MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 40761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_011959	CGA	2	6	540668	540673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632572
11002	NC_011959	TCG	2	6	540684	540689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632572
11003	NC_011959	ACG	2	6	540691	540696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632572
11004	NC_011959	CAT	2	6	540870	540875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632572
11005	NC_011959	ACC	2	6	541017	541022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632572
11006	NC_011959	AGG	2	6	541024	541029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632572
11007	NC_011959	TGA	2	6	541124	541129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632573
11008	NC_011959	GAG	2	6	541237	541242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632573
11009	NC_011959	GAC	2	6	541245	541250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632573
11010	NC_011959	TTG	2	6	541321	541326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632573
11011	NC_011959	AG	3	6	541334	541339	50 %	0 %	50 %	0 %	221632573
11012	NC_011959	AAG	2	6	541348	541353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632573
11013	NC_011959	TGC	2	6	541413	541418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632573
11014	NC_011959	GAA	2	6	541454	541459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632573
11015	NC_011959	AGA	2	6	541462	541467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632573
11016	NC_011959	AGG	2	6	541477	541482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632573
11017	NC_011959	GAC	2	6	541650	541655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632573
11018	NC_011959	CGA	2	6	541674	541679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632573
11019	NC_011959	GAT	2	6	541698	541703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632573
11020	NC_011959	AGT	2	6	541724	541729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632573
11021	NC_011959	CCG	2	6	541747	541752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632573
11022	NC_011959	GA	3	6	541771	541776	50 %	0 %	50 %	0 %	221632573
11023	NC_011959	CAG	2	6	541800	541805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632573
11024	NC_011959	GAGC	2	8	541811	541818	25 %	0 %	50 %	25 %	221632573
11025	NC_011959	GAA	2	6	541853	541858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632573
11026	NC_011959	GC	3	6	541894	541899	0 %	0 %	50 %	50 %	221632573
11027	NC_011959	GGT	2	6	541912	541917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632573
11028	NC_011959	TCGA	2	8	541936	541943	25 %	25 %	25 %	25 %	221632573
11029	NC_011959	TTC	2	6	542019	542024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632574
11030	NC_011959	TCTG	2	8	542033	542040	0 %	50 %	25 %	25 %	221632574
11031	NC_011959	CCAG	2	8	542981	542988	25 %	0 %	25 %	50 %	221632575
11032	NC_011959	CGTCTC	2	12	543129	543140	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	221632575
11033	NC_011959	CA	3	6	543275	543280	50 %	0 %	0 %	50 %	221632575
11034	NC_011959	CGG	2	6	543338	543343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632575
11035	NC_011959	GT	3	6	543346	543351	0 %	50 %	50 %	0 %	221632575
11036	NC_011959	TCG	2	6	543352	543357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632575
11037	NC_011959	CGTTAA	2	12	543464	543475	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	221632575
11038	NC_011959	CAG	2	6	543476	543481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632575
11039	NC_011959	TAT	2	6	543482	543487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221632575
11040	NC_011959	CGTTAA	2	12	543489	543500	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	221632575
11041	NC_011959	GTC	2	6	543516	543521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632575
11042	NC_011959	ACC	2	6	543586	543591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632575
11043	NC_011959	GAT	2	6	543702	543707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632575
11044	NC_011959	GCTC	2	8	543724	543731	0 %	25 %	25 %	50 %	221632575
11045	NC_011959	GGT	2	6	543744	543749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632575
11046	NC_011959	GTCACC	2	12	543763	543774	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	221632575
11047	NC_011959	GTT	2	6	543828	543833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632575
11048	NC_011959	GAC	2	6	543897	543902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632575
11049	NC_011959	TGG	2	6	543979	543984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632575
11050	NC_011959	CCA	2	6	543986	543991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632575
11051	NC_011959	GCA	2	6	543992	543997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632575
11052	NC_011959	GCC	2	6	543999	544004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632575
11053	NC_011959	CAC	2	6	544038	544043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632575
11054	NC_011959	GCT	2	6	544075	544080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632575
11055	NC_011959	CCGA	2	8	544081	544088	25 %	0 %	25 %	50 %	221632575
11056	NC_011959	G	6	6	544154	544159	0 %	0 %	100 %	0 %	221632575
11057	NC_011959	CAGC	2	8	544166	544173	25 %	0 %	25 %	50 %	221632575
11058	NC_011959	TGC	2	6	544243	544248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632575
11059	NC_011959	CAG	2	6	544322	544327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632575
11060	NC_011959	CCG	2	6	544372	544377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632575
11061	NC_011959	CCA	2	6	544421	544426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632575
11062	NC_011959	ACCGG	2	10	544463	544472	20 %	0 %	40 %	40 %	221632575
11063	NC_011959	GCC	2	6	544488	544493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632575
11064	NC_011959	GTCG	2	8	544497	544504	0 %	25 %	50 %	25 %	221632575
11065	NC_011959	TGG	2	6	544510	544515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632575
11066	NC_011959	CCA	2	6	544574	544579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632575
11067	NC_011959	CCG	2	6	544608	544613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632575
11068	NC_011959	CTG	2	6	544620	544625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632575
11069	NC_011959	CAGC	2	8	544671	544678	25 %	0 %	25 %	50 %	221632575
11070	NC_011959	ACCG	2	8	544710	544717	25 %	0 %	25 %	50 %	221632575
11071	NC_011959	CTG	2	6	544767	544772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632575
11072	NC_011959	CGGC	2	8	544802	544809	0 %	0 %	50 %	50 %	221632575
11073	NC_011959	GGTCG	2	10	544827	544836	0 %	20 %	60 %	20 %	221632575
11074	NC_011959	CTGG	2	8	544952	544959	0 %	25 %	50 %	25 %	221632575
11075	NC_011959	CGTTG	2	10	544985	544994	0 %	40 %	40 %	20 %	221632575
11076	NC_011959	TGCGT	2	10	545029	545038	0 %	40 %	40 %	20 %	221632575
11077	NC_011959	GATGCT	2	12	545063	545074	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	221632575
11078	NC_011959	ACC	2	6	545087	545092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632575
11079	NC_011959	GCC	2	6	545097	545102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632575
11080	NC_011959	GTC	2	6	545107	545112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632575
11081	NC_011959	TGG	2	6	545113	545118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632575
11082	NC_011959	CCT	2	6	545168	545173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632575
11083	NC_011959	GCT	2	6	545189	545194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632575
11084	NC_011959	TGGC	2	8	545240	545247	0 %	25 %	50 %	25 %	221632575
11085	NC_011959	AGC	2	6	545271	545276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632575
11086	NC_011959	AGT	2	6	545292	545297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632575
11087	NC_011959	CGGAC	2	10	545384	545393	20 %	0 %	40 %	40 %	221632576
11088	NC_011959	TCG	2	6	545468	545473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632576
11089	NC_011959	GTC	2	6	545520	545525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632576
11090	NC_011959	TGA	2	6	545531	545536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632576
11091	NC_011959	CCA	2	6	545538	545543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632576
11092	NC_011959	GCC	2	6	545554	545559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632576
11093	NC_011959	TCG	2	6	545644	545649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632576
11094	NC_011959	TCA	2	6	545735	545740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632576
11095	NC_011959	CA	3	6	545739	545744	50 %	0 %	0 %	50 %	221632576
11096	NC_011959	TCCG	2	8	545797	545804	0 %	25 %	25 %	50 %	221632577
11097	NC_011959	TCC	2	6	545839	545844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632577
11098	NC_011959	GGTC	2	8	545897	545904	0 %	25 %	50 %	25 %	221632577
11099	NC_011959	GAC	2	6	545958	545963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632577
11100	NC_011959	CAT	2	6	545967	545972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632577
11101	NC_011959	GCCG	2	8	546282	546289	0 %	0 %	50 %	50 %	221632578
11102	NC_011959	CAGG	2	8	546360	546367	25 %	0 %	50 %	25 %	221632578
11103	NC_011959	CAA	2	6	546379	546384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632578
11104	NC_011959	GTG	2	6	546415	546420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632578
11105	NC_011959	G	6	6	546428	546433	0 %	0 %	100 %	0 %	221632578
11106	NC_011959	GCG	2	6	546467	546472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632578
11107	NC_011959	CGGC	2	8	546662	546669	0 %	0 %	50 %	50 %	221632578
11108	NC_011959	GAC	2	6	546688	546693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632578
11109	NC_011959	CAGCG	2	10	546728	546737	20 %	0 %	40 %	40 %	221632578
11110	NC_011959	C	6	6	546747	546752	0 %	0 %	0 %	100 %	221632578
11111	NC_011959	CCA	2	6	546780	546785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632578
11112	NC_011959	GTC	2	6	546799	546804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632578
11113	NC_011959	GGCATC	2	12	546838	546849	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	221632578
11114	NC_011959	GGC	2	6	546863	546868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632578
11115	NC_011959	GAC	2	6	546886	546891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632578
11116	NC_011959	AGC	2	6	546942	546947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632578
11117	NC_011959	CCGA	2	8	546975	546982	25 %	0 %	25 %	50 %	221632578
11118	NC_011959	GAA	2	6	546997	547002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632578
11119	NC_011959	GTG	2	6	547063	547068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632578
11120	NC_011959	GTA	2	6	547090	547095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632578
11121	NC_011959	GGT	2	6	547172	547177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632578
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11232	NC_011959	CCAGC	2	10	553378	553387	20 %	0 %	20 %	60 %	221632584
11233	NC_011959	GGT	2	6	553442	553447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632584
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11237	NC_011959	AGT	2	6	553596	553601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632584
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11356	NC_011959	CGA	2	6	559394	559399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632588
11357	NC_011959	GGA	2	6	559427	559432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632588
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11462	NC_011959	CTCCG	2	10	564342	564351	0 %	20 %	20 %	60 %	221632591
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11473	NC_011959	CG	3	6	564799	564804	0 %	0 %	50 %	50 %	221632593
11474	NC_011959	CGAC	2	8	564809	564816	25 %	0 %	25 %	50 %	221632593
11475	NC_011959	AGC	2	6	564963	564968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632593
11476	NC_011959	GATC	2	8	564989	564996	25 %	25 %	25 %	25 %	221632593
11477	NC_011959	TCGT	2	8	565233	565240	0 %	50 %	25 %	25 %	221632593
11478	NC_011959	GTT	2	6	565262	565267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632593
11479	NC_011959	CG	5	10	565346	565355	0 %	0 %	50 %	50 %	221632593
11480	NC_011959	AGC	2	6	565356	565361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632593
11481	NC_011959	CGC	2	6	565421	565426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632593
11482	NC_011959	GCT	2	6	565436	565441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632593
11483	NC_011959	CGA	2	6	565442	565447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632593
11484	NC_011959	GCC	2	6	565471	565476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632593
11485	NC_011959	CAC	2	6	565484	565489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632593
11486	NC_011959	AATCC	2	10	565512	565521	40 %	20 %	0 %	40 %	221632593
11487	NC_011959	TCGC	2	8	565555	565562	0 %	25 %	25 %	50 %	221632593
11488	NC_011959	TGT	2	6	565643	565648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632593
11489	NC_011959	ACG	2	6	565702	565707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632593
11490	NC_011959	CTT	2	6	565772	565777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632593
11491	NC_011959	CGA	2	6	565805	565810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632593
11492	NC_011959	TCG	2	6	565822	565827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632593
11493	NC_011959	CGA	2	6	565832	565837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632593
11494	NC_011959	GATGTC	2	12	565839	565850	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	221632593
11495	NC_011959	GCG	2	6	565869	565874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632593
11496	NC_011959	GATC	2	8	565889	565896	25 %	25 %	25 %	25 %	221632593
11497	NC_011959	CCA	2	6	565928	565933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632593
11498	NC_011959	CCT	2	6	565934	565939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632593
11499	NC_011959	GAG	3	9	565962	565970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632593
11500	NC_011959	CTC	2	6	566016	566021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632593

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