MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 40761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29001	NC_011959	CTGA	2	8	1448292	1448299	25 %	25 %	25 %	25 %	221633438
29002	NC_011959	GTA	2	6	1448328	1448333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633438
29003	NC_011959	CCG	2	6	1448357	1448362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633438
29004	NC_011959	TCG	2	6	1448391	1448396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633438
29005	NC_011959	CCA	2	6	1448417	1448422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633438
29006	NC_011959	GCA	2	6	1448480	1448485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633438
29007	NC_011959	CGC	2	6	1448542	1448547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633438
29008	NC_011959	ACC	2	6	1448560	1448565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633438
29009	NC_011959	GCG	2	6	1448577	1448582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633438
29010	NC_011959	CTC	2	6	1448613	1448618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633438
29011	NC_011959	GCCA	2	8	1448619	1448626	25 %	0 %	25 %	50 %	221633438
29012	NC_011959	CGA	2	6	1448666	1448671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633438
29013	NC_011959	CGA	2	6	1448720	1448725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633438
29014	NC_011959	CGAT	2	8	1448761	1448768	25 %	25 %	25 %	25 %	221633438
29015	NC_011959	ACGA	2	8	1448831	1448838	50 %	0 %	25 %	25 %	221633439
29016	NC_011959	TGA	2	6	1448843	1448848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633439
29017	NC_011959	ACC	2	6	1448890	1448895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633439
29018	NC_011959	ACC	2	6	1448946	1448951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633439
29019	NC_011959	GTC	2	6	1448974	1448979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633439
29020	NC_011959	GAG	2	6	1448985	1448990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633439
29021	NC_011959	TTC	2	6	1449048	1449053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633439
29022	NC_011959	CGA	2	6	1449059	1449064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633439
29023	NC_011959	CTC	2	6	1449162	1449167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633439
29024	NC_011959	CTC	2	6	1449267	1449272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633439
29025	NC_011959	TCT	2	6	1449293	1449298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633439
29026	NC_011959	CTG	2	6	1449360	1449365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633439
29027	NC_011959	CG	3	6	1449469	1449474	0 %	0 %	50 %	50 %	221633439
29028	NC_011959	CAG	2	6	1449491	1449496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633439
29029	NC_011959	ACG	2	6	1449526	1449531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633439
29030	NC_011959	CGAT	2	8	1449548	1449555	25 %	25 %	25 %	25 %	221633439
29031	NC_011959	ACCG	2	8	1449660	1449667	25 %	0 %	25 %	50 %	221633439
29032	NC_011959	CGAC	2	8	1449700	1449707	25 %	0 %	25 %	50 %	221633439
29033	NC_011959	ATCGAT	2	12	1449717	1449728	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	221633439
29034	NC_011959	CCA	2	6	1449734	1449739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633439
29035	NC_011959	CGCT	2	8	1449823	1449830	0 %	25 %	25 %	50 %	221633439
29036	NC_011959	CTT	2	6	1449914	1449919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633440
29037	NC_011959	CTC	3	9	1449938	1449946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633440
29038	NC_011959	AGC	2	6	1449956	1449961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633440
29039	NC_011959	TTC	2	6	1449992	1449997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633440
29040	NC_011959	TCG	2	6	1450011	1450016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633440
29041	NC_011959	GCC	2	6	1450057	1450062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633440
29042	NC_011959	CAC	2	6	1450099	1450104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633440
29043	NC_011959	GC	3	6	1450107	1450112	0 %	0 %	50 %	50 %	221633440
29044	NC_011959	CGA	2	6	1450135	1450140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633440
29045	NC_011959	CCA	2	6	1450171	1450176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633440
29046	NC_011959	CCT	2	6	1450612	1450617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633441
29047	NC_011959	GCGAT	2	10	1450668	1450677	20 %	20 %	40 %	20 %	221633441
29048	NC_011959	GGCT	2	8	1450691	1450698	0 %	25 %	50 %	25 %	221633441
29049	NC_011959	TCC	2	6	1450707	1450712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633441
29050	NC_011959	CTC	2	6	1450715	1450720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633441
29051	NC_011959	GCT	2	6	1450832	1450837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633441
29052	NC_011959	CGA	2	6	1450885	1450890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633441
29053	NC_011959	CGA	2	6	1450893	1450898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633441
29054	NC_011959	GCC	2	6	1450979	1450984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633441
29055	NC_011959	TGC	2	6	1451052	1451057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633441
29056	NC_011959	CACG	2	8	1451071	1451078	25 %	0 %	25 %	50 %	221633441
29057	NC_011959	CGA	2	6	1451167	1451172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633441
29058	NC_011959	CGA	2	6	1451188	1451193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633441
29059	NC_011959	TC	3	6	1451228	1451233	0 %	50 %	0 %	50 %	221633441
29060	NC_011959	CGA	2	6	1451299	1451304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633441
29061	NC_011959	GGT	2	6	1451305	1451310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633441
29062	NC_011959	GCA	2	6	1451336	1451341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633441
29063	NC_011959	GAC	2	6	1451345	1451350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633441
29064	NC_011959	CGGCG	2	10	1451428	1451437	0 %	0 %	60 %	40 %	221633441
29065	NC_011959	TGGA	2	8	1451469	1451476	25 %	25 %	50 %	0 %	221633441
29066	NC_011959	GGC	2	6	1451484	1451489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633441
29067	NC_011959	GCA	2	6	1451504	1451509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633441
29068	NC_011959	CG	3	6	1451510	1451515	0 %	0 %	50 %	50 %	221633441
29069	NC_011959	CAG	2	6	1451531	1451536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633441
29070	NC_011959	CTTC	2	8	1451548	1451555	0 %	50 %	0 %	50 %	221633441
29071	NC_011959	CGC	2	6	1451639	1451644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633442
29072	NC_011959	CCTC	2	8	1451678	1451685	0 %	25 %	0 %	75 %	221633442
29073	NC_011959	GCT	2	6	1451690	1451695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633442
29074	NC_011959	GCG	2	6	1451727	1451732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633442
29075	NC_011959	CAT	2	6	1451735	1451740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633442
29076	NC_011959	GAGC	2	8	1451772	1451779	25 %	0 %	50 %	25 %	221633442
29077	NC_011959	CGA	2	6	1451792	1451797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633442
29078	NC_011959	CGC	2	6	1451858	1451863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633442
29079	NC_011959	CGA	2	6	1451933	1451938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633442
29080	NC_011959	CGA	2	6	1451948	1451953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633442
29081	NC_011959	CGA	2	6	1451978	1451983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633442
29082	NC_011959	GC	3	6	1451988	1451993	0 %	0 %	50 %	50 %	221633442
29083	NC_011959	GT	3	6	1452056	1452061	0 %	50 %	50 %	0 %	221633442
29084	NC_011959	CGCTC	2	10	1452074	1452083	0 %	20 %	20 %	60 %	221633442
29085	NC_011959	GGC	2	6	1452089	1452094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633442
29086	NC_011959	GCC	2	6	1452165	1452170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633442
29087	NC_011959	TGC	2	6	1452199	1452204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633442
29088	NC_011959	TAC	2	6	1452419	1452424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633443
29089	NC_011959	CAT	2	6	1452430	1452435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633443
29090	NC_011959	AAG	2	6	1452443	1452448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633443
29091	NC_011959	CAG	2	6	1452492	1452497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633443
29092	NC_011959	GAC	2	6	1452513	1452518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633443
29093	NC_011959	AAG	2	6	1452556	1452561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633443
29094	NC_011959	AGC	2	6	1452611	1452616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633443
29095	NC_011959	CAG	2	6	1452617	1452622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633443
29096	NC_011959	ACGC	2	8	1452732	1452739	25 %	0 %	25 %	50 %	221633443
29097	NC_011959	GAG	2	6	1452769	1452774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633443
29098	NC_011959	CGAG	2	8	1452794	1452801	25 %	0 %	50 %	25 %	221633443
29099	NC_011959	CGA	2	6	1452921	1452926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633443
29100	NC_011959	CTG	2	6	1452937	1452942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633443
29101	NC_011959	ATC	2	6	1452977	1452982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633443
29102	NC_011959	CAT	2	6	1453000	1453005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633443
29103	NC_011959	CAT	2	6	1453012	1453017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633443
29104	NC_011959	GTG	2	6	1453121	1453126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633443
29105	NC_011959	GAT	2	6	1453150	1453155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633443
29106	NC_011959	TCA	2	6	1453341	1453346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633444
29107	NC_011959	GAT	2	6	1453423	1453428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633444
29108	NC_011959	GGC	2	6	1453435	1453440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633444
29109	NC_011959	TCG	2	6	1453464	1453469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633444
29110	NC_011959	CG	3	6	1453468	1453473	0 %	0 %	50 %	50 %	221633444
29111	NC_011959	C	6	6	1453475	1453480	0 %	0 %	0 %	100 %	221633444
29112	NC_011959	GTC	2	6	1453506	1453511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633444
29113	NC_011959	AGC	2	6	1453580	1453585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633444
29114	NC_011959	GTC	2	6	1453586	1453591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633444
29115	NC_011959	ACC	2	6	1453618	1453623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633444
29116	NC_011959	GCT	2	6	1453659	1453664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633444
29117	NC_011959	CGG	2	6	1453831	1453836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633444
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29229	NC_011959	GA	3	6	1459607	1459612	50 %	0 %	50 %	0 %	221633449
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29231	NC_011959	GCGA	2	8	1459647	1459654	25 %	0 %	50 %	25 %	221633449
29232	NC_011959	ACAGAT	2	12	1459664	1459675	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	221633449
29233	NC_011959	GCA	2	6	1459733	1459738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633449
29234	NC_011959	GCA	2	6	1459744	1459749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633449
29235	NC_011959	CGC	2	6	1459883	1459888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633449
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29238	NC_011959	GCA	2	6	1460132	1460137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633449
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29336	NC_011959	GC	4	8	1464554	1464561	0 %	0 %	50 %	50 %	221633455
29337	NC_011959	CCGAG	2	10	1464680	1464689	20 %	0 %	40 %	40 %	221633455
29338	NC_011959	ACCGA	2	10	1464700	1464709	40 %	0 %	20 %	40 %	221633455
29339	NC_011959	ATCG	3	12	1464944	1464955	25 %	25 %	25 %	25 %	221633455
29340	NC_011959	CTCGCG	2	12	1465014	1465025	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	221633455
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29342	NC_011959	ATCG	2	8	1465061	1465068	25 %	25 %	25 %	25 %	221633455
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29347	NC_011959	GCT	3	9	1465422	1465430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633456
29348	NC_011959	GAT	2	6	1465438	1465443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633456
29349	NC_011959	C	6	6	1465494	1465499	0 %	0 %	0 %	100 %	221633456
29350	NC_011959	GAT	2	6	1465504	1465509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633456
29351	NC_011959	TGA	2	6	1465515	1465520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633456
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