MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 40761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27001	NC_011959	CGA	2	6	1350964	1350969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633340
27002	NC_011959	TCC	2	6	1350983	1350988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633340
27003	NC_011959	TCG	2	6	1351021	1351026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633340
27004	NC_011959	CGT	2	6	1351074	1351079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633340
27005	NC_011959	CG	3	6	1351084	1351089	0 %	0 %	50 %	50 %	221633340
27006	NC_011959	ATCG	2	8	1351106	1351113	25 %	25 %	25 %	25 %	221633340
27007	NC_011959	CT	3	6	1351131	1351136	0 %	50 %	0 %	50 %	221633340
27008	NC_011959	CACG	2	8	1351186	1351193	25 %	0 %	25 %	50 %	221633340
27009	NC_011959	GTC	2	6	1351194	1351199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633340
27010	NC_011959	GATC	2	8	1351243	1351250	25 %	25 %	25 %	25 %	221633340
27011	NC_011959	CGT	2	6	1351286	1351291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633340
27012	NC_011959	TGC	2	6	1351434	1351439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633341
27013	NC_011959	CAC	2	6	1351453	1351458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633341
27014	NC_011959	AG	3	6	1351467	1351472	50 %	0 %	50 %	0 %	221633341
27015	NC_011959	GAT	2	6	1351503	1351508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633341
27016	NC_011959	CTC	2	6	1351582	1351587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633342
27017	NC_011959	CGT	2	6	1351615	1351620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633342
27018	NC_011959	CT	3	6	1351663	1351668	0 %	50 %	0 %	50 %	221633342
27019	NC_011959	CCA	2	6	1351729	1351734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633342
27020	NC_011959	GGGC	2	8	1351762	1351769	0 %	0 %	75 %	25 %	221633342
27021	NC_011959	GCTG	2	8	1351811	1351818	0 %	25 %	50 %	25 %	221633342
27022	NC_011959	CGA	2	6	1351839	1351844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633342
27023	NC_011959	TCG	2	6	1351853	1351858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633342
27024	NC_011959	CTG	2	6	1351938	1351943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633343
27025	NC_011959	CGA	2	6	1351959	1351964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633343
27026	NC_011959	TCG	2	6	1351967	1351972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633343
27027	NC_011959	CTG	2	6	1352035	1352040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633343
27028	NC_011959	CCG	2	6	1352041	1352046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633343
27029	NC_011959	TCGA	2	8	1352191	1352198	25 %	25 %	25 %	25 %	221633343
27030	NC_011959	CG	3	6	1352237	1352242	0 %	0 %	50 %	50 %	221633343
27031	NC_011959	CAA	2	6	1352258	1352263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221633343
27032	NC_011959	TCG	2	6	1352294	1352299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633343
27033	NC_011959	GCGA	2	8	1352315	1352322	25 %	0 %	50 %	25 %	221633343
27034	NC_011959	AGA	2	6	1352394	1352399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633343
27035	NC_011959	TCG	2	6	1352438	1352443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633343
27036	NC_011959	GCGG	2	8	1352476	1352483	0 %	0 %	75 %	25 %	221633343
27037	NC_011959	GCC	2	6	1352545	1352550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633343
27038	NC_011959	CTC	2	6	1352620	1352625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633343
27039	NC_011959	ATC	2	6	1352635	1352640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633343
27040	NC_011959	CGT	2	6	1352718	1352723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633343
27041	NC_011959	GCG	2	6	1352726	1352731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633343
27042	NC_011959	CGC	2	6	1352742	1352747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633343
27043	NC_011959	GCA	2	6	1352768	1352773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633343
27044	NC_011959	CTG	2	6	1352865	1352870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633344
27045	NC_011959	CGG	2	6	1352882	1352887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633344
27046	NC_011959	GCT	2	6	1352888	1352893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633344
27047	NC_011959	GCT	2	6	1352966	1352971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633344
27048	NC_011959	TGA	2	6	1353023	1353028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633344
27049	NC_011959	CCAG	2	8	1353048	1353055	25 %	0 %	25 %	50 %	221633344
27050	NC_011959	GCA	2	6	1353219	1353224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633344
27051	NC_011959	GGC	2	6	1353231	1353236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633344
27052	NC_011959	GGAT	2	8	1353273	1353280	25 %	25 %	50 %	0 %	221633344
27053	NC_011959	CGC	2	6	1353324	1353329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633344
27054	NC_011959	TCG	2	6	1353337	1353342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633344
27055	NC_011959	GCG	2	6	1353427	1353432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633344
27056	NC_011959	CTC	2	6	1353507	1353512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633344
27057	NC_011959	CG	4	8	1353523	1353530	0 %	0 %	50 %	50 %	221633344
27058	NC_011959	CTG	2	6	1353650	1353655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633345
27059	NC_011959	G	6	6	1353729	1353734	0 %	0 %	100 %	0 %	221633345
27060	NC_011959	CCA	2	6	1353790	1353795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633345
27061	NC_011959	TGC	2	6	1353837	1353842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633345
27062	NC_011959	GCA	2	6	1353900	1353905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633345
27063	NC_011959	CGG	2	6	1353925	1353930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633345
27064	NC_011959	CGA	2	6	1354129	1354134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633345
27065	NC_011959	GAG	2	6	1354202	1354207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633345
27066	NC_011959	CGA	2	6	1354282	1354287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633345
27067	NC_011959	CGGTC	2	10	1354430	1354439	0 %	20 %	40 %	40 %	221633345
27068	NC_011959	GAT	2	6	1354466	1354471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633345
27069	NC_011959	GTCG	2	8	1354513	1354520	0 %	25 %	50 %	25 %	221633345
27070	NC_011959	CGA	3	9	1354543	1354551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633345
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27072	NC_011959	GTA	2	6	1354646	1354651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633345
27073	NC_011959	CGG	2	6	1354673	1354678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633345
27074	NC_011959	TCG	2	6	1354695	1354700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633345
27075	NC_011959	TGA	2	6	1354723	1354728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633345
27076	NC_011959	GAG	2	6	1354748	1354753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633345
27077	NC_011959	GCCA	2	8	1354769	1354776	25 %	0 %	25 %	50 %	221633345
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27081	NC_011959	ACG	2	6	1354860	1354865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633345
27082	NC_011959	TGCG	2	8	1354992	1354999	0 %	25 %	50 %	25 %	221633346
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27088	NC_011959	CTC	2	6	1355261	1355266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633346
27089	NC_011959	GC	3	6	1355294	1355299	0 %	0 %	50 %	50 %	221633346
27090	NC_011959	GGA	2	6	1355317	1355322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633346
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27096	NC_011959	CGA	2	6	1355500	1355505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633346
27097	NC_011959	GGTCAT	2	12	1355557	1355568	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	221633346
27098	NC_011959	CGA	2	6	1355569	1355574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633346
27099	NC_011959	CCG	2	6	1355588	1355593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633346
27100	NC_011959	CGCTCC	2	12	1355610	1355621	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	221633346
27101	NC_011959	CTT	2	6	1355652	1355657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633346
27102	NC_011959	TCA	2	6	1355689	1355694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633347
27103	NC_011959	CGCC	2	8	1355730	1355737	0 %	0 %	25 %	75 %	221633347
27104	NC_011959	GCC	2	6	1355799	1355804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633348
27105	NC_011959	GCA	2	6	1355833	1355838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633348
27106	NC_011959	CTC	2	6	1355847	1355852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633348
27107	NC_011959	GC	3	6	1355860	1355865	0 %	0 %	50 %	50 %	221633348
27108	NC_011959	CGA	3	9	1355888	1355896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633348
27109	NC_011959	TCCG	2	8	1355911	1355918	0 %	25 %	25 %	50 %	221633348
27110	NC_011959	CCA	2	6	1355972	1355977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633348
27111	NC_011959	AAG	2	6	1356043	1356048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633348
27112	NC_011959	GC	4	8	1356065	1356072	0 %	0 %	50 %	50 %	221633348
27113	NC_011959	TGC	2	6	1356162	1356167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633348
27114	NC_011959	GCTA	2	8	1356174	1356181	25 %	25 %	25 %	25 %	221633348
27115	NC_011959	GAG	2	6	1356207	1356212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633348
27116	NC_011959	GCT	2	6	1356227	1356232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633348
27117	NC_011959	CGC	2	6	1356241	1356246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633348
27118	NC_011959	GTC	2	6	1356247	1356252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633348
27119	NC_011959	CGA	2	6	1356270	1356275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633348
27120	NC_011959	CGT	2	6	1356294	1356299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633348
27121	NC_011959	ATGG	2	8	1356300	1356307	25 %	25 %	50 %	0 %	221633348
27122	NC_011959	CGA	2	6	1356311	1356316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633348
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27225	NC_011959	GCC	2	6	1362075	1362080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633352
27226	NC_011959	CAG	2	6	1362149	1362154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633352
27227	NC_011959	CGCT	2	8	1362189	1362196	0 %	25 %	25 %	50 %	221633352
27228	NC_011959	CCG	3	9	1362209	1362217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633352
27229	NC_011959	GCCG	2	8	1362240	1362247	0 %	0 %	50 %	50 %	221633352
27230	NC_011959	CGT	2	6	1362269	1362274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633352
27231	NC_011959	GCGAC	2	10	1362332	1362341	20 %	0 %	40 %	40 %	221633352
27232	NC_011959	TCG	2	6	1362373	1362378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633352
27233	NC_011959	CG	3	6	1362411	1362416	0 %	0 %	50 %	50 %	221633352
27234	NC_011959	CCG	2	6	1362452	1362457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633352
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27342	NC_011959	CGA	2	6	1366627	1366632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633354
27343	NC_011959	TCC	2	6	1366695	1366700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633354
27344	NC_011959	CG	3	6	1366714	1366719	0 %	0 %	50 %	50 %	221633354
27345	NC_011959	GAGC	2	8	1366787	1366794	25 %	0 %	50 %	25 %	221633354
27346	NC_011959	CGA	2	6	1366827	1366832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633354
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27348	NC_011959	CGA	2	6	1366868	1366873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633354
27349	NC_011959	GAG	2	6	1366874	1366879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633354
27350	NC_011959	CG	3	6	1366889	1366894	0 %	0 %	50 %	50 %	221633354
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27450	NC_011959	GC	4	8	1372061	1372068	0 %	0 %	50 %	50 %	221633362
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27454	NC_011959	CG	4	8	1372116	1372123	0 %	0 %	50 %	50 %	221633362
27455	NC_011959	CG	3	6	1372145	1372150	0 %	0 %	50 %	50 %	221633362
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27461	NC_011959	GTC	2	6	1372482	1372487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633362
27462	NC_011959	CG	3	6	1372504	1372509	0 %	0 %	50 %	50 %	221633362
27463	NC_011959	CGCTCC	2	12	1372523	1372534	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	221633362
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27465	NC_011959	TCG	2	6	1372673	1372678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633362
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