MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 40761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_011959	GAC	2	6	1300578	1300583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633290
26003	NC_011959	CAGC	2	8	1300598	1300605	25 %	0 %	25 %	50 %	221633290
26004	NC_011959	AGA	2	6	1300615	1300620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633290
26005	NC_011959	TGGG	2	8	1300683	1300690	0 %	25 %	75 %	0 %	221633290
26006	NC_011959	TCC	2	6	1300753	1300758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633290
26007	NC_011959	GAA	2	6	1300767	1300772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633290
26008	NC_011959	CG	3	6	1300866	1300871	0 %	0 %	50 %	50 %	221633290
26009	NC_011959	GAT	2	6	1300962	1300967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633290
26010	NC_011959	ATC	2	6	1300996	1301001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633290
26011	NC_011959	GCC	2	6	1301003	1301008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633291
26012	NC_011959	GAT	2	6	1301021	1301026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633291
26013	NC_011959	CGC	2	6	1301112	1301117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633291
26014	NC_011959	TCC	2	6	1301226	1301231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633291
26015	NC_011959	GCG	2	6	1301237	1301242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633291
26016	NC_011959	GCC	3	9	1301434	1301442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633292
26017	NC_011959	GAG	2	6	1301451	1301456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633292
26018	NC_011959	CG	3	6	1301480	1301485	0 %	0 %	50 %	50 %	221633292
26019	NC_011959	CGA	2	6	1301510	1301515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633292
26020	NC_011959	CGA	2	6	1301528	1301533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633292
26021	NC_011959	ATAG	2	8	1301544	1301551	50 %	25 %	25 %	0 %	221633292
26022	NC_011959	CTGG	2	8	1301609	1301616	0 %	25 %	50 %	25 %	221633292
26023	NC_011959	GAC	2	6	1301628	1301633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633292
26024	NC_011959	CAT	2	6	1301670	1301675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633292
26025	NC_011959	GTG	2	6	1301683	1301688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633292
26026	NC_011959	CGA	2	6	1301699	1301704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633292
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26028	NC_011959	TCCG	2	8	1301853	1301860	0 %	25 %	25 %	50 %	221633292
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26030	NC_011959	ACC	2	6	1301944	1301949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633292
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26032	NC_011959	GAG	2	6	1302021	1302026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633292
26033	NC_011959	TCC	2	6	1302074	1302079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633292
26034	NC_011959	GCA	2	6	1302082	1302087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633292
26035	NC_011959	GCC	2	6	1302102	1302107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633292
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26041	NC_011959	GCAC	2	8	1302449	1302456	25 %	0 %	25 %	50 %	221633293
26042	NC_011959	CGA	2	6	1302480	1302485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633293
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26044	NC_011959	TGC	2	6	1302563	1302568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633293
26045	NC_011959	TCC	2	6	1302596	1302601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633293
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26050	NC_011959	TCA	2	6	1302816	1302821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633293
26051	NC_011959	CGA	2	6	1302867	1302872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633293
26052	NC_011959	TC	3	6	1302971	1302976	0 %	50 %	0 %	50 %	221633293
26053	NC_011959	CCT	2	6	1303120	1303125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633293
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26055	NC_011959	CTCC	2	8	1303142	1303149	0 %	25 %	0 %	75 %	221633293
26056	NC_011959	TCC	2	6	1303175	1303180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633293
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26058	NC_011959	GCA	2	6	1303251	1303256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633293
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26087	NC_011959	TCG	2	6	1304479	1304484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633294
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26099	NC_011959	CCGC	2	8	1304894	1304901	0 %	0 %	25 %	75 %	221633294
26100	NC_011959	GCGA	2	8	1304909	1304916	25 %	0 %	50 %	25 %	221633294
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26102	NC_011959	GC	3	6	1305013	1305018	0 %	0 %	50 %	50 %	221633294
26103	NC_011959	ACCGGT	2	12	1305083	1305094	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	221633294
26104	NC_011959	GCT	2	6	1305840	1305845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633295
26105	NC_011959	GCG	2	6	1305846	1305851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633295
26106	NC_011959	AG	3	6	1305852	1305857	50 %	0 %	50 %	0 %	221633295
26107	NC_011959	CTG	2	6	1305897	1305902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633295
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26109	NC_011959	CG	3	6	1305953	1305958	0 %	0 %	50 %	50 %	221633295
26110	NC_011959	TTG	2	6	1306086	1306091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221633295
26111	NC_011959	TCG	2	6	1306098	1306103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633295
26112	NC_011959	GC	3	6	1306221	1306226	0 %	0 %	50 %	50 %	221633295
26113	NC_011959	TCGG	2	8	1306252	1306259	0 %	25 %	50 %	25 %	221633295
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26115	NC_011959	CCT	2	6	1306422	1306427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633295
26116	NC_011959	CTG	2	6	1306620	1306625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633295
26117	NC_011959	TAT	2	6	1306658	1306663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221633295
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26225	NC_011959	CG	3	6	1311337	1311342	0 %	0 %	50 %	50 %	221633299
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26229	NC_011959	AGC	2	6	1311493	1311498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633299
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26345	NC_011959	CGA	2	6	1317199	1317204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633306
26346	NC_011959	CTC	2	6	1317261	1317266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633306
26347	NC_011959	CCG	2	6	1317268	1317273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633306
26348	NC_011959	CGA	3	9	1317301	1317309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633306
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26350	NC_011959	CTC	2	6	1317401	1317406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633307
26351	NC_011959	GAG	2	6	1317420	1317425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633307
26352	NC_011959	TCCGAG	2	12	1317569	1317580	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	221633307
26353	NC_011959	CCA	2	6	1317599	1317604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633307
26354	NC_011959	GCA	2	6	1317628	1317633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633307
26355	NC_011959	CGT	2	6	1317653	1317658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633307
26356	NC_011959	CGA	2	6	1317690	1317695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633307
26357	NC_011959	CCA	2	6	1317742	1317747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633307
26358	NC_011959	CAGC	2	8	1317769	1317776	25 %	0 %	25 %	50 %	221633307
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26363	NC_011959	CG	3	6	1317914	1317919	0 %	0 %	50 %	50 %	221633307
26364	NC_011959	CTG	2	6	1317926	1317931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633307
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26373	NC_011959	CCGA	2	8	1318224	1318231	25 %	0 %	25 %	50 %	221633307
26374	NC_011959	CGACC	2	10	1318249	1318258	20 %	0 %	20 %	60 %	221633307
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26450	NC_011959	CGGTGG	2	12	1322197	1322208	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	221633311
26451	NC_011959	GCA	2	6	1322228	1322233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633311
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26455	NC_011959	CTCG	3	12	1322639	1322650	0 %	25 %	25 %	50 %	221633311
26456	NC_011959	TCG	2	6	1322665	1322670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633311
26457	NC_011959	GGA	3	9	1322749	1322757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633311
26458	NC_011959	CTC	2	6	1322855	1322860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633311
26459	NC_011959	CAT	2	6	1322872	1322877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633311
26460	NC_011959	ACCT	2	8	1322972	1322979	25 %	25 %	0 %	50 %	221633311
26461	NC_011959	CGAG	2	8	1323040	1323047	25 %	0 %	50 %	25 %	221633311
26462	NC_011959	CA	4	8	1323160	1323167	50 %	0 %	0 %	50 %	221633311
26463	NC_011959	GCT	2	6	1323214	1323219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633311
26464	NC_011959	TCG	2	6	1323240	1323245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633311
26465	NC_011959	TGA	2	6	1323264	1323269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633311
26466	NC_011959	GGT	2	6	1323404	1323409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633311
26467	NC_011959	CAT	2	6	1323415	1323420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633311
26468	NC_011959	ATC	2	6	1323437	1323442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633311
26469	NC_011959	CG	3	6	1323492	1323497	0 %	0 %	50 %	50 %	221633311
26470	NC_011959	CAAC	2	8	1323512	1323519	50 %	0 %	0 %	50 %	221633311
26471	NC_011959	AGC	2	6	1323527	1323532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633311
26472	NC_011959	GTC	2	6	1323587	1323592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633311
26473	NC_011959	CGGT	2	8	1323627	1323634	0 %	25 %	50 %	25 %	221633311
26474	NC_011959	CGA	3	9	1323643	1323651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633311
26475	NC_011959	TGC	2	6	1323657	1323662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633311
26476	NC_011959	CTA	2	6	1323679	1323684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633311
26477	NC_011959	TCT	2	6	1323834	1323839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633312
26478	NC_011959	T	6	6	1323848	1323853	0 %	100 %	0 %	0 %	221633312
26479	NC_011959	CTCA	2	8	1323868	1323875	25 %	25 %	0 %	50 %	221633312
26480	NC_011959	TCG	2	6	1323897	1323902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633312
26481	NC_011959	CAT	2	6	1323967	1323972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633312
26482	NC_011959	TCC	2	6	1324038	1324043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633312
26483	NC_011959	CGA	2	6	1324053	1324058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633312
26484	NC_011959	GTGCT	2	10	1324065	1324074	0 %	40 %	40 %	20 %	221633312
26485	NC_011959	CTC	2	6	1324082	1324087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633312
26486	NC_011959	CG	3	6	1324106	1324111	0 %	0 %	50 %	50 %	221633312
26487	NC_011959	CTT	2	6	1324136	1324141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633312
26488	NC_011959	GAA	2	6	1324175	1324180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633312
26489	NC_011959	CG	3	6	1324210	1324215	0 %	0 %	50 %	50 %	221633312
26490	NC_011959	CGG	2	6	1324228	1324233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633312
26491	NC_011959	CG	3	6	1324247	1324252	0 %	0 %	50 %	50 %	221633312
26492	NC_011959	GAT	2	6	1324303	1324308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633312
26493	NC_011959	GCT	2	6	1324333	1324338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633312
26494	NC_011959	CGG	2	6	1324443	1324448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633312
26495	NC_011959	GCG	2	6	1324473	1324478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633312
26496	NC_011959	CGT	2	6	1324480	1324485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633312
26497	NC_011959	ATC	2	6	1324490	1324495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633312
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26500	NC_011959	ACG	2	6	1324657	1324662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633313

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