MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 40761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_011959	GCGG	2	8	1634518	1634525	0 %	0 %	75 %	25 %	221633615
33003	NC_011959	GA	3	6	1634584	1634589	50 %	0 %	50 %	0 %	221633615
33004	NC_011959	GACG	2	8	1634594	1634601	25 %	0 %	50 %	25 %	221633615
33005	NC_011959	GAG	2	6	1634613	1634618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633615
33006	NC_011959	ACC	2	6	1634654	1634659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633616
33007	NC_011959	GGTC	2	8	1634770	1634777	0 %	25 %	50 %	25 %	221633616
33008	NC_011959	CGA	2	6	1634854	1634859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633616
33009	NC_011959	CGG	2	6	1634917	1634922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633616
33010	NC_011959	TCA	2	6	1635039	1635044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633616
33011	NC_011959	CGA	2	6	1635061	1635066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633616
33012	NC_011959	CAGC	2	8	1635067	1635074	25 %	0 %	25 %	50 %	221633616
33013	NC_011959	GCCG	2	8	1635092	1635099	0 %	0 %	50 %	50 %	221633616
33014	NC_011959	CAT	2	6	1635124	1635129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633616
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33016	NC_011959	GAG	2	6	1635179	1635184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633616
33017	NC_011959	GTG	2	6	1635207	1635212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633616
33018	NC_011959	CCA	2	6	1635267	1635272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633616
33019	NC_011959	CGA	2	6	1635295	1635300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633616
33020	NC_011959	ATC	2	6	1635314	1635319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633616
33021	NC_011959	CGA	2	6	1635331	1635336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633616
33022	NC_011959	GAAG	2	8	1635394	1635401	50 %	0 %	50 %	0 %	221633616
33023	NC_011959	GCA	2	6	1635436	1635441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633616
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33027	NC_011959	CGA	2	6	1635610	1635615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633616
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33029	NC_011959	CGG	2	6	1635628	1635633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633616
33030	NC_011959	TTC	2	6	1635674	1635679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633616
33031	NC_011959	CGGCG	2	10	1635727	1635736	0 %	0 %	60 %	40 %	221633616
33032	NC_011959	GGCG	2	8	1635742	1635749	0 %	0 %	75 %	25 %	221633616
33033	NC_011959	AGG	2	6	1635768	1635773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633616
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33039	NC_011959	CGT	2	6	1635925	1635930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633616
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33044	NC_011959	GC	3	6	1636070	1636075	0 %	0 %	50 %	50 %	221633616
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33063	NC_011959	CACC	2	8	1637726	1637733	25 %	0 %	0 %	75 %	221633617
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33103	NC_011959	CGC	2	6	1638818	1638823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633618
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33106	NC_011959	CTGG	2	8	1638879	1638886	0 %	25 %	50 %	25 %	221633618
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33111	NC_011959	GGCG	2	8	1639156	1639163	0 %	0 %	75 %	25 %	221633618
33112	NC_011959	CGACCT	2	12	1639170	1639181	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	221633618
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33114	NC_011959	GC	3	6	1639254	1639259	0 %	0 %	50 %	50 %	221633618
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33233	NC_011959	GC	3	6	1645338	1645343	0 %	0 %	50 %	50 %	221633623
33234	NC_011959	GCA	2	6	1645353	1645358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633623
33235	NC_011959	GCC	2	6	1645404	1645409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633623
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33345	NC_011959	CA	3	6	1653001	1653006	50 %	0 %	0 %	50 %	221633629
33346	NC_011959	CGC	2	6	1653045	1653050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633629
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33349	NC_011959	TGG	2	6	1653323	1653328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633629
33350	NC_011959	TCG	2	6	1653342	1653347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633629
33351	NC_011959	GC	3	6	1653348	1653353	0 %	0 %	50 %	50 %	221633629
33352	NC_011959	CGA	2	6	1653364	1653369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633629
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33463	NC_011959	GC	3	6	1657974	1657979	0 %	0 %	50 %	50 %	221633634
33464	NC_011959	CG	3	6	1657989	1657994	0 %	0 %	50 %	50 %	221633634
33465	NC_011959	CGT	2	6	1658011	1658016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633634
33466	NC_011959	GAC	2	6	1658062	1658067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633634
33467	NC_011959	GAGC	2	8	1658134	1658141	25 %	0 %	50 %	25 %	221633634
33468	NC_011959	CCG	2	6	1658170	1658175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633634
33469	NC_011959	CGG	2	6	1658243	1658248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633634
33470	NC_011959	GTC	2	6	1658319	1658324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633634
33471	NC_011959	CTC	2	6	1658377	1658382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633634
33472	NC_011959	TTC	2	6	1658389	1658394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633634
33473	NC_011959	GCC	2	6	1658429	1658434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633634
33474	NC_011959	GGCT	2	8	1658436	1658443	0 %	25 %	50 %	25 %	221633634
33475	NC_011959	ACG	2	6	1658450	1658455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633634
33476	NC_011959	CCA	2	6	1658462	1658467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633634
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33478	NC_011959	GCC	2	6	1658555	1658560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633634
33479	NC_011959	C	6	6	1658610	1658615	0 %	0 %	0 %	100 %	221633634
33480	NC_011959	CGCT	2	8	1658664	1658671	0 %	25 %	25 %	50 %	221633635
33481	NC_011959	GTG	2	6	1658751	1658756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633635
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33484	NC_011959	AGC	2	6	1658812	1658817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633635
33485	NC_011959	GCC	2	6	1658866	1658871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633635
33486	NC_011959	CAC	2	6	1658892	1658897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633635
33487	NC_011959	GAT	2	6	1658943	1658948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633635
33488	NC_011959	GAT	2	6	1658954	1658959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633635
33489	NC_011959	CGGGCG	2	12	1658961	1658972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633635
33490	NC_011959	GA	3	6	1659022	1659027	50 %	0 %	50 %	0 %	221633635
33491	NC_011959	CCA	2	6	1659057	1659062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633635
33492	NC_011959	GCA	2	6	1659176	1659181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633635
33493	NC_011959	GAC	2	6	1659196	1659201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633635
33494	NC_011959	CAG	2	6	1659228	1659233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633635
33495	NC_011959	TCG	2	6	1659332	1659337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633636
33496	NC_011959	GCC	2	6	1659389	1659394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633636
33497	NC_011959	ACC	2	6	1659404	1659409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633636
33498	NC_011959	ACC	2	6	1659455	1659460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633636
33499	NC_011959	CACG	2	8	1659476	1659483	25 %	0 %	25 %	50 %	221633636
33500	NC_011959	TCC	2	6	1659491	1659496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633636

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