MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 40761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_011959	GTC	3	9	820065	820073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632844
16502	NC_011959	TCA	2	6	820099	820104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632844
16503	NC_011959	TGG	2	6	820107	820112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632844
16504	NC_011959	GCT	2	6	820118	820123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632844
16505	NC_011959	GGTT	2	8	820134	820141	0 %	50 %	50 %	0 %	221632844
16506	NC_011959	GAA	2	6	820166	820171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632844
16507	NC_011959	TGA	2	6	820182	820187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632844
16508	NC_011959	GTC	2	6	820193	820198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632845
16509	NC_011959	GATC	2	8	820200	820207	25 %	25 %	25 %	25 %	221632845
16510	NC_011959	TGC	2	6	820233	820238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632845
16511	NC_011959	GACTG	2	10	820248	820257	20 %	20 %	40 %	20 %	221632845
16512	NC_011959	TC	3	6	820307	820312	0 %	50 %	0 %	50 %	221632845
16513	NC_011959	CT	3	6	820334	820339	0 %	50 %	0 %	50 %	221632845
16514	NC_011959	CT	3	6	820466	820471	0 %	50 %	0 %	50 %	221632845
16515	NC_011959	GAT	2	6	820473	820478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632845
16516	NC_011959	GC	3	6	820481	820486	0 %	0 %	50 %	50 %	221632845
16517	NC_011959	CTG	2	6	820564	820569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632845
16518	NC_011959	TTG	2	6	820646	820651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632845
16519	NC_011959	CGG	2	6	820736	820741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632845
16520	NC_011959	TGGCA	2	10	820743	820752	20 %	20 %	40 %	20 %	221632845
16521	NC_011959	GTTGT	2	10	820762	820771	0 %	60 %	40 %	0 %	221632845
16522	NC_011959	GCG	2	6	820843	820848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632845
16523	NC_011959	CTG	2	6	820865	820870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632845
16524	NC_011959	TCG	2	6	820871	820876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632845
16525	NC_011959	GCC	2	6	820891	820896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632845
16526	NC_011959	TGG	2	6	820909	820914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632845
16527	NC_011959	CTT	2	6	820939	820944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632845
16528	NC_011959	CG	3	6	820967	820972	0 %	0 %	50 %	50 %	221632845
16529	NC_011959	GCT	2	6	820998	821003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632845
16530	NC_011959	CTGG	2	8	821035	821042	0 %	25 %	50 %	25 %	221632845
16531	NC_011959	TCT	2	6	821049	821054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632845
16532	NC_011959	TCT	2	6	821064	821069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632845
16533	NC_011959	G	6	6	821124	821129	0 %	0 %	100 %	0 %	221632845
16534	NC_011959	CA	3	6	821279	821284	50 %	0 %	0 %	50 %	221632845
16535	NC_011959	TCC	2	6	821327	821332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632845
16536	NC_011959	GC	3	6	821342	821347	0 %	0 %	50 %	50 %	221632845
16537	NC_011959	CTGG	2	8	821484	821491	0 %	25 %	50 %	25 %	221632845
16538	NC_011959	GGGC	2	8	821579	821586	0 %	0 %	75 %	25 %	221632846
16539	NC_011959	GCT	2	6	821613	821618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632846
16540	NC_011959	TTC	2	6	821701	821706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632846
16541	NC_011959	GCT	2	6	821817	821822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632846
16542	NC_011959	TCGG	2	8	821830	821837	0 %	25 %	50 %	25 %	221632846
16543	NC_011959	TACC	2	8	821838	821845	25 %	25 %	0 %	50 %	221632846
16544	NC_011959	CTG	2	6	821848	821853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632846
16545	NC_011959	ATCC	2	8	821923	821930	25 %	25 %	0 %	50 %	221632846
16546	NC_011959	GGA	2	6	821937	821942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632846
16547	NC_011959	ACG	2	6	821984	821989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632846
16548	NC_011959	CG	3	6	822057	822062	0 %	0 %	50 %	50 %	221632846
16549	NC_011959	CGT	2	6	822108	822113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632846
16550	NC_011959	ACGA	2	8	822278	822285	50 %	0 %	25 %	25 %	221632846
16551	NC_011959	GA	3	6	822312	822317	50 %	0 %	50 %	0 %	221632846
16552	NC_011959	GAC	2	6	822364	822369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632846
16553	NC_011959	GC	4	8	822400	822407	0 %	0 %	50 %	50 %	221632846
16554	NC_011959	TTGG	2	8	822413	822420	0 %	50 %	50 %	0 %	221632846
16555	NC_011959	GGA	2	6	822438	822443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632846
16556	NC_011959	ACT	2	6	822464	822469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632846
16557	NC_011959	CTCG	2	8	822481	822488	0 %	25 %	25 %	50 %	221632846
16558	NC_011959	GCT	3	9	822490	822498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632846
16559	NC_011959	ATGA	2	8	822503	822510	50 %	25 %	25 %	0 %	221632846
16560	NC_011959	CTC	2	6	822557	822562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632847
16561	NC_011959	GCTC	2	8	822571	822578	0 %	25 %	25 %	50 %	221632847
16562	NC_011959	CAT	2	6	822628	822633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632847
16563	NC_011959	CGT	2	6	822646	822651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632847
16564	NC_011959	CTT	2	6	822665	822670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632847
16565	NC_011959	TCCGT	2	10	822689	822698	0 %	40 %	20 %	40 %	221632847
16566	NC_011959	TGGG	2	8	822723	822730	0 %	25 %	75 %	0 %	221632847
16567	NC_011959	CAC	2	6	822739	822744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632847
16568	NC_011959	CTG	2	6	822761	822766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632847
16569	NC_011959	TCG	2	6	822796	822801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632847
16570	NC_011959	CGA	2	6	822837	822842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632847
16571	NC_011959	CAG	2	6	822924	822929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632847
16572	NC_011959	TCAT	2	8	822951	822958	25 %	50 %	0 %	25 %	221632847
16573	NC_011959	TCG	2	6	822960	822965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632847
16574	NC_011959	TGT	2	6	822979	822984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632847
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16576	NC_011959	CCAAC	2	10	823117	823126	40 %	0 %	0 %	60 %	221632847
16577	NC_011959	TGGC	2	8	823160	823167	0 %	25 %	50 %	25 %	221632847
16578	NC_011959	CCG	2	6	823219	823224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632847
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16580	NC_011959	CGA	2	6	823257	823262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632847
16581	NC_011959	CGA	2	6	823281	823286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632847
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16585	NC_011959	CGG	2	6	823488	823493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632847
16586	NC_011959	CGAA	2	8	823501	823508	50 %	0 %	25 %	25 %	221632847
16587	NC_011959	GCT	2	6	823513	823518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632847
16588	NC_011959	GTC	2	6	823580	823585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632847
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16591	NC_011959	GAC	2	6	823879	823884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632847
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16593	NC_011959	GCC	2	6	824075	824080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632848
16594	NC_011959	GTT	2	6	824089	824094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632848
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16598	NC_011959	GCTC	2	8	824277	824284	0 %	25 %	25 %	50 %	221632848
16599	NC_011959	C	6	6	824291	824296	0 %	0 %	0 %	100 %	221632848
16600	NC_011959	GCTGT	2	10	824408	824417	0 %	40 %	40 %	20 %	221632848
16601	NC_011959	TC	3	6	824423	824428	0 %	50 %	0 %	50 %	221632848
16602	NC_011959	TCG	2	6	824447	824452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632848
16603	NC_011959	CTC	2	6	824503	824508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632848
16604	NC_011959	GA	3	6	824525	824530	50 %	0 %	50 %	0 %	221632848
16605	NC_011959	ATC	2	6	824551	824556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632848
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16607	NC_011959	GTC	2	6	824638	824643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632848
16608	NC_011959	ATCGC	2	10	824653	824662	20 %	20 %	20 %	40 %	221632848
16609	NC_011959	ATCG	2	8	824680	824687	25 %	25 %	25 %	25 %	221632848
16610	NC_011959	AGC	2	6	824739	824744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632848
16611	NC_011959	GC	4	8	824761	824768	0 %	0 %	50 %	50 %	221632848
16612	NC_011959	CTG	2	6	824824	824829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632848
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16615	NC_011959	ACT	2	6	825003	825008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632848
16616	NC_011959	CG	3	6	825085	825090	0 %	0 %	50 %	50 %	221632849
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16618	NC_011959	TCT	2	6	825174	825179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632849
16619	NC_011959	GTC	2	6	825288	825293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632849
16620	NC_011959	TCC	2	6	825361	825366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632849
16621	NC_011959	TCGTT	2	10	825394	825403	0 %	60 %	20 %	20 %	221632849
16622	NC_011959	TGC	2	6	825427	825432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632849
16623	NC_011959	TCA	2	6	825448	825453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632849
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16629	NC_011959	CGGT	2	8	825619	825626	0 %	25 %	50 %	25 %	221632849
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16654	NC_011959	TCC	2	6	826628	826633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632850
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16657	NC_011959	CCAG	2	8	826729	826736	25 %	0 %	25 %	50 %	221632850
16658	NC_011959	TTCGC	2	10	826820	826829	0 %	40 %	20 %	40 %	221632850
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16738	NC_011959	TGA	2	6	831464	831469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632856
16739	NC_011959	GCT	2	6	831558	831563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632856
16740	NC_011959	TCGC	2	8	831571	831578	0 %	25 %	25 %	50 %	221632856
16741	NC_011959	TTCT	2	8	831583	831590	0 %	75 %	0 %	25 %	221632856
16742	NC_011959	TGGT	2	8	831595	831602	0 %	50 %	50 %	0 %	221632856
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16751	NC_011959	TCG	2	6	832031	832036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632856
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16858	NC_011959	TGCCGA	2	12	837390	837401	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	221632859
16859	NC_011959	GATC	2	8	837495	837502	25 %	25 %	25 %	25 %	221632859
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16978	NC_011959	TTC	2	6	844557	844562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632866
16979	NC_011959	CGT	2	6	844675	844680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632866
16980	NC_011959	ACA	2	6	844800	844805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632866
16981	NC_011959	GC	3	6	844864	844869	0 %	0 %	50 %	50 %	221632866
16982	NC_011959	ATCG	2	8	844897	844904	25 %	25 %	25 %	25 %	221632866
16983	NC_011959	CG	3	6	844922	844927	0 %	0 %	50 %	50 %	221632866
16984	NC_011959	GATC	2	8	844942	844949	25 %	25 %	25 %	25 %	221632866
16985	NC_011959	CGAG	2	8	845025	845032	25 %	0 %	50 %	25 %	221632867
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16987	NC_011959	GCA	2	6	845041	845046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632867
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