MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 40761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011959	CGA	2	6	24881	24886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632058
502	NC_011959	GTC	2	6	24903	24908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632058
503	NC_011959	GAC	2	6	24977	24982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632058
504	NC_011959	TCG	2	6	25136	25141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632059
505	NC_011959	ACG	2	6	25145	25150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632059
506	NC_011959	CG	3	6	25167	25172	0 %	0 %	50 %	50 %	221632059
507	NC_011959	GCC	2	6	25187	25192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632059
508	NC_011959	ACTC	2	8	25233	25240	25 %	25 %	0 %	50 %	221632059
509	NC_011959	CCG	2	6	25251	25256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632059
510	NC_011959	GCA	2	6	25260	25265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632059
511	NC_011959	ATCG	2	8	25282	25289	25 %	25 %	25 %	25 %	221632059
512	NC_011959	AACC	2	8	25366	25373	50 %	0 %	0 %	50 %	221632059
513	NC_011959	CTCCGC	2	12	25398	25409	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	221632060
514	NC_011959	GGC	2	6	25425	25430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632060
515	NC_011959	CCA	2	6	25478	25483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632060
516	NC_011959	CGG	2	6	25503	25508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632060
517	NC_011959	ACC	2	6	25510	25515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632060
518	NC_011959	CGA	2	6	25520	25525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632060
519	NC_011959	CGC	2	6	25530	25535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632060
520	NC_011959	CAGCG	2	10	25551	25560	20 %	0 %	40 %	40 %	221632060
521	NC_011959	CGGA	2	8	25581	25588	25 %	0 %	50 %	25 %	221632060
522	NC_011959	TGA	3	9	25592	25600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632060
523	NC_011959	CGC	2	6	25617	25622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632060
524	NC_011959	GAT	2	6	25674	25679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632060
525	NC_011959	CCA	2	6	25727	25732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632060
526	NC_011959	CCG	2	6	25735	25740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632060
527	NC_011959	CGC	2	6	25745	25750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632060
528	NC_011959	CGT	2	6	25760	25765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632060
529	NC_011959	CGT	2	6	25781	25786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632060
530	NC_011959	CGG	2	6	25805	25810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632060
531	NC_011959	AAC	2	6	25843	25848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632060
532	NC_011959	GGC	2	6	25881	25886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632060
533	NC_011959	CGC	2	6	25923	25928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632060
534	NC_011959	CGC	2	6	25935	25940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632060
535	NC_011959	CAC	2	6	25950	25955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632060
536	NC_011959	CCG	2	6	26000	26005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632060
537	NC_011959	GCC	2	6	26028	26033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632060
538	NC_011959	GAT	2	6	26079	26084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632060
539	NC_011959	TCG	2	6	26117	26122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632060
540	NC_011959	TCG	2	6	26204	26209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632060
541	NC_011959	GGC	2	6	26244	26249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632060
542	NC_011959	GGT	2	6	26289	26294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632060
543	NC_011959	CGA	2	6	26324	26329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632060
544	NC_011959	GCG	2	6	26369	26374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632060
545	NC_011959	GAT	2	6	26397	26402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632060
546	NC_011959	GC	3	6	26704	26709	0 %	0 %	50 %	50 %	221632061
547	NC_011959	TCGT	2	8	26746	26753	0 %	50 %	25 %	25 %	221632061
548	NC_011959	GAT	2	6	26778	26783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632061
549	NC_011959	GGCA	2	8	26818	26825	25 %	0 %	50 %	25 %	221632061
550	NC_011959	GC	3	6	26884	26889	0 %	0 %	50 %	50 %	221632061
551	NC_011959	GTG	2	6	26891	26896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632061
552	NC_011959	CGA	3	9	26912	26920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632061
553	NC_011959	GCG	2	6	26961	26966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632061
554	NC_011959	CGG	2	6	27017	27022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632061
555	NC_011959	CAG	2	6	27036	27041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632061
556	NC_011959	AGC	2	6	27106	27111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632061
557	NC_011959	GTG	2	6	27139	27144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632061
558	NC_011959	GAT	2	6	27159	27164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632061
559	NC_011959	TGC	2	6	27210	27215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632061
560	NC_011959	CCT	2	6	27299	27304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632062
561	NC_011959	CG	3	6	27312	27317	0 %	0 %	50 %	50 %	221632062
562	NC_011959	GCT	2	6	27327	27332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632062
563	NC_011959	CG	3	6	27381	27386	0 %	0 %	50 %	50 %	221632062
564	NC_011959	CGA	2	6	27432	27437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632062
565	NC_011959	CGA	2	6	27486	27491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632062
566	NC_011959	GCA	2	6	27524	27529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632062
567	NC_011959	CCACC	2	10	27543	27552	20 %	0 %	0 %	80 %	221632062
568	NC_011959	AGA	2	6	27558	27563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632062
569	NC_011959	ACG	2	6	27566	27571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632062
570	NC_011959	GCA	2	6	27632	27637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632062
571	NC_011959	TTC	2	6	27646	27651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632062
572	NC_011959	CGA	2	6	27714	27719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632062
573	NC_011959	TGC	2	6	27744	27749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632062
574	NC_011959	ATC	2	6	27752	27757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632062
575	NC_011959	CG	3	6	27798	27803	0 %	0 %	50 %	50 %	221632062
576	NC_011959	GTC	2	6	27853	27858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632062
577	NC_011959	TCG	2	6	27881	27886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632062
578	NC_011959	CGA	2	6	27924	27929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632062
579	NC_011959	CCT	2	6	27972	27977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632062
580	NC_011959	GGA	2	6	27984	27989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632062
581	NC_011959	CGG	2	6	28028	28033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632062
582	NC_011959	ACGGCG	2	12	28064	28075	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	221632062
583	NC_011959	GAC	2	6	28111	28116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632062
584	NC_011959	ATG	2	6	28121	28126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632062
585	NC_011959	CGC	2	6	28128	28133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632062
586	NC_011959	GCT	2	6	28245	28250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632063
587	NC_011959	CGA	2	6	28319	28324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632063
588	NC_011959	GCG	2	6	28327	28332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632063
589	NC_011959	ACGA	2	8	28360	28367	50 %	0 %	25 %	25 %	221632063
590	NC_011959	CGA	2	6	28385	28390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632063
591	NC_011959	CAC	2	6	28477	28482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632063
592	NC_011959	CGG	2	6	28496	28501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632063
593	NC_011959	GC	3	6	28517	28522	0 %	0 %	50 %	50 %	221632063
594	NC_011959	CAG	2	6	28548	28553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632063
595	NC_011959	CGC	2	6	28579	28584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632063
596	NC_011959	G	6	6	28600	28605	0 %	0 %	100 %	0 %	221632063
597	NC_011959	GGC	2	6	28610	28615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632063
598	NC_011959	GAT	2	6	28716	28721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632063
599	NC_011959	GTG	2	6	28762	28767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632063
600	NC_011959	GCG	2	6	28805	28810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632063
601	NC_011959	GTGGCG	2	12	28811	28822	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	221632063
602	NC_011959	GTC	2	6	28848	28853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632063
603	NC_011959	CGA	2	6	28856	28861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632063
604	NC_011959	GCC	2	6	28970	28975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632063
605	NC_011959	GC	3	6	28987	28992	0 %	0 %	50 %	50 %	221632063
606	NC_011959	TCG	2	6	29020	29025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632063
607	NC_011959	CGA	2	6	29120	29125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632063
608	NC_011959	CGA	2	6	29135	29140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632063
609	NC_011959	GAC	2	6	29166	29171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632063
610	NC_011959	CCG	2	6	29183	29188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632063
611	NC_011959	TCG	2	6	29299	29304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632063
612	NC_011959	AGC	2	6	29305	29310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632063
613	NC_011959	GCG	3	9	29383	29391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632063
614	NC_011959	CGC	2	6	29462	29467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632063
615	NC_011959	CGG	2	6	29468	29473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632063
616	NC_011959	CGA	3	9	29504	29512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632063
617	NC_011959	TGA	2	6	29537	29542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632063
618	NC_011959	GGC	2	6	29604	29609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632064
619	NC_011959	CGGG	2	8	29639	29646	0 %	0 %	75 %	25 %	221632064
620	NC_011959	CGC	2	6	29651	29656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632064
621	NC_011959	CGG	2	6	29668	29673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632064
622	NC_011959	GCT	2	6	29675	29680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632064
623	NC_011959	CAGC	2	8	29681	29688	25 %	0 %	25 %	50 %	221632064
624	NC_011959	CCT	2	6	29740	29745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632064
625	NC_011959	CCAA	2	8	29827	29834	50 %	0 %	0 %	50 %	221632064
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752	NC_011959	CG	3	6	40822	40827	0 %	0 %	50 %	50 %	221632069
753	NC_011959	CCT	2	6	40942	40947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632069
754	NC_011959	TGG	2	6	40965	40970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632069
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757	NC_011959	CGG	2	6	41049	41054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632069
758	NC_011959	TCT	2	6	41083	41088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632069
759	NC_011959	GCT	2	6	41122	41127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632069
760	NC_011959	GCTC	2	8	41146	41153	0 %	25 %	25 %	50 %	221632069
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763	NC_011959	CG	4	8	41192	41199	0 %	0 %	50 %	50 %	221632070
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876	NC_011959	AGCC	2	8	46928	46935	25 %	0 %	25 %	50 %	221632077
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1000	NC_011959	AGC	2	6	52270	52275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632083

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