MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 40761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_011959	AGGT	2	8	490940	490947	25 %	25 %	50 %	0 %	221632521
10002	NC_011959	TCG	3	9	490964	490972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632521
10003	NC_011959	CG	3	6	490995	491000	0 %	0 %	50 %	50 %	221632521
10004	NC_011959	CCG	2	6	491027	491032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632521
10005	NC_011959	TCG	2	6	491048	491053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632521
10006	NC_011959	TCG	2	6	491093	491098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632521
10007	NC_011959	GC	4	8	491133	491140	0 %	0 %	50 %	50 %	221632521
10008	NC_011959	TCC	2	6	491162	491167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632521
10009	NC_011959	CAGC	2	8	491203	491210	25 %	0 %	25 %	50 %	221632521
10010	NC_011959	GTT	2	6	491239	491244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632521
10011	NC_011959	TCC	2	6	491251	491256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632521
10012	NC_011959	TCC	2	6	491269	491274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632521
10013	NC_011959	TGG	2	6	491339	491344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632521
10014	NC_011959	CCG	2	6	491522	491527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632521
10015	NC_011959	CGG	2	6	491543	491548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632521
10016	NC_011959	ACGC	2	8	491577	491584	25 %	0 %	25 %	50 %	221632521
10017	NC_011959	AGG	2	6	491624	491629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632521
10018	NC_011959	CGG	2	6	491642	491647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632521
10019	NC_011959	CTT	2	6	491650	491655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632521
10020	NC_011959	CAG	2	6	491697	491702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632521
10021	NC_011959	CGT	2	6	491826	491831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632521
10022	NC_011959	GC	3	6	491839	491844	0 %	0 %	50 %	50 %	221632521
10023	NC_011959	AAGTAG	2	12	491870	491881	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	221632521
10024	NC_011959	CGA	2	6	491988	491993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632521
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10027	NC_011959	CG	3	6	492171	492176	0 %	0 %	50 %	50 %	221632521
10028	NC_011959	ATC	2	6	492197	492202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632521
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10030	NC_011959	ATCG	2	8	492331	492338	25 %	25 %	25 %	25 %	221632521
10031	NC_011959	TCG	2	6	492355	492360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632521
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10036	NC_011959	CTC	2	6	492619	492624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632522
10037	NC_011959	CGT	2	6	492651	492656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632522
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10040	NC_011959	CGCT	2	8	492763	492770	0 %	25 %	25 %	50 %	221632522
10041	NC_011959	TGC	2	6	492778	492783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632522
10042	NC_011959	TGC	2	6	492829	492834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632522
10043	NC_011959	TGA	2	6	492840	492845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632522
10044	NC_011959	TCGGGT	2	12	492888	492899	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	221632522
10045	NC_011959	TGAA	2	8	492912	492919	50 %	25 %	25 %	0 %	221632522
10046	NC_011959	CGA	2	6	492972	492977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632522
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10048	NC_011959	CGCTT	2	10	493085	493094	0 %	40 %	20 %	40 %	221632522
10049	NC_011959	GTGC	2	8	493124	493131	0 %	25 %	50 %	25 %	221632522
10050	NC_011959	GAT	2	6	493132	493137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632522
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10052	NC_011959	GC	3	6	493272	493277	0 %	0 %	50 %	50 %	221632522
10053	NC_011959	GGT	2	6	493306	493311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632522
10054	NC_011959	CGA	2	6	493356	493361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632522
10055	NC_011959	CGA	2	6	493446	493451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632522
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10057	NC_011959	GCA	2	6	493460	493465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632522
10058	NC_011959	CGT	2	6	493501	493506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632522
10059	NC_011959	GAG	2	6	493630	493635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632522
10060	NC_011959	GTTC	2	8	493716	493723	0 %	50 %	25 %	25 %	221632522
10061	NC_011959	TGC	2	6	494164	494169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632523
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10086	NC_011959	CGG	2	6	495168	495173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632524
10087	NC_011959	CAC	2	6	495248	495253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632524
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10089	NC_011959	TCG	2	6	495315	495320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632524
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10099	NC_011959	GC	3	6	495743	495748	0 %	0 %	50 %	50 %	221632524
10100	NC_011959	TGG	2	6	495782	495787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632524
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10103	NC_011959	TTC	2	6	495951	495956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632525
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10105	NC_011959	TCG	2	6	496086	496091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632525
10106	NC_011959	GA	3	6	496100	496105	50 %	0 %	50 %	0 %	221632525
10107	NC_011959	GTGC	2	8	497073	497080	0 %	25 %	50 %	25 %	221632526
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10109	NC_011959	CGC	2	6	497158	497163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632526
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10111	NC_011959	CCG	2	6	497399	497404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632526
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10114	NC_011959	C	6	6	497492	497497	0 %	0 %	0 %	100 %	221632526
10115	NC_011959	GTG	2	6	497506	497511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632526
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10117	NC_011959	CG	3	6	497556	497561	0 %	0 %	50 %	50 %	221632526
10118	NC_011959	CTGGC	2	10	497630	497639	0 %	20 %	40 %	40 %	221632526
10119	NC_011959	CTCC	2	8	497669	497676	0 %	25 %	0 %	75 %	221632526
10120	NC_011959	GCG	2	6	497677	497682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632526
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10151	NC_011959	CGC	2	6	499402	499407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632527
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10238	NC_011959	TCG	2	6	503939	503944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632531
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10242	NC_011959	ACGT	2	8	504154	504161	25 %	25 %	25 %	25 %	221632531
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10358	NC_011959	GAA	2	6	509562	509567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632535
10359	NC_011959	TGTA	2	8	509596	509603	25 %	50 %	25 %	0 %	221632535
10360	NC_011959	AC	3	6	509669	509674	50 %	0 %	0 %	50 %	221632535
10361	NC_011959	CAG	2	6	509679	509684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632535
10362	NC_011959	TCG	2	6	509731	509736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632535
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10364	NC_011959	GCA	2	6	509807	509812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632535
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10372	NC_011959	CGGCG	2	10	510050	510059	0 %	0 %	60 %	40 %	221632535
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10473	NC_011959	ATG	2	6	514851	514856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632541
10474	NC_011959	GTC	2	6	514893	514898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632542
10475	NC_011959	GCT	2	6	514899	514904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632542
10476	NC_011959	CGA	2	6	514929	514934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632542
10477	NC_011959	GAT	2	6	514959	514964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632542
10478	NC_011959	CAG	2	6	515014	515019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632542
10479	NC_011959	CGA	2	6	515043	515048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632542
10480	NC_011959	TCC	2	6	515059	515064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632542
10481	NC_011959	TTG	2	6	515098	515103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632542
10482	NC_011959	GC	3	6	515214	515219	0 %	0 %	50 %	50 %	221632542
10483	NC_011959	GCA	2	6	515241	515246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632542
10484	NC_011959	AGG	2	6	515292	515297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632542
10485	NC_011959	GCC	2	6	515354	515359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632542
10486	NC_011959	TAA	2	6	515377	515382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221632542
10487	NC_011959	CGC	2	6	515404	515409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632542
10488	NC_011959	TCTCC	2	10	515589	515598	0 %	40 %	0 %	60 %	221632543
10489	NC_011959	CGG	2	6	515611	515616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632543
10490	NC_011959	TCG	2	6	515651	515656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632543
10491	NC_011959	TCG	2	6	515711	515716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632543
10492	NC_011959	CGG	2	6	515800	515805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632543
10493	NC_011959	GC	3	6	515870	515875	0 %	0 %	50 %	50 %	221632543
10494	NC_011959	CCG	2	6	515882	515887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632543
10495	NC_011959	CGC	2	6	515940	515945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632543
10496	NC_011959	CGC	2	6	516004	516009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632543
10497	NC_011959	GC	3	6	516030	516035	0 %	0 %	50 %	50 %	221632543
10498	NC_011959	CG	3	6	516119	516124	0 %	0 %	50 %	50 %	221632544
10499	NC_011959	GCGG	2	8	516183	516190	0 %	0 %	75 %	25 %	221632544
10500	NC_011959	GTC	2	6	516316	516321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632544

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