MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 40761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_011959	GC	3	6	516325	516330	0 %	0 %	50 %	50 %	221632544
10502	NC_011959	GCGA	2	8	516385	516392	25 %	0 %	50 %	25 %	221632544
10503	NC_011959	CTC	2	6	516418	516423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632544
10504	NC_011959	CGA	2	6	516444	516449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632544
10505	NC_011959	AAG	3	9	516526	516534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632544
10506	NC_011959	TGC	2	6	516552	516557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632544
10507	NC_011959	GCA	3	9	516586	516594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632544
10508	NC_011959	GCG	2	6	516675	516680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632544
10509	NC_011959	TTG	2	6	516948	516953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632545
10510	NC_011959	CTT	2	6	516958	516963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632545
10511	NC_011959	GCT	2	6	516987	516992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632545
10512	NC_011959	ATG	2	6	517011	517016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632545
10513	NC_011959	GCTC	2	8	517174	517181	0 %	25 %	25 %	50 %	221632545
10514	NC_011959	CGA	2	6	517228	517233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632545
10515	NC_011959	GTT	2	6	517244	517249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632545
10516	NC_011959	CTGG	2	8	517250	517257	0 %	25 %	50 %	25 %	221632545
10517	NC_011959	GAG	2	6	517286	517291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632545
10518	NC_011959	GGC	2	6	517358	517363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632545
10519	NC_011959	ACC	2	6	517395	517400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632545
10520	NC_011959	CTT	2	6	517432	517437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632545
10521	NC_011959	TGA	2	6	517576	517581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632545
10522	NC_011959	AGT	2	6	517585	517590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632545
10523	NC_011959	GAG	2	6	517601	517606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632545
10524	NC_011959	ATG	2	6	517620	517625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632545
10525	NC_011959	CGT	2	6	517654	517659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632545
10526	NC_011959	TGC	2	6	517816	517821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632545
10527	NC_011959	CG	3	6	517852	517857	0 %	0 %	50 %	50 %	221632545
10528	NC_011959	GTCGGC	2	12	517881	517892	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	221632545
10529	NC_011959	GCAG	2	8	517904	517911	25 %	0 %	50 %	25 %	221632545
10530	NC_011959	CGAA	2	8	517930	517937	50 %	0 %	25 %	25 %	221632545
10531	NC_011959	CGC	2	6	517959	517964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632545
10532	NC_011959	CTG	2	6	517991	517996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632545
10533	NC_011959	CGAC	2	8	518060	518067	25 %	0 %	25 %	50 %	221632546
10534	NC_011959	AGC	2	6	518112	518117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632546
10535	NC_011959	CGC	2	6	518157	518162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632546
10536	NC_011959	CGT	2	6	518189	518194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632546
10537	NC_011959	GAA	2	6	518213	518218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632546
10538	NC_011959	TGA	2	6	518221	518226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632546
10539	NC_011959	GTC	2	6	518231	518236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632546
10540	NC_011959	CAA	2	6	518255	518260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632546
10541	NC_011959	GAT	2	6	518270	518275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632546
10542	NC_011959	GAG	2	6	518285	518290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632546
10543	NC_011959	GC	3	6	518382	518387	0 %	0 %	50 %	50 %	221632546
10544	NC_011959	ACG	2	6	518388	518393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632546
10545	NC_011959	CGA	2	6	518398	518403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632546
10546	NC_011959	GATCGT	2	12	518429	518440	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	221632546
10547	NC_011959	CTTGAG	2	12	518453	518464	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	221632546
10548	NC_011959	GAA	2	6	518468	518473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632546
10549	NC_011959	CCAG	2	8	518479	518486	25 %	0 %	25 %	50 %	221632546
10550	NC_011959	GAA	2	6	518501	518506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632546
10551	NC_011959	CAG	2	6	518510	518515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632546
10552	NC_011959	GAT	2	6	518543	518548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632546
10553	NC_011959	GC	3	6	518611	518616	0 %	0 %	50 %	50 %	221632546
10554	NC_011959	TCG	2	6	518644	518649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632546
10555	NC_011959	GCG	2	6	518679	518684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632546
10556	NC_011959	GC	3	6	518711	518716	0 %	0 %	50 %	50 %	221632546
10557	NC_011959	GAT	2	6	518789	518794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632546
10558	NC_011959	ATTGAG	2	12	518828	518839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632546
10559	NC_011959	GAAA	2	8	518852	518859	75 %	0 %	25 %	0 %	221632546
10560	NC_011959	TCG	3	9	518878	518886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632546
10561	NC_011959	CCG	2	6	518917	518922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632547
10562	NC_011959	ACGA	2	8	518978	518985	50 %	0 %	25 %	25 %	221632547
10563	NC_011959	CTG	2	6	519025	519030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632547
10564	NC_011959	GCC	2	6	519061	519066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632547
10565	NC_011959	AGA	2	6	519168	519173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632547
10566	NC_011959	TCGA	2	8	519233	519240	25 %	25 %	25 %	25 %	221632547
10567	NC_011959	ACG	2	6	519293	519298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632547
10568	NC_011959	AG	5	10	519317	519326	50 %	0 %	50 %	0 %	221632547
10569	NC_011959	CGAT	2	8	519329	519336	25 %	25 %	25 %	25 %	221632547
10570	NC_011959	GTT	2	6	519358	519363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632547
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10572	NC_011959	ATG	2	6	519392	519397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632547
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10574	NC_011959	GCG	2	6	519466	519471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632547
10575	NC_011959	CGAAGG	2	12	519489	519500	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	221632547
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10577	NC_011959	GC	3	6	519589	519594	0 %	0 %	50 %	50 %	221632547
10578	NC_011959	GCGA	2	8	519643	519650	25 %	0 %	50 %	25 %	221632547
10579	NC_011959	AAG	2	6	519683	519688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632547
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10581	NC_011959	AG	3	6	519726	519731	50 %	0 %	50 %	0 %	221632547
10582	NC_011959	GC	3	6	519767	519772	0 %	0 %	50 %	50 %	221632547
10583	NC_011959	TCG	2	6	519960	519965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632548
10584	NC_011959	GAC	2	6	519982	519987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632548
10585	NC_011959	CTT	2	6	520017	520022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632548
10586	NC_011959	ATTCG	2	10	520219	520228	20 %	40 %	20 %	20 %	221632548
10587	NC_011959	CGA	2	6	520242	520247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632548
10588	NC_011959	TCA	2	6	520311	520316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632548
10589	NC_011959	CTT	3	9	520344	520352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632548
10590	NC_011959	CGTG	2	8	520356	520363	0 %	25 %	50 %	25 %	221632548
10591	NC_011959	TGT	3	9	520514	520522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632548
10592	NC_011959	CTC	2	6	520549	520554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632548
10593	NC_011959	TCG	2	6	520607	520612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632548
10594	NC_011959	CG	3	6	520611	520616	0 %	0 %	50 %	50 %	221632548
10595	NC_011959	CGG	2	6	520736	520741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632548
10596	NC_011959	TCCC	2	8	520953	520960	0 %	25 %	0 %	75 %	221632548
10597	NC_011959	CGAT	2	8	521065	521072	25 %	25 %	25 %	25 %	221632549
10598	NC_011959	CAG	2	6	521085	521090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632549
10599	NC_011959	ATC	2	6	521225	521230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632549
10600	NC_011959	GT	3	6	521243	521248	0 %	50 %	50 %	0 %	221632549
10601	NC_011959	GCA	2	6	521289	521294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632549
10602	NC_011959	GTG	2	6	521316	521321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632549
10603	NC_011959	CAC	2	6	521324	521329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632549
10604	NC_011959	AG	3	6	521395	521400	50 %	0 %	50 %	0 %	221632549
10605	NC_011959	GCC	2	6	521448	521453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632549
10606	NC_011959	T	6	6	521455	521460	0 %	100 %	0 %	0 %	221632549
10607	NC_011959	GAT	2	6	521504	521509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632549
10608	NC_011959	GGT	2	6	521531	521536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632549
10609	NC_011959	TCC	2	6	521573	521578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632549
10610	NC_011959	TAA	2	6	521645	521650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221632549
10611	NC_011959	AGTG	2	8	521684	521691	25 %	25 %	50 %	0 %	221632549
10612	NC_011959	AAT	2	6	521719	521724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221632549
10613	NC_011959	GAT	2	6	521780	521785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632549
10614	NC_011959	GAC	2	6	521824	521829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632549
10615	NC_011959	TGA	2	6	521836	521841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632549
10616	NC_011959	GGT	2	6	521909	521914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632549
10617	NC_011959	GAC	2	6	521936	521941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632549
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10619	NC_011959	ACC	2	6	522059	522064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632549
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10980	NC_011959	CGG	2	6	539654	539659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632569
10981	NC_011959	CT	3	6	539664	539669	0 %	50 %	0 %	50 %	221632569
10982	NC_011959	AGCG	2	8	539791	539798	25 %	0 %	50 %	25 %	221632570
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