MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosipho africanus TCF52B chromosome

Total Repeats: 47428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011653	TC	3	6	678	683	0 %	50 %	0 %	50 %	254555126
2	NC_011653	CTG	2	6	693	698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555126
3	NC_011653	ATT	2	6	701	706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555126
4	NC_011653	TA	3	6	730	735	50 %	50 %	0 %	0 %	254555126
5	NC_011653	CTT	2	6	741	746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555126
6	NC_011653	CCA	2	6	756	761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555126
7	NC_011653	TCC	2	6	764	769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254555126
8	NC_011653	TCT	2	6	815	820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555126
9	NC_011653	T	6	6	849	854	0 %	100 %	0 %	0 %	254555126
10	NC_011653	T	6	6	877	882	0 %	100 %	0 %	0 %	254555126
11	NC_011653	AT	3	6	892	897	50 %	50 %	0 %	0 %	254555126
12	NC_011653	T	6	6	937	942	0 %	100 %	0 %	0 %	254555126
13	NC_011653	TCT	2	6	959	964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555126
14	NC_011653	TAT	2	6	976	981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555126
15	NC_011653	TGGG	2	8	994	1001	0 %	25 %	75 %	0 %	254555126
16	NC_011653	TAA	2	6	1006	1011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555126
17	NC_011653	T	6	6	1103	1108	0 %	100 %	0 %	0 %	254555126
18	NC_011653	TTG	2	6	1131	1136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555126
19	NC_011653	TTA	2	6	1140	1145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555126
20	NC_011653	AT	4	8	1159	1166	50 %	50 %	0 %	0 %	254555126
21	NC_011653	AT	3	6	1177	1182	50 %	50 %	0 %	0 %	254555126
22	NC_011653	TTA	2	6	1203	1208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555126
23	NC_011653	ATC	2	6	1258	1263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555126
24	NC_011653	AGT	2	6	1356	1361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555126
25	NC_011653	ACT	2	6	1385	1390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555126
26	NC_011653	TTC	2	6	1405	1410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555126
27	NC_011653	T	6	6	1425	1430	0 %	100 %	0 %	0 %	254555126
28	NC_011653	CCAT	2	8	1448	1455	25 %	25 %	0 %	50 %	254555126
29	NC_011653	TAT	2	6	1458	1463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555126
30	NC_011653	AATCA	2	10	1480	1489	60 %	20 %	0 %	20 %	254555126
31	NC_011653	CAT	2	6	1504	1509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555126
32	NC_011653	CAAT	2	8	1548	1555	50 %	25 %	0 %	25 %	254555126
33	NC_011653	T	7	7	1578	1584	0 %	100 %	0 %	0 %	254555126
34	NC_011653	TCT	2	6	1696	1701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076134
35	NC_011653	AAT	2	6	1722	1727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076134
36	NC_011653	TTA	2	6	1730	1735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076134
37	NC_011653	TTCTAA	2	12	1737	1748	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	217076134
38	NC_011653	TTC	2	6	1761	1766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076134
39	NC_011653	TTC	2	6	1824	1829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076134
40	NC_011653	TATT	2	8	1840	1847	25 %	75 %	0 %	0 %	217076134
41	NC_011653	TAA	2	6	1893	1898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076134
42	NC_011653	T	6	6	1901	1906	0 %	100 %	0 %	0 %	217076134
43	NC_011653	T	6	6	1970	1975	0 %	100 %	0 %	0 %	217076134
44	NC_011653	TAT	2	6	1982	1987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076134
45	NC_011653	A	6	6	2011	2016	100 %	0 %	0 %	0 %	217076134
46	NC_011653	TAT	3	9	2078	2086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076134
47	NC_011653	TTC	2	6	2088	2093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076134
48	NC_011653	CAA	2	6	2106	2111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076134
49	NC_011653	CAT	2	6	2124	2129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076134
50	NC_011653	CAA	2	6	2152	2157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076135
51	NC_011653	TCAT	2	8	2175	2182	25 %	50 %	0 %	25 %	217076135
52	NC_011653	TTCA	2	8	2210	2217	25 %	50 %	0 %	25 %	217076135
53	NC_011653	TTG	2	6	2231	2236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217076135
54	NC_011653	ATT	3	9	2259	2267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076135
55	NC_011653	AATT	2	8	2300	2307	50 %	50 %	0 %	0 %	217076135
56	NC_011653	AT	3	6	2326	2331	50 %	50 %	0 %	0 %	217076135
57	NC_011653	TGA	2	6	2486	2491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076135
58	NC_011653	T	6	6	2516	2521	0 %	100 %	0 %	0 %	217076135
59	NC_011653	TA	3	6	2549	2554	50 %	50 %	0 %	0 %	217076135
60	NC_011653	T	7	7	2567	2573	0 %	100 %	0 %	0 %	217076135
61	NC_011653	TCTCT	2	10	2575	2584	0 %	60 %	0 %	40 %	217076135
62	NC_011653	TATT	2	8	2587	2594	25 %	75 %	0 %	0 %	217076135
63	NC_011653	TAT	2	6	2606	2611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076135
64	NC_011653	TTG	2	6	2612	2617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217076135
65	NC_011653	CAA	2	6	2626	2631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076135
66	NC_011653	ATTTT	2	10	2632	2641	20 %	80 %	0 %	0 %	217076135
67	NC_011653	T	6	6	2638	2643	0 %	100 %	0 %	0 %	217076135
68	NC_011653	T	6	6	2674	2679	0 %	100 %	0 %	0 %	217076135
69	NC_011653	AATTT	2	10	2718	2727	40 %	60 %	0 %	0 %	217076135
70	NC_011653	ATT	2	6	2729	2734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076135
71	NC_011653	T	6	6	2746	2751	0 %	100 %	0 %	0 %	217076135
72	NC_011653	ATT	2	6	2757	2762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076135
73	NC_011653	T	8	8	2783	2790	0 %	100 %	0 %	0 %	217076135
74	NC_011653	TA	3	6	2794	2799	50 %	50 %	0 %	0 %	217076135
75	NC_011653	TAA	2	6	2803	2808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076135
76	NC_011653	TTTC	2	8	2835	2842	0 %	75 %	0 %	25 %	217076135
77	NC_011653	TTG	2	6	2859	2864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217076135
78	NC_011653	TTC	2	6	2867	2872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076135
79	NC_011653	TAA	3	9	2971	2979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076135
80	NC_011653	ATTT	2	8	3055	3062	25 %	75 %	0 %	0 %	217076135
81	NC_011653	GGTA	2	8	3089	3096	25 %	25 %	50 %	0 %	217076135
82	NC_011653	ACCA	2	8	3154	3161	50 %	0 %	0 %	50 %	217076135
83	NC_011653	CTTT	2	8	3196	3203	0 %	75 %	0 %	25 %	217076135
84	NC_011653	T	6	6	3246	3251	0 %	100 %	0 %	0 %	217076135
85	NC_011653	T	6	6	3266	3271	0 %	100 %	0 %	0 %	217076135
86	NC_011653	T	6	6	3326	3331	0 %	100 %	0 %	0 %	217076135
87	NC_011653	T	6	6	3334	3339	0 %	100 %	0 %	0 %	217076135
88	NC_011653	GATCT	2	10	3350	3359	20 %	40 %	20 %	20 %	217076135
89	NC_011653	T	6	6	3380	3385	0 %	100 %	0 %	0 %	217076135
90	NC_011653	T	7	7	3408	3414	0 %	100 %	0 %	0 %	217076135
91	NC_011653	TCTT	2	8	3420	3427	0 %	75 %	0 %	25 %	217076135
92	NC_011653	ATT	2	6	3437	3442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076135
93	NC_011653	TC	3	6	3459	3464	0 %	50 %	0 %	50 %	217076135
94	NC_011653	T	6	6	3481	3486	0 %	100 %	0 %	0 %	217076135
95	NC_011653	TCA	2	6	3567	3572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076135
96	NC_011653	AAT	2	6	3574	3579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076135
97	NC_011653	T	7	7	3647	3653	0 %	100 %	0 %	0 %	217076135
98	NC_011653	ATT	2	6	3672	3677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076135
99	NC_011653	AAAG	2	8	3693	3700	75 %	0 %	25 %	0 %	217076135
100	NC_011653	CTTT	2	8	3771	3778	0 %	75 %	0 %	25 %	217076135
101	NC_011653	TCA	2	6	3822	3827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076135
102	NC_011653	ATT	3	9	3836	3844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076135
103	NC_011653	CAA	2	6	3952	3957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076135
104	NC_011653	ATT	2	6	3980	3985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076135
105	NC_011653	ATC	2	6	4062	4067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076136
106	NC_011653	AATT	2	8	4090	4097	50 %	50 %	0 %	0 %	217076136
107	NC_011653	T	6	6	4096	4101	0 %	100 %	0 %	0 %	217076136
108	NC_011653	TCA	2	6	4124	4129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076136
109	NC_011653	A	6	6	4155	4160	100 %	0 %	0 %	0 %	217076136
110	NC_011653	ATA	2	6	4167	4172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076136
111	NC_011653	CTT	2	6	4191	4196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076136
112	NC_011653	T	6	6	4221	4226	0 %	100 %	0 %	0 %	217076136
113	NC_011653	AGA	2	6	4252	4257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076136
114	NC_011653	TTCA	2	8	4290	4297	25 %	50 %	0 %	25 %	217076137
115	NC_011653	AAT	2	6	4338	4343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076137
116	NC_011653	CCTTT	2	10	4350	4359	0 %	60 %	0 %	40 %	217076137
117	NC_011653	TCT	2	6	4399	4404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076137
118	NC_011653	TTC	2	6	4472	4477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076137
119	NC_011653	TCA	2	6	4558	4563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076137
120	NC_011653	AAT	2	6	4590	4595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076137
121	NC_011653	TTA	2	6	4633	4638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076137
122	NC_011653	AT	4	8	4665	4672	50 %	50 %	0 %	0 %	217076137
123	NC_011653	TAA	2	6	4683	4688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076137
124	NC_011653	TTA	2	6	4703	4708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076137
125	NC_011653	ATC	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076137
126	NC_011653	ATT	2	6	4726	4731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076137
127	NC_011653	ATT	2	6	4749	4754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076137
128	NC_011653	TCT	2	6	4777	4782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076137
129	NC_011653	T	6	6	4798	4803	0 %	100 %	0 %	0 %	217076137
130	NC_011653	TAA	2	6	4811	4816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076137
131	NC_011653	TTA	2	6	4829	4834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076137
132	NC_011653	TCA	2	6	4852	4857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076137
133	NC_011653	TCA	2	6	4867	4872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076137
134	NC_011653	GAA	2	6	4885	4890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076137
135	NC_011653	T	6	6	4933	4938	0 %	100 %	0 %	0 %	217076137
136	NC_011653	ATA	4	12	4971	4982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076137
137	NC_011653	TAT	2	6	4997	5002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076137
138	NC_011653	A	6	6	5077	5082	100 %	0 %	0 %	0 %	217076137
139	NC_011653	TAA	2	6	5235	5240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076137
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