MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 40761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_011959	CAG	2	6	314336	314341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632338
6502	NC_011959	AGC	2	6	314352	314357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632338
6503	NC_011959	GAG	2	6	314359	314364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632338
6504	NC_011959	GAA	2	6	314374	314379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632338
6505	NC_011959	CG	4	8	314403	314410	0 %	0 %	50 %	50 %	221632338
6506	NC_011959	GTGC	2	8	314415	314422	0 %	25 %	50 %	25 %	221632338
6507	NC_011959	GCA	2	6	314426	314431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632338
6508	NC_011959	CGC	2	6	314449	314454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632338
6509	NC_011959	CGCA	2	8	314541	314548	25 %	0 %	25 %	50 %	221632338
6510	NC_011959	GAC	2	6	314596	314601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632338
6511	NC_011959	TG	3	6	314630	314635	0 %	50 %	50 %	0 %	221632338
6512	NC_011959	GTC	2	6	314677	314682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632338
6513	NC_011959	GA	3	6	314707	314712	50 %	0 %	50 %	0 %	221632338
6514	NC_011959	CGTC	2	8	314721	314728	0 %	25 %	25 %	50 %	221632338
6515	NC_011959	CG	3	6	314786	314791	0 %	0 %	50 %	50 %	221632338
6516	NC_011959	CGA	2	6	314820	314825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632338
6517	NC_011959	GCC	2	6	314837	314842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632338
6518	NC_011959	GATC	2	8	314851	314858	25 %	25 %	25 %	25 %	221632338
6519	NC_011959	GAC	2	6	314884	314889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632338
6520	NC_011959	GCG	2	6	314897	314902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632338
6521	NC_011959	CGA	2	6	314942	314947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632338
6522	NC_011959	GTT	2	6	314983	314988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632338
6523	NC_011959	CGA	2	6	315030	315035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632338
6524	NC_011959	CGG	2	6	315045	315050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632338
6525	NC_011959	CGG	2	6	315114	315119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632338
6526	NC_011959	TCG	2	6	315120	315125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632338
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6528	NC_011959	CG	3	6	315213	315218	0 %	0 %	50 %	50 %	221632338
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6530	NC_011959	GCTC	2	8	315302	315309	0 %	25 %	25 %	50 %	221632338
6531	NC_011959	GC	3	6	315315	315320	0 %	0 %	50 %	50 %	221632338
6532	NC_011959	GCC	2	6	315374	315379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632338
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6534	NC_011959	GAA	2	6	315505	315510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632338
6535	NC_011959	CTG	2	6	315513	315518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632338
6536	NC_011959	TCG	2	6	315539	315544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632338
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6538	NC_011959	ATG	2	6	315703	315708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632339
6539	NC_011959	AGGGA	2	10	315716	315725	40 %	0 %	60 %	0 %	221632339
6540	NC_011959	GAG	2	6	315733	315738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632339
6541	NC_011959	GAC	2	6	315798	315803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632339
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6545	NC_011959	GCGT	2	8	316127	316134	0 %	25 %	50 %	25 %	221632339
6546	NC_011959	CGA	2	6	316140	316145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632339
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6553	NC_011959	CGAT	2	8	316397	316404	25 %	25 %	25 %	25 %	221632339
6554	NC_011959	GGCT	2	8	316406	316413	0 %	25 %	50 %	25 %	221632339
6555	NC_011959	GGA	2	6	316437	316442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632340
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6558	NC_011959	GGC	2	6	316722	316727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632340
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6561	NC_011959	CTG	2	6	316839	316844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632340
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6572	NC_011959	CG	3	6	317592	317597	0 %	0 %	50 %	50 %	221632341
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6586	NC_011959	GTG	2	6	318268	318273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632342
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6591	NC_011959	CGA	2	6	318434	318439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632342
6592	NC_011959	GGTC	2	8	318470	318477	0 %	25 %	50 %	25 %	221632342
6593	NC_011959	GGT	2	6	318488	318493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632342
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6604	NC_011959	GC	3	6	319113	319118	0 %	0 %	50 %	50 %	221632342
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6620	NC_011959	GAG	2	6	319883	319888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632343
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6622	NC_011959	GCC	2	6	319991	319996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632343
6623	NC_011959	CCGG	2	8	320019	320026	0 %	0 %	50 %	50 %	221632343
6624	NC_011959	ACG	3	9	320064	320072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632343
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6643	NC_011959	TCG	2	6	320724	320729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632344
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6729	NC_011959	GGTC	2	8	326409	326416	0 %	25 %	50 %	25 %	221632350
6730	NC_011959	ACG	2	6	326438	326443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632350
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6732	NC_011959	GTC	2	6	326595	326600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632351
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6735	NC_011959	CGGC	2	8	326654	326661	0 %	0 %	50 %	50 %	221632351
6736	NC_011959	GAT	2	6	326679	326684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632351
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6739	NC_011959	TGC	2	6	326890	326895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632351
6740	NC_011959	GTG	2	6	326919	326924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632351
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6743	NC_011959	GCG	2	6	327117	327122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632351
6744	NC_011959	CGC	2	6	327131	327136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632351
6745	NC_011959	GCG	2	6	327144	327149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632351
6746	NC_011959	TGA	2	6	327161	327166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632351
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6863	NC_011959	CA	3	6	334445	334450	50 %	0 %	0 %	50 %	221632360
6864	NC_011959	CGCC	2	8	334459	334466	0 %	0 %	25 %	75 %	221632360
6865	NC_011959	ATCG	2	8	334499	334506	25 %	25 %	25 %	25 %	221632360
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6871	NC_011959	CGA	2	6	335062	335067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632360
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6985	NC_011959	CGA	2	6	339717	339722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632364
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6987	NC_011959	GC	3	6	339766	339771	0 %	0 %	50 %	50 %	221632364
6988	NC_011959	CGC	2	6	339806	339811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632364
6989	NC_011959	CGC	2	6	339890	339895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632364
6990	NC_011959	AGTCG	2	10	339916	339925	20 %	20 %	40 %	20 %	221632364
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