MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 73430

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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60002	NC_011901	CA	3	6	2832176	2832181	50 %	0 %	0 %	50 %	220935851
60003	NC_011901	CAG	2	6	2832203	2832208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220935851
60004	NC_011901	GTAGGT	2	12	2832209	2832220	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	220935851
60005	NC_011901	GCT	2	6	2832241	2832246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220935851
60006	NC_011901	CTG	2	6	2832459	2832464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220935852
60007	NC_011901	CGGC	2	8	2832512	2832519	0 %	0 %	50 %	50 %	220935852
60008	NC_011901	GCCACG	2	12	2832559	2832570	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220935852
60009	NC_011901	CGC	3	9	2832595	2832603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220935852
60010	NC_011901	GCC	2	6	2832605	2832610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220935852
60011	NC_011901	AGG	2	6	2832640	2832645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220935852
60012	NC_011901	GC	3	6	2832697	2832702	0 %	0 %	50 %	50 %	220935852
60013	NC_011901	CTG	2	6	2832843	2832848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220935852
60014	NC_011901	CGA	2	6	2832863	2832868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220935852
60015	NC_011901	GGC	2	6	2832893	2832898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220935852
60016	NC_011901	GAC	2	6	2832924	2832929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220935852
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60018	NC_011901	ACGTGA	2	12	2833069	2833080	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	220935852
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60020	NC_011901	GC	3	6	2833173	2833178	0 %	0 %	50 %	50 %	220935852
60021	NC_011901	GC	3	6	2833193	2833198	0 %	0 %	50 %	50 %	220935852
60022	NC_011901	GGACGC	2	12	2833235	2833246	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220935852
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60032	NC_011901	GCT	2	6	2833720	2833725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220935854
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60054	NC_011901	TGC	2	6	2834501	2834506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220935855
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60103	NC_011901	GC	3	6	2836256	2836261	0 %	0 %	50 %	50 %	220935857
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60115	NC_011901	TGC	2	6	2836964	2836969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220935858
60116	NC_011901	GTT	2	6	2836983	2836988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220935858
60117	NC_011901	CAT	2	6	2837064	2837069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220935858
60118	NC_011901	GC	3	6	2837145	2837150	0 %	0 %	50 %	50 %	220935858
60119	NC_011901	GC	3	6	2837185	2837190	0 %	0 %	50 %	50 %	220935858
60120	NC_011901	CGG	2	6	2837217	2837222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220935858
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60122	NC_011901	CGG	2	6	2837253	2837258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220935858
60123	NC_011901	CGTG	2	8	2837277	2837284	0 %	25 %	50 %	25 %	220935858
60124	NC_011901	TCA	2	6	2837327	2837332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220935858
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60127	NC_011901	GCC	2	6	2837453	2837458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220935858
60128	NC_011901	CTG	2	6	2837476	2837481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220935858
60129	NC_011901	CTG	2	6	2837488	2837493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220935858
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60131	NC_011901	GTG	2	6	2837506	2837511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220935858
60132	NC_011901	CAT	2	6	2837571	2837576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220935858
60133	NC_011901	CG	3	6	2837577	2837582	0 %	0 %	50 %	50 %	220935858
60134	NC_011901	TCA	2	6	2837609	2837614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220935858
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60138	NC_011901	ACG	2	6	2837753	2837758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220935858
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60140	NC_011901	TGC	2	6	2837876	2837881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220935858
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60143	NC_011901	TGC	2	6	2838100	2838105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220935859
60144	NC_011901	GAG	2	6	2838132	2838137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220935859
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60146	NC_011901	GAG	2	6	2838267	2838272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220935859
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60154	NC_011901	CCA	2	6	2838613	2838618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220935859
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60162	NC_011901	AGCA	2	8	2839123	2839130	50 %	0 %	25 %	25 %	220935860
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60188	NC_011901	ACAA	2	8	2840430	2840437	75 %	0 %	0 %	25 %	220935861
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60191	NC_011901	TGA	2	6	2840499	2840504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220935861
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60200	NC_011901	CGG	2	6	2840981	2840986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220935862
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60202	NC_011901	CTG	2	6	2841060	2841065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220935862
60203	NC_011901	CGA	2	6	2841077	2841082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220935862
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60207	NC_011901	GCA	2	6	2841310	2841315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220935862
60208	NC_011901	CCGG	2	8	2841516	2841523	0 %	0 %	50 %	50 %	220935863
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60212	NC_011901	ACC	2	6	2841697	2841702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220935863
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60215	NC_011901	CCCAC	2	10	2842016	2842025	20 %	0 %	0 %	80 %	220935863
60216	NC_011901	TC	3	6	2842057	2842062	0 %	50 %	0 %	50 %	220935863
60217	NC_011901	AAG	2	6	2842074	2842079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220935863
60218	NC_011901	CCGATA	2	12	2842088	2842099	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	220935863
60219	NC_011901	TCTT	2	8	2842158	2842165	0 %	75 %	0 %	25 %	220935863
60220	NC_011901	ACC	2	6	2843403	2843408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220935864
60221	NC_011901	TC	3	6	2843474	2843479	0 %	50 %	0 %	50 %	220935864
60222	NC_011901	AAC	2	6	2843513	2843518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220935864
60223	NC_011901	AAT	2	6	2843522	2843527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220935864
60224	NC_011901	AATTTA	2	12	2843529	2843540	50 %	50 %	0 %	0 %	220935864
60225	NC_011901	GAA	2	6	2843546	2843551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220935864
60226	NC_011901	GCATC	2	10	2843662	2843671	20 %	20 %	20 %	40 %	220935864
60227	NC_011901	AGA	2	6	2843729	2843734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220935864
60228	NC_011901	TTC	2	6	2843771	2843776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220935864
60229	NC_011901	CGA	2	6	2843784	2843789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220935864
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60231	NC_011901	CTA	2	6	2843835	2843840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220935864
60232	NC_011901	ATC	2	6	2843873	2843878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220935864
60233	NC_011901	CTA	2	6	2843881	2843886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220935864
60234	NC_011901	CCT	2	6	2843899	2843904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220935864
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60463	NC_011901	CAC	2	6	2854282	2854287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220935874
60464	NC_011901	CACGG	2	10	2854300	2854309	20 %	0 %	40 %	40 %	220935874
60465	NC_011901	CTG	2	6	2854330	2854335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220935874
60466	NC_011901	CGA	2	6	2854524	2854529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220935875
60467	NC_011901	CCT	2	6	2854542	2854547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220935875
60468	NC_011901	TCG	2	6	2854562	2854567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220935875
60469	NC_011901	GAA	2	6	2854609	2854614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220935875
60470	NC_011901	AGG	2	6	2854674	2854679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220935875
60471	NC_011901	TCG	2	6	2854730	2854735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220935875
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60473	NC_011901	AGC	2	6	2854904	2854909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220935875
60474	NC_011901	GC	3	6	2854944	2854949	0 %	0 %	50 %	50 %	220935875
60475	NC_011901	CGA	2	6	2854965	2854970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220935875
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60477	NC_011901	TGG	2	6	2855269	2855274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220935876
60478	NC_011901	CCT	2	6	2855309	2855314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220935876
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60482	NC_011901	GCC	2	6	2855361	2855366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220935876
60483	NC_011901	CGA	2	6	2855390	2855395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220935876
60484	NC_011901	CGACGC	2	12	2855435	2855446	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220935876
60485	NC_011901	TCAG	2	8	2855479	2855486	25 %	25 %	25 %	25 %	220935876
60486	NC_011901	GCC	2	6	2855521	2855526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220935876
60487	NC_011901	CTG	2	6	2855541	2855546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220935876
60488	NC_011901	GCG	2	6	2855608	2855613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220935876
60489	NC_011901	GCG	2	6	2855668	2855673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220935876
60490	NC_011901	CGA	2	6	2855693	2855698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220935876
60491	NC_011901	CTA	2	6	2855762	2855767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220935876
60492	NC_011901	GCC	2	6	2855862	2855867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220935876
60493	NC_011901	AGCG	2	8	2855868	2855875	25 %	0 %	50 %	25 %	220935876
60494	NC_011901	GCC	2	6	2855904	2855909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220935876
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