MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 40761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_011959	CCT	2	6	1230952	1230957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633227
24502	NC_011959	CCAG	2	8	1230992	1230999	25 %	0 %	25 %	50 %	221633227
24503	NC_011959	TCA	2	6	1231011	1231016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633227
24504	NC_011959	GC	3	6	1231061	1231066	0 %	0 %	50 %	50 %	221633227
24505	NC_011959	CTGG	2	8	1231093	1231100	0 %	25 %	50 %	25 %	221633227
24506	NC_011959	AGC	2	6	1231140	1231145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633227
24507	NC_011959	ATA	2	6	1231211	1231216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221633227
24508	NC_011959	GCT	3	9	1231263	1231271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633227
24509	NC_011959	CGAT	2	8	1231290	1231297	25 %	25 %	25 %	25 %	221633227
24510	NC_011959	TCG	2	6	1231305	1231310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633227
24511	NC_011959	ACC	2	6	1231316	1231321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633227
24512	NC_011959	AAG	2	6	1231419	1231424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633227
24513	NC_011959	CTG	2	6	1231439	1231444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633227
24514	NC_011959	GGC	2	6	1231499	1231504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633227
24515	NC_011959	GAC	2	6	1231508	1231513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633227
24516	NC_011959	CTG	2	6	1231540	1231545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633227
24517	NC_011959	AGC	2	6	1231550	1231555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633227
24518	NC_011959	CG	4	8	1231557	1231564	0 %	0 %	50 %	50 %	221633227
24519	NC_011959	CGGT	2	8	1231687	1231694	0 %	25 %	50 %	25 %	221633228
24520	NC_011959	CGG	2	6	1231736	1231741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633228
24521	NC_011959	TGG	2	6	1231748	1231753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221633228
24522	NC_011959	TCG	2	6	1231813	1231818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633228
24523	NC_011959	TCG	2	6	1231833	1231838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633228
24524	NC_011959	GCTC	2	8	1231882	1231889	0 %	25 %	25 %	50 %	221633228
24525	NC_011959	GCC	2	6	1231955	1231960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633228
24526	NC_011959	TCG	2	6	1231992	1231997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633228
24527	NC_011959	CG	3	6	1232017	1232022	0 %	0 %	50 %	50 %	221633228
24528	NC_011959	CCG	2	6	1232040	1232045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633228
24529	NC_011959	TCGA	2	8	1232064	1232071	25 %	25 %	25 %	25 %	221633228
24530	NC_011959	TCGC	2	8	1232072	1232079	0 %	25 %	25 %	50 %	221633228
24531	NC_011959	TCG	2	6	1232086	1232091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633228
24532	NC_011959	GCC	2	6	1232133	1232138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633228
24533	NC_011959	CAA	2	6	1232150	1232155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221633228
24534	NC_011959	TG	3	6	1232158	1232163	0 %	50 %	50 %	0 %	221633228
24535	NC_011959	GCTCG	2	10	1232176	1232185	0 %	20 %	40 %	40 %	221633228
24536	NC_011959	GA	3	6	1232271	1232276	50 %	0 %	50 %	0 %	221633228
24537	NC_011959	TTC	2	6	1232295	1232300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633228
24538	NC_011959	GCTGTC	2	12	1232319	1232330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633228
24539	NC_011959	CCT	2	6	1232338	1232343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633228
24540	NC_011959	CGTCGG	2	12	1232354	1232365	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	221633228
24541	NC_011959	GCG	2	6	1232404	1232409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633228
24542	NC_011959	CCG	2	6	1232461	1232466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633228
24543	NC_011959	GATC	2	8	1232497	1232504	25 %	25 %	25 %	25 %	221633228
24544	NC_011959	CTG	2	6	1232538	1232543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633228
24545	NC_011959	TCC	2	6	1232562	1232567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633228
24546	NC_011959	CTCG	2	8	1232572	1232579	0 %	25 %	25 %	50 %	221633228
24547	NC_011959	TCA	2	6	1232625	1232630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633228
24548	NC_011959	TGAT	2	8	1232652	1232659	25 %	50 %	25 %	0 %	221633228
24549	NC_011959	GTC	2	6	1232676	1232681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633228
24550	NC_011959	GCT	2	6	1232683	1232688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633228
24551	NC_011959	CTG	2	6	1232726	1232731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633228
24552	NC_011959	CTGAT	2	10	1232766	1232775	20 %	40 %	20 %	20 %	221633228
24553	NC_011959	AGT	2	6	1232803	1232808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633228
24554	NC_011959	CGA	3	9	1232839	1232847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633228
24555	NC_011959	CCG	2	6	1232886	1232891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633228
24556	NC_011959	AGC	2	6	1232907	1232912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633228
24557	NC_011959	AAC	2	6	1232915	1232920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221633228
24558	NC_011959	CTG	2	6	1232935	1232940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633228
24559	NC_011959	CGA	2	6	1232967	1232972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633228
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24561	NC_011959	C	6	6	1233004	1233009	0 %	0 %	0 %	100 %	221633228
24562	NC_011959	CGG	2	6	1233012	1233017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633228
24563	NC_011959	GCC	2	6	1233025	1233030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633228
24564	NC_011959	AGG	2	6	1233130	1233135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221633229
24565	NC_011959	GC	4	8	1233160	1233167	0 %	0 %	50 %	50 %	221633229
24566	NC_011959	GCG	2	6	1233227	1233232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633229
24567	NC_011959	CCG	2	6	1233240	1233245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633229
24568	NC_011959	GAC	2	6	1233248	1233253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633229
24569	NC_011959	TCT	2	6	1233272	1233277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633229
24570	NC_011959	CTT	2	6	1233306	1233311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633229
24571	NC_011959	TAG	2	6	1233319	1233324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633229
24572	NC_011959	AGCG	2	8	1233338	1233345	25 %	0 %	50 %	25 %	221633229
24573	NC_011959	CAT	2	6	1233392	1233397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633229
24574	NC_011959	CCG	2	6	1233398	1233403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633229
24575	NC_011959	TTC	2	6	1233417	1233422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633229
24576	NC_011959	ATC	2	6	1233480	1233485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221633230
24577	NC_011959	TTC	2	6	1233525	1233530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633230
24578	NC_011959	CGA	2	6	1233533	1233538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633230
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24582	NC_011959	CGA	2	6	1233611	1233616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633230
24583	NC_011959	CAG	2	6	1233730	1233735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633230
24584	NC_011959	CAC	3	9	1233779	1233787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633230
24585	NC_011959	AGCG	2	8	1233804	1233811	25 %	0 %	50 %	25 %	221633230
24586	NC_011959	TTCGA	2	10	1233882	1233891	20 %	40 %	20 %	20 %	221633230
24587	NC_011959	GCG	2	6	1234024	1234029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633231
24588	NC_011959	CTT	2	6	1234060	1234065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221633231
24589	NC_011959	CGG	2	6	1234092	1234097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221633231
24590	NC_011959	ACC	2	6	1234149	1234154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221633231
24591	NC_011959	GCT	2	6	1234176	1234181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633231
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24597	NC_011959	CGA	2	6	1234533	1234538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221633232
24598	NC_011959	ACCG	2	8	1234543	1234550	25 %	0 %	25 %	50 %	221633232
24599	NC_011959	CCG	2	6	1234571	1234576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633232
24600	NC_011959	GAA	2	6	1234671	1234676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633232
24601	NC_011959	AAG	2	6	1234724	1234729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221633232
24602	NC_011959	TTAC	2	8	1234972	1234979	25 %	50 %	0 %	25 %	221633233
24603	NC_011959	GC	3	6	1235005	1235010	0 %	0 %	50 %	50 %	221633233
24604	NC_011959	TCG	2	6	1235025	1235030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633233
24605	NC_011959	CGAT	2	8	1235055	1235062	25 %	25 %	25 %	25 %	221633233
24606	NC_011959	GTA	2	6	1235065	1235070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221633233
24607	NC_011959	CATC	2	8	1235083	1235090	25 %	25 %	0 %	50 %	221633233
24608	NC_011959	CCG	2	6	1235128	1235133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633233
24609	NC_011959	CGCT	2	8	1235135	1235142	0 %	25 %	25 %	50 %	221633233
24610	NC_011959	GCCCC	2	10	1235170	1235179	0 %	0 %	20 %	80 %	221633233
24611	NC_011959	GCCA	2	8	1235201	1235208	25 %	0 %	25 %	50 %	221633233
24612	NC_011959	CGAT	2	8	1235217	1235224	25 %	25 %	25 %	25 %	221633233
24613	NC_011959	CCT	2	6	1235227	1235232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221633233
24614	NC_011959	CG	3	6	1235252	1235257	0 %	0 %	50 %	50 %	221633233
24615	NC_011959	TCG	2	6	1235274	1235279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221633233
24616	NC_011959	CGC	2	6	1235379	1235384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633233
24617	NC_011959	CTGC	2	8	1235473	1235480	0 %	25 %	25 %	50 %	221633233
24618	NC_011959	GCC	2	6	1235643	1235648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633233
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24731	NC_011959	GC	4	8	1240997	1241004	0 %	0 %	50 %	50 %	221633237
24732	NC_011959	CGC	2	6	1241006	1241011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221633237
24733	NC_011959	CG	3	6	1241054	1241059	0 %	0 %	50 %	50 %	221633237
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