MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 32806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011529	GAA	2	6	135012	135017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223303
2502	NC_011529	CT	3	6	135206	135211	0 %	50 %	0 %	50 %	212223304
2503	NC_011529	GTA	2	6	135230	135235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223304
2504	NC_011529	GTA	2	6	135301	135306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223304
2505	NC_011529	CTC	2	6	135379	135384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223304
2506	NC_011529	ATG	2	6	135414	135419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223304
2507	NC_011529	CCG	2	6	135495	135500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223304
2508	NC_011529	GCT	2	6	135504	135509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223304
2509	NC_011529	AAT	2	6	135521	135526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223304
2510	NC_011529	TAATCC	2	12	135535	135546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223304
2511	NC_011529	CCGA	2	8	135557	135564	25 %	0 %	25 %	50 %	212223304
2512	NC_011529	GT	3	6	135619	135624	0 %	50 %	50 %	0 %	212223304
2513	NC_011529	GTA	2	6	135770	135775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223304
2514	NC_011529	CAG	2	6	135779	135784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223304
2515	NC_011529	GTA	2	6	135850	135855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223304
2516	NC_011529	AG	3	6	135900	135905	50 %	0 %	50 %	0 %	212223304
2517	NC_011529	GGT	2	6	135974	135979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223304
2518	NC_011529	CCA	2	6	136038	136043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223304
2519	NC_011529	TAC	2	6	136130	136135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223304
2520	NC_011529	AT	3	6	136139	136144	50 %	50 %	0 %	0 %	212223304
2521	NC_011529	ATC	2	6	136182	136187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223304
2522	NC_011529	TCA	2	6	136188	136193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223305
2523	NC_011529	CCT	2	6	136195	136200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223305
2524	NC_011529	AGT	2	6	136238	136243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223305
2525	NC_011529	TATCAT	2	12	136249	136260	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	212223305
2526	NC_011529	GA	3	6	136261	136266	50 %	0 %	50 %	0 %	212223305
2527	NC_011529	ACC	2	6	136268	136273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223305
2528	NC_011529	GA	3	6	136310	136315	50 %	0 %	50 %	0 %	212223305
2529	NC_011529	TAT	2	6	136345	136350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223305
2530	NC_011529	ACC	2	6	136366	136371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223305
2531	NC_011529	TAT	2	6	136420	136425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223305
2532	NC_011529	GAAG	2	8	136455	136462	50 %	0 %	50 %	0 %	212223305
2533	NC_011529	ACCA	2	8	136474	136481	50 %	0 %	0 %	50 %	212223305
2534	NC_011529	GCC	3	9	136493	136501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223305
2535	NC_011529	CAG	2	6	136609	136614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223305
2536	NC_011529	CGA	2	6	136626	136631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223305
2537	NC_011529	AGG	2	6	136646	136651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223305
2538	NC_011529	CAT	2	6	136804	136809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223305
2539	NC_011529	CCT	2	6	136883	136888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223305
2540	NC_011529	GAGCCC	2	12	136924	136935	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	212223305
2541	NC_011529	GTGAGC	2	12	137018	137029	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212223305
2542	NC_011529	ATC	2	6	137174	137179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223306
2543	NC_011529	AGA	2	6	137209	137214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212223306
2544	NC_011529	CTT	2	6	137261	137266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223306
2545	NC_011529	GAGC	2	8	137353	137360	25 %	0 %	50 %	25 %	212223306
2546	NC_011529	TCG	2	6	137373	137378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223306
2547	NC_011529	TAAT	2	8	137401	137408	50 %	50 %	0 %	0 %	212223306
2548	NC_011529	ACC	2	6	137438	137443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223306
2549	NC_011529	T	6	6	137475	137480	0 %	100 %	0 %	0 %	212223306
2550	NC_011529	GA	3	6	137496	137501	50 %	0 %	50 %	0 %	212223306
2551	NC_011529	TTC	3	9	137525	137533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223306
2552	NC_011529	AG	3	6	137534	137539	50 %	0 %	50 %	0 %	212223306
2553	NC_011529	GTT	2	6	137591	137596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212223306
2554	NC_011529	G	6	6	137639	137644	0 %	0 %	100 %	0 %	212223306
2555	NC_011529	TCC	2	6	137677	137682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223306
2556	NC_011529	CGT	2	6	137693	137698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223306
2557	NC_011529	GTG	2	6	137757	137762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223306
2558	NC_011529	C	6	6	137855	137860	0 %	0 %	0 %	100 %	212223307
2559	NC_011529	TGCCCT	2	12	137913	137924	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	212223307
2560	NC_011529	GGT	2	6	137958	137963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223307
2561	NC_011529	GAG	2	6	138001	138006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223307
2562	NC_011529	TCA	2	6	138117	138122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223307
2563	NC_011529	GAG	2	6	138139	138144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223307
2564	NC_011529	ACC	2	6	138154	138159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223307
2565	NC_011529	CTG	2	6	138171	138176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223307
2566	NC_011529	CACG	2	8	138221	138228	25 %	0 %	25 %	50 %	212223307
2567	NC_011529	CTC	2	6	138238	138243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223307
2568	NC_011529	AGTG	2	8	138331	138338	25 %	25 %	50 %	0 %	212223307
2569	NC_011529	TCT	2	6	138416	138421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223307
2570	NC_011529	TAT	2	6	138508	138513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223307
2571	NC_011529	TC	3	6	138526	138531	0 %	50 %	0 %	50 %	212223307
2572	NC_011529	ACTC	2	8	138544	138551	25 %	25 %	0 %	50 %	212223307
2573	NC_011529	CCA	2	6	138569	138574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212223307
2574	NC_011529	TCG	2	6	138775	138780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223308
2575	NC_011529	TGA	2	6	138801	138806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223308
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2577	NC_011529	GCA	2	6	138916	138921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223308
2578	NC_011529	CGT	2	6	138932	138937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223308
2579	NC_011529	CTT	2	6	138999	139004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223308
2580	NC_011529	CCT	2	6	139070	139075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223308
2581	NC_011529	TCCG	2	8	139101	139108	0 %	25 %	25 %	50 %	212223308
2582	NC_011529	GA	3	6	139156	139161	50 %	0 %	50 %	0 %	212223308
2583	NC_011529	ATA	2	6	139223	139228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223308
2584	NC_011529	AATT	2	8	139232	139239	50 %	50 %	0 %	0 %	212223308
2585	NC_011529	TCG	2	6	139343	139348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223308
2586	NC_011529	TGG	2	6	139515	139520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223308
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2588	NC_011529	TCC	2	6	139741	139746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223308
2589	NC_011529	TCT	2	6	139772	139777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223308
2590	NC_011529	TCCG	2	8	139779	139786	0 %	25 %	25 %	50 %	212223308
2591	NC_011529	GCT	2	6	139845	139850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223308
2592	NC_011529	TCC	2	6	139887	139892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223308
2593	NC_011529	CAG	2	6	139914	139919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223308
2594	NC_011529	TGC	2	6	139935	139940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223308
2595	NC_011529	CTT	2	6	139944	139949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223308
2596	NC_011529	TTCT	2	8	140237	140244	0 %	75 %	0 %	25 %	212223309
2597	NC_011529	ATC	2	6	140262	140267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223309
2598	NC_011529	TTC	2	6	140290	140295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223309
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2600	NC_011529	GTA	2	6	140354	140359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223309
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2602	NC_011529	TCT	2	6	140495	140500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223309
2603	NC_011529	CTC	2	6	140540	140545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223309
2604	NC_011529	TTTGAT	2	12	140570	140581	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	212223309
2605	NC_011529	GTC	2	6	140639	140644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223309
2606	NC_011529	GCTC	2	8	140674	140681	0 %	25 %	25 %	50 %	212223309
2607	NC_011529	GGT	2	6	140707	140712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223309
2608	NC_011529	GGA	2	6	140824	140829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223309
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2610	NC_011529	TAT	2	6	140975	140980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212223309
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2612	NC_011529	GA	3	6	140994	140999	50 %	0 %	50 %	0 %	212223309
2613	NC_011529	CGT	2	6	141001	141006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212223309
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2618	NC_011529	ATCT	2	8	141134	141141	25 %	50 %	0 %	25 %	212223309
2619	NC_011529	TCA	2	6	141181	141186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223309
2620	NC_011529	TTC	2	6	141219	141224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223309
2621	NC_011529	GTA	2	6	141281	141286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223309
2622	NC_011529	CT	3	6	141294	141299	0 %	50 %	0 %	50 %	212223309
2623	NC_011529	TA	3	6	141326	141331	50 %	50 %	0 %	0 %	212223309
2624	NC_011529	G	6	6	141351	141356	0 %	0 %	100 %	0 %	212223309
2625	NC_011529	CCT	2	6	141373	141378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223309
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2628	NC_011529	GAC	2	6	141624	141629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223310
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2632	NC_011529	GGT	2	6	141802	141807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223310
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2635	NC_011529	GAC	2	6	141942	141947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223310
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2639	NC_011529	CGTT	2	8	142130	142137	0 %	50 %	25 %	25 %	212223311
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2740	NC_011529	CTT	2	6	147218	147223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223315
2741	NC_011529	ATG	2	6	147225	147230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212223315
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2743	NC_011529	CGA	2	6	147265	147270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212223315
2744	NC_011529	G	6	6	147296	147301	0 %	0 %	100 %	0 %	212223315
2745	NC_011529	TCGG	2	8	147363	147370	0 %	25 %	50 %	25 %	212223315
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2851	NC_011529	TGG	2	6	153041	153046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223321
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2857	NC_011529	TGG	2	6	153288	153293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212223321
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2865	NC_011529	AGAC	2	8	153605	153612	50 %	0 %	25 %	25 %	212223321
2866	NC_011529	AAGA	2	8	153655	153662	75 %	0 %	25 %	0 %	212223321
2867	NC_011529	GA	3	6	153682	153687	50 %	0 %	50 %	0 %	212223321
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2983	NC_011529	GCCA	2	8	158714	158721	25 %	0 %	25 %	50 %	212223329
2984	NC_011529	TCACCG	2	12	158752	158763	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	212223329
2985	NC_011529	TCC	2	6	158889	158894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223329
2986	NC_011529	GCCG	2	8	159739	159746	0 %	0 %	50 %	50 %	212223330
2987	NC_011529	AGG	2	6	159768	159773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223330
2988	NC_011529	AGGGA	2	10	159806	159815	40 %	0 %	60 %	0 %	212223330
2989	NC_011529	TCCC	2	8	159825	159832	0 %	25 %	0 %	75 %	212223330
2990	NC_011529	AGG	2	6	160127	160132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223330
2991	NC_011529	GAG	2	6	160558	160563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223331
2992	NC_011529	GAG	2	6	160591	160596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223331
2993	NC_011529	AG	3	6	160616	160621	50 %	0 %	50 %	0 %	212223331
2994	NC_011529	CCG	2	6	160622	160627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212223331
2995	NC_011529	TCA	2	6	160757	160762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212223332
2996	NC_011529	CCT	2	6	160815	160820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212223332
2997	NC_011529	AG	3	6	160830	160835	50 %	0 %	50 %	0 %	212223332
2998	NC_011529	TAA	2	6	160862	160867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212223332
2999	NC_011529	TTC	2	6	160921	160926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212223332
3000	NC_011529	GGA	2	6	160929	160934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212223332

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