MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 40761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_011959	GAG	2	6	647249	647254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632669
13002	NC_011959	ACG	2	6	647265	647270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632669
13003	NC_011959	CGC	2	6	647282	647287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632669
13004	NC_011959	CG	3	6	647319	647324	0 %	0 %	50 %	50 %	221632669
13005	NC_011959	TCT	2	6	647350	647355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632669
13006	NC_011959	CTG	2	6	647441	647446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632669
13007	NC_011959	TGA	2	6	647485	647490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632669
13008	NC_011959	TCG	2	6	647493	647498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632669
13009	NC_011959	CGC	2	6	647541	647546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632669
13010	NC_011959	CGC	2	6	647574	647579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632669
13011	NC_011959	TTG	2	6	647715	647720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632669
13012	NC_011959	GAT	2	6	647891	647896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632669
13013	NC_011959	GAC	2	6	647942	647947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632669
13014	NC_011959	GGC	2	6	647972	647977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632669
13015	NC_011959	TCC	2	6	648005	648010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632669
13016	NC_011959	CGA	2	6	648094	648099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632669
13017	NC_011959	TG	3	6	648112	648117	0 %	50 %	50 %	0 %	221632669
13018	NC_011959	TGG	2	6	648127	648132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632669
13019	NC_011959	ACCG	2	8	648137	648144	25 %	0 %	25 %	50 %	221632669
13020	NC_011959	GGA	2	6	648190	648195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632669
13021	NC_011959	CG	3	6	648205	648210	0 %	0 %	50 %	50 %	221632669
13022	NC_011959	TTC	2	6	648269	648274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632669
13023	NC_011959	GC	3	6	648290	648295	0 %	0 %	50 %	50 %	221632669
13024	NC_011959	CGG	2	6	648313	648318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632669
13025	NC_011959	CGT	2	6	648406	648411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632669
13026	NC_011959	CGA	2	6	648457	648462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632669
13027	NC_011959	TGA	2	6	648634	648639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632669
13028	NC_011959	GCTC	2	8	648661	648668	0 %	25 %	25 %	50 %	221632669
13029	NC_011959	CCAT	2	8	648678	648685	25 %	25 %	0 %	50 %	221632669
13030	NC_011959	TGG	2	6	648827	648832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632670
13031	NC_011959	ATC	2	6	648958	648963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632670
13032	NC_011959	GC	3	6	648971	648976	0 %	0 %	50 %	50 %	221632670
13033	NC_011959	CAG	2	6	648999	649004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632670
13034	NC_011959	ATC	2	6	649017	649022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632670
13035	NC_011959	GGTC	2	8	649042	649049	0 %	25 %	50 %	25 %	221632670
13036	NC_011959	GAC	3	9	649050	649058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632670
13037	NC_011959	CG	3	6	649120	649125	0 %	0 %	50 %	50 %	221632670
13038	NC_011959	ATG	2	6	649129	649134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632670
13039	NC_011959	GAA	2	6	649164	649169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632670
13040	NC_011959	GAC	2	6	649178	649183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632670
13041	NC_011959	CGA	2	6	649211	649216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632670
13042	NC_011959	TCCGG	2	10	649264	649273	0 %	20 %	40 %	40 %	221632670
13043	NC_011959	CGA	3	9	649349	649357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632670
13044	NC_011959	ACG	2	6	649396	649401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632670
13045	NC_011959	CTG	2	6	649440	649445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632670
13046	NC_011959	GCT	2	6	649456	649461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632670
13047	NC_011959	GTA	2	6	649539	649544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632670
13048	NC_011959	TCA	2	6	649547	649552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632670
13049	NC_011959	TGA	2	6	649559	649564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632670
13050	NC_011959	CG	3	6	649570	649575	0 %	0 %	50 %	50 %	221632670
13051	NC_011959	AGC	2	6	649601	649606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632670
13052	NC_011959	CGT	2	6	649642	649647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632670
13053	NC_011959	GGAAGA	2	12	649658	649669	50 %	0 %	50 %	0 %	221632670
13054	NC_011959	CCA	2	6	649811	649816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632671
13055	NC_011959	CAC	2	6	649827	649832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632671
13056	NC_011959	GAC	2	6	649980	649985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632671
13057	NC_011959	CGT	2	6	650000	650005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632671
13058	NC_011959	CGAC	2	8	650059	650066	25 %	0 %	25 %	50 %	221632671
13059	NC_011959	GAG	2	6	650096	650101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632671
13060	NC_011959	GAA	2	6	650218	650223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632671
13061	NC_011959	GAG	2	6	650285	650290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632671
13062	NC_011959	AG	3	6	650366	650371	50 %	0 %	50 %	0 %	221632671
13063	NC_011959	CCG	2	6	650372	650377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632671
13064	NC_011959	TCG	2	6	650391	650396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632671
13065	NC_011959	CAG	2	6	650399	650404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632671
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13067	NC_011959	CCA	2	6	650528	650533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632672
13068	NC_011959	CG	3	6	650537	650542	0 %	0 %	50 %	50 %	221632672
13069	NC_011959	TCG	2	6	650548	650553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632672
13070	NC_011959	ACTGG	2	10	650558	650567	20 %	20 %	40 %	20 %	221632672
13071	NC_011959	CAG	2	6	650666	650671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632672
13072	NC_011959	CAC	2	6	650755	650760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632672
13073	NC_011959	TCT	2	6	650864	650869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632672
13074	NC_011959	CGCTCC	2	12	650881	650892	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	221632672
13075	NC_011959	CGAT	2	8	650941	650948	25 %	25 %	25 %	25 %	221632672
13076	NC_011959	CGC	2	6	650954	650959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632672
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13078	NC_011959	TGG	2	6	651149	651154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632672
13079	NC_011959	AGGA	2	8	651171	651178	50 %	0 %	50 %	0 %	221632672
13080	NC_011959	ACG	2	6	651184	651189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632672
13081	NC_011959	CAG	2	6	651227	651232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632672
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13083	NC_011959	GA	4	8	651260	651267	50 %	0 %	50 %	0 %	221632672
13084	NC_011959	TTG	2	6	651391	651396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632672
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13086	NC_011959	GCC	2	6	651444	651449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632672
13087	NC_011959	GTA	2	6	651501	651506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632672
13088	NC_011959	GAT	2	6	651549	651554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632672
13089	NC_011959	GCG	2	6	651775	651780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632673
13090	NC_011959	AGG	2	6	652024	652029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632674
13091	NC_011959	GCA	2	6	652066	652071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632674
13092	NC_011959	GATC	2	8	652087	652094	25 %	25 %	25 %	25 %	221632674
13093	NC_011959	AGC	2	6	652147	652152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632674
13094	NC_011959	GTC	2	6	652203	652208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632674
13095	NC_011959	GAC	2	6	652288	652293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632674
13096	NC_011959	GGTG	2	8	652309	652316	0 %	25 %	75 %	0 %	221632674
13097	NC_011959	CTG	2	6	652349	652354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632674
13098	NC_011959	GCA	2	6	652417	652422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632674
13099	NC_011959	GGAT	2	8	652557	652564	25 %	25 %	50 %	0 %	221632674
13100	NC_011959	CGA	2	6	652591	652596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632674
13101	NC_011959	TCG	2	6	652607	652612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632674
13102	NC_011959	GGC	2	6	652616	652621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632674
13103	NC_011959	GCTC	2	8	652658	652665	0 %	25 %	25 %	50 %	221632674
13104	NC_011959	CGA	2	6	652675	652680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632674
13105	NC_011959	GGCA	2	8	652705	652712	25 %	0 %	50 %	25 %	221632674
13106	NC_011959	A	6	6	652743	652748	100 %	0 %	0 %	0 %	221632674
13107	NC_011959	CGGAC	2	10	652776	652785	20 %	0 %	40 %	40 %	221632674
13108	NC_011959	AGC	2	6	652803	652808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632674
13109	NC_011959	AGCG	2	8	652815	652822	25 %	0 %	50 %	25 %	221632674
13110	NC_011959	TGG	2	6	652842	652847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632674
13111	NC_011959	CGT	2	6	652861	652866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632674
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13113	NC_011959	CGG	2	6	652875	652880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632674
13114	NC_011959	AGC	2	6	652951	652956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632674
13115	NC_011959	GCG	2	6	652996	653001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632674
13116	NC_011959	GAC	2	6	653006	653011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632674
13117	NC_011959	GGC	2	6	653069	653074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632674
13118	NC_011959	TGA	2	6	653095	653100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632674
13119	NC_011959	CGA	2	6	653220	653225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632675
13120	NC_011959	CG	4	8	653228	653235	0 %	0 %	50 %	50 %	221632675
13121	NC_011959	AGA	2	6	653298	653303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632675
13122	NC_011959	CGT	2	6	653341	653346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632675
13123	NC_011959	TCC	2	6	653456	653461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632675
13124	NC_011959	AGCC	2	8	653534	653541	25 %	0 %	25 %	50 %	221632675
13125	NC_011959	GAGC	2	8	653579	653586	25 %	0 %	50 %	25 %	221632675
13126	NC_011959	CAG	2	6	653688	653693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632675
13127	NC_011959	GAA	2	6	653716	653721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632675
13128	NC_011959	TCG	2	6	653726	653731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632675
13129	NC_011959	TCG	2	6	653759	653764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632675
13130	NC_011959	GGCA	2	8	653932	653939	25 %	0 %	50 %	25 %	221632675
13131	NC_011959	AGGCG	2	10	654009	654018	20 %	0 %	60 %	20 %	221632675
13132	NC_011959	CGG	2	6	654075	654080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632675
13133	NC_011959	GACC	2	8	654087	654094	25 %	0 %	25 %	50 %	221632675
13134	NC_011959	CAG	2	6	654220	654225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632675
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13137	NC_011959	TCG	2	6	654280	654285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632676
13138	NC_011959	CAT	2	6	654297	654302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632676
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13142	NC_011959	ACGGCG	2	12	654454	654465	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	221632676
13143	NC_011959	GCT	2	6	654502	654507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632676
13144	NC_011959	CAA	2	6	654513	654518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632676
13145	NC_011959	GAG	2	6	654560	654565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632676
13146	NC_011959	GCT	2	6	654567	654572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632676
13147	NC_011959	GAG	2	6	654594	654599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632676
13148	NC_011959	AGC	2	6	654625	654630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632676
13149	NC_011959	CCG	2	6	654680	654685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632676
13150	NC_011959	GGC	3	9	654696	654704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632676
13151	NC_011959	ACG	2	6	654721	654726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632676
13152	NC_011959	GCG	2	6	654778	654783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632676
13153	NC_011959	TCG	2	6	654838	654843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632676
13154	NC_011959	CGC	2	6	654891	654896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632676
13155	NC_011959	GAT	2	6	654950	654955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632676
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13165	NC_011959	TCG	2	6	655477	655482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632677
13166	NC_011959	CGG	2	6	655526	655531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632677
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13171	NC_011959	GCA	2	6	655617	655622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632677
13172	NC_011959	GGCC	2	8	655630	655637	0 %	0 %	50 %	50 %	221632677
13173	NC_011959	GCC	2	6	655680	655685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632677
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13176	NC_011959	CGA	2	6	655780	655785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632677
13177	NC_011959	TGC	2	6	655795	655800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632677
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13181	NC_011959	TGC	2	6	656012	656017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632677
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13188	NC_011959	CGT	2	6	656336	656341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632677
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13219	NC_011959	GCGA	2	8	657763	657770	25 %	0 %	50 %	25 %	221632679
13220	NC_011959	TTC	2	6	657838	657843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632679
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13223	NC_011959	TCGC	2	8	657922	657929	0 %	25 %	25 %	50 %	221632679
13224	NC_011959	GAT	2	6	657985	657990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632679
13225	NC_011959	GAC	2	6	658057	658062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632679
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13227	NC_011959	GAC	2	6	658096	658101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632679
13228	NC_011959	GGC	2	6	658114	658119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632679
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13230	NC_011959	GCC	2	6	658162	658167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632679
13231	NC_011959	GC	3	6	658264	658269	0 %	0 %	50 %	50 %	221632680
13232	NC_011959	AGG	2	6	658360	658365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632680
13233	NC_011959	GGTC	2	8	658462	658469	0 %	25 %	50 %	25 %	221632680
13234	NC_011959	CCG	2	6	658492	658497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632680
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13238	NC_011959	GATGCG	2	12	658641	658652	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	221632680
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13351	NC_011959	TCG	2	6	664064	664069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632685
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13354	NC_011959	CGT	2	6	664161	664166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632685
13355	NC_011959	GAA	2	6	664170	664175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632685
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13361	NC_011959	CTCG	2	8	664335	664342	0 %	25 %	25 %	50 %	221632685
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13472	NC_011959	CGA	2	6	669312	669317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632688
13473	NC_011959	TGGGC	2	10	669319	669328	0 %	20 %	60 %	20 %	221632688
13474	NC_011959	GCG	2	6	669390	669395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632689
13475	NC_011959	CCCTG	2	10	669416	669425	0 %	20 %	20 %	60 %	221632689
13476	NC_011959	GCGA	2	8	669555	669562	25 %	0 %	50 %	25 %	221632689
13477	NC_011959	GGAA	2	8	669572	669579	50 %	0 %	50 %	0 %	221632689
13478	NC_011959	CGA	2	6	669599	669604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632689
13479	NC_011959	CT	3	6	669611	669616	0 %	50 %	0 %	50 %	221632689
13480	NC_011959	CGGT	2	8	669671	669678	0 %	25 %	50 %	25 %	221632689
13481	NC_011959	TGGCG	2	10	669708	669717	0 %	20 %	60 %	20 %	221632689
13482	NC_011959	CGG	2	6	669778	669783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632689
13483	NC_011959	CGAGC	2	10	669866	669875	20 %	0 %	40 %	40 %	221632689
13484	NC_011959	CGT	2	6	669995	670000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632689
13485	NC_011959	TGCG	2	8	670033	670040	0 %	25 %	50 %	25 %	221632689
13486	NC_011959	GCA	2	6	670125	670130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632689
13487	NC_011959	GCTC	2	8	670151	670158	0 %	25 %	25 %	50 %	221632689
13488	NC_011959	GTGG	2	8	670165	670172	0 %	25 %	75 %	0 %	221632689
13489	NC_011959	GTC	2	6	670206	670211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632689
13490	NC_011959	TTC	2	6	670222	670227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632689
13491	NC_011959	GCT	2	6	670235	670240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632689
13492	NC_011959	TCG	2	6	670303	670308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632689
13493	NC_011959	G	6	6	670321	670326	0 %	0 %	100 %	0 %	221632689
13494	NC_011959	CTG	2	6	670335	670340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632689
13495	NC_011959	GGT	2	6	670343	670348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632689
13496	NC_011959	GGT	2	6	670436	670441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632689
13497	NC_011959	CTGG	2	8	670493	670500	0 %	25 %	50 %	25 %	221632689
13498	NC_011959	GT	3	6	670504	670509	0 %	50 %	50 %	0 %	221632689
13499	NC_011959	GGAACG	2	12	670581	670592	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	221632689
13500	NC_011959	GCGA	2	8	670670	670677	25 %	0 %	50 %	25 %	221632689

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