MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 73430

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_011901	GGC	2	6	585498	585503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933740
12502	NC_011901	CGG	2	6	585551	585556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933740
12503	NC_011901	CGG	2	6	585567	585572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933740
12504	NC_011901	GCC	2	6	585585	585590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933740
12505	NC_011901	CGA	2	6	585636	585641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933740
12506	NC_011901	GCGCG	2	10	585642	585651	0 %	0 %	60 %	40 %	220933740
12507	NC_011901	CAT	2	6	585678	585683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933740
12508	NC_011901	GCCGAT	2	12	585724	585735	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220933740
12509	NC_011901	ACC	2	6	585812	585817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933740
12510	NC_011901	CGAGGG	2	12	585870	585881	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	220933740
12511	NC_011901	TCGGGG	2	12	585926	585937	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	220933741
12512	NC_011901	CGC	2	6	585953	585958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933741
12513	NC_011901	GAC	2	6	585990	585995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933741
12514	NC_011901	AGG	3	9	586006	586014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933741
12515	NC_011901	CGG	2	6	586056	586061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933741
12516	NC_011901	TCGC	2	8	586150	586157	0 %	25 %	25 %	50 %	220933741
12517	NC_011901	GGCCC	2	10	586253	586262	0 %	0 %	40 %	60 %	220933741
12518	NC_011901	GCG	2	6	586322	586327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933741
12519	NC_011901	CTG	2	6	586347	586352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933741
12520	NC_011901	GACCTG	2	12	586416	586427	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220933741
12521	NC_011901	CGGG	2	8	586443	586450	0 %	0 %	75 %	25 %	220933741
12522	NC_011901	CAC	2	6	586475	586480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933741
12523	NC_011901	GCG	3	9	586518	586526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933741
12524	NC_011901	GCG	2	6	586532	586537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933741
12525	NC_011901	CTG	2	6	586584	586589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933741
12526	NC_011901	ACGG	2	8	586614	586621	25 %	0 %	50 %	25 %	220933741
12527	NC_011901	CTG	2	6	586635	586640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933741
12528	NC_011901	GCG	2	6	586641	586646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933741
12529	NC_011901	GCC	2	6	586647	586652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933741
12530	NC_011901	GGC	2	6	586667	586672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933741
12531	NC_011901	TGC	3	9	586681	586689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933741
12532	NC_011901	ACG	2	6	586801	586806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933741
12533	NC_011901	CGGC	2	8	586814	586821	0 %	0 %	50 %	50 %	220933741
12534	NC_011901	TGG	2	6	586825	586830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933741
12535	NC_011901	CTG	2	6	586851	586856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933741
12536	NC_011901	GC	3	6	586875	586880	0 %	0 %	50 %	50 %	220933741
12537	NC_011901	CGC	3	9	586878	586886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933741
12538	NC_011901	GCC	2	6	586934	586939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933741
12539	NC_011901	CTG	2	6	587146	587151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933742
12540	NC_011901	CGGC	2	8	587191	587198	0 %	0 %	50 %	50 %	220933742
12541	NC_011901	GCTGG	2	10	587200	587209	0 %	20 %	60 %	20 %	220933742
12542	NC_011901	GCC	2	6	587269	587274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933742
12543	NC_011901	G	6	6	587355	587360	0 %	0 %	100 %	0 %	220933742
12544	NC_011901	GGC	2	6	587416	587421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933742
12545	NC_011901	CAG	2	6	587485	587490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933742
12546	NC_011901	CAC	2	6	587497	587502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933742
12547	NC_011901	CGGGT	2	10	587620	587629	0 %	20 %	60 %	20 %	220933742
12548	NC_011901	GGGGGC	2	12	587638	587649	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	220933742
12549	NC_011901	CCGGG	2	10	587690	587699	0 %	0 %	60 %	40 %	220933742
12550	NC_011901	CGG	2	6	587733	587738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933742
12551	NC_011901	CGG	2	6	587745	587750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933742
12552	NC_011901	GGCG	2	8	587754	587761	0 %	0 %	75 %	25 %	220933742
12553	NC_011901	TCC	2	6	587786	587791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933742
12554	NC_011901	GTC	2	6	587845	587850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933742
12555	NC_011901	GTG	2	6	587896	587901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933742
12556	NC_011901	GC	3	6	588019	588024	0 %	0 %	50 %	50 %	220933742
12557	NC_011901	CCG	2	6	588077	588082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933742
12558	NC_011901	AGC	2	6	588116	588121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933742
12559	NC_011901	GCC	2	6	588122	588127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933742
12560	NC_011901	CCT	2	6	588135	588140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933742
12561	NC_011901	GC	3	6	588175	588180	0 %	0 %	50 %	50 %	220933742
12562	NC_011901	CGG	2	6	588186	588191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933742
12563	NC_011901	TGA	2	6	588252	588257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933742
12564	NC_011901	GCAC	2	8	588278	588285	25 %	0 %	25 %	50 %	220933742
12565	NC_011901	ACC	2	6	588302	588307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933742
12566	NC_011901	CGG	2	6	588339	588344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933742
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12569	NC_011901	CGG	3	9	588423	588431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933742
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12571	NC_011901	CGG	2	6	588509	588514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933742
12572	NC_011901	CATG	2	8	588531	588538	25 %	25 %	25 %	25 %	220933742
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12574	NC_011901	CGT	2	6	588630	588635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933743
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12577	NC_011901	CAC	3	9	588695	588703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933743
12578	NC_011901	CGT	2	6	588715	588720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933743
12579	NC_011901	GCCGGT	2	12	588731	588742	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	220933743
12580	NC_011901	CTG	2	6	588747	588752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933743
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12587	NC_011901	CGG	2	6	589045	589050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933743
12588	NC_011901	GAGCT	2	10	589074	589083	20 %	20 %	40 %	20 %	220933743
12589	NC_011901	CCA	2	6	589097	589102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933743
12590	NC_011901	CAT	2	6	589130	589135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933743
12591	NC_011901	CTGG	2	8	589142	589149	0 %	25 %	50 %	25 %	220933743
12592	NC_011901	CCGA	2	8	589175	589182	25 %	0 %	25 %	50 %	220933743
12593	NC_011901	CCG	2	6	589357	589362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933744
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12602	NC_011901	ACC	2	6	589671	589676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933744
12603	NC_011901	CAGGTC	2	12	589691	589702	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220933744
12604	NC_011901	TGC	2	6	589704	589709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933744
12605	NC_011901	GCAG	2	8	589741	589748	25 %	0 %	50 %	25 %	220933744
12606	NC_011901	TGC	2	6	589798	589803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933744
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12616	NC_011901	GCA	3	9	590227	590235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933744
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12619	NC_011901	GGT	2	6	590344	590349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933744
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12975	NC_011901	CCA	2	6	608357	608362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933762
12976	NC_011901	TCC	2	6	608443	608448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933762
12977	NC_011901	T	6	6	608457	608462	0 %	100 %	0 %	0 %	220933762
12978	NC_011901	TGC	2	6	608465	608470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933762
12979	NC_011901	GCC	2	6	608478	608483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933762
12980	NC_011901	CAC	3	9	608744	608752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933763
12981	NC_011901	GC	3	6	608789	608794	0 %	0 %	50 %	50 %	220933763
12982	NC_011901	CAT	2	6	608828	608833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933763
12983	NC_011901	TGG	2	6	608899	608904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933763
12984	NC_011901	CGG	2	6	608924	608929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933763
12985	NC_011901	CGG	2	6	608984	608989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933763
12986	NC_011901	ATC	2	6	609018	609023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933763
12987	NC_011901	CGG	2	6	609155	609160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933763
12988	NC_011901	ATC	2	6	609183	609188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933763
12989	NC_011901	AGG	2	6	609196	609201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933763
12990	NC_011901	ACCTGG	2	12	609205	609216	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220933763
12991	NC_011901	CCG	2	6	609232	609237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933763
12992	NC_011901	ATGGAA	2	12	609267	609278	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	220933763
12993	NC_011901	CCAC	2	8	609391	609398	25 %	0 %	0 %	75 %	220933763
12994	NC_011901	TGG	3	9	609436	609444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933763
12995	NC_011901	GAC	2	6	609471	609476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933763
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12997	NC_011901	TGC	2	6	609568	609573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933763
12998	NC_011901	CTG	2	6	609576	609581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933763
12999	NC_011901	AGG	2	6	609592	609597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933763
13000	NC_011901	GGA	2	6	609692	609697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933763

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