807543	1807548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633776
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36642	NC_011959	TGA	2	6	1807580	1807585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633776
36643	NC_011959	CGGG	2	8	1807613	1807620	0 %	0 %	75 %	25 %	221633776
36644	NC_011959	CGA	2	6	1807643	1807648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633776
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36653	NC_011959	CGTA	2	8	1807859	1807866	25 %	25 %	25 %	25 %	221633776
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36702	NC_011959	GC	3	6	1810251	1810256	0 %	0 %	50 %	50 %	221633779
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36705	NC_011959	CGGG	2	8	1810338	1810345	0 %	0 %	75 %	25 %	221633779
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36709	NC_011959	CTGG	2	8	1810584	1810591	0 %	25 %	50 %	25 %	221633779
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36720	NC_011959	TGG	2	6	1810855	1810860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633779
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36722	NC_011959	GAC	2	6	1810886	1810891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633779
36723	NC_011959	TCCTT	2	10	1810915	1810924	0 %	60 %	0 %	40 %	221633779
36724	NC_011959	CAT	2	6	1810929	1810934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633779
36725	NC_011959	ACGA	2	8	1811003	1811010	50 %	0 %	25 %	25 %	221633779
36726	NC_011959	ATC	2	6	1811044	1811049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633779
36727	NC_011959	AGCA	2	8	1811053	1811060	50 %	0 %	25 %	25 %	221633779
36728	NC_011959	TCG	2	6	1811061	1811066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633779
36729	NC_011959	ACC	2	6	1811088	1811093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633779
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36731	NC_011959	CGTG	2	8	1811148	1811155	0 %	25 %	50 %	25 %	221633779
36732	NC_011959	TCG	2	6	1811228	1811233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633779
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36845	NC_011959	GGC	2	6	1816631	1816636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633784
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36848	NC_011959	CGT	2	6	1816693	1816698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633784
36849	NC_011959	AAG	2	6	1816716	1816721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633784
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36950	NC_011959	CCGA	2	8	1821011	1821018	25 %	0 %	25 %	50 %	221633787
36951	NC_011959	TCG	2	6	1821033	1821038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633787
36952	NC_011959	GA	3	6	1821092	1821097	50 %	0 %	50 %	0 %	221633787
36953	NC_011959	CA	3	6	1821187	1821192	50 %	0 %	0 %	50 %	221633788
36954	NC_011959	GCT	2	6	1821227	1821232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633788
36955	NC_011959	GCG	2	6	1821301	1821306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633788
36956	NC_011959	CG	3	6	1821329	1821334	0 %	0 %	50 %	50 %	221633788
36957	NC_011959	GC	3	6	1821349	1821354	0 %	0 %	50 %	50 %	221633788
36958	NC_011959	CTCGT	2	10	1821370	1821379	0 %	40 %	20 %	40 %	221633788
36959	NC_011959	TCGA	2	8	1821387	1821394	25 %	25 %	25 %	25 %	221633788
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36961	NC_011959	TGG	2	6	1821456	1821461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633788
36962	NC_011959	GAT	2	6	1821522	1821527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633788
36963	NC_011959	CGA	2	6	1821560	1821565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633788
36964	NC_011959	GAAGGT	2	12	1821588	1821599	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	221633788
36965	NC_011959	CTC	2	6	1821609	1821614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633788
36966	NC_011959	GATCGC	2	12	1821645	1821656	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	221633788
36967	NC_011959	CGTCC	2	10	1821723	1821732	0 %	20 %	20 %	60 %	221633788
36968	NC_011959	CCG	2	6	1821766	1821771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633788
36969	NC_011959	CGA	2	6	1821833	1821838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633788
36970	NC_011959	GCG	2	6	1821863	1821868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633788
36971	NC_011959	GCTC	3	12	1821892	1821903	0 %	25 %	25 %	50 %	221633788
36972	NC_011959	GCT	2	6	1821915	1821920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633788
36973	NC_011959	GCC	2	6	1821986	1821991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633788
36974	NC_011959	CAT	2	6	1822092	1822097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633788
36975	NC_011959	CGT	2	6	1822226	1822231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633788
36976	NC_011959	AGA	2	6	1822273	1822278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633788
36977	NC_011959	GGCT	2	8	1822288	1822295	0 %	25 %	50 %	25 %	221633788
36978	NC_011959	TGC	2	6	1822329	1822334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633788
36979	NC_011959	AGC	2	6	1822389	1822394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633788
36980	NC_011959	CG	3	6	1822427	1822432	0 %	0 %	50 %	50 %	221633788
36981	NC_011959	GTCGA	2	10	1822467	1822476	20 %	20 %	40 %	20 %	221633788
36982	NC_011959	CTT	2	6	1822593	1822598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633788
36983	NC_011959	CGGT	2	8	1822667	1822674	0 %	25 %	50 %	25 %	221633788
36984	NC_011959	CGA	2	6	1822757	1822762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633788
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36986	NC_011959	GGC	2	6	1822842	1822847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633788
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36988	NC_011959	CGC	2	6	1822920	1822925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633788
36989	NC_011959	ATG	2	6	1822960	1822965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633788
36990	NC_011959	GCG	2	6	1822978	1822983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633788
36991	NC_011959	TCA	2	6	1823024	1823029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633788
36992	NC_011959	GCGAG	2	10	1823222	1823231	20 %	0 %	60 %	20 %	221633788
36993	NC_011959	GTC	2	6	1823244	1823249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633788
36994	NC_011959	AT	3	6	1823257	1823262	50 %	50 %	0 %	0 %	221633788
36995	NC_011959	GCAGG	2	10	1823299	1823308	20 %	0 %	60 %	20 %	221633788
36996	NC_011959	TCG	2	6	1823324	1823329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633788
36997	NC_011959	ATC	2	6	1823377	1823382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633788
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37000	NC_011959	CGA	2	6	1823567	1823572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633788

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