MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 40761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_011959	GAC	2	6	671055	671060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632690
13502	NC_011959	CGG	2	6	671066	671071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632690
13503	NC_011959	GGA	2	6	671142	671147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632690
13504	NC_011959	GCG	2	6	671266	671271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632690
13505	NC_011959	GATG	2	8	671274	671281	25 %	25 %	50 %	0 %	221632690
13506	NC_011959	TGG	2	6	671291	671296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632690
13507	NC_011959	GTG	2	6	671374	671379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632690
13508	NC_011959	GAT	2	6	671404	671409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632690
13509	NC_011959	GTT	2	6	671415	671420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632690
13510	NC_011959	TGG	2	6	671426	671431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632690
13511	NC_011959	GGT	2	6	671487	671492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632690
13512	NC_011959	GTG	2	6	671578	671583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632690
13513	NC_011959	GCGG	2	8	671607	671614	0 %	0 %	75 %	25 %	221632690
13514	NC_011959	GGT	2	6	671673	671678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632690
13515	NC_011959	GGC	2	6	671699	671704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632690
13516	NC_011959	TGGGGC	2	12	671732	671743	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	221632690
13517	NC_011959	GGT	2	6	671757	671762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632690
13518	NC_011959	TCGA	2	8	671767	671774	25 %	25 %	25 %	25 %	221632690
13519	NC_011959	ACA	2	6	671813	671818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632690
13520	NC_011959	TTG	2	6	671827	671832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632690
13521	NC_011959	GGC	2	6	671874	671879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632690
13522	NC_011959	CGC	2	6	671894	671899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632690
13523	NC_011959	AGG	3	9	671936	671944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632690
13524	NC_011959	G	7	7	671943	671949	0 %	0 %	100 %	0 %	221632690
13525	NC_011959	GAC	2	6	671997	672002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632690
13526	NC_011959	GTG	2	6	672019	672024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632690
13527	NC_011959	GGA	2	6	672105	672110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632690
13528	NC_011959	CGT	2	6	672159	672164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632690
13529	NC_011959	ATC	2	6	672172	672177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632690
13530	NC_011959	AGT	2	6	672179	672184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632690
13531	NC_011959	AAAG	2	8	672228	672235	75 %	0 %	25 %	0 %	221632691
13532	NC_011959	AGA	2	6	672302	672307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632691
13533	NC_011959	GCC	2	6	672359	672364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632691
13534	NC_011959	TCA	2	6	672366	672371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632691
13535	NC_011959	GCGG	2	8	672637	672644	0 %	0 %	75 %	25 %	221632692
13536	NC_011959	TCG	2	6	672696	672701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632692
13537	NC_011959	GAC	2	6	672766	672771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632692
13538	NC_011959	GCT	2	6	672784	672789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632692
13539	NC_011959	TCT	2	6	672862	672867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632692
13540	NC_011959	GTG	2	6	672923	672928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632693
13541	NC_011959	CAG	2	6	672946	672951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632693
13542	NC_011959	GATG	2	8	673029	673036	25 %	25 %	50 %	0 %	221632693
13543	NC_011959	GGT	2	6	673093	673098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632693
13544	NC_011959	GAT	2	6	673149	673154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632693
13545	NC_011959	CGA	2	6	673158	673163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632693
13546	NC_011959	ATC	2	6	673261	673266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632693
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13548	NC_011959	ATC	2	6	673330	673335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632693
13549	NC_011959	TTC	2	6	673414	673419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632693
13550	NC_011959	TCC	2	6	673448	673453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632693
13551	NC_011959	GAA	2	6	673545	673550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632694
13552	NC_011959	CGG	2	6	673580	673585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632694
13553	NC_011959	GCC	2	6	673602	673607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632694
13554	NC_011959	GTC	3	9	673705	673713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632694
13555	NC_011959	CTG	2	6	673760	673765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632694
13556	NC_011959	GCG	2	6	673783	673788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632694
13557	NC_011959	GGC	2	6	673803	673808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632694
13558	NC_011959	GGTC	2	8	673827	673834	0 %	25 %	50 %	25 %	221632694
13559	NC_011959	GA	3	6	673856	673861	50 %	0 %	50 %	0 %	221632694
13560	NC_011959	ACGC	2	8	673889	673896	25 %	0 %	25 %	50 %	221632694
13561	NC_011959	GC	3	6	673933	673938	0 %	0 %	50 %	50 %	221632694
13562	NC_011959	TCG	2	6	674058	674063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632695
13563	NC_011959	AGG	2	6	674088	674093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632695
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13565	NC_011959	CGA	2	6	674131	674136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632695
13566	NC_011959	CCACG	2	10	674171	674180	20 %	0 %	20 %	60 %	221632695
13567	NC_011959	ACGGG	2	10	674217	674226	20 %	0 %	60 %	20 %	221632695
13568	NC_011959	CG	3	6	674235	674240	0 %	0 %	50 %	50 %	221632695
13569	NC_011959	GGTG	2	8	674254	674261	0 %	25 %	75 %	0 %	221632695
13570	NC_011959	GCT	2	6	674264	674269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632695
13571	NC_011959	AGG	2	6	674332	674337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632695
13572	NC_011959	GCG	2	6	674354	674359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632695
13573	NC_011959	GTC	2	6	674450	674455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632695
13574	NC_011959	GCCG	2	8	674473	674480	0 %	0 %	50 %	50 %	221632695
13575	NC_011959	CAG	2	6	674573	674578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632695
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13577	NC_011959	CGA	2	6	674673	674678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632695
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13585	NC_011959	GCT	2	6	675082	675087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632696
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13587	NC_011959	CCT	2	6	675117	675122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632696
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13589	NC_011959	CG	3	6	675192	675197	0 %	0 %	50 %	50 %	221632696
13590	NC_011959	CTC	2	6	675229	675234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632696
13591	NC_011959	GTC	2	6	675239	675244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632696
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13601	NC_011959	GCG	3	9	675643	675651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632697
13602	NC_011959	GAAGA	2	10	675661	675670	60 %	0 %	40 %	0 %	221632697
13603	NC_011959	CAA	2	6	675705	675710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632697
13604	NC_011959	GTG	2	6	675727	675732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632697
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13978	NC_011959	TCGA	2	8	693790	693797	25 %	25 %	25 %	25 %	221632715
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13983	NC_011959	GGA	2	6	694067	694072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632715
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13999	NC_011959	CGTCC	2	10	694933	694942	0 %	20 %	20 %	60 %	221632715
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