MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 40761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_011959	GAC	2	6	620930	620935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632648
12502	NC_011959	TCG	3	9	620950	620958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632648
12503	NC_011959	GGC	2	6	620972	620977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632648
12504	NC_011959	GC	3	6	620983	620988	0 %	0 %	50 %	50 %	221632648
12505	NC_011959	ATC	2	6	621093	621098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632648
12506	NC_011959	CGC	2	6	621110	621115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632648
12507	NC_011959	TCG	2	6	621190	621195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632648
12508	NC_011959	CG	3	6	621194	621199	0 %	0 %	50 %	50 %	221632648
12509	NC_011959	CAC	2	6	621244	621249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632648
12510	NC_011959	TCG	2	6	621298	621303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632648
12511	NC_011959	GTG	2	6	621375	621380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632648
12512	NC_011959	CTC	2	6	621393	621398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632648
12513	NC_011959	CGA	3	9	621479	621487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632648
12514	NC_011959	CGCAT	2	10	621493	621502	20 %	20 %	20 %	40 %	221632648
12515	NC_011959	CCGG	2	8	621512	621519	0 %	0 %	50 %	50 %	221632648
12516	NC_011959	GAC	2	6	621608	621613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632649
12517	NC_011959	GCC	2	6	621628	621633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632649
12518	NC_011959	GCA	2	6	621644	621649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632649
12519	NC_011959	CAA	2	6	622401	622406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632650
12520	NC_011959	CAA	2	6	622489	622494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632650
12521	NC_011959	GCTG	2	8	622520	622527	0 %	25 %	50 %	25 %	221632650
12522	NC_011959	GA	3	6	622828	622833	50 %	0 %	50 %	0 %	221632651
12523	NC_011959	GATGG	2	10	622959	622968	20 %	20 %	60 %	0 %	221632651
12524	NC_011959	GGT	2	6	622980	622985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632651
12525	NC_011959	ACG	2	6	623148	623153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632651
12526	NC_011959	GC	4	8	623225	623232	0 %	0 %	50 %	50 %	221632651
12527	NC_011959	TGA	2	6	623395	623400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632651
12528	NC_011959	GAT	2	6	623403	623408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632651
12529	NC_011959	CGAC	2	8	623422	623429	25 %	0 %	25 %	50 %	221632651
12530	NC_011959	GAC	2	6	623451	623456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632651
12531	NC_011959	TGG	2	6	623509	623514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632651
12532	NC_011959	CAG	2	6	623551	623556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632651
12533	NC_011959	TCG	2	6	623557	623562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632651
12534	NC_011959	AGCC	2	8	623572	623579	25 %	0 %	25 %	50 %	221632651
12535	NC_011959	CAG	2	6	623618	623623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632651
12536	NC_011959	GAT	2	6	623630	623635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632651
12537	NC_011959	ATC	2	6	623646	623651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632651
12538	NC_011959	TGG	2	6	623702	623707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632651
12539	NC_011959	GTC	2	6	623717	623722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632652
12540	NC_011959	CCG	2	6	623744	623749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632652
12541	NC_011959	GCGA	2	8	623778	623785	25 %	0 %	50 %	25 %	221632652
12542	NC_011959	CTC	2	6	623801	623806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632652
12543	NC_011959	CTCGT	2	10	623823	623832	0 %	40 %	20 %	40 %	221632652
12544	NC_011959	CGG	2	6	623835	623840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632652
12545	NC_011959	GGA	2	6	623860	623865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632652
12546	NC_011959	GGCT	2	8	623890	623897	0 %	25 %	50 %	25 %	221632652
12547	NC_011959	G	6	6	623966	623971	0 %	0 %	100 %	0 %	221632652
12548	NC_011959	GTC	2	6	623993	623998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632652
12549	NC_011959	GTC	2	6	624257	624262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632652
12550	NC_011959	GGC	2	6	624265	624270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632652
12551	NC_011959	GCGA	2	8	624428	624435	25 %	0 %	50 %	25 %	221632652
12552	NC_011959	CTCGTT	2	12	624506	624517	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	221632652
12553	NC_011959	TCG	2	6	624629	624634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632653
12554	NC_011959	GGAGCT	2	12	624777	624788	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	221632653
12555	NC_011959	TTTC	2	8	624790	624797	0 %	75 %	0 %	25 %	221632653
12556	NC_011959	GCG	2	6	624812	624817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632653
12557	NC_011959	ACTT	2	8	624839	624846	25 %	50 %	0 %	25 %	221632653
12558	NC_011959	GCA	2	6	624853	624858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632653
12559	NC_011959	CTCG	2	8	624904	624911	0 %	25 %	25 %	50 %	221632653
12560	NC_011959	GAA	2	6	624927	624932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632653
12561	NC_011959	CGC	2	6	625023	625028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632653
12562	NC_011959	AGG	2	6	625055	625060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632653
12563	NC_011959	GCG	2	6	625089	625094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632653
12564	NC_011959	GAG	2	6	625108	625113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632653
12565	NC_011959	TCG	2	6	625118	625123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632653
12566	NC_011959	CAC	2	6	625142	625147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632653
12567	NC_011959	AATC	2	8	625152	625159	50 %	25 %	0 %	25 %	221632653
12568	NC_011959	CGA	2	6	625276	625281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632654
12569	NC_011959	GAAGC	2	10	625320	625329	40 %	0 %	40 %	20 %	221632654
12570	NC_011959	CCGG	2	8	625337	625344	0 %	0 %	50 %	50 %	221632654
12571	NC_011959	CGG	2	6	625366	625371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632654
12572	NC_011959	ACC	2	6	625415	625420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632654
12573	NC_011959	CAGA	2	8	625466	625473	50 %	0 %	25 %	25 %	221632654
12574	NC_011959	GC	3	6	625509	625514	0 %	0 %	50 %	50 %	221632654
12575	NC_011959	GAT	3	9	625529	625537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632654
12576	NC_011959	GCA	2	6	625557	625562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632654
12577	NC_011959	GCT	2	6	625585	625590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632654
12578	NC_011959	GC	3	6	625634	625639	0 %	0 %	50 %	50 %	221632654
12579	NC_011959	GCAA	2	8	625686	625693	50 %	0 %	25 %	25 %	221632654
12580	NC_011959	GATC	2	8	625765	625772	25 %	25 %	25 %	25 %	221632654
12581	NC_011959	GAC	2	6	625805	625810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632654
12582	NC_011959	CGA	2	6	625831	625836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632654
12583	NC_011959	TG	3	6	625857	625862	0 %	50 %	50 %	0 %	221632654
12584	NC_011959	CCG	2	6	625893	625898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632654
12585	NC_011959	CAG	2	6	625945	625950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632654
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12587	NC_011959	GAC	2	6	625985	625990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632654
12588	NC_011959	GAG	2	6	626033	626038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632654
12589	NC_011959	GAG	2	6	626040	626045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632654
12590	NC_011959	GCC	2	6	626060	626065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632654
12591	NC_011959	TCG	2	6	626124	626129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632654
12592	NC_011959	TCGC	2	8	626152	626159	0 %	25 %	25 %	50 %	221632654
12593	NC_011959	CGG	2	6	626301	626306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632654
12594	NC_011959	GAAC	2	8	626325	626332	50 %	0 %	25 %	25 %	221632654
12595	NC_011959	TCG	2	6	626334	626339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632654
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12598	NC_011959	CGG	2	6	626407	626412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632654
12599	NC_011959	TCC	2	6	626507	626512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632655
12600	NC_011959	GGCG	2	8	626526	626533	0 %	0 %	75 %	25 %	221632655
12601	NC_011959	GAT	2	6	626644	626649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632655
12602	NC_011959	CG	3	6	626697	626702	0 %	0 %	50 %	50 %	221632655
12603	NC_011959	CGGT	2	8	626706	626713	0 %	25 %	50 %	25 %	221632655
12604	NC_011959	CGTGA	2	10	626743	626752	20 %	20 %	40 %	20 %	221632655
12605	NC_011959	GAC	2	6	626755	626760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632655
12606	NC_011959	CTCG	2	8	626767	626774	0 %	25 %	25 %	50 %	221632655
12607	NC_011959	TGA	2	6	626793	626798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632655
12608	NC_011959	GAT	2	6	626839	626844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632655
12609	NC_011959	GAGC	2	8	626846	626853	25 %	0 %	50 %	25 %	221632655
12610	NC_011959	CTG	2	6	626854	626859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632655
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12613	NC_011959	GC	3	6	627030	627035	0 %	0 %	50 %	50 %	221632655
12614	NC_011959	CGA	2	6	627045	627050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632655
12615	NC_011959	CCAG	2	8	627186	627193	25 %	0 %	25 %	50 %	221632655
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12619	NC_011959	AGCC	2	8	627384	627391	25 %	0 %	25 %	50 %	221632655
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12857	NC_011959	GAT	2	6	639013	639018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632663
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12975	NC_011959	GCGAT	2	10	644932	644941	20 %	20 %	40 %	20 %	221632668
12976	NC_011959	GCA	2	6	645023	645028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632668
12977	NC_011959	GCG	2	6	645063	645068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632668
12978	NC_011959	GCC	2	6	645155	645160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632668
12979	NC_011959	TG	3	6	645167	645172	0 %	50 %	50 %	0 %	221632668
12980	NC_011959	AAG	2	6	645190	645195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632668
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12983	NC_011959	ATG	2	6	645252	645257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632668
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