MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 73430

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011901	CTG	2	6	140769	140774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933322
3002	NC_011901	CAG	2	6	140775	140780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933322
3003	NC_011901	CAA	2	6	140819	140824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933322
3004	NC_011901	CGC	2	6	140845	140850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933322
3005	NC_011901	GC	3	6	140904	140909	0 %	0 %	50 %	50 %	220933322
3006	NC_011901	CCT	2	6	140923	140928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933322
3007	NC_011901	ACG	2	6	140962	140967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933322
3008	NC_011901	TCT	2	6	141007	141012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933322
3009	NC_011901	GCT	2	6	141023	141028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933322
3010	NC_011901	CAC	2	6	141029	141034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933322
3011	NC_011901	CG	3	6	141060	141065	0 %	0 %	50 %	50 %	220933322
3012	NC_011901	CATC	2	8	141083	141090	25 %	25 %	0 %	50 %	220933322
3013	NC_011901	CGA	2	6	141104	141109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933322
3014	NC_011901	CCT	2	6	141115	141120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933322
3015	NC_011901	CGC	2	6	141722	141727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933323
3016	NC_011901	CCG	2	6	141756	141761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933323
3017	NC_011901	C	6	6	141790	141795	0 %	0 %	0 %	100 %	220933323
3018	NC_011901	GGC	2	6	141836	141841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933323
3019	NC_011901	CGC	2	6	141905	141910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933323
3020	NC_011901	CCG	2	6	141961	141966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933323
3021	NC_011901	CTG	2	6	142068	142073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933323
3022	NC_011901	GCC	2	6	142074	142079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933323
3023	NC_011901	GCT	2	6	142124	142129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933323
3024	NC_011901	GC	3	6	142130	142135	0 %	0 %	50 %	50 %	220933323
3025	NC_011901	ACG	2	6	142141	142146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933323
3026	NC_011901	TGG	2	6	142161	142166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933323
3027	NC_011901	GCC	2	6	142177	142182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933323
3028	NC_011901	CCG	2	6	142300	142305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933323
3029	NC_011901	GCA	2	6	142356	142361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933323
3030	NC_011901	GCC	2	6	142365	142370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933323
3031	NC_011901	AGC	2	6	142478	142483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933324
3032	NC_011901	GGT	2	6	142545	142550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933324
3033	NC_011901	CGC	2	6	142620	142625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933324
3034	NC_011901	CAT	2	6	142699	142704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933324
3035	NC_011901	GAA	2	6	142711	142716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933324
3036	NC_011901	GCT	2	6	142749	142754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933324
3037	NC_011901	CTG	2	6	142798	142803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933324
3038	NC_011901	GGA	2	6	142824	142829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933324
3039	NC_011901	CGCCA	2	10	142894	142903	20 %	0 %	20 %	60 %	220933324
3040	NC_011901	CCG	2	6	142904	142909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933324
3041	NC_011901	CCA	2	6	143034	143039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933324
3042	NC_011901	GCT	2	6	143046	143051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933324
3043	NC_011901	GAC	2	6	143056	143061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933324
3044	NC_011901	CAG	3	9	143125	143133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933324
3045	NC_011901	CCG	2	6	143174	143179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933324
3046	NC_011901	CCGC	2	8	143228	143235	0 %	0 %	25 %	75 %	220933324
3047	NC_011901	ACC	2	6	143248	143253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933324
3048	NC_011901	CGC	2	6	143262	143267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933324
3049	NC_011901	GGC	2	6	143286	143291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933324
3050	NC_011901	TGG	2	6	143342	143347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933324
3051	NC_011901	GAGC	2	8	143451	143458	25 %	0 %	50 %	25 %	220933324
3052	NC_011901	GCT	2	6	143460	143465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933324
3053	NC_011901	CTG	2	6	143476	143481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933324
3054	NC_011901	CCGC	2	8	143493	143500	0 %	0 %	25 %	75 %	220933324
3055	NC_011901	CCGC	2	8	143519	143526	0 %	0 %	25 %	75 %	220933324
3056	NC_011901	GCT	2	6	143574	143579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933324
3057	NC_011901	GATC	2	8	143590	143597	25 %	25 %	25 %	25 %	220933324
3058	NC_011901	TGA	2	6	143732	143737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933325
3059	NC_011901	GC	3	6	143739	143744	0 %	0 %	50 %	50 %	220933325
3060	NC_011901	TCG	3	9	143746	143754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933325
3061	NC_011901	TCG	2	6	143797	143802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933325
3062	NC_011901	CG	3	6	143801	143806	0 %	0 %	50 %	50 %	220933325
3063	NC_011901	CTC	2	6	143829	143834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933325
3064	NC_011901	CCG	2	6	143843	143848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933325
3065	NC_011901	TTGC	2	8	143865	143872	0 %	50 %	25 %	25 %	220933325
3066	NC_011901	GCCC	2	8	143895	143902	0 %	0 %	25 %	75 %	220933325
3067	NC_011901	CGA	2	6	143906	143911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933325
3068	NC_011901	GCC	2	6	143920	143925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933325
3069	NC_011901	GAT	3	9	143931	143939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933325
3070	NC_011901	CAG	2	6	144072	144077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933325
3071	NC_011901	TGA	2	6	144080	144085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933325
3072	NC_011901	CG	3	6	144123	144128	0 %	0 %	50 %	50 %	220933325
3073	NC_011901	GAT	2	6	144132	144137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933325
3074	NC_011901	GT	3	6	144159	144164	0 %	50 %	50 %	0 %	220933325
3075	NC_011901	CGG	2	6	145450	145455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933326
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3078	NC_011901	TCCA	2	8	145570	145577	25 %	25 %	0 %	50 %	220933326
3079	NC_011901	CCAG	2	8	145598	145605	25 %	0 %	25 %	50 %	220933326
3080	NC_011901	CGCCA	2	10	145613	145622	20 %	0 %	20 %	60 %	220933326
3081	NC_011901	CG	3	6	145625	145630	0 %	0 %	50 %	50 %	220933326
3082	NC_011901	CGT	2	6	145649	145654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933326
3083	NC_011901	CCAG	2	8	145730	145737	25 %	0 %	25 %	50 %	220933326
3084	NC_011901	ATG	2	6	145747	145752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933326
3085	NC_011901	GC	3	6	145845	145850	0 %	0 %	50 %	50 %	220933326
3086	NC_011901	CGAT	2	8	145891	145898	25 %	25 %	25 %	25 %	220933326
3087	NC_011901	ATCA	2	8	145914	145921	50 %	25 %	0 %	25 %	220933326
3088	NC_011901	TCT	2	6	145931	145936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933326
3089	NC_011901	GGC	2	6	145964	145969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933326
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3091	NC_011901	TCG	2	6	146017	146022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933326
3092	NC_011901	GCC	2	6	146023	146028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933326
3093	NC_011901	GAA	2	6	146123	146128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933326
3094	NC_011901	GGC	2	6	146138	146143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933326
3095	NC_011901	AGC	2	6	146239	146244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933326
3096	NC_011901	GCAC	2	8	146314	146321	25 %	0 %	25 %	50 %	220933326
3097	NC_011901	GGATCG	2	12	146464	146475	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	220933326
3098	NC_011901	G	6	6	146516	146521	0 %	0 %	100 %	0 %	220933326
3099	NC_011901	CG	3	6	146526	146531	0 %	0 %	50 %	50 %	220933326
3100	NC_011901	CAG	2	6	146592	146597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933326
3101	NC_011901	CCA	2	6	146741	146746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933326
3102	NC_011901	CTG	2	6	146764	146769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933326
3103	NC_011901	CGC	2	6	146853	146858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933326
3104	NC_011901	CCA	2	6	146927	146932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933326
3105	NC_011901	GCG	2	6	146990	146995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933326
3106	NC_011901	CGGG	2	8	147017	147024	0 %	0 %	75 %	25 %	220933326
3107	NC_011901	CCAG	2	8	147110	147117	25 %	0 %	25 %	50 %	220933326
3108	NC_011901	AGC	2	6	147160	147165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933326
3109	NC_011901	CAG	2	6	147210	147215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933326
3110	NC_011901	CTG	2	6	147264	147269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933326
3111	NC_011901	CGGATC	2	12	147345	147356	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220933326
3112	NC_011901	GTC	2	6	147372	147377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933326
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3116	NC_011901	CTG	2	6	147679	147684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933327
3117	NC_011901	TGG	2	6	147738	147743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933327
3118	NC_011901	GCCC	2	8	147790	147797	0 %	0 %	25 %	75 %	220933327
3119	NC_011901	GGCT	2	8	147798	147805	0 %	25 %	50 %	25 %	220933327
3120	NC_011901	GTT	2	6	147806	147811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933327
3121	NC_011901	TGG	2	6	147846	147851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933327
3122	NC_011901	GCG	2	6	147896	147901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933327
3123	NC_011901	ATCG	2	8	147911	147918	25 %	25 %	25 %	25 %	220933327
3124	NC_011901	ACC	2	6	148087	148092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933327
3125	NC_011901	TCGT	2	8	148116	148123	0 %	50 %	25 %	25 %	220933327
3126	NC_011901	CGC	2	6	148312	148317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933327
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3130	NC_011901	CAGGC	2	10	148665	148674	20 %	0 %	40 %	40 %	220933327
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3132	NC_011901	GCT	2	6	148812	148817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933327
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3134	NC_011901	TCC	2	6	148887	148892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933327
3135	NC_011901	GCT	2	6	148956	148961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933327
3136	NC_011901	GCT	2	6	148983	148988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933327
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3138	NC_011901	GGC	2	6	149167	149172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933327
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3140	NC_011901	GCC	2	6	149499	149504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933327
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3153	NC_011901	GCT	2	6	151074	151079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933328
3154	NC_011901	CTG	3	9	151093	151101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933328
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3234	NC_011901	TCGT	2	8	153940	153947	0 %	50 %	25 %	25 %	220933330
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3239	NC_011901	GCCC	2	8	154271	154278	0 %	0 %	25 %	75 %	220933331
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3242	NC_011901	CAG	2	6	154422	154427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933331
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3362	NC_011901	CGC	2	6	159649	159654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933336
3363	NC_011901	GAG	2	6	159726	159731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933336
3364	NC_011901	AGG	2	6	159755	159760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933336
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3471	NC_011901	GCGCT	2	10	165019	165028	0 %	20 %	40 %	40 %	220933339
3472	NC_011901	GCT	2	6	165047	165052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933339
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3474	NC_011901	CTA	2	6	165098	165103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933339
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3479	NC_011901	ACGGG	2	10	165489	165498	20 %	0 %	60 %	20 %	220933340
3480	NC_011901	CTG	2	6	165549	165554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933340
3481	NC_011901	CCA	2	6	165556	165561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933340
3482	NC_011901	GTG	2	6	165711	165716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933340
3483	NC_011901	GAGC	2	8	165729	165736	25 %	0 %	50 %	25 %	220933340
3484	NC_011901	GAG	2	6	165747	165752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933340
3485	NC_011901	GGTCC	2	10	165776	165785	0 %	20 %	40 %	40 %	220933340
3486	NC_011901	CTG	2	6	165810	165815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933340
3487	NC_011901	TGG	2	6	165922	165927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933340
3488	NC_011901	GGT	2	6	165986	165991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933340
3489	NC_011901	CGC	2	6	166060	166065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933340
3490	NC_011901	TGG	2	6	166099	166104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933340
3491	NC_011901	TCTG	2	8	166120	166127	0 %	50 %	25 %	25 %	220933340
3492	NC_011901	CTGGC	2	10	166131	166140	0 %	20 %	40 %	40 %	220933340
3493	NC_011901	CAG	2	6	166149	166154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933340
3494	NC_011901	GC	3	6	166183	166188	0 %	0 %	50 %	50 %	220933340
3495	NC_011901	CGC	2	6	166202	166207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933340
3496	NC_011901	GAG	2	6	166215	166220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933340
3497	NC_011901	TCGCC	2	10	166262	166271	0 %	20 %	20 %	60 %	220933340
3498	NC_011901	GGT	3	9	166298	166306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933340
3499	NC_011901	GGC	2	6	166366	166371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933340
3500	NC_011901	AC	3	6	166380	166385	50 %	0 %	0 %	50 %	220933340

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