MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 40761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_011959	TC	3	6	566027	566032	0 %	50 %	0 %	50 %	221632593
11502	NC_011959	TGC	2	6	566067	566072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632593
11503	NC_011959	GTT	2	6	566105	566110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632593
11504	NC_011959	CTGC	2	8	566165	566172	0 %	25 %	25 %	50 %	221632593
11505	NC_011959	GGC	2	6	566241	566246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632593
11506	NC_011959	GC	3	6	566318	566323	0 %	0 %	50 %	50 %	221632593
11507	NC_011959	CGT	2	6	566340	566345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632593
11508	NC_011959	TGT	2	6	566399	566404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632593
11509	NC_011959	CCT	2	6	566420	566425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632593
11510	NC_011959	TCC	2	6	566478	566483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632594
11511	NC_011959	CG	3	6	566489	566494	0 %	0 %	50 %	50 %	221632594
11512	NC_011959	AAGC	2	8	566540	566547	50 %	0 %	25 %	25 %	221632594
11513	NC_011959	TCG	2	6	566568	566573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632594
11514	NC_011959	AGG	2	6	566595	566600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632594
11515	NC_011959	GAG	2	6	566672	566677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632594
11516	NC_011959	GTC	2	6	566678	566683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632594
11517	NC_011959	GGTCTG	2	12	566695	566706	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	221632594
11518	NC_011959	GCT	2	6	566727	566732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632594
11519	NC_011959	GGC	2	6	566751	566756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632594
11520	NC_011959	GCTC	2	8	566776	566783	0 %	25 %	25 %	50 %	221632594
11521	NC_011959	GGCG	2	8	566809	566816	0 %	0 %	75 %	25 %	221632594
11522	NC_011959	CG	3	6	566822	566827	0 %	0 %	50 %	50 %	221632594
11523	NC_011959	TCGG	2	8	566952	566959	0 %	25 %	50 %	25 %	221632594
11524	NC_011959	CGA	2	6	566962	566967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632594
11525	NC_011959	TCG	2	6	567072	567077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632594
11526	NC_011959	GTGGG	2	10	567086	567095	0 %	20 %	80 %	0 %	221632594
11527	NC_011959	GAG	2	6	567106	567111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632594
11528	NC_011959	CGG	3	9	567138	567146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632594
11529	NC_011959	CGG	3	9	567174	567182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632594
11530	NC_011959	CG	3	6	567569	567574	0 %	0 %	50 %	50 %	221632595
11531	NC_011959	GC	3	6	567650	567655	0 %	0 %	50 %	50 %	221632595
11532	NC_011959	AGCC	2	8	567706	567713	25 %	0 %	25 %	50 %	221632595
11533	NC_011959	TGA	2	6	567717	567722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632595
11534	NC_011959	GGC	2	6	567727	567732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632595
11535	NC_011959	GC	3	6	567748	567753	0 %	0 %	50 %	50 %	221632595
11536	NC_011959	AGC	2	6	567788	567793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632595
11537	NC_011959	CA	3	6	567798	567803	50 %	0 %	0 %	50 %	221632595
11538	NC_011959	GTC	2	6	567836	567841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632595
11539	NC_011959	TCG	2	6	568037	568042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632595
11540	NC_011959	TTC	2	6	568045	568050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632595
11541	NC_011959	GCTC	2	8	568072	568079	0 %	25 %	25 %	50 %	221632595
11542	NC_011959	CCG	2	6	568268	568273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632595
11543	NC_011959	CTGA	2	8	568282	568289	25 %	25 %	25 %	25 %	221632595
11544	NC_011959	GT	3	6	568332	568337	0 %	50 %	50 %	0 %	221632595
11545	NC_011959	ATG	2	6	568346	568351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632595
11546	NC_011959	TCG	2	6	568354	568359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632595
11547	NC_011959	CGTC	2	8	568400	568407	0 %	25 %	25 %	50 %	221632595
11548	NC_011959	GAG	2	6	568516	568521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632595
11549	NC_011959	TCCC	2	8	568537	568544	0 %	25 %	0 %	75 %	221632595
11550	NC_011959	CTC	2	6	568603	568608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632595
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11552	NC_011959	GGAG	2	8	568676	568683	25 %	0 %	75 %	0 %	221632595
11553	NC_011959	GTG	2	6	568698	568703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632595
11554	NC_011959	CGA	2	6	568728	568733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632595
11555	NC_011959	GC	3	6	568753	568758	0 %	0 %	50 %	50 %	221632595
11556	NC_011959	CCAG	2	8	568887	568894	25 %	0 %	25 %	50 %	221632595
11557	NC_011959	AG	3	6	568893	568898	50 %	0 %	50 %	0 %	221632595
11558	NC_011959	GCGTG	2	10	568950	568959	0 %	20 %	60 %	20 %	221632595
11559	NC_011959	AGG	2	6	568985	568990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632595
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11561	NC_011959	GCA	2	6	569057	569062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632595
11562	NC_011959	AGG	2	6	569075	569080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632595
11563	NC_011959	GAG	2	6	569119	569124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632595
11564	NC_011959	GCTG	2	8	569206	569213	0 %	25 %	50 %	25 %	221632595
11565	NC_011959	GGT	2	6	569227	569232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632595
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11569	NC_011959	CGC	2	6	569477	569482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632596
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11575	NC_011959	ACCGCC	2	12	569783	569794	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	221632596
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11591	NC_011959	ATG	2	6	570321	570326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632596
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11595	NC_011959	GGT	2	6	570455	570460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632597
11596	NC_011959	CGGC	2	8	570663	570670	0 %	0 %	50 %	50 %	221632597
11597	NC_011959	GCC	2	6	570673	570678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632597
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11602	NC_011959	GA	3	6	570884	570889	50 %	0 %	50 %	0 %	221632597
11603	NC_011959	GTG	2	6	570890	570895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632597
11604	NC_011959	CGAG	2	8	570897	570904	25 %	0 %	50 %	25 %	221632597
11605	NC_011959	CCA	2	6	570948	570953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632597
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11608	NC_011959	CGA	2	6	571035	571040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632597
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11610	NC_011959	GAT	2	6	571126	571131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632597
11611	NC_011959	TCGA	2	8	571210	571217	25 %	25 %	25 %	25 %	221632597
11612	NC_011959	GCA	2	6	571298	571303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632597
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11615	NC_011959	GGA	2	6	571521	571526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632597
11616	NC_011959	CGGT	2	8	571532	571539	0 %	25 %	50 %	25 %	221632597
11617	NC_011959	TCACG	2	10	571551	571560	20 %	20 %	20 %	40 %	221632597
11618	NC_011959	GC	4	8	571562	571569	0 %	0 %	50 %	50 %	221632597
11619	NC_011959	ACG	2	6	571577	571582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632597
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11859	NC_011959	CCGG	2	8	584278	584285	0 %	0 %	50 %	50 %	221632608
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11969	NC_011959	GC	3	6	592269	592274	0 %	0 %	50 %	50 %	221632620
11970	NC_011959	GGTC	2	8	592295	592302	0 %	25 %	50 %	25 %	221632620
11971	NC_011959	GCTG	2	8	592367	592374	0 %	25 %	50 %	25 %	221632620
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11978	NC_011959	GCC	2	6	592584	592589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632620
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11981	NC_011959	TCGC	2	8	592652	592659	0 %	25 %	25 %	50 %	221632620
11982	NC_011959	CGA	2	6	592672	592677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632620
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