MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus onnurineus NA1 chromosome

Total Repeats: 32806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20117	NC_011529	AC	3	6	1130534	1130539	50 %	0 %	0 %	50 %	212224389
20118	NC_011529	GAC	2	6	1130589	1130594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224389
20119	NC_011529	GA	3	6	1130669	1130674	50 %	0 %	50 %	0 %	212224389
20120	NC_011529	TGAGG	2	10	1130686	1130695	20 %	20 %	60 %	0 %	212224389
20121	NC_011529	TCGG	2	8	1130717	1130724	0 %	25 %	50 %	25 %	212224390
20122	NC_011529	TGA	2	6	1130733	1130738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224390
20123	NC_011529	AAG	2	6	1130794	1130799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224390
20124	NC_011529	GA	3	6	1130865	1130870	50 %	0 %	50 %	0 %	212224390
20125	NC_011529	GTT	2	6	1130887	1130892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212224390
20126	NC_011529	ATC	2	6	1130959	1130964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224390
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20128	NC_011529	AGG	2	6	1131111	1131116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224391
20129	NC_011529	ATC	2	6	1131159	1131164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224391
20130	NC_011529	GGGA	2	8	1131195	1131202	25 %	0 %	75 %	0 %	212224391
20131	NC_011529	AGA	2	6	1131223	1131228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224391
20132	NC_011529	TGA	2	6	1131242	1131247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224391
20133	NC_011529	AGA	2	6	1131252	1131257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224391
20134	NC_011529	AGG	2	6	1131288	1131293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224391
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20136	NC_011529	CTT	2	6	1131405	1131410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224391
20137	NC_011529	GAACTC	2	12	1131413	1131424	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	212224391
20138	NC_011529	CCAT	2	8	1131466	1131473	25 %	25 %	0 %	50 %	212224391
20139	NC_011529	AAC	2	6	1131494	1131499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224391
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20141	NC_011529	TGA	2	6	1131910	1131915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224391
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20144	NC_011529	GCCATC	2	12	1132323	1132334	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	212224391
20145	NC_011529	AGA	2	6	1132345	1132350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224391
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20147	NC_011529	TCC	2	6	1132586	1132591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224392
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20149	NC_011529	CTT	2	6	1132612	1132617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224392
20150	NC_011529	ATT	2	6	1132643	1132648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212224392
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20152	NC_011529	GTGG	2	8	1132705	1132712	0 %	25 %	75 %	0 %	212224392
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20192	NC_011529	CGA	3	9	1135364	1135372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224395
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20216	NC_011529	CGT	2	6	1137085	1137090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224397
20217	NC_011529	CGAG	2	8	1137203	1137210	25 %	0 %	50 %	25 %	212224397
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20220	NC_011529	TGG	2	6	1137317	1137322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224397
20221	NC_011529	AG	3	6	1137444	1137449	50 %	0 %	50 %	0 %	212224397
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20223	NC_011529	CT	3	6	1137501	1137506	0 %	50 %	0 %	50 %	212224397
20224	NC_011529	CGA	2	6	1137754	1137759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224398
20225	NC_011529	ACG	2	6	1137801	1137806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224398
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20227	NC_011529	AG	3	6	1137871	1137876	50 %	0 %	50 %	0 %	212224398
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20230	NC_011529	TCA	2	6	1138026	1138031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224398
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20232	NC_011529	GAG	2	6	1138073	1138078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224398
20233	NC_011529	ACA	2	6	1138101	1138106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224398
20234	NC_011529	CTACGC	2	12	1138132	1138143	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	212224398
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20347	NC_011529	TGA	2	6	1143807	1143812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224406
20348	NC_011529	GAG	2	6	1144092	1144097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224407
20349	NC_011529	TGGG	2	8	1144111	1144118	0 %	25 %	75 %	0 %	212224407
20350	NC_011529	GCA	2	6	1144155	1144160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224407
20351	NC_011529	GCA	2	6	1144164	1144169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224407
20352	NC_011529	GCG	2	6	1144222	1144227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224407
20353	NC_011529	GCT	2	6	1144229	1144234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224407
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20355	NC_011529	T	7	7	1144409	1144415	0 %	100 %	0 %	0 %	212224407
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20461	NC_011529	CGA	2	6	1151652	1151657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224414
20462	NC_011529	TGGA	2	8	1151659	1151666	25 %	25 %	50 %	0 %	212224414
20463	NC_011529	AGG	2	6	1151714	1151719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224414
20464	NC_011529	CGA	2	6	1151784	1151789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224414
20465	NC_011529	AG	3	6	1151819	1151824	50 %	0 %	50 %	0 %	212224414
20466	NC_011529	GGCA	2	8	1151854	1151861	25 %	0 %	50 %	25 %	212224414
20467	NC_011529	TGG	2	6	1151888	1151893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224414
20468	NC_011529	GA	3	6	1151895	1151900	50 %	0 %	50 %	0 %	212224414
20469	NC_011529	GAG	2	6	1151946	1151951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224415
20470	NC_011529	CGAG	2	8	1151974	1151981	25 %	0 %	50 %	25 %	212224415
20471	NC_011529	GCT	2	6	1152127	1152132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212224415
20472	NC_011529	CT	4	8	1152131	1152138	0 %	50 %	0 %	50 %	212224415
20473	NC_011529	TTC	2	6	1152165	1152170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212224415
20474	NC_011529	ATG	2	6	1152171	1152176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224415
20475	NC_011529	GAG	2	6	1152243	1152248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224415
20476	NC_011529	GA	3	6	1152315	1152320	50 %	0 %	50 %	0 %	212224415
20477	NC_011529	GGT	2	6	1152392	1152397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224415
20478	NC_011529	GA	3	6	1152398	1152403	50 %	0 %	50 %	0 %	212224415
20479	NC_011529	GAA	2	6	1152621	1152626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224416
20480	NC_011529	ATC	2	6	1152628	1152633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224416
20481	NC_011529	ACG	2	6	1152644	1152649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224416
20482	NC_011529	AGG	2	6	1152803	1152808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224416
20483	NC_011529	TGG	2	6	1152863	1152868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224416
20484	NC_011529	GTG	2	6	1152869	1152874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212224416
20485	NC_011529	ATC	2	6	1152893	1152898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212224417
20486	NC_011529	GGC	2	6	1152899	1152904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224417
20487	NC_011529	AAT	2	6	1152907	1152912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224417
20488	NC_011529	GAA	2	6	1152970	1152975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224417
20489	NC_011529	GA	3	6	1153079	1153084	50 %	0 %	50 %	0 %	212224417
20490	NC_011529	CGA	2	6	1153143	1153148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224417
20491	NC_011529	GAG	3	9	1153151	1153159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224417
20492	NC_011529	ACA	2	6	1153176	1153181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212224417
20493	NC_011529	AAT	2	6	1153666	1153671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212224417
20494	NC_011529	CGA	2	6	1153708	1153713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212224417
20495	NC_011529	CTC	2	6	1153856	1153861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212224417
20496	NC_011529	ATG	2	6	1153904	1153909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212224417
20497	NC_011529	GCG	2	6	1154007	1154012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212224417
20498	NC_011529	GAG	2	6	1154017	1154022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212224417
20499	NC_011529	AT	3	6	1154044	1154049	50 %	50 %	0 %	0 %	212224417
20500	NC_011529	AGA	2	6	1154337	1154342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212224418

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