MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 73430

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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57002	NC_011901	CCGG	2	8	2691139	2691146	0 %	0 %	50 %	50 %	220935715
57003	NC_011901	CGC	2	6	2691190	2691195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220935715
57004	NC_011901	GCGCA	2	10	2691345	2691354	20 %	0 %	40 %	40 %	220935715
57005	NC_011901	GCC	3	9	2691359	2691367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220935715
57006	NC_011901	CCA	3	9	2691370	2691378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220935715
57007	NC_011901	AGC	2	6	2691436	2691441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220935715
57008	NC_011901	GCC	2	6	2691476	2691481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220935715
57009	NC_011901	CGCC	2	8	2691508	2691515	0 %	0 %	25 %	75 %	220935715
57010	NC_011901	CGG	2	6	2691541	2691546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220935715
57011	NC_011901	CGC	2	6	2691719	2691724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220935716
57012	NC_011901	TGG	3	9	2691731	2691739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220935716
57013	NC_011901	CGT	2	6	2691743	2691748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220935716
57014	NC_011901	CACC	2	8	2691761	2691768	25 %	0 %	0 %	75 %	220935716
57015	NC_011901	CTG	2	6	2691771	2691776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220935716
57016	NC_011901	GCG	2	6	2691808	2691813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220935716
57017	NC_011901	TGA	2	6	2691923	2691928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220935716
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57020	NC_011901	TTC	2	6	2692048	2692053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220935716
57021	NC_011901	CAC	2	6	2692111	2692116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220935716
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57028	NC_011901	GC	3	6	2692323	2692328	0 %	0 %	50 %	50 %	220935716
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57044	NC_011901	GCCT	2	8	2692722	2692729	0 %	25 %	25 %	50 %	220935716
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57051	NC_011901	CTG	2	6	2692956	2692961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220935716
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57053	NC_011901	CTT	2	6	2693257	2693262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220935717
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57116	NC_011901	AC	3	6	2695958	2695963	50 %	0 %	0 %	50 %	220935719
57117	NC_011901	CCT	2	6	2695990	2695995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220935719
57118	NC_011901	TCC	2	6	2696004	2696009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220935719
57119	NC_011901	AGC	2	6	2696010	2696015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220935719
57120	NC_011901	ACC	2	6	2696028	2696033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220935719
57121	NC_011901	GTT	2	6	2696036	2696041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220935719
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57124	NC_011901	CG	3	6	2696084	2696089	0 %	0 %	50 %	50 %	220935719
57125	NC_011901	CAG	2	6	2696099	2696104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220935719
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57127	NC_011901	GCG	2	6	2696192	2696197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220935719
57128	NC_011901	CG	3	6	2696263	2696268	0 %	0 %	50 %	50 %	220935719
57129	NC_011901	GATCC	2	10	2696273	2696282	20 %	20 %	20 %	40 %	220935719
57130	NC_011901	GCG	2	6	2696316	2696321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220935719
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57132	NC_011901	CGT	2	6	2696415	2696420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220935720
57133	NC_011901	GT	3	6	2696430	2696435	0 %	50 %	50 %	0 %	220935720
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57138	NC_011901	CCAG	2	8	2696547	2696554	25 %	0 %	25 %	50 %	220935720
57139	NC_011901	GC	3	6	2696677	2696682	0 %	0 %	50 %	50 %	220935720
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57145	NC_011901	TGG	2	6	2697246	2697251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220935721
57146	NC_011901	ACCC	2	8	2697338	2697345	25 %	0 %	0 %	75 %	220935721
57147	NC_011901	TGC	2	6	2697378	2697383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220935721
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57150	NC_011901	CTG	2	6	2697512	2697517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220935721
57151	NC_011901	GCC	2	6	2697526	2697531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220935721
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57153	NC_011901	GCCGGC	2	12	2697616	2697627	0 %	0 %	50 %	50 %	220935721
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57169	NC_011901	CTGG	2	8	2698446	2698453	0 %	25 %	50 %	25 %	220935722
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57176	NC_011901	GGC	2	6	2698795	2698800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220935722
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57185	NC_011901	ATCG	2	8	2699260	2699267	25 %	25 %	25 %	25 %	220935722
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57193	NC_011901	GAT	2	6	2699568	2699573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220935722
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57195	NC_011901	TGC	2	6	2699701	2699706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220935723
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57200	NC_011901	GACG	2	8	2699861	2699868	25 %	0 %	50 %	25 %	220935723
57201	NC_011901	TGCG	2	8	2699899	2699906	0 %	25 %	50 %	25 %	220935723
57202	NC_011901	CCG	2	6	2699994	2699999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220935723
57203	NC_011901	CTGG	2	8	2700017	2700024	0 %	25 %	50 %	25 %	220935723
57204	NC_011901	CGG	2	6	2700152	2700157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220935723
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57206	NC_011901	GCT	2	6	2700221	2700226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220935723
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57208	NC_011901	CG	3	6	2700261	2700266	0 %	0 %	50 %	50 %	220935723
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57211	NC_011901	GGC	2	6	2700348	2700353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220935723
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57215	NC_011901	GGCG	2	8	2700620	2700627	0 %	0 %	75 %	25 %	220935723
57216	NC_011901	GCCT	2	8	2700747	2700754	0 %	25 %	25 %	50 %	220935723
57217	NC_011901	CGA	2	6	2700803	2700808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220935723
57218	NC_011901	CCG	2	6	2700850	2700855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220935723
57219	NC_011901	GC	4	8	2700907	2700914	0 %	0 %	50 %	50 %	220935723
57220	NC_011901	TGG	2	6	2700928	2700933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220935723
57221	NC_011901	C	6	6	2701093	2701098	0 %	0 %	0 %	100 %	220935724
57222	NC_011901	CTT	2	6	2701140	2701145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220935724
57223	NC_011901	CTG	2	6	2701147	2701152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220935724
57224	NC_011901	GGT	2	6	2701167	2701172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220935724
57225	NC_011901	CTC	2	6	2701180	2701185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220935724
57226	NC_011901	CGG	3	9	2701203	2701211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220935724
57227	NC_011901	GAT	2	6	2701260	2701265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220935724
57228	NC_011901	GTG	2	6	2701285	2701290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220935724
57229	NC_011901	GCT	2	6	2701353	2701358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220935724
57230	NC_011901	CTG	2	6	2701360	2701365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220935724
57231	NC_011901	GGC	2	6	2701411	2701416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220935724
57232	NC_011901	CG	3	6	2701476	2701481	0 %	0 %	50 %	50 %	220935724
57233	NC_011901	CTG	2	6	2701627	2701632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220935724
57234	NC_011901	TGC	2	6	2701634	2701639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220935724
57235	NC_011901	TCATGG	2	12	2701643	2701654	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	220935724
57236	NC_011901	TTC	2	6	2701672	2701677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220935724
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57460	NC_011901	ACCGGC	2	12	2711976	2711987	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220935733
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57463	NC_011901	TTC	2	6	2712093	2712098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220935733
57464	NC_011901	GCC	2	6	2712126	2712131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220935733
57465	NC_011901	GACG	2	8	2712141	2712148	25 %	0 %	50 %	25 %	220935733
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57467	NC_011901	TGC	2	6	2712232	2712237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220935733
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57494	NC_011901	CGC	2	6	2713368	2713373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220935734
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57499	NC_011901	CCA	2	6	2713716	2713721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220935735
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