MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 73430

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_011901	TGC	3	9	519540	519548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933672
11002	NC_011901	CCG	2	6	519564	519569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933672
11003	NC_011901	CAT	2	6	519604	519609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933672
11004	NC_011901	GTG	2	6	519616	519621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933672
11005	NC_011901	GAG	2	6	519662	519667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933672
11006	NC_011901	ACG	2	6	519690	519695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933672
11007	NC_011901	ACG	2	6	519747	519752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933672
11008	NC_011901	TGA	2	6	519822	519827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933672
11009	NC_011901	GCC	2	6	519977	519982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933672
11010	NC_011901	CAA	2	6	520048	520053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933672
11011	NC_011901	CAT	2	6	520072	520077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933672
11012	NC_011901	CGC	2	6	520090	520095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933672
11013	NC_011901	GCC	2	6	520100	520105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933672
11014	NC_011901	GGA	2	6	520180	520185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933672
11015	NC_011901	ACG	2	6	520230	520235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933672
11016	NC_011901	AGG	2	6	520248	520253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933672
11017	NC_011901	CGTG	2	8	520321	520328	0 %	25 %	50 %	25 %	220933672
11018	NC_011901	AGG	2	6	520359	520364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933672
11019	NC_011901	GC	3	6	520413	520418	0 %	0 %	50 %	50 %	220933672
11020	NC_011901	CGG	2	6	520839	520844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933673
11021	NC_011901	TCC	2	6	520939	520944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933673
11022	NC_011901	CCG	2	6	520956	520961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933673
11023	NC_011901	CGCC	2	8	521040	521047	0 %	0 %	25 %	75 %	220933673
11024	NC_011901	CAG	3	9	521119	521127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933673
11025	NC_011901	GA	3	6	521151	521156	50 %	0 %	50 %	0 %	220933673
11026	NC_011901	GAG	2	6	521161	521166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933673
11027	NC_011901	TCC	2	6	521234	521239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933673
11028	NC_011901	GAG	2	6	521272	521277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933673
11029	NC_011901	GGA	2	6	521298	521303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933673
11030	NC_011901	GCC	2	6	521347	521352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933673
11031	NC_011901	TGG	2	6	521450	521455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933673
11032	NC_011901	GC	3	6	521474	521479	0 %	0 %	50 %	50 %	220933673
11033	NC_011901	AGCG	2	8	521512	521519	25 %	0 %	50 %	25 %	220933673
11034	NC_011901	GC	3	6	521523	521528	0 %	0 %	50 %	50 %	220933673
11035	NC_011901	GAG	2	6	521530	521535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933673
11036	NC_011901	ATC	2	6	521536	521541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933673
11037	NC_011901	CAG	3	9	521542	521550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933673
11038	NC_011901	CAG	2	6	521611	521616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933673
11039	NC_011901	GCT	3	9	521652	521660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933673
11040	NC_011901	AGG	2	6	521681	521686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933673
11041	NC_011901	ACG	2	6	521705	521710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933673
11042	NC_011901	AGC	2	6	521733	521738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933673
11043	NC_011901	GATACG	2	12	521764	521775	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	220933673
11044	NC_011901	CGCC	2	8	521778	521785	0 %	0 %	25 %	75 %	220933673
11045	NC_011901	GGA	2	6	521841	521846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933673
11046	NC_011901	TAC	2	6	521884	521889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933673
11047	NC_011901	TGA	2	6	521969	521974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933673
11048	NC_011901	AGG	2	6	522050	522055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933673
11049	NC_011901	CAGG	2	8	522090	522097	25 %	0 %	50 %	25 %	220933673
11050	NC_011901	TGGT	2	8	522209	522216	0 %	50 %	50 %	0 %	220933673
11051	NC_011901	CGG	2	6	522218	522223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933673
11052	NC_011901	ATTC	2	8	522225	522232	25 %	50 %	0 %	25 %	220933673
11053	NC_011901	GGA	2	6	522240	522245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933673
11054	NC_011901	GGGT	2	8	522263	522270	0 %	25 %	75 %	0 %	220933673
11055	NC_011901	GCG	2	6	522294	522299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933673
11056	NC_011901	ACC	2	6	522407	522412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933673
11057	NC_011901	CCT	2	6	522465	522470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933673
11058	NC_011901	GATC	2	8	522606	522613	25 %	25 %	25 %	25 %	220933673
11059	NC_011901	ACG	2	6	522647	522652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933673
11060	NC_011901	CAT	2	6	522669	522674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933673
11061	NC_011901	GCT	2	6	522741	522746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933673
11062	NC_011901	CGG	2	6	522800	522805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933673
11063	NC_011901	ATG	2	6	523174	523179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933674
11064	NC_011901	CCCAG	2	10	523181	523190	20 %	0 %	20 %	60 %	220933674
11065	NC_011901	CGC	2	6	523194	523199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933674
11066	NC_011901	AAG	2	6	523234	523239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933674
11067	NC_011901	GAA	2	6	523266	523271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933674
11068	NC_011901	CGA	2	6	523332	523337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933674
11069	NC_011901	CGA	2	6	523437	523442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933674
11070	NC_011901	ACCC	2	8	523488	523495	25 %	0 %	0 %	75 %	220933674
11071	NC_011901	GGA	2	6	523644	523649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933674
11072	NC_011901	TCA	2	6	523670	523675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933674
11073	NC_011901	GTT	2	6	523716	523721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933674
11074	NC_011901	GC	3	6	523781	523786	0 %	0 %	50 %	50 %	220933674
11075	NC_011901	GC	3	6	523788	523793	0 %	0 %	50 %	50 %	220933674
11076	NC_011901	ATG	2	6	523825	523830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933674
11077	NC_011901	ACG	2	6	523892	523897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933674
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11079	NC_011901	ACCGGC	2	12	523954	523965	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220933674
11080	NC_011901	GAG	2	6	523993	523998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933674
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11083	NC_011901	GC	3	6	524289	524294	0 %	0 %	50 %	50 %	220933674
11084	NC_011901	CGG	2	6	524296	524301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933674
11085	NC_011901	TCA	3	9	524336	524344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933674
11086	NC_011901	CGG	2	6	524346	524351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933674
11087	NC_011901	TCA	2	6	524372	524377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933674
11088	NC_011901	GGCCCT	2	12	524379	524390	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220933674
11089	NC_011901	CATCGC	2	12	524403	524414	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	220933674
11090	NC_011901	GGC	2	6	524445	524450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933674
11091	NC_011901	GC	3	6	524449	524454	0 %	0 %	50 %	50 %	220933674
11092	NC_011901	ACCA	2	8	524464	524471	50 %	0 %	0 %	50 %	220933674
11093	NC_011901	GGC	2	6	524535	524540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933674
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11095	NC_011901	GAC	2	6	524632	524637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933674
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11098	NC_011901	TGG	2	6	525001	525006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933675
11099	NC_011901	TGG	2	6	525010	525015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933675
11100	NC_011901	CGCC	2	8	525074	525081	0 %	0 %	25 %	75 %	220933675
11101	NC_011901	GCC	2	6	525099	525104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933675
11102	NC_011901	C	6	6	525103	525108	0 %	0 %	0 %	100 %	220933675
11103	NC_011901	CGTAC	2	10	525242	525251	20 %	20 %	20 %	40 %	220933676
11104	NC_011901	GGC	2	6	525311	525316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933676
11105	NC_011901	GTGG	2	8	525390	525397	0 %	25 %	75 %	0 %	220933676
11106	NC_011901	GGC	2	6	525447	525452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933676
11107	NC_011901	CTG	2	6	525478	525483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933676
11108	NC_011901	GCA	2	6	525513	525518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933676
11109	NC_011901	TTG	2	6	525538	525543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933676
11110	NC_011901	GCCA	2	8	525547	525554	25 %	0 %	25 %	50 %	220933676
11111	NC_011901	TTC	2	6	525619	525624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933676
11112	NC_011901	GCG	2	6	525627	525632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933676
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11114	NC_011901	GAAGCC	2	12	526067	526078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933677
11115	NC_011901	GCC	2	6	526400	526405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933678
11116	NC_011901	CGTC	2	8	526536	526543	0 %	25 %	25 %	50 %	220933678
11117	NC_011901	GATGG	2	10	526595	526604	20 %	20 %	60 %	0 %	220933678
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11119	NC_011901	CTG	2	6	526646	526651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933678
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11238	NC_011901	CGC	2	6	531095	531100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933682
11239	NC_011901	GCC	2	6	531129	531134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933682
11240	NC_011901	CTG	3	9	531150	531158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933682
11241	NC_011901	GGC	3	9	531197	531205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933682
11242	NC_011901	CGG	2	6	531245	531250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933682
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11244	NC_011901	TCG	2	6	531268	531273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933682
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11350	NC_011901	TC	4	8	535701	535708	0 %	50 %	0 %	50 %	220933686
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11476	NC_011901	GGC	2	6	541678	541683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933695
11477	NC_011901	CAG	2	6	541813	541818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933695
11478	NC_011901	GGC	2	6	541828	541833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933695
11479	NC_011901	GTC	2	6	541858	541863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933695
11480	NC_011901	CCG	2	6	541975	541980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933696
11481	NC_011901	TGG	2	6	542094	542099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933696
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11486	NC_011901	CTG	2	6	542237	542242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933696
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11491	NC_011901	CGGCG	2	10	542456	542465	0 %	0 %	60 %	40 %	220933696
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11499	NC_011901	CAG	2	6	542753	542758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933696
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