MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 40761

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12121	NC_011959	GAG	2	6	600631	600636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632628
12122	NC_011959	CGA	2	6	600747	600752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632628
12123	NC_011959	ACC	2	6	600787	600792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632628
12124	NC_011959	CGG	2	6	600816	600821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632628
12125	NC_011959	CGAG	2	8	600824	600831	25 %	0 %	50 %	25 %	221632628
12126	NC_011959	CGT	2	6	600852	600857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632628
12127	NC_011959	GAG	2	6	600877	600882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632628
12128	NC_011959	AGGC	2	8	600917	600924	25 %	0 %	50 %	25 %	221632628
12129	NC_011959	GGA	2	6	601112	601117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632628
12130	NC_011959	CGGT	2	8	601125	601132	0 %	25 %	50 %	25 %	221632628
12131	NC_011959	CTC	2	6	601157	601162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632629
12132	NC_011959	GATTCC	2	12	601181	601192	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	221632629
12133	NC_011959	GAT	2	6	601213	601218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632629
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12135	NC_011959	CATCGT	2	12	601324	601335	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	221632629
12136	NC_011959	AGCCG	2	10	601355	601364	20 %	0 %	40 %	40 %	221632629
12137	NC_011959	CGGT	3	12	601383	601394	0 %	25 %	50 %	25 %	221632629
12138	NC_011959	GAC	2	6	601427	601432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632629
12139	NC_011959	TCGG	2	8	601443	601450	0 %	25 %	50 %	25 %	221632629
12140	NC_011959	CGA	2	6	601576	601581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632629
12141	NC_011959	CGT	2	6	601605	601610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632629
12142	NC_011959	CGA	2	6	601624	601629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632629
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12145	NC_011959	CCA	2	6	601732	601737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632629
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12147	NC_011959	CGAT	2	8	601776	601783	25 %	25 %	25 %	25 %	221632629
12148	NC_011959	CGGTGG	2	12	601789	601800	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	221632629
12149	NC_011959	CGC	2	6	601924	601929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632629
12150	NC_011959	CGATGC	2	12	601948	601959	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	221632629
12151	NC_011959	GAA	3	9	602027	602035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632629
12152	NC_011959	TCG	2	6	602097	602102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632629
12153	NC_011959	ACG	2	6	602196	602201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632629
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12155	NC_011959	CCG	2	6	602238	602243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632629
12156	NC_011959	CGG	2	6	602259	602264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632629
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12158	NC_011959	GAC	2	6	602439	602444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632630
12159	NC_011959	CGA	2	6	602532	602537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632630
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12184	NC_011959	CGA	2	6	603710	603715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632630
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12213	NC_011959	GGTCG	2	10	605912	605921	0 %	20 %	60 %	20 %	221632632
12214	NC_011959	GC	3	6	605989	605994	0 %	0 %	50 %	50 %	221632632
12215	NC_011959	TCGACG	2	12	606040	606051	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	221632632
12216	NC_011959	CTG	2	6	606059	606064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632632
12217	NC_011959	CGGC	2	8	606080	606087	0 %	0 %	50 %	50 %	221632632
12218	NC_011959	TGGC	2	8	606099	606106	0 %	25 %	50 %	25 %	221632632
12219	NC_011959	GGA	2	6	606148	606153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632632
12220	NC_011959	GCGG	2	8	606215	606222	0 %	0 %	75 %	25 %	221632632
12221	NC_011959	CGG	2	6	606240	606245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632632
12222	NC_011959	CAT	2	6	606250	606255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632632
12223	NC_011959	GCGGA	2	10	606302	606311	20 %	0 %	60 %	20 %	221632632
12224	NC_011959	GGAC	2	8	606407	606414	25 %	0 %	50 %	25 %	221632632
12225	NC_011959	TGG	2	6	606493	606498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632632
12226	NC_011959	CCG	2	6	606530	606535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632632
12227	NC_011959	GCA	2	6	606623	606628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632633
12228	NC_011959	TCG	2	6	606640	606645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632633
12229	NC_011959	ACC	2	6	606684	606689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632633
12230	NC_011959	GCCG	2	8	606695	606702	0 %	0 %	50 %	50 %	221632633
12231	NC_011959	CG	3	6	606707	606712	0 %	0 %	50 %	50 %	221632633
12232	NC_011959	GGA	2	6	606800	606805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632633
12233	NC_011959	GAG	2	6	606852	606857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632633
12234	NC_011959	TCG	2	6	606895	606900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632633
12235	NC_011959	GGTGCG	2	12	606905	606916	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	221632633
12236	NC_011959	TCG	2	6	606941	606946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632633
12237	NC_011959	CGG	2	6	606982	606987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632633
12238	NC_011959	GCT	2	6	606996	607001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632633
12239	NC_011959	GTC	2	6	607077	607082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632633
12240	NC_011959	CAC	2	6	607127	607132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632633
12241	NC_011959	ATC	2	6	607227	607232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632633
12242	NC_011959	CGA	2	6	607243	607248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632633
12243	NC_011959	GCT	2	6	607256	607261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632633
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12245	NC_011959	CTT	2	6	607439	607444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632634
12246	NC_011959	TGC	2	6	607468	607473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632634
12247	NC_011959	GGCCGC	2	12	607481	607492	0 %	0 %	50 %	50 %	221632634
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12252	NC_011959	CG	3	6	607723	607728	0 %	0 %	50 %	50 %	221632634
12253	NC_011959	CG	3	6	608040	608045	0 %	0 %	50 %	50 %	221632635
12254	NC_011959	CGT	2	6	608088	608093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632635
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12263	NC_011959	ACT	2	6	608480	608485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632635
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12267	NC_011959	GCC	2	6	608733	608738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632635
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12271	NC_011959	CAT	2	6	608946	608951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632635
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12275	NC_011959	CGG	2	6	609024	609029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632635
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12277	NC_011959	GTCG	2	8	609160	609167	0 %	25 %	50 %	25 %	221632635
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12326	NC_011959	AGGC	2	8	611261	611268	25 %	0 %	50 %	25 %	221632638
12327	NC_011959	GGT	2	6	611355	611360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632638
12328	NC_011959	GTC	2	6	611410	611415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632638
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12342	NC_011959	ACG	2	6	612120	612125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632639
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12345	NC_011959	GACG	2	8	612266	612273	25 %	0 %	50 %	25 %	221632639
12346	NC_011959	TCG	2	6	612364	612369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632639
12347	NC_011959	GCA	2	6	612383	612388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632639
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12349	NC_011959	GTT	2	6	612407	612412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632639
12350	NC_011959	CGTTC	2	10	612428	612437	0 %	40 %	20 %	40 %	221632639
12351	NC_011959	CTC	2	6	612489	612494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632639
12352	NC_011959	GGC	2	6	612499	612504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632639
12353	NC_011959	CTT	2	6	612563	612568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632639
12354	NC_011959	TCGGTT	2	12	612577	612588	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	221632639
12355	NC_011959	CGG	2	6	612610	612615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632639
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12357	NC_011959	CT	3	6	612655	612660	0 %	50 %	0 %	50 %	221632639
12358	NC_011959	GCC	2	6	612684	612689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632639
12359	NC_011959	TGC	2	6	612718	612723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632639
12360	NC_011959	GCA	2	6	612747	612752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632639
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12362	NC_011959	TCGC	2	8	612857	612864	0 %	25 %	25 %	50 %	221632639
12363	NC_011959	TGG	2	6	612865	612870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632639
12364	NC_011959	GGT	2	6	613009	613014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632640
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12394	NC_011959	GACC	2	8	614294	614301	25 %	0 %	25 %	50 %	221632640
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12404	NC_011959	CGGT	2	8	615028	615035	0 %	25 %	50 %	25 %	221632640
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12435	NC_011959	GCGGCT	2	12	616771	616782	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	221632642
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12456	NC_011959	TCGG	2	8	618137	618144	0 %	25 %	50 %	25 %	221632644
12457	NC_011959	GTC	2	6	618171	618176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632644
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12461	NC_011959	GAT	2	6	618294	618299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632644
12462	NC_011959	ATGCCG	2	12	618355	618366	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	221632644
12463	NC_011959	ATG	2	6	618367	618372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632644
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12467	NC_011959	TGA	3	9	618539	618547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632644
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12469	NC_011959	GGTC	2	8	618633	618640	0 %	25 %	50 %	25 %	221632644
12470	NC_011959	GC	3	6	618741	618746	0 %	0 %	50 %	50 %	221632644
12471	NC_011959	TGGC	2	8	618767	618774	0 %	25 %	50 %	25 %	221632644
12472	NC_011959	TGT	2	6	618803	618808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632644
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12474	NC_011959	TGG	2	6	618950	618955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632644
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12476	NC_011959	ATG	2	6	619056	619061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632644
12477	NC_011959	GGA	2	6	619094	619099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632644
12478	NC_011959	TCG	2	6	619209	619214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632644
12479	NC_011959	CCCT	2	8	619243	619250	0 %	25 %	0 %	75 %	221632644
12480	NC_011959	GTC	2	6	619259	619264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632644
12481	NC_011959	CGC	2	6	619413	619418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632645
12482	NC_011959	CAG	2	6	619434	619439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632645
12483	NC_011959	TCA	2	6	619462	619467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632645
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12485	NC_011959	CCT	2	6	619507	619512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632645
12486	NC_011959	CTGC	2	8	619832	619839	0 %	25 %	25 %	50 %	221632646
12487	NC_011959	CG	3	6	619880	619885	0 %	0 %	50 %	50 %	221632646
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12492	NC_011959	CT	3	6	620110	620115	0 %	50 %	0 %	50 %	221632646
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12499	NC_011959	CTT	2	6	620753	620758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632647
12500	NC_011959	TCG	2	6	620884	620889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632648

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