MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 40761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28501	NC_011959	CAGCG	2	10	1424454	1424463	20 %	0 %	40 %	40 %	221633411
28502	NC_011959	TC	3	6	1424484	1424489	0 %	50 %	0 %	50 %	221633411
28503	NC_011959	CTG	2	6	1424519	1424524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633411
28504	NC_011959	GGC	2	6	1424553	1424558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633411
28505	NC_011959	GCT	2	6	1424628	1424633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633411
28506	NC_011959	TCG	2	6	1424636	1424641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633411
28507	NC_011959	CCT	2	6	1424643	1424648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633411
28508	NC_011959	ATG	2	6	1424683	1424688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633411
28509	NC_011959	TCG	2	6	1424750	1424755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633411
28510	NC_011959	GGA	2	6	1424761	1424766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633411
28511	NC_011959	GCT	2	6	1424773	1424778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633411
28512	NC_011959	CCT	2	6	1424805	1424810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633411
28513	NC_011959	CTG	2	6	1424825	1424830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633411
28514	NC_011959	CTG	2	6	1424869	1424874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633411
28515	NC_011959	TTC	2	6	1424875	1424880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633411
28516	NC_011959	GCT	2	6	1425070	1425075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633412
28517	NC_011959	CGT	2	6	1425104	1425109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633412
28518	NC_011959	CGG	2	6	1425222	1425227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633412
28519	NC_011959	TCC	2	6	1425321	1425326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633412
28520	NC_011959	GCCG	2	8	1425390	1425397	0 %	0 %	50 %	50 %	221633412
28521	NC_011959	CGC	2	6	1425398	1425403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633412
28522	NC_011959	GAA	2	6	1425416	1425421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633412
28523	NC_011959	TCA	2	6	1425451	1425456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633412
28524	NC_011959	CAT	2	6	1425512	1425517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633412
28525	NC_011959	TGC	2	6	1425754	1425759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633413
28526	NC_011959	GCCAG	2	10	1425794	1425803	20 %	0 %	40 %	40 %	221633413
28527	NC_011959	AGC	2	6	1425847	1425852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633413
28528	NC_011959	TCG	2	6	1425883	1425888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633413
28529	NC_011959	CTC	2	6	1425996	1426001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633413
28530	NC_011959	TCC	2	6	1426006	1426011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633413
28531	NC_011959	CT	3	6	1426066	1426071	0 %	50 %	0 %	50 %	221633413
28532	NC_011959	TGGC	2	8	1426084	1426091	0 %	25 %	50 %	25 %	221633413
28533	NC_011959	CGC	2	6	1426134	1426139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633413
28534	NC_011959	AGCC	2	8	1426177	1426184	25 %	0 %	25 %	50 %	221633413
28535	NC_011959	GGC	2	6	1426208	1426213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633413
28536	NC_011959	GCG	2	6	1426241	1426246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633413
28537	NC_011959	CGC	2	6	1426337	1426342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633413
28538	NC_011959	CAGC	2	8	1426405	1426412	25 %	0 %	25 %	50 %	221633413
28539	NC_011959	GCT	2	6	1426469	1426474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633413
28540	NC_011959	ACT	2	6	1426498	1426503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633413
28541	NC_011959	CAT	2	6	1426520	1426525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633413
28542	NC_011959	GGA	2	6	1426551	1426556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633413
28543	NC_011959	GCT	2	6	1426601	1426606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633413
28544	NC_011959	CCATG	2	10	1426637	1426646	20 %	20 %	20 %	40 %	221633413
28545	NC_011959	TCG	2	6	1426660	1426665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633413
28546	NC_011959	TCG	2	6	1426678	1426683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633413
28547	NC_011959	TTG	2	6	1426695	1426700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221633413
28548	NC_011959	CTC	2	6	1426725	1426730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633413
28549	NC_011959	CTT	2	6	1426776	1426781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633413
28550	NC_011959	TTC	2	6	1426782	1426787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633413
28551	NC_011959	TGG	2	6	1426862	1426867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633413
28552	NC_011959	CGC	2	6	1426889	1426894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633413
28553	NC_011959	CTC	2	6	1426902	1426907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633413
28554	NC_011959	CGA	3	9	1426926	1426934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633413
28555	NC_011959	CGAT	2	8	1427064	1427071	25 %	25 %	25 %	25 %	221633414
28556	NC_011959	CAGCTC	2	12	1427094	1427105	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	221633414
28557	NC_011959	GCC	2	6	1427161	1427166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633414
28558	NC_011959	GCT	2	6	1427255	1427260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633414
28559	NC_011959	CTC	2	6	1427322	1427327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633414
28560	NC_011959	GCT	2	6	1427348	1427353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633414
28561	NC_011959	GC	4	8	1427522	1427529	0 %	0 %	50 %	50 %	221633414
28562	NC_011959	CGC	2	6	1427549	1427554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633414
28563	NC_011959	GATCT	2	10	1427598	1427607	20 %	40 %	20 %	20 %	221633414
28564	NC_011959	TC	3	6	1427660	1427665	0 %	50 %	0 %	50 %	221633414
28565	NC_011959	TCCG	2	8	1427749	1427756	0 %	25 %	25 %	50 %	221633414
28566	NC_011959	CGA	3	9	1427759	1427767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633414
28567	NC_011959	CGT	2	6	1427768	1427773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633414
28568	NC_011959	GCT	2	6	1427857	1427862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633414
28569	NC_011959	CTCG	2	8	1427863	1427870	0 %	25 %	25 %	50 %	221633414
28570	NC_011959	ACA	2	6	1427875	1427880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221633414
28571	NC_011959	CGG	2	6	1427939	1427944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633414
28572	NC_011959	CG	4	8	1427984	1427991	0 %	0 %	50 %	50 %	221633414
28573	NC_011959	TCGA	2	8	1428027	1428034	25 %	25 %	25 %	25 %	221633414
28574	NC_011959	GAT	2	6	1428059	1428064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633414
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28576	NC_011959	CCG	2	6	1428097	1428102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633414
28577	NC_011959	CGA	2	6	1428158	1428163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633414
28578	NC_011959	CTG	2	6	1428228	1428233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633414
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28582	NC_011959	GCTC	2	8	1428509	1428516	0 %	25 %	25 %	50 %	221633415
28583	NC_011959	CGT	3	9	1428533	1428541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633415
28584	NC_011959	GCCC	2	8	1428694	1428701	0 %	0 %	25 %	75 %	221633415
28585	NC_011959	TTG	2	6	1428711	1428716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221633415
28586	NC_011959	TGG	2	6	1428730	1428735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633415
28587	NC_011959	ACG	2	6	1428804	1428809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633415
28588	NC_011959	GCG	2	6	1428824	1428829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633415
28589	NC_011959	CGC	2	6	1428838	1428843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633415
28590	NC_011959	GGT	2	6	1428902	1428907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633415
28591	NC_011959	AGG	2	6	1428910	1428915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633415
28592	NC_011959	GCG	2	6	1428917	1428922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633415
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28594	NC_011959	CG	3	6	1429026	1429031	0 %	0 %	50 %	50 %	221633415
28595	NC_011959	CGT	2	6	1429198	1429203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633416
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28597	NC_011959	CGA	2	6	1429250	1429255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633416
28598	NC_011959	CCG	2	6	1429270	1429275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633416
28599	NC_011959	AACC	2	8	1429310	1429317	50 %	0 %	0 %	50 %	221633416
28600	NC_011959	GC	3	6	1429380	1429385	0 %	0 %	50 %	50 %	221633416
28601	NC_011959	TCGA	2	8	1429440	1429447	25 %	25 %	25 %	25 %	221633416
28602	NC_011959	TCG	2	6	1429498	1429503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633416
28603	NC_011959	CGA	2	6	1429589	1429594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633416
28604	NC_011959	GGC	2	6	1429600	1429605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633416
28605	NC_011959	CTTCG	2	10	1429632	1429641	0 %	40 %	20 %	40 %	221633416
28606	NC_011959	GAC	2	6	1429644	1429649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633416
28607	NC_011959	ACG	2	6	1429710	1429715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633416
28608	NC_011959	CGA	2	6	1429718	1429723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633416
28609	NC_011959	TCC	2	6	1429735	1429740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633416
28610	NC_011959	GTC	2	6	1429767	1429772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633416
28611	NC_011959	GAC	2	6	1429861	1429866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633416
28612	NC_011959	TGC	2	6	1429877	1429882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633416
28613	NC_011959	GAGC	2	8	1429908	1429915	25 %	0 %	50 %	25 %	221633416
28614	NC_011959	GAA	2	6	1429929	1429934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633416
28615	NC_011959	GTC	2	6	1429950	1429955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633416
28616	NC_011959	GCT	2	6	1430058	1430063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633416
28617	NC_011959	CG	3	6	1430064	1430069	0 %	0 %	50 %	50 %	221633416
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28848	NC_011959	CAC	2	6	1440794	1440799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633429
28849	NC_011959	GCT	2	6	1440800	1440805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633429
28850	NC_011959	CG	5	10	1440807	1440816	0 %	0 %	50 %	50 %	221633429
28851	NC_011959	CGC	2	6	1440831	1440836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633429
28852	NC_011959	AGC	2	6	1440934	1440939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633429
28853	NC_011959	CGA	2	6	1441007	1441012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633429
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28863	NC_011959	CAG	2	6	1441409	1441414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633429
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28875	NC_011959	CG	3	6	1441784	1441789	0 %	0 %	50 %	50 %	221633430
28876	NC_011959	CG	3	6	1441813	1441818	0 %	0 %	50 %	50 %	221633430
28877	NC_011959	AAGGG	3	15	1441821	1441835	40 %	0 %	60 %	0 %	221633430
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28955	NC_011959	GAT	2	6	1446411	1446416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633436
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28958	NC_011959	TCC	2	6	1446490	1446495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633436
28959	NC_011959	TACGGA	2	12	1446526	1446537	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	221633436
28960	NC_011959	TAG	2	6	1446541	1446546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633436
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28962	NC_011959	GAT	2	6	1446648	1446653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633436
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28989	NC_011959	C	6	6	1447585	1447590	0 %	0 %	0 %	100 %	221633437
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28991	NC_011959	CCCG	2	8	1447676	1447683	0 %	0 %	25 %	75 %	221633437
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28995	NC_011959	TCGA	2	8	1448049	1448056	25 %	25 %	25 %	25 %	221633437
28996	NC_011959	CGA	2	6	1448092	1448097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633437
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28999	NC_011959	GCTCCT	2	12	1448216	1448227	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	221633438
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