MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 40761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_011959	GGAG	2	8	695063	695070	25 %	0 %	75 %	0 %	221632715
14002	NC_011959	CGT	2	6	695113	695118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632715
14003	NC_011959	TGG	2	6	695184	695189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632715
14004	NC_011959	CGC	2	6	695287	695292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632715
14005	NC_011959	GCC	2	6	695314	695319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632715
14006	NC_011959	CGA	2	6	695334	695339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632715
14007	NC_011959	GCT	2	6	695340	695345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632715
14008	NC_011959	GAT	2	6	695348	695353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632715
14009	NC_011959	CG	3	6	695368	695373	0 %	0 %	50 %	50 %	221632715
14010	NC_011959	TGC	2	6	695417	695422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632715
14011	NC_011959	GTG	2	6	695551	695556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632716
14012	NC_011959	TCG	2	6	695612	695617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632716
14013	NC_011959	GCG	2	6	695618	695623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632716
14014	NC_011959	GTTG	2	8	695676	695683	0 %	50 %	50 %	0 %	221632716
14015	NC_011959	CGA	2	6	695694	695699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632716
14016	NC_011959	GGCG	2	8	695717	695724	0 %	0 %	75 %	25 %	221632716
14017	NC_011959	TGG	2	6	695729	695734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632716
14018	NC_011959	CCGA	2	8	695735	695742	25 %	0 %	25 %	50 %	221632716
14019	NC_011959	GGT	2	6	695779	695784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632716
14020	NC_011959	GCTG	2	8	695860	695867	0 %	25 %	50 %	25 %	221632716
14021	NC_011959	GTC	2	6	695911	695916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632716
14022	NC_011959	TG	3	6	695917	695922	0 %	50 %	50 %	0 %	221632716
14023	NC_011959	GAG	2	6	695972	695977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632716
14024	NC_011959	CTC	2	6	695992	695997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632716
14025	NC_011959	AGG	2	6	696017	696022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632716
14026	NC_011959	TGG	2	6	696053	696058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632716
14027	NC_011959	GGCTG	2	10	696084	696093	0 %	20 %	60 %	20 %	221632716
14028	NC_011959	TCG	2	6	696263	696268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632716
14029	NC_011959	GCT	2	6	696277	696282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632716
14030	NC_011959	TCC	2	6	696314	696319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632716
14031	NC_011959	AGCG	2	8	696320	696327	25 %	0 %	50 %	25 %	221632716
14032	NC_011959	GCTC	2	8	696338	696345	0 %	25 %	25 %	50 %	221632716
14033	NC_011959	TCG	2	6	696425	696430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632716
14034	NC_011959	ATC	2	6	696505	696510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632717
14035	NC_011959	CGA	2	6	696544	696549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632717
14036	NC_011959	GAC	2	6	696554	696559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632717
14037	NC_011959	ATC	2	6	696564	696569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632717
14038	NC_011959	CGG	2	6	696586	696591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632717
14039	NC_011959	GCC	2	6	696630	696635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632717
14040	NC_011959	CCG	2	6	696657	696662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632717
14041	NC_011959	CTT	2	6	696683	696688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632717
14042	NC_011959	GTC	2	6	696714	696719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632717
14043	NC_011959	CGA	2	6	696730	696735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632717
14044	NC_011959	CCG	2	6	696768	696773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632717
14045	NC_011959	CCT	2	6	696778	696783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632717
14046	NC_011959	AGA	2	6	696789	696794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632717
14047	NC_011959	GAT	2	6	696803	696808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632717
14048	NC_011959	TGA	2	6	696823	696828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632717
14049	NC_011959	CCTTC	2	10	696901	696910	0 %	40 %	0 %	60 %	221632717
14050	NC_011959	CAA	2	6	696911	696916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632717
14051	NC_011959	GTC	2	6	696937	696942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632717
14052	NC_011959	CTT	2	6	696946	696951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632717
14053	NC_011959	GCC	2	6	696962	696967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632717
14054	NC_011959	ACG	2	6	697041	697046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632717
14055	NC_011959	CG	3	6	697045	697050	0 %	0 %	50 %	50 %	221632717
14056	NC_011959	GCT	2	6	697072	697077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632717
14057	NC_011959	AGCCG	2	10	697127	697136	20 %	0 %	40 %	40 %	221632717
14058	NC_011959	TGG	2	6	697162	697167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632717
14059	NC_011959	GACC	2	8	697196	697203	25 %	0 %	25 %	50 %	221632717
14060	NC_011959	CGA	2	6	697279	697284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632717
14061	NC_011959	GAC	2	6	697350	697355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632717
14062	NC_011959	TGA	2	6	697447	697452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632717
14063	NC_011959	GCG	2	6	697482	697487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632717
14064	NC_011959	GAA	2	6	697520	697525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632717
14065	NC_011959	CAC	2	6	697553	697558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632717
14066	NC_011959	GACC	2	8	697561	697568	25 %	0 %	25 %	50 %	221632717
14067	NC_011959	GCC	2	6	697590	697595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632717
14068	NC_011959	ACG	2	6	697644	697649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632717
14069	NC_011959	CAGC	2	8	697664	697671	25 %	0 %	25 %	50 %	221632717
14070	NC_011959	AAG	2	6	697683	697688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632717
14071	NC_011959	GAT	2	6	697781	697786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632717
14072	NC_011959	GGAT	2	8	697795	697802	25 %	25 %	50 %	0 %	221632717
14073	NC_011959	GAG	2	6	697862	697867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632717
14074	NC_011959	GTC	2	6	697979	697984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632717
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14076	NC_011959	CTG	2	6	698032	698037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632717
14077	NC_011959	CG	3	6	698064	698069	0 %	0 %	50 %	50 %	221632717
14078	NC_011959	GACC	2	8	698101	698108	25 %	0 %	25 %	50 %	221632717
14079	NC_011959	TGA	2	6	698128	698133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632717
14080	NC_011959	AGACCG	2	12	698157	698168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632717
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14083	NC_011959	GCTC	2	8	698217	698224	0 %	25 %	25 %	50 %	221632717
14084	NC_011959	CCG	2	6	698245	698250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632717
14085	NC_011959	TCGC	2	8	698260	698267	0 %	25 %	25 %	50 %	221632717
14086	NC_011959	CGA	2	6	698317	698322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632717
14087	NC_011959	GTC	2	6	698337	698342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632717
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14089	NC_011959	CGA	2	6	698383	698388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632717
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14091	NC_011959	TCA	2	6	698466	698471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632717
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14094	NC_011959	CGA	2	6	698855	698860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632718
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14100	NC_011959	AAC	2	6	699205	699210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632719
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14102	NC_011959	GT	3	6	699255	699260	0 %	50 %	50 %	0 %	221632719
14103	NC_011959	GAA	2	6	699282	699287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632719
14104	NC_011959	CGTGAG	2	12	699309	699320	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	221632719
14105	NC_011959	GTA	2	6	699348	699353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632719
14106	NC_011959	GCC	2	6	699357	699362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632719
14107	NC_011959	AG	3	6	699368	699373	50 %	0 %	50 %	0 %	221632719
14108	NC_011959	GAG	2	6	699393	699398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632719
14109	NC_011959	GGAGA	2	10	699465	699474	40 %	0 %	60 %	0 %	221632719
14110	NC_011959	CG	3	6	699518	699523	0 %	0 %	50 %	50 %	221632719
14111	NC_011959	G	6	6	699528	699533	0 %	0 %	100 %	0 %	221632719
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14115	NC_011959	TGCGCC	2	12	699667	699678	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	221632719
14116	NC_011959	CTC	2	6	699770	699775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632720
14117	NC_011959	CCT	2	6	699788	699793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632720
14118	NC_011959	GAA	2	6	699834	699839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632720
14119	NC_011959	CGA	2	6	699860	699865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632720
14120	NC_011959	CCGTG	2	10	699893	699902	0 %	20 %	40 %	40 %	221632720
14121	NC_011959	ATC	2	6	699946	699951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632720
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14123	NC_011959	GTT	2	6	700013	700018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632720
14124	NC_011959	CGT	2	6	700033	700038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632720
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14129	NC_011959	AGT	2	6	700466	700471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632720
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14134	NC_011959	ATCG	2	8	700653	700660	25 %	25 %	25 %	25 %	221632720
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14227	NC_011959	GC	3	6	705117	705122	0 %	0 %	50 %	50 %	221632723
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14230	NC_011959	ACTC	2	8	705234	705241	25 %	25 %	0 %	50 %	221632723
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14233	NC_011959	TCGC	2	8	705285	705292	0 %	25 %	25 %	50 %	221632723
14234	NC_011959	TCG	2	6	705309	705314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632723
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14236	NC_011959	ACG	2	6	705395	705400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632723
14237	NC_011959	CTGA	2	8	705404	705411	25 %	25 %	25 %	25 %	221632723
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14356	NC_011959	AAC	2	6	712608	712613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632729
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14359	NC_011959	TCC	2	6	712663	712668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632729
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14361	NC_011959	TCCG	2	8	712821	712828	0 %	25 %	25 %	50 %	221632730
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14474	NC_011959	GAG	2	6	719508	719513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632736
14475	NC_011959	GGAG	2	8	719585	719592	25 %	0 %	75 %	0 %	221632736
14476	NC_011959	CGT	2	6	719633	719638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632736
14477	NC_011959	TCGA	2	8	719640	719647	25 %	25 %	25 %	25 %	221632736
14478	NC_011959	TG	3	6	719665	719670	0 %	50 %	50 %	0 %	221632736
14479	NC_011959	CGA	2	6	719720	719725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632736
14480	NC_011959	TCGAA	2	10	719750	719759	40 %	20 %	20 %	20 %	221632736
14481	NC_011959	GCA	3	9	719876	719884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632736
14482	NC_011959	GCT	2	6	719919	719924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632736
14483	NC_011959	GAGC	2	8	719958	719965	25 %	0 %	50 %	25 %	221632736
14484	NC_011959	GTC	2	6	719988	719993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632736
14485	NC_011959	GC	3	6	719995	720000	0 %	0 %	50 %	50 %	221632736
14486	NC_011959	CTCG	2	8	720014	720021	0 %	25 %	25 %	50 %	221632736
14487	NC_011959	CGA	2	6	720030	720035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632736
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14491	NC_011959	G	6	6	720145	720150	0 %	0 %	100 %	0 %	221632736
14492	NC_011959	GTC	2	6	720165	720170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632736
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14495	NC_011959	CTG	2	6	720319	720324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632737
14496	NC_011959	GGTC	2	8	720332	720339	0 %	25 %	50 %	25 %	221632737
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14498	NC_011959	GAG	2	6	720372	720377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632737
14499	NC_011959	GTG	2	6	720383	720388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632737
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