MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 73430

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_011901	GCCG	2	8	838734	838741	0 %	0 %	50 %	50 %	220933959
18002	NC_011901	ACG	2	6	838778	838783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933959
18003	NC_011901	CGG	2	6	838797	838802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933959
18004	NC_011901	CAT	2	6	838809	838814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933959
18005	NC_011901	GCCG	2	8	838867	838874	0 %	0 %	50 %	50 %	220933959
18006	NC_011901	CTT	2	6	838899	838904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933959
18007	NC_011901	AGG	2	6	838982	838987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933959
18008	NC_011901	CTG	2	6	839077	839082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933959
18009	NC_011901	ACG	2	6	839087	839092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933959
18010	NC_011901	GGT	2	6	839115	839120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933959
18011	NC_011901	CTG	2	6	839140	839145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933959
18012	NC_011901	GCA	2	6	839228	839233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933959
18013	NC_011901	GAG	2	6	839236	839241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933959
18014	NC_011901	GGCT	2	8	839308	839315	0 %	25 %	50 %	25 %	220933959
18015	NC_011901	GAC	2	6	839326	839331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933959
18016	NC_011901	GAG	2	6	839338	839343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933959
18017	NC_011901	CCA	2	6	839361	839366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933959
18018	NC_011901	GCC	2	6	839371	839376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933959
18019	NC_011901	AGG	2	6	839393	839398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933959
18020	NC_011901	TGC	2	6	839444	839449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933959
18021	NC_011901	GCC	2	6	839482	839487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933959
18022	NC_011901	CTG	2	6	839584	839589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933959
18023	NC_011901	CAG	2	6	839671	839676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933959
18024	NC_011901	GCC	2	6	839683	839688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933959
18025	NC_011901	GGCG	2	8	839745	839752	0 %	0 %	75 %	25 %	220933959
18026	NC_011901	CCG	2	6	839775	839780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933959
18027	NC_011901	CTG	2	6	839811	839816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933959
18028	NC_011901	AAG	2	6	839830	839835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933959
18029	NC_011901	CTGA	2	8	840031	840038	25 %	25 %	25 %	25 %	220933960
18030	NC_011901	GCC	2	6	840085	840090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933960
18031	NC_011901	GCC	2	6	840151	840156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933960
18032	NC_011901	TCA	2	6	840242	840247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933960
18033	NC_011901	CAATGC	2	12	840255	840266	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	220933960
18034	NC_011901	GC	3	6	840462	840467	0 %	0 %	50 %	50 %	220933960
18035	NC_011901	CAT	2	6	840468	840473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933960
18036	NC_011901	CGG	2	6	840522	840527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933960
18037	NC_011901	CCG	2	6	840623	840628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933960
18038	NC_011901	CCA	2	6	840701	840706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933960
18039	NC_011901	ACG	2	6	840707	840712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933960
18040	NC_011901	GC	3	6	840771	840776	0 %	0 %	50 %	50 %	220933960
18041	NC_011901	ATC	2	6	840806	840811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933960
18042	NC_011901	CGA	2	6	840845	840850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933960
18043	NC_011901	TCA	2	6	840854	840859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933960
18044	NC_011901	GAG	2	6	840889	840894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933960
18045	NC_011901	TGG	2	6	840902	840907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933960
18046	NC_011901	C	6	6	840926	840931	0 %	0 %	0 %	100 %	220933960
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18048	NC_011901	CGG	2	6	841065	841070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933960
18049	NC_011901	GC	3	6	841071	841076	0 %	0 %	50 %	50 %	220933960
18050	NC_011901	GTGGCC	2	12	841392	841403	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	220933961
18051	NC_011901	CAT	2	6	841406	841411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933961
18052	NC_011901	CG	3	6	841436	841441	0 %	0 %	50 %	50 %	220933961
18053	NC_011901	GGGC	2	8	841463	841470	0 %	0 %	75 %	25 %	220933961
18054	NC_011901	CGG	2	6	841484	841489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933961
18055	NC_011901	CGC	2	6	841558	841563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933961
18056	NC_011901	CCAT	2	8	841585	841592	25 %	25 %	0 %	50 %	220933961
18057	NC_011901	GGTG	2	8	841694	841701	0 %	25 %	75 %	0 %	220933961
18058	NC_011901	CGC	2	6	841724	841729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933961
18059	NC_011901	CAT	2	6	841739	841744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933961
18060	NC_011901	GC	3	6	841747	841752	0 %	0 %	50 %	50 %	220933961
18061	NC_011901	TCA	2	6	841774	841779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933961
18062	NC_011901	TCA	2	6	841810	841815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933961
18063	NC_011901	GC	3	6	841865	841870	0 %	0 %	50 %	50 %	220933961
18064	NC_011901	CCCT	2	8	841872	841879	0 %	25 %	0 %	75 %	220933961
18065	NC_011901	GCTG	2	8	841901	841908	0 %	25 %	50 %	25 %	220933961
18066	NC_011901	TGC	2	6	841948	841953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933961
18067	NC_011901	GC	3	6	841987	841992	0 %	0 %	50 %	50 %	220933961
18068	NC_011901	GCA	2	6	842036	842041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933961
18069	NC_011901	CTG	2	6	842052	842057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933961
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18071	NC_011901	GC	3	6	842097	842102	0 %	0 %	50 %	50 %	220933961
18072	NC_011901	TCG	2	6	842116	842121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933961
18073	NC_011901	TC	3	6	842122	842127	0 %	50 %	0 %	50 %	220933961
18074	NC_011901	GACGC	2	10	842154	842163	20 %	0 %	40 %	40 %	220933961
18075	NC_011901	GC	3	6	842252	842257	0 %	0 %	50 %	50 %	220933961
18076	NC_011901	TGG	2	6	842267	842272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933961
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18078	NC_011901	CTGG	2	8	842374	842381	0 %	25 %	50 %	25 %	220933962
18079	NC_011901	G	6	6	842389	842394	0 %	0 %	100 %	0 %	220933962
18080	NC_011901	G	6	6	842407	842412	0 %	0 %	100 %	0 %	220933962
18081	NC_011901	GCT	2	6	842437	842442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933962
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18084	NC_011901	GATCC	2	10	842525	842534	20 %	20 %	20 %	40 %	220933962
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18088	NC_011901	GC	3	6	842716	842721	0 %	0 %	50 %	50 %	220933962
18089	NC_011901	TAC	2	6	842750	842755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933962
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18091	NC_011901	CGG	2	6	843054	843059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933963
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18109	NC_011901	TGT	2	6	843876	843881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933964
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18112	NC_011901	TCCCG	2	10	843963	843972	0 %	20 %	20 %	60 %	220933964
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18477	NC_011901	GGGT	2	8	863451	863458	0 %	25 %	75 %	0 %	220933978
18478	NC_011901	CAG	2	6	863549	863554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933978
18479	NC_011901	TCT	2	6	864008	864013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933979
18480	NC_011901	CGT	2	6	864026	864031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933979
18481	NC_011901	GCTG	2	8	864205	864212	0 %	25 %	50 %	25 %	220933979
18482	NC_011901	CTG	2	6	864330	864335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933979
18483	NC_011901	GCC	2	6	864339	864344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933979
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18485	NC_011901	TATT	2	8	864423	864430	25 %	75 %	0 %	0 %	220933979
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18489	NC_011901	CTCA	2	8	864554	864561	25 %	25 %	0 %	50 %	220933979
18490	NC_011901	TTG	2	6	864646	864651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933979
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18498	NC_011901	TGG	2	6	865231	865236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933979
18499	NC_011901	TGGG	2	8	865252	865259	0 %	25 %	75 %	0 %	220933979
18500	NC_011901	TGGCCA	2	12	865312	865323	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220933979

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