MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosipho africanus TCF52B chromosome

Total Repeats: 47428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011653	ATA	2	6	18439	18444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076150
502	NC_011653	T	6	6	18522	18527	0 %	100 %	0 %	0 %	217076151
503	NC_011653	ACA	3	9	18555	18563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076151
504	NC_011653	TCA	2	6	18600	18605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076151
505	NC_011653	A	6	6	18605	18610	100 %	0 %	0 %	0 %	217076151
506	NC_011653	ATT	2	6	18651	18656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076151
507	NC_011653	TCTT	2	8	18679	18686	0 %	75 %	0 %	25 %	217076151
508	NC_011653	AAT	2	6	18694	18699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076151
509	NC_011653	AGT	2	6	18735	18740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076151
510	NC_011653	TAA	2	6	18753	18758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076151
511	NC_011653	TA	3	6	18772	18777	50 %	50 %	0 %	0 %	217076151
512	NC_011653	T	7	7	18866	18872	0 %	100 %	0 %	0 %	217076151
513	NC_011653	TAA	2	6	18892	18897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076151
514	NC_011653	TGC	2	6	18914	18919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217076151
515	NC_011653	TAA	2	6	18929	18934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076151
516	NC_011653	T	6	6	18970	18975	0 %	100 %	0 %	0 %	217076151
517	NC_011653	ATA	2	6	18988	18993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076151
518	NC_011653	TAAAT	2	10	19025	19034	60 %	40 %	0 %	0 %	217076151
519	NC_011653	TA	3	6	19051	19056	50 %	50 %	0 %	0 %	217076151
520	NC_011653	AAAAC	2	10	19096	19105	80 %	0 %	0 %	20 %	217076151
521	NC_011653	AAAAG	2	10	19141	19150	80 %	0 %	20 %	0 %	217076151
522	NC_011653	A	6	6	19190	19195	100 %	0 %	0 %	0 %	217076151
523	NC_011653	T	6	6	19221	19226	0 %	100 %	0 %	0 %	217076151
524	NC_011653	A	6	6	19235	19240	100 %	0 %	0 %	0 %	217076151
525	NC_011653	AAT	2	6	19250	19255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076151
526	NC_011653	A	7	7	19261	19267	100 %	0 %	0 %	0 %	217076151
527	NC_011653	TGA	3	9	19340	19348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076151
528	NC_011653	ATT	2	6	19359	19364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076151
529	NC_011653	ATACGA	2	12	19544	19555	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	217076152
530	NC_011653	TTGAAA	2	12	19576	19587	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	217076152
531	NC_011653	CTA	2	6	19605	19610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076152
532	NC_011653	A	8	8	19649	19656	100 %	0 %	0 %	0 %	217076152
533	NC_011653	GGC	2	6	19836	19841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217076152
534	NC_011653	ATC	2	6	19852	19857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076152
535	NC_011653	TGT	2	6	19874	19879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217076152
536	NC_011653	CCA	2	6	19886	19891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217076152
537	NC_011653	AGA	2	6	19908	19913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076152
538	NC_011653	AAAT	2	8	19940	19947	75 %	25 %	0 %	0 %	217076152
539	NC_011653	TGG	2	6	19976	19981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217076152
540	NC_011653	CTA	2	6	19990	19995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076152
541	NC_011653	GGT	2	6	20046	20051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217076152
542	NC_011653	AATG	2	8	20121	20128	50 %	25 %	25 %	0 %	217076152
543	NC_011653	AGA	2	6	20165	20170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076152
544	NC_011653	A	6	6	20195	20200	100 %	0 %	0 %	0 %	217076152
545	NC_011653	T	6	6	20212	20217	0 %	100 %	0 %	0 %	217076152
546	NC_011653	T	6	6	20286	20291	0 %	100 %	0 %	0 %	217076152
547	NC_011653	AAT	2	6	20331	20336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076152
548	NC_011653	ACA	2	6	20351	20356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076152
549	NC_011653	ATC	2	6	20390	20395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076152
550	NC_011653	T	6	6	20400	20405	0 %	100 %	0 %	0 %	217076152
551	NC_011653	AGA	2	6	20406	20411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076152
552	NC_011653	T	6	6	20435	20440	0 %	100 %	0 %	0 %	217076152
553	NC_011653	AT	4	8	20468	20475	50 %	50 %	0 %	0 %	217076152
554	NC_011653	ATC	2	6	20494	20499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076153
555	NC_011653	CTG	2	6	20579	20584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217076153
556	NC_011653	AT	3	6	20603	20608	50 %	50 %	0 %	0 %	217076153
557	NC_011653	TAA	2	6	20622	20627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076153
558	NC_011653	A	7	7	20626	20632	100 %	0 %	0 %	0 %	217076153
559	NC_011653	ACA	2	6	20662	20667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076153
560	NC_011653	TAA	2	6	20690	20695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076153
561	NC_011653	TAT	2	6	20696	20701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076153
562	NC_011653	A	6	6	20733	20738	100 %	0 %	0 %	0 %	217076153
563	NC_011653	GCC	2	6	20760	20765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217076153
564	NC_011653	A	6	6	20781	20786	100 %	0 %	0 %	0 %	217076153
565	NC_011653	T	7	7	20820	20826	0 %	100 %	0 %	0 %	217076153
566	NC_011653	A	6	6	20859	20864	100 %	0 %	0 %	0 %	217076153
567	NC_011653	A	7	7	20875	20881	100 %	0 %	0 %	0 %	217076153
568	NC_011653	AAT	2	6	20889	20894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076153
569	NC_011653	AAG	2	6	20901	20906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076153
570	NC_011653	T	6	6	21006	21011	0 %	100 %	0 %	0 %	217076153
571	NC_011653	T	6	6	21016	21021	0 %	100 %	0 %	0 %	217076153
572	NC_011653	TACC	2	8	21047	21054	25 %	25 %	0 %	50 %	217076153
573	NC_011653	CCA	3	9	21124	21132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217076153
574	NC_011653	CTG	2	6	21152	21157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217076153
575	NC_011653	A	6	6	21168	21173	100 %	0 %	0 %	0 %	217076153
576	NC_011653	T	6	6	21200	21205	0 %	100 %	0 %	0 %	217076153
577	NC_011653	ATT	2	6	21387	21392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076154
578	NC_011653	ATC	2	6	21395	21400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076154
579	NC_011653	ATC	2	6	21497	21502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076154
580	NC_011653	TGA	2	6	21509	21514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076154
581	NC_011653	CAA	2	6	21526	21531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076154
582	NC_011653	AAAT	2	8	21532	21539	75 %	25 %	0 %	0 %	217076154
583	NC_011653	AT	3	6	21570	21575	50 %	50 %	0 %	0 %	217076154
584	NC_011653	T	6	6	21597	21602	0 %	100 %	0 %	0 %	217076154
585	NC_011653	AAT	2	6	21679	21684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076154
586	NC_011653	TAC	2	6	21839	21844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076154
587	NC_011653	TCAC	2	8	21908	21915	25 %	25 %	0 %	50 %	217076155
588	NC_011653	TAAA	2	8	21917	21924	75 %	25 %	0 %	0 %	217076155
589	NC_011653	TTC	2	6	21932	21937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076155
590	NC_011653	T	7	7	21965	21971	0 %	100 %	0 %	0 %	217076155
591	NC_011653	CAA	2	6	21988	21993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076155
592	NC_011653	TTTTA	2	10	21995	22004	20 %	80 %	0 %	0 %	217076155
593	NC_011653	AACCA	2	10	22058	22067	60 %	0 %	0 %	40 %	217076155
594	NC_011653	TAT	2	6	22087	22092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076155
595	NC_011653	AAT	2	6	22099	22104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076155
596	NC_011653	ACT	2	6	22122	22127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076155
597	NC_011653	ATA	2	6	22242	22247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076155
598	NC_011653	CTT	2	6	22255	22260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076155
599	NC_011653	CTT	2	6	22345	22350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076155
600	NC_011653	A	6	6	22353	22358	100 %	0 %	0 %	0 %	217076155
601	NC_011653	TTA	2	6	22368	22373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076155
602	NC_011653	TAG	2	6	22381	22386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076155
603	NC_011653	T	6	6	22400	22405	0 %	100 %	0 %	0 %	217076155
604	NC_011653	TTA	2	6	22435	22440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076155
605	NC_011653	CAT	2	6	22447	22452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076155
606	NC_011653	TTA	2	6	22474	22479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076155
607	NC_011653	ACCAAA	2	12	22604	22615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076155
608	NC_011653	TA	3	6	22630	22635	50 %	50 %	0 %	0 %	217076155
609	NC_011653	TTC	2	6	22652	22657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076155
610	NC_011653	ATT	2	6	22659	22664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076155
611	NC_011653	T	7	7	22663	22669	0 %	100 %	0 %	0 %	217076155
612	NC_011653	CTT	2	6	22711	22716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076155
613	NC_011653	GGAT	2	8	22737	22744	25 %	25 %	50 %	0 %	217076155
614	NC_011653	CAAA	2	8	22794	22801	75 %	0 %	0 %	25 %	217076155
615	NC_011653	TAA	2	6	22816	22821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076155
616	NC_011653	AAT	2	6	22891	22896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076155
617	NC_011653	ATT	2	6	22904	22909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076155
618	NC_011653	ATT	2	6	22956	22961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076155
619	NC_011653	TAAT	2	8	22980	22987	50 %	50 %	0 %	0 %	217076155
620	NC_011653	T	6	6	23017	23022	0 %	100 %	0 %	0 %	217076155
621	NC_011653	TGG	2	6	23066	23071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217076155
622	NC_011653	AT	3	6	23073	23078	50 %	50 %	0 %	0 %	217076155
623	NC_011653	ATT	2	6	23082	23087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076155
624	NC_011653	CTT	2	6	23092	23097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076155
625	NC_011653	ACC	2	6	23105	23110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217076155
626	NC_011653	CTT	2	6	23141	23146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076155
627	NC_011653	TAT	2	6	23210	23215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076155
628	NC_011653	T	6	6	23248	23253	0 %	100 %	0 %	0 %	217076155
629	NC_011653	T	6	6	23296	23301	0 %	100 %	0 %	0 %	217076155
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