MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 73430

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_011901	AGCC	2	8	659697	659704	25 %	0 %	25 %	50 %	220933806
14002	NC_011901	GGC	2	6	659707	659712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933806
14003	NC_011901	TGA	2	6	659740	659745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933806
14004	NC_011901	GC	3	6	659755	659760	0 %	0 %	50 %	50 %	220933806
14005	NC_011901	CAC	2	6	659795	659800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933806
14006	NC_011901	GC	3	6	659831	659836	0 %	0 %	50 %	50 %	220933806
14007	NC_011901	CGG	2	6	659884	659889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933806
14008	NC_011901	GGT	2	6	659915	659920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933806
14009	NC_011901	CAG	2	6	659924	659929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933806
14010	NC_011901	CGA	2	6	660025	660030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933806
14011	NC_011901	CAG	2	6	660038	660043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933806
14012	NC_011901	CCCA	2	8	660048	660055	25 %	0 %	0 %	75 %	220933806
14013	NC_011901	GCC	2	6	660059	660064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933806
14014	NC_011901	GCA	2	6	660076	660081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933806
14015	NC_011901	GGC	2	6	660122	660127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933806
14016	NC_011901	CCA	2	6	660148	660153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933806
14017	NC_011901	TCA	2	6	660166	660171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933806
14018	NC_011901	GGC	2	6	660206	660211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933806
14019	NC_011901	ACC	3	9	660225	660233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933806
14020	NC_011901	TGG	2	6	660241	660246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933806
14021	NC_011901	TGA	2	6	660247	660252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933806
14022	NC_011901	GAA	2	6	660266	660271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933806
14023	NC_011901	GAT	2	6	660332	660337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933806
14024	NC_011901	ACC	2	6	660348	660353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933806
14025	NC_011901	CGG	2	6	660466	660471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933806
14026	NC_011901	CCA	2	6	660472	660477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933806
14027	NC_011901	GGCG	2	8	660781	660788	0 %	0 %	75 %	25 %	220933807
14028	NC_011901	CAC	2	6	660839	660844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933807
14029	NC_011901	AGC	3	9	660897	660905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933807
14030	NC_011901	AGC	2	6	660936	660941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933807
14031	NC_011901	GAT	2	6	660986	660991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933807
14032	NC_011901	CAC	2	6	660998	661003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933807
14033	NC_011901	GAACAG	2	12	661034	661045	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	220933807
14034	NC_011901	GC	3	6	661103	661108	0 %	0 %	50 %	50 %	220933807
14035	NC_011901	GAA	2	6	661109	661114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933807
14036	NC_011901	GC	3	6	661125	661130	0 %	0 %	50 %	50 %	220933807
14037	NC_011901	CCA	2	6	661145	661150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933807
14038	NC_011901	GAC	2	6	661172	661177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933807
14039	NC_011901	CCA	2	6	661195	661200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933807
14040	NC_011901	CAC	2	6	661214	661219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933807
14041	NC_011901	CGC	2	6	661262	661267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933807
14042	NC_011901	CAG	2	6	661343	661348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933807
14043	NC_011901	CAG	2	6	661355	661360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933807
14044	NC_011901	CGC	2	6	661373	661378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933807
14045	NC_011901	AGG	2	6	661389	661394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933807
14046	NC_011901	CAG	2	6	661412	661417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933807
14047	NC_011901	GC	3	6	661676	661681	0 %	0 %	50 %	50 %	220933808
14048	NC_011901	G	6	6	661694	661699	0 %	0 %	100 %	0 %	220933808
14049	NC_011901	CCT	2	6	661768	661773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933808
14050	NC_011901	GGTGAG	2	12	661802	661813	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	220933808
14051	NC_011901	CTC	2	6	661856	661861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933808
14052	NC_011901	TCC	3	9	661872	661880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933808
14053	NC_011901	GCA	2	6	661897	661902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933808
14054	NC_011901	CCA	2	6	661918	661923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933808
14055	NC_011901	GGC	2	6	661952	661957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933808
14056	NC_011901	TCA	2	6	661966	661971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933808
14057	NC_011901	GTC	2	6	661988	661993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933808
14058	NC_011901	CGC	2	6	661996	662001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933808
14059	NC_011901	GCC	2	6	662060	662065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933808
14060	NC_011901	CCTT	2	8	662073	662080	0 %	50 %	0 %	50 %	220933808
14061	NC_011901	TCCAG	2	10	662095	662104	20 %	20 %	20 %	40 %	220933808
14062	NC_011901	GGC	2	6	662135	662140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933808
14063	NC_011901	CAG	2	6	662162	662167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933808
14064	NC_011901	GTC	2	6	662171	662176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933808
14065	NC_011901	CAG	2	6	662249	662254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933808
14066	NC_011901	CGGG	2	8	662289	662296	0 %	0 %	75 %	25 %	220933808
14067	NC_011901	GTC	2	6	662435	662440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933808
14068	NC_011901	CAG	2	6	662453	662458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933808
14069	NC_011901	GAA	2	6	662498	662503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933808
14070	NC_011901	GCC	2	6	662510	662515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933808
14071	NC_011901	GCA	2	6	662545	662550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933808
14072	NC_011901	TGG	2	6	662571	662576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933808
14073	NC_011901	CGGTG	2	10	662611	662620	0 %	20 %	60 %	20 %	220933808
14074	NC_011901	CCA	2	6	662647	662652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933808
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14076	NC_011901	CGT	2	6	662674	662679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933808
14077	NC_011901	GCAGG	2	10	662681	662690	20 %	0 %	60 %	20 %	220933808
14078	NC_011901	CTCGCC	2	12	662702	662713	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	220933808
14079	NC_011901	GC	3	6	662716	662721	0 %	0 %	50 %	50 %	220933808
14080	NC_011901	GTT	2	6	662750	662755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933808
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14082	NC_011901	TGA	2	6	662818	662823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933808
14083	NC_011901	CTG	2	6	662843	662848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933808
14084	NC_011901	GGC	2	6	662852	662857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933808
14085	NC_011901	CGGGC	2	10	662866	662875	0 %	0 %	60 %	40 %	220933808
14086	NC_011901	GTC	3	9	662900	662908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933808
14087	NC_011901	CGG	2	6	662914	662919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933808
14088	NC_011901	C	6	6	662924	662929	0 %	0 %	0 %	100 %	220933808
14089	NC_011901	CAG	2	6	662942	662947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933808
14090	NC_011901	CCA	2	6	662992	662997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933808
14091	NC_011901	TCC	2	6	663045	663050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933808
14092	NC_011901	GTC	2	6	663077	663082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933808
14093	NC_011901	GC	4	8	663109	663116	0 %	0 %	50 %	50 %	220933808
14094	NC_011901	GGC	2	6	663122	663127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933808
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14098	NC_011901	TGG	2	6	663219	663224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933808
14099	NC_011901	TCG	2	6	663249	663254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933808
14100	NC_011901	CAG	2	6	663275	663280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933808
14101	NC_011901	CGG	2	6	663292	663297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933808
14102	NC_011901	CGG	2	6	663345	663350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933808
14103	NC_011901	GCC	2	6	663447	663452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933808
14104	NC_011901	TTG	2	6	663453	663458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933808
14105	NC_011901	GGC	2	6	663470	663475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933808
14106	NC_011901	CCAGCA	2	12	663562	663573	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	220933808
14107	NC_011901	CGG	2	6	663595	663600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933808
14108	NC_011901	GCT	2	6	663604	663609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933808
14109	NC_011901	G	7	7	663624	663630	0 %	0 %	100 %	0 %	220933808
14110	NC_011901	CAC	2	6	663853	663858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933809
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14115	NC_011901	CGCCTG	2	12	664107	664118	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220933810
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14117	NC_011901	TGG	2	6	664255	664260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933810
14118	NC_011901	GCTT	2	8	664330	664337	0 %	50 %	25 %	25 %	220933811
14119	NC_011901	TCAAT	2	10	664426	664435	40 %	40 %	0 %	20 %	220933811
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14122	NC_011901	GCT	2	6	664522	664527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933811
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14238	NC_011901	CTG	3	9	669253	669261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933818
14239	NC_011901	ATC	2	6	669262	669267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933818
14240	NC_011901	CCCTGT	2	12	669272	669283	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	220933818
14241	NC_011901	TCT	2	6	669284	669289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933818
14242	NC_011901	CAC	2	6	669291	669296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933818
14243	NC_011901	GGC	2	6	669305	669310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933818
14244	NC_011901	GCG	2	6	669369	669374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933818
14245	NC_011901	TCA	2	6	669440	669445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933818
14246	NC_011901	CTGG	2	8	669465	669472	0 %	25 %	50 %	25 %	220933818
14247	NC_011901	CTT	2	6	669540	669545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933818
14248	NC_011901	CGG	2	6	669558	669563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933818
14249	NC_011901	ATC	2	6	669697	669702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933818
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14252	NC_011901	GCG	2	6	669746	669751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933818
14253	NC_011901	ACC	2	6	669934	669939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933818
14254	NC_011901	TGC	2	6	669971	669976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933818
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14258	NC_011901	GCT	2	6	670140	670145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933818
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14261	NC_011901	CCGG	2	8	670240	670247	0 %	0 %	50 %	50 %	220933818
14262	NC_011901	GTG	2	6	670252	670257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933818
14263	NC_011901	GCCC	2	8	670263	670270	0 %	0 %	25 %	75 %	220933818
14264	NC_011901	GGT	2	6	670287	670292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933818
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14267	NC_011901	TCG	2	6	670376	670381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933818
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14269	NC_011901	GCCCTG	2	12	670662	670673	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220933819
14270	NC_011901	GCT	2	6	670674	670679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933819
14271	NC_011901	GAT	2	6	670680	670685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933819
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14273	NC_011901	CGG	2	6	670697	670702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933819
14274	NC_011901	CTG	2	6	670720	670725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933819
14275	NC_011901	CGC	2	6	670728	670733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933819
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14282	NC_011901	GCC	2	6	670896	670901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933819
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14291	NC_011901	CTG	2	6	671478	671483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933820
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14294	NC_011901	CTG	2	6	671514	671519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933820
14295	NC_011901	CTG	2	6	671541	671546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933820
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14322	NC_011901	CTG	2	6	672771	672776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933821
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14327	NC_011901	CGTG	2	8	673922	673929	0 %	25 %	50 %	25 %	220933822
14328	NC_011901	CTGG	2	8	673934	673941	0 %	25 %	50 %	25 %	220933822
14329	NC_011901	GGGC	2	8	673978	673985	0 %	0 %	75 %	25 %	220933822
14330	NC_011901	TGGC	2	8	674001	674008	0 %	25 %	50 %	25 %	220933822
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14338	NC_011901	CAGGG	2	10	674195	674204	20 %	0 %	60 %	20 %	220933822
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14340	NC_011901	GGCT	2	8	674269	674276	0 %	25 %	50 %	25 %	220933823
14341	NC_011901	GC	3	6	674404	674409	0 %	0 %	50 %	50 %	220933823
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14343	NC_011901	GCT	2	6	674571	674576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933823
14344	NC_011901	AC	3	6	674687	674692	50 %	0 %	0 %	50 %	220933823
14345	NC_011901	TGCGC	2	10	674711	674720	0 %	20 %	40 %	40 %	220933823
14346	NC_011901	A	6	6	674737	674742	100 %	0 %	0 %	0 %	220933823
14347	NC_011901	CGC	2	6	674778	674783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933823
14348	NC_011901	GCA	2	6	674796	674801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933823
14349	NC_011901	GCA	2	6	674817	674822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933823
14350	NC_011901	GTA	2	6	674824	674829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933823
14351	NC_011901	CG	3	6	674885	674890	0 %	0 %	50 %	50 %	220933823
14352	NC_011901	CG	4	8	674897	674904	0 %	0 %	50 %	50 %	220933823
14353	NC_011901	CATC	2	8	674937	674944	25 %	25 %	0 %	50 %	220933823
14354	NC_011901	GCT	2	6	675101	675106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933824
14355	NC_011901	CA	3	6	675123	675128	50 %	0 %	0 %	50 %	220933824
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14357	NC_011901	CGA	2	6	675248	675253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933824
14358	NC_011901	GCCC	2	8	675257	675264	0 %	0 %	25 %	75 %	220933824
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