MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 73430

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_011901	GCA	2	6	276085	276090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933438
6003	NC_011901	CGC	2	6	276102	276107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933438
6004	NC_011901	CGC	2	6	276114	276119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933438
6005	NC_011901	CTT	2	6	276181	276186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933438
6006	NC_011901	GGC	2	6	276435	276440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933439
6007	NC_011901	CG	3	6	276527	276532	0 %	0 %	50 %	50 %	220933439
6008	NC_011901	ACG	2	6	276578	276583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933439
6009	NC_011901	CAC	2	6	276696	276701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933439
6010	NC_011901	GGA	2	6	276738	276743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933439
6011	NC_011901	CGG	2	6	276798	276803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933439
6012	NC_011901	GC	3	6	276816	276821	0 %	0 %	50 %	50 %	220933439
6013	NC_011901	CGG	2	6	276852	276857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933439
6014	NC_011901	GTG	2	6	276946	276951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933439
6015	NC_011901	CGG	2	6	276974	276979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933439
6016	NC_011901	GGC	2	6	276982	276987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933439
6017	NC_011901	GTGC	2	8	277033	277040	0 %	25 %	50 %	25 %	220933439
6018	NC_011901	TGA	2	6	277116	277121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933439
6019	NC_011901	TCGG	2	8	277159	277166	0 %	25 %	50 %	25 %	220933439
6020	NC_011901	TGG	2	6	277208	277213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933439
6021	NC_011901	ACG	2	6	277232	277237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933439
6022	NC_011901	GCG	2	6	277261	277266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933439
6023	NC_011901	GCA	2	6	277301	277306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933439
6024	NC_011901	GGA	2	6	277338	277343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933439
6025	NC_011901	GGA	2	6	277476	277481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933439
6026	NC_011901	TAC	2	6	277486	277491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933439
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6028	NC_011901	CCGGT	2	10	277931	277940	0 %	20 %	40 %	40 %	220933440
6029	NC_011901	CGG	3	9	278064	278072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933440
6030	NC_011901	GAC	2	6	278101	278106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933440
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6032	NC_011901	GCG	2	6	278132	278137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933440
6033	NC_011901	CG	3	6	278153	278158	0 %	0 %	50 %	50 %	220933440
6034	NC_011901	GCC	2	6	278167	278172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933440
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6036	NC_011901	CGG	2	6	278208	278213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933440
6037	NC_011901	CTGAT	2	10	278223	278232	20 %	40 %	20 %	20 %	220933440
6038	NC_011901	C	6	6	278719	278724	0 %	0 %	0 %	100 %	220933441
6039	NC_011901	GC	3	6	278739	278744	0 %	0 %	50 %	50 %	220933441
6040	NC_011901	CTC	2	6	278745	278750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933441
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6042	NC_011901	TCCACG	2	12	278905	278916	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	220933441
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6046	NC_011901	GC	4	8	279144	279151	0 %	0 %	50 %	50 %	220933441
6047	NC_011901	CGC	2	6	279188	279193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933441
6048	NC_011901	TCCCGG	2	12	279223	279234	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220933441
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6050	NC_011901	GCG	2	6	279598	279603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933441
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6056	NC_011901	GGC	2	6	279821	279826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933441
6057	NC_011901	GCG	2	6	279867	279872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933441
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6059	NC_011901	CGT	2	6	279998	280003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933441
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6065	NC_011901	CGT	2	6	280187	280192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933441
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6087	NC_011901	GCT	3	9	280904	280912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933441
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6119	NC_011901	GTCC	2	8	282227	282234	0 %	25 %	25 %	50 %	220933441
6120	NC_011901	CGC	2	6	282236	282241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933441
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6122	NC_011901	CGC	2	6	282296	282301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933441
6123	NC_011901	CAC	2	6	282306	282311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933441
6124	NC_011901	GC	3	6	282405	282410	0 %	0 %	50 %	50 %	220933441
6125	NC_011901	CG	3	6	282420	282425	0 %	0 %	50 %	50 %	220933441
6126	NC_011901	CGG	2	6	282467	282472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933441
6127	NC_011901	GC	3	6	282501	282506	0 %	0 %	50 %	50 %	220933441
6128	NC_011901	TGA	2	6	282769	282774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933442
6129	NC_011901	CGG	2	6	282782	282787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933442
6130	NC_011901	CTG	2	6	282887	282892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933442
6131	NC_011901	CGA	2	6	283023	283028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933443
6132	NC_011901	TGAT	2	8	283037	283044	25 %	50 %	25 %	0 %	220933443
6133	NC_011901	A	6	6	283242	283247	100 %	0 %	0 %	0 %	220933444
6134	NC_011901	TCG	2	6	283264	283269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933444
6135	NC_011901	CTG	2	6	283307	283312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933444
6136	NC_011901	TCGGCC	2	12	283314	283325	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220933444
6137	NC_011901	GCT	2	6	283366	283371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933444
6138	NC_011901	TGG	2	6	283386	283391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933444
6139	NC_011901	GGT	2	6	283409	283414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933444
6140	NC_011901	GCTCAT	2	12	283417	283428	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	220933444
6141	NC_011901	ATC	2	6	283454	283459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933444
6142	NC_011901	GC	3	6	283477	283482	0 %	0 %	50 %	50 %	220933444
6143	NC_011901	GAA	2	6	283730	283735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933445
6144	NC_011901	CGTG	2	8	283831	283838	0 %	25 %	50 %	25 %	220933445
6145	NC_011901	GAG	2	6	283844	283849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933445
6146	NC_011901	CCA	2	6	283875	283880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933445
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6148	NC_011901	CAT	2	6	283942	283947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933445
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6150	NC_011901	GTC	2	6	284071	284076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933445
6151	NC_011901	GA	3	6	284091	284096	50 %	0 %	50 %	0 %	220933445
6152	NC_011901	AAG	3	9	284188	284196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933446
6153	NC_011901	CTG	2	6	284266	284271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933446
6154	NC_011901	ACC	2	6	284281	284286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933446
6155	NC_011901	TCATG	2	10	284307	284316	20 %	40 %	20 %	20 %	220933446
6156	NC_011901	GCT	2	6	284430	284435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933446
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6158	NC_011901	CGG	2	6	284528	284533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933446
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6161	NC_011901	CAT	2	6	284580	284585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933446
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6178	NC_011901	CGG	2	6	285291	285296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933446
6179	NC_011901	GC	3	6	285366	285371	0 %	0 %	50 %	50 %	220933446
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6189	NC_011901	CG	3	6	285678	285683	0 %	0 %	50 %	50 %	220933446
6190	NC_011901	CTG	2	6	285736	285741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933446
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6201	NC_011901	GGGCGA	2	12	285993	286004	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	220933446
6202	NC_011901	GGT	2	6	286005	286010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933446
6203	NC_011901	GCG	2	6	286037	286042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933446
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6206	NC_011901	TCGC	2	8	286114	286121	0 %	25 %	25 %	50 %	220933446
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6210	NC_011901	GCC	2	6	286324	286329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933446
6211	NC_011901	GCC	2	6	286343	286348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933446
6212	NC_011901	ATC	2	6	286357	286362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933446
6213	NC_011901	CTCAT	2	10	286379	286388	20 %	40 %	0 %	40 %	220933446
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6218	NC_011901	CTG	2	6	286640	286645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933447
6219	NC_011901	CGCT	2	8	286702	286709	0 %	25 %	25 %	50 %	220933447
6220	NC_011901	CTG	2	6	286793	286798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933447
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6223	NC_011901	CTG	3	9	286949	286957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933447
6224	NC_011901	CTG	2	6	286976	286981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933447
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6226	NC_011901	GT	4	8	287039	287046	0 %	50 %	50 %	0 %	220933447
6227	NC_011901	ACG	2	6	287052	287057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933447
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6229	NC_011901	GCC	2	6	287075	287080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933447
6230	NC_011901	CTGGCC	2	12	287081	287092	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220933447
6231	NC_011901	CCG	2	6	287104	287109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933447
6232	NC_011901	CG	3	6	287154	287159	0 %	0 %	50 %	50 %	220933447
6233	NC_011901	CG	3	6	287164	287169	0 %	0 %	50 %	50 %	220933447
6234	NC_011901	ATCCTG	2	12	287192	287203	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	220933447
6235	NC_011901	CGG	2	6	287205	287210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933447
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6239	NC_011901	TGC	2	6	287805	287810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933448
6240	NC_011901	CCA	2	6	287916	287921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933448
6241	NC_011901	CGG	4	12	287940	287951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933448
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6361	NC_011901	GTGGC	2	10	293903	293912	0 %	20 %	60 %	20 %	220933453
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6483	NC_011901	CAC	2	6	299611	299616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933458
6484	NC_011901	CCG	2	6	299696	299701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933458
6485	NC_011901	CAG	2	6	299791	299796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933458
6486	NC_011901	TCG	2	6	299861	299866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933458
6487	NC_011901	CAGG	2	8	299932	299939	25 %	0 %	50 %	25 %	220933458
6488	NC_011901	GCA	2	6	300017	300022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933458
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6491	NC_011901	CGG	2	6	300138	300143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933458
6492	NC_011901	CG	3	6	300160	300165	0 %	0 %	50 %	50 %	220933458
6493	NC_011901	CAG	2	6	300226	300231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933458
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6495	NC_011901	GCC	2	6	300280	300285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933458
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6497	NC_011901	TCG	2	6	300374	300379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933458
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6499	NC_011901	TCA	2	6	300479	300484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933458
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